基因總覽
S100 calcium binding protein A12（S100A12）是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質，屬於 S-100 家族，能結合鈣、鋅與銅離子。其蛋白質序列長 92 個胺基酸，含有兩個 EF-hand 結構域，並具有一段 hinge domain。這些特徵構成其基本的分子性質；其在發炎與免疫反應中的具體作用，則包括調節免疫細胞活動及相關訊號。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000368737 ★ | 153,373,711–153,375,621 | 3 |
| ENST00001091356 | 153,373,703–153,375,660 | 3 |
| ENST00001091357 | 153,373,703–153,375,660 | 3 |
| ENST00001091358 | 153,373,703–153,375,375 | 3 |
| ENST00001127790 | 153,373,703–153,375,660 | 3 |
| ENST00001144920 | 153,373,703–153,375,660 | 3 |
| ENST00001127791 | 153,373,707–153,375,660 | 3 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
S100A12 參與發炎過程與免疫反應，其促發炎作用涵蓋白血球募集、細胞激素與趨化因子的產生，以及白血球黏附和移動的調節。它可作為警報素或損傷相關分子模式（DAMP），透過結合晚期糖化終產物受體 AGER 刺激先天免疫細胞。此結合會活化 MAP-kinase 與 NF-kappa-B 訊號路徑，促使促發炎細胞激素產生，並提高細胞黏附分子 ICAM1 和 VCAM1 的表現。
S100A12 可吸引單核球與肥大細胞，也能促使肥大細胞活化及脫顆粒。肥大細胞因此產生趨化因子、組織胺與細胞激素，進一步促進白血球募集至發炎部位。這些作用連結了局部免疫細胞的活化與後續細胞募集。
此外，S100A12 可藉由螯合基質金屬蛋白酶活性位點中的 Zn(2+)，抑制 MMP2、MMP3 與 MMP9 的活性。來源亦記載其具有殺絲蟲及抑制絲蟲生長的活性。Calcitermin 具有抗真菌活性，可作用於 C.albicans；對 E.coli 和 P.aeruginosa 也有活性，但對 L.monocytogenes 和 S.aureus 則無此活性。
Promoter 與基因調控
>S100A12 ENST00000368737 GRCh38 chr1:153375521-153376621 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTTGCCTCCAGATCCAGAGAGGTCGGTGGGCACATGAAATGAACTAGCTTTGCTAAGGGGGATATCTGTG TTGTGGGGTAGATGGCAGCACAGGTTCTGGCATGGCCTTGATTGCTCAGCAATCTTATTGACCTCTAGGC ATAAACCAAGGGCAGAGTGCTTTTGGATGTCCCTTAGCTTTGGTGCGACATGGGGAATGTACAGATGAGA CTTAATCCATTTTGGGCAGGTTTCTGAATCTTGAAGGACCACCTCTCCATGAATCCTGGGCATCTGTTGT CCCTTGCTGCCTCTCTGTGAGTAATAAAGTTGCTTTACTAAAACTCGTGTGAATGTTCTGTCTTACTGAA CTCATGAACATGGTAAAGTAACCTAGGCATGGTGAACTTTCTTCACACACAATGATTACCCTACTCCAGC TTTCTAGGTCTTTGTAACAGCCAAGTTAGAAAGTTGGGAAAGCAAAGGGGAGGCATAGTAGCATTGCTCT CTCCTTTTTTGAAAACCTTGGAATCTATTTTGAAAACTGATCCTCTGCTCCAGTGATGAACTTTGCATCC CAGAACGACTTAGGAGGAGGTCTCCCTACCTATCTCCTTAGCTGCATAAAGATCTTTAAGTTGATATTCC ATTTGCCAAAACTGAAGAGCTGGTAACCTCATCTGTTAAAACAAGACACTCAGGCTGTAAAGTTTGTTCT CCTAGTCTTTTATTAGGGAGCAGTGGAGTAGAGCTAAACCTGAAACCTGGGCCCTGGCTCAGGGCTAAAA AAGGTTCAGGGCACCCCTGTGCGGGTGGGTGGAGTGGGGGTGATTTTGTTTCAGGCTGAGCAGGAGGGCA AAATTCAGTCTGGGTACAATCTGGGCTGCTCCTGTGGCAGCCTAAGCCACAGGTTTGAAGCTTCTATTGA GCAACAGAGTACTTTACATAAATTGCCTCAAGATGAATCAGAGATTTCTTCACCCAAGGGCTAAGATGAA GCCTGAACTGATTATAAAACCTTCCTTGGCTCAGTGCCCTTCACCACTGCTGGCTTTTTGCTGTAGCTCC ACATTCCTGTGCATTGAGGGGTAAGTGCATTTTCCTTGGATGGGTTCTTAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| S100A12_1 ↗ | 1:153,375,598 | 負股 | 153,375,588–153,375,647 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_86HQCZ · enhancer · 153375370–153375610 · regulatory
ENSR1_948TNK · promoter · 153375611–153375931 · regulatory
· motif · 153375707–153375716 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：92 aa
S100A12 長 92 個胺基酸，屬於 S-100 家族。蛋白質含有 EF-hand 1（第 13–48 位）與 EF-hand 2（第 49–84 位）兩個結構域，並在第 38–53 位具有 hinge domain。
蛋白質三維結構
細胞內定位
細胞內鈣濃度升高時，蛋白質會由細胞質轉移至細胞骨架與細胞膜；嗜中性球活化時，則可經由微管介導的替代途徑分泌。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- AGERQ15109 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TNFP01375 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
S100A12 可形成同源二聚體；在鈣、鋅與銅離子存在時，也可形成四聚體或六聚體。它會與 AGER 互作，且鈣與鋅對此互作皆為必要條件；另可依賴鈣離子與 CACYBP 互作。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | S100A12 可結合鈣、鋅與銅，參與發炎及免疫調節，促進白血球募集、細胞激素與趨化因子產生，並調節白血球黏附和移動。它作為警報素或 DAMP 結合 AGER，活化 MAP-kinase 與 NF-kappa-B 路徑；也能吸引單核球及肥大細胞、促使肥大細胞脫顆粒，並藉螯合鋅抑制 MMP2、MMP3、MMP9。此外，Calcitermin 對特定微生物有抗微生物活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源S100A12 is a calcium-, zinc- and copper-binding protein which plays a prominent role in the regulation of inflammatory processes and immune response. Its pro-inflammatory activity involves recruitment of leukocytes, promotion of cytokine and chemokine production, and regulation of leukocyte adhesion and migration. Acts as an alarmin or a danger associated molecular pattern (DAMP) molecule and stimulates innate immune cells via binding to receptor for advanced glycation endproducts (AGER). Binding to AGER activates the MAP-kinase and NF-kappa-B signaling pathways leading to production of pro-inflammatory cytokines and up-regulation of cell adhesion molecules ICAM1 and VCAM1. Acts as a monocyte and mast cell chemoattractant. Can stimulate mast cell degranulation and activation which generates chemokines, histamine and cytokines inducing further leukocyte recruitment to the sites of inflammation. Can inhibit the activity of matrix metalloproteinases; MMP2, MMP3 and MMP9 by chelating Zn(2+) from their active sites. Possesses filariacidal and filariastatic activity. Calcitermin possesses antifungal activity against C.albicans and is also active against E.coli and P.aeruginosa but not L.monocytogenes and S.aureus PMID 11522286 ↗ · PMID 17208591 ↗ · PMID 18292089 ↗ · PMID 19386136 ↗ |
| 交互作用 | S100A12 可形成同源二聚體；在鈣、鋅與銅離子存在時，可形成四聚體或六聚體。它與 AGER 互作需要鈣與鋅，與 CACYBP 的互作則依賴鈣離子。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Homooligomer (tetramer or hexamer) in the presence of calcium, zinc and copper ions. Interacts with AGER and both calcium and zinc are essential for the interaction. Interacts with CACYBP in a calcium-dependent manner PMID 12042313 ↗ · PMID 19386136 ↗ |
| 細胞定位 | S100A12 主要位於細胞質；細胞內鈣濃度升高時，會轉移至細胞骨架與細胞膜。嗜中性球活化後，S100A12 可透過微管介導的替代途徑分泌。 | 含實驗來源 | 證據與來源Secreted; Cytoplasm; Cytoplasm, cytoskeleton; Cell membrane / Peripheral membrane protein; Predominantly localized in the cytoplasm. Upon elevation of the intracellular calcium level, translocated from the cytoplasm to the cytoskeleton and the cell membrane. Upon neutrophil activation is secreted via a microtubule-mediated, alternative pathway PMID 22811950 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CTTCCTTGGCTCAGTGCCCTTCACCACTGCTGGCTTTTTG40CTGTAGCTCCACATTCCTGTGCATTGAGGGGTTAACATTA80GGCTGGGAAGATGACAAAACTTGAAGAGCATCTGGAGGGA120ATTGTCAATATCTTCCACCAATACTCAGTTCGGAAGGGGC160ATTTTGACACCCTCTCTAAGGGTGAGCTGAAGCAGCTGCT200TACAAAGGAGCTTGCAAACACCATCAAGAATATCAAAGAT240AAAGCTGTCATTGATGAAATATTCCAAGGCCTGGATGCTA280ATCAAGATGAACAGGTCGACTTTCAAGAATTCATATCCCT320GGTAGCCATTGCGCTGAAGGCTGCCCATTACCACACCCAC360AAAGAGTAGGTAGCTCTCTGAAGGCTTTTTACCCAGCAAT400GTCCTCAATGAGGGTCTTTTCTTTCCCTCACCAAAACCCA440GCCTTGCCCGTGGGGAGTAAGAGTTAATAAACACACTCAC480GAAAA485cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。