演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

S100A10P11

S100 calcium binding protein A10

S100A10 是蛋白質編碼基因,產物屬於 S-100 family,並可能透過影響 ANXA2/p36 的二聚化,參與調節蛋白質磷酸化。

Homo sapiens1q21.3UniProt P60903
OFFICIAL SYMBOL
S100A10
CHROMOSOME
1
UNIPROT
P60903
PDB / ALPHAFOLD
1A4P
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

S100A10(S100 calcium binding protein A10)是蛋白質編碼基因,產物為 Protein S100-A10,也稱 p11,屬於 S-100 family。其蛋白質長度為 97 個胺基酸;序列註解標示第 60 至 71 位胺基酸為 Ancestral calcium site。現有資料提供了其家族歸屬與一項區域註解,未進一步說明其他結構或基本性質。

Official symbol
S100A10
Gene name
S100 calcium binding protein A10
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10487
UniProt
P60903
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
P1142CCLP11ANX2LGCAL1L

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q21.3
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegS100A10pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr1:151,981,697–151,993,891
Gene span
12,195 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000368811 ★151,982,915–151,993,8593
ENST00000368809151,981,697–151,992,6563
ENST00000872056151,981,697–151,993,8163
ENST00000872057151,981,697–151,993,8914
ENST00000919940151,981,697–151,993,8913
ENST00000919941151,981,697–151,993,8914
ENST00000919942151,981,697–151,992,8363
ENST00000919943151,981,697–151,992,6213
ENST00001084286151,981,697–151,993,8913
ENST00001145682151,981,697–151,993,8913
ENST00001129921151,983,479–151,993,8912

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

S100A10 可能透過促進 ANXA2/p36 二聚化,影響蛋白質磷酸化的調節。資料提出,這種調節作用可能與 ANXA2/p36 的單體形式有關:在體外,ANXA2 單體是酪胺酸專一性激酶較偏好的標的。因此,S100A10 促進二聚化可能改變 ANXA2 被此類激酶作用的情形;但來源僅指出這是一種可能的調節功能,並未提供其在體內作用的證據或更進一步的機制細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 151993859 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>S100A10 ENST00000368811 GRCh38 chr1:151993759-151994859 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTAACCTTTTTCTTTTCTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTG
TCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGTCTCCCAGGTTCAAGCGATT
CTCATGCCTCAGTCTCCTGGGATTACAGGCGCGCATCACCACTCCCGGCTAATTTTTGTATCAGTAGAGA
CAAGGTTTCACCATGTTGGCTAAGCTGGTGTTGAACTCCTGACCTGAGGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTC
CCAAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAGTTTTTAACACTATTAGCCACACTGAA
ACTGAACTATTGATCAAGTGACGCCACACAAAGGGGTAAATCCCCTGTTCAACAAAGGGTTTGTGACGCC
CCTGGGTGCTGACAAGCCAAACCGCACCCTCCCTGCGGCACCTCGCGGGCCGGTGGGGCGGGAAGCCCGG
CTTCTGGGGAGGTGCCGCCCCTCCACTGGCGCAGGCCGCCGAGACCCCCAGACGGACCTCCTAGGGCTAA
TCTGATAGTGCCTCTGAGGTCGATAGGACTCCACGTGCCACTCCCTGCAGGGTCATCCAGCAAGTAATTC
CTAGACCCGTAGGTGGCCGCAGAGCCGGTTACCTCTGGTTCTGCGCCAGCGTGCCCCACCCGCAGGACGG
CCGGGTTCTTTGATTTGTACACTTTCTAAAACCAAACCCGAGAGGAAGGGCAGGCTCAGGGTGGGGATGC
CCTGAAATATTCGAGAGCAGGACCGTTTCTACTGAAGAGAAGTTTACAAGAACGCTCTGTCTGGGGCGGG
CGAGGCCTCTGCGAGGCGGGTCCGGGAGCGAGGGCAGGGCGTGGGCCGCGCGCCCGGGGTCGGGGGAGTC
GGGGGCAGGAAGAGGGGGAGGAGACAGGGCTGGGGGAGCGCCCTGCCGAGCGCCCGCCAGGCTCCTCCCG
CTCCCGCGCCGCCTCCCTCTACCCACCCGCCGCACGTACTAAGGAAGGCGCACAGCCCGCCGCGCTCGCC
TCTCCGCCCCGCGTCCAGCTCGCCCAGCTCGCCCAGCGTCCGCCGCGCCTC
S100A10 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
S100A10_1 ↗1:151,993,859負股151,993,849–151,993,908
S100A10_2 ↗1:151,994,403負股151,994,393–151,994,452

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_B356FL · enhancer · 151991671–151992567 · regulatory

ENSR1_948BTD · promoter · 151992568–151993068 · regulatory

ENSR1_B356FW · promoter · 151993849–151994541 · regulatory

ENSR1_53BQ95Q · CTCF_binding_site · 151994388–151994409 · regulatory

ENSR1_CK482 · enhancer · 151994542–151995605 · regulatory

ENSR1_86GMRM · enhancer · 151995865–151996102 · regulatory

ENSR1_53BQ9GD · CTCF_binding_site · 151996250–151996271 · regulatory

ENSR1_B356G9 · enhancer · 151996537–151997119 · regulatory

ENSR1_53BQ9KQ · CTCF_binding_site · 151996979–151997000 · regulatory

ENSR1_86GMSF · enhancer · 151997267–151997431 · regulatory

ENSR1_B356GK · enhancer · 151998553–151999387 · regulatory

· motif · 151994261–151994270 · motif

· motif · 151994390–151994406 · motif

· motif · 151994602–151994614 · motif

· motif · 151994604–151994619 · motif

· motif · 151996252–151996268 · motif

· motif · 151996981–151996997 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:97 aa

1 aa97 aa功能區域
依 P60903 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Protein S100-A10 長 97 個胺基酸,屬於 S-100 family。序列註解指出,第 60 至 71 位胺基酸為 Ancestral calcium site;資料未提供其他功能區域資訊。

功能區域Ancestral calcium site60–71 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1A4P…

PDB · 1A4P

X-ray · 2.25 A · A/B=2-97

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 11 個夥伴 · 最多顯示 50 個
P11S100A10AHNAKANXA2CCR10HLTFMLKLNANOS2S100A3S100ZTRPM4USP2ZGPAT
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

S100A10/p11 與 ANXA2/p36 組成異源四聚體,其中包含兩條 S100A10/p11 輕鏈及兩條 ANXA2/p36 重鏈。另有資料依相似性指出 S100A10 與 SCN10A 互作;此項互作並非來源所述的實驗證據。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能S100A10 促進 ANXA2/p36 二聚化,因此可能參與調節蛋白質磷酸化;在體外,ANXA2 單體是酪胺酸專一性激酶較偏好的作用標的。資料庫紀錄
證據與來源

Because S100A10 induces the dimerization of ANXA2/p36, it may function as a regulator of protein phosphorylation in that the ANXA2 monomer is the preferred target (in vitro) of tyrosine-specific kinase

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用S100A10/p11 與 ANXA2/p36 形成異源四聚體,由兩條輕鏈和兩條重鏈組成;另有依相似性提出的 S100A10 與 SCN10A 互作。含實驗來源
證據與來源

Heterotetramer containing 2 light chains of S100A10/p11 and 2 heavy chains of ANXA2/p36. Interacts with SCN10A (By similarity)

PMID 9886297 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000368811 · 671 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACCCACCCGCCGCACGTACTAAGGAAGGCGCACAGCCCGC40
41CGCGCTCGCCTCTCCGCCCCGCGTCCAGCTCGCCCAGCTC80
81GCCCAGCGTCCGCCGCGCCTCGGCCAAGGCTTCAACGGAC120
121CACACCAAAATGCCATCTCAAATGGAACACGCCATGGAAA160
161CCATGATGTTTACATTTCACAAATTCGCTGGGGATAAAGG200
201CTACTTAACAAAGGAGGACCTGAGAGTACTCATGGAAAAG240
241GAGTTCCCTGGATTTTTGGAAAATCAAAAAGACCCTCTGG280
281CTGTGGACAAAATAATGAAGGACCTGGACCAGTGTAGAGA320
321TGGCAAAGTGGGCTTCCAGAGCTTCTTTTCCCTAATTGCG360
361GGCCTCACCATTGCATGCAATGACTATTTTGTAGTACACA400
401TGAAGCAGAAGGGAAAGAAGTAGGCAGAAATGAGCAGTTC440
441GCTCCTCCCTGATAAGAGTTGTCCCAAAGGGTCGCTTAAG480
481GAATCTGCCCCACAGCTTCCCCCATAGAAGGATTTCATGA520
521GCAGATCAGGACACTTAGCAAATGTAAAAATAAAATCTAA560
561CTCTCATTTGACAAGCAGAGAAAGAAAAGTTAAATACCAG600
601ATAAGCTTTTGATTTTTGTATTGTTTGCATCCCCTTGCCC640
641TCAATAAATAAAGTTCTTTTTTAGTTCCAAA671

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。