基因總覽
RYR3 是蛋白質編碼基因，產物 ryanodine receptor 3 屬於 ryanodine receptor 家族的 RYR3 亞家族。此蛋白是多次穿膜蛋白，主要部分位於細胞質側，另有多段跨膜螺旋。其基本角色是作為鈣離子通道，參與細胞內鈣離子調節與訊號傳遞；在肌肉和非肌肉細胞中，來源描述了不同的鈣離子釋放情境。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000634891 ★ | 33,310,967–33,866,102 | 104 |
| ENST00000415757 | 33,310,947–33,866,102 | 103 |
| ENST00000389232 | 33,310,947–33,866,102 | 104 |
| ENST00001136852 | 33,310,947–33,866,102 | 104 |
| ENST00000634418 | 33,311,046–33,865,724 | 102 |
| ENST00000634750 | 33,311,068–33,503,738 | 2 |
| ENST00000635842 | 33,836,913–33,837,946 | 2 |
| ENST00000638032 | 33,836,917–33,838,331 | 2 |
| ENST00000634730 | 33,838,659–33,866,121 | 15 |
| ENST00000636568 | 33,841,968–33,866,077 | 13 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ryanodine receptor 3 是受細胞質鈣離子活化的鈣離子通道。在肌肉中，它促使肌漿網內的 Ca(2+) 釋放至細胞質，參與觸發肌肉收縮。這項作用使儲存於細胞內膜系統的鈣離子能進入細胞質，連結鈣離子變化與肌肉收縮的啟動。
在非肌肉細胞中，RYR3 也介導內質網的鈣離子誘發鈣離子釋放。也就是說，Ca(2+) 可促進更多 Ca(2+) 從內質網釋出。來源並指出，RYR3 可能調節其他鈣離子通道所介導的鈣離子釋放；此處以「可能」描述，不能視為已確立的調控作用。
RYR3 所介導的鈣離子釋放與細胞鈣離子恆定及鈣訊號傳遞有關。來源將其對鈣離子恆定的貢獻標示為相似性推定，並未提供更具體的細胞類型或實驗條件。因此，可確認的功能範圍包括肌肉收縮觸發、非肌肉細胞中的內質網鈣離子釋放，以及細胞鈣訊號；更細部的調控機制則不宜由此推定。
Promoter 與基因調控
>RYR3 ENST00000634891 GRCh38 chr15:33309967-33311067 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCTTTAGAGTCCACAGGGCTGGAACTCTAAATGCAGAATAAGGTTAGGGGTGGGCAGAGAGGAAGGGTTG TGATGCCACCTGACTTCCAAATTGAGGGTGGCACAGGATCCCCCAGAAGCTCCCTGGGGTACAGAAGTCA CAGCAACCCTGGACAATCCAGGGGTTTGGTAAAGTGTACTTACCAATTTTGAAGAGGGGAAGGGGTTCTC TTAAGGTGTAGAAAGGACTATCCAGGGAGTTGCAAACTTTGTTGTAAGTGGACAATCACCCTCGCTCCTC ACTGCACCGTCTTCTCCTTGCCCAACAATGCACGCGGGTCCTAGCAAGGTATTCGAGTCCAGATCTCTCT CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTGTCTCTCTCTCTTTCCTCTCTCTGTCTCTCTGTCTCTGTCTC TCTCTTTCCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTGTCTCTCTCTTTCCTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTGTCAC ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGGCAAAGTGGGCAAAGCGGGCAAAGCGAGCA AAGCGAGAGGGTTGGTACCCAGTCTGGGCGCGCTGGAGCTAAGCAACTGGCCTTTGTTTGTGAATTGGAG CAGTTTAGGGGACATCCTCCGGTCGCCGCGGGGCGCGCGCCTCCGCTGAGTGTGCGGTGCGGTACCCAGC GGTGCGGGGGAGGCTCCACCGCGCCAGCCCAGGGCCCCCGCACCGCCCCCGCCAGCTCGACGCGCCCAGC GTTGCGCTCTCCACGGAGCGGGCGGCCGCAGCGCACTTGGCTGGGGCGAGAGGCGAGAGGGGTGGGCGGA CTGCTTGGTTGGCGTTGGCGCTCTGCAGTGCAGTGGAGTGTTAGCCCAGCTCCCTATATGGTCGGGGATT AGCTTGGCGCTGCTGAGGCTGAGGCTGAGCCAGGAGCTGGAGGAGGAGGTGGAGGACGAGGACGAAAAGG AGGAGGAGAAAGAGCGCAGCAGCAGTCAGCGCACGCCGAGCGGCTGCCGGGGGAAGCAGAGGCGCCGGAG GCTGGGGCACCGCCGACGCCTCGGGAGCCATGGCCGAAGGGGGAGAAGGAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RYR3_3 ↗ | 15:33,303,172 | 正股 | 33,303,123–33,303,182 |
| RYR3_2 ↗ | 15:33,310,743 | 正股 | 33,310,694–33,310,753 |
| RYR3_1 ↗ | 15:33,310,957 | 正股 | 33,310,908–33,310,967 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR15_9H7Z8 · enhancer · 33309587–33310038 · regulatory
ENSR15_59SJJF · CTCF_binding_site · 33309654–33309675 · regulatory
ENSR15_59SJK7 · CTCF_binding_site · 33309822–33309843 · regulatory
ENSR15_B8LH9 · promoter · 33310478–33311056 · regulatory
ENSR15_B8LHC · enhancer · 33311057–33311896 · regulatory
ENSR15_59SJWF · CTCF_binding_site · 33311819–33311840 · regulatory
ENSR15_59SKB9 · CTCF_binding_site · 33314159–33314180 · regulatory
ENSR15_59SKCG · CTCF_binding_site · 33314419–33314440 · regulatory
· motif · 33309656–33309672 · motif
· motif · 33309824–33309840 · motif
· motif · 33311821–33311837 · motif
· motif · 33314161–33314177 · motif
· motif · 33314421–33314437 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：4870 aa
ryanodine receptor 3 屬於 ryanodine receptor 家族的 RYR3 亞家族，蛋白質長 4,870 個胺基酸。其大部分區段位於細胞質側，末端區域包含多段跨膜螺旋；另有 MIR、B30.2/SPRY 結構域及重複序列。資料亦標註與 FKBP1A、CALM 互作的區域，以及兩段預測為無序的區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ryanodine receptor 3 位於肌漿網膜，並具有多次穿膜特徵。 現有定位資料未描述其他細胞區室、定位變化條件或異構型間差異。
未繪示構造：Sarcoplasmic reticulum membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
ryanodine receptor 3 可形成同源四聚體，也可與 RYR2 形成異源四聚體。資料另記載其與 FKBP1A 互作；與 CALM 及 SELENON 的互作則標示為相似性推定。來源未進一步說明這些互作是否構成同一複合體或其功能後果。
疾病與遺傳關聯
RYR3 變異可能造成先天性肌病 20（CMYO20），但此描述表示可能的致病關聯，不應解讀為所有 RYR3 變異皆會致病。此常染色體隱性神經肌肉疾病表現不一：部分患者出生後不久出現肢體或遠端攣縮，另一些患者在幼年出現肌力減弱，以及跑步、爬樓梯困難。也可能伴隨臉部特徵異常、發展遲緩與智能障礙。骨骼肌切片可見肌纖維大小不一、第一型肌纖維比例偏高並萎縮、第二型肌纖維肥大，以及大量線狀小體。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RYR3 是受細胞質鈣離子活化的鈣離子通道，在肌肉中介導 Ca(2+) 從肌漿網釋放到細胞質，參與觸發肌肉收縮；它也可能調節其他鈣離子通道所介導的釋放。在非肌肉細胞中，RYR3 介導內質網的鈣離子誘發鈣離子釋放，並參與細胞鈣離子恆定與鈣訊號傳遞，其中鈣離子恆定的描述為相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytosolic calcium-activated calcium channel that mediates the release of Ca(2+) from the sarcoplasmic reticulum into the cytoplasm in muscle and thereby plays a role in triggering muscle contraction. May regulate Ca(2+) release by other calcium channels. Calcium channel that mediates Ca(2+)-induced Ca(2+) release from the endoplasmic reticulum in non-muscle cells. Contributes to cellular calcium ion homeostasis (By similarity). Plays a role in cellular calcium signaling PMID 12354756 ↗ · PMID 9395096 ↗ |
| 分子活性 | Ca(2+)(in) = Ca(2+)(out) | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | RYR3 可形成同源四聚體，也可與 RYR2 形成異源四聚體。來源另記載其與 FKBP1A 互作；與 CALM 及 SELENON 的互作則屬相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homotetramer. Heterotetramer with RYR2. Interacts with CALM (By similarity). Interacts with FKBP1A. Interacts with SELENON (By similarity) PMID 22100703 ↗ |
| 細胞定位 | RYR3 位於肌漿網膜，並被描述為多次穿膜蛋白。 | 推論支持 | |
| 疾病關聯 | RYR3 變異可能造成先天性肌病 20，這是一種表現可變的常染色體隱性神經肌肉疾病。患者可能在出生後不久出現肢體或遠端攣縮，或於幼年發生肌力減弱及跑步、爬樓梯困難；其他特徵包括臉部特徵異常、發展遲緩與智能障礙。骨骼肌切片可能見肌纖維大小不一、第一型肌纖維偏多且萎縮、第二型肌纖維肥大及大量線狀小體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Congenital myopathy 20 CMYO20 An autosomal recessive neuromuscular disorder characterized by variable manifestations. Some patients have congenital limb or distal contractures manifesting soon after birth, while others develop muscle weakness with difficulty running and climbing stairs in early childhood. Additional features may include facial dysmorphism, and delayed development with intellectual disability. Skeletal muscle biopsy may show variation in fiber size with type 1 fiber predominance and atrophy, hypertrophic type 2 fibers, and abundant nemaline bodies. The disease may be caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620310 PMID 29498452 ↗ · PMID 31230720 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGCAGTCAGCGCACGCCGAGCGGCTGCCGGGGGAAGCAGA40GGCGCCGGAGGCTGGGGCACCGCCGACGCCTCGGGAGCCA80TGGCCGAAGGGGGAGAAGGAGGCGAGGACGAGATCCAGTT120TCTGAGGACTGAGGATGAAGTGGTACTCCAGTGCATCGCC160ACCATTCATAAGGAGCAGAGGAAGTTCTGCCTGGCAGCCG200AGGGACTTGGGAATCGCCTGTGCTTCTTGGAACCCACTTC240AGAAGCCAAGTACATTCCTCCAGATCTCTGCGTCTGCAAT280TTTGTGCTGGAACAGTCCCTATCTGTCAGAGCCCTGCAGG320AAATGCTTGCCAACACAGGTGAAAATGGCGGCGAAGGGGC360AGCACAAGGAGGTGGCCACAGGACCCTGTTATACGGCCAT400GCAGTTCTCCTGAGGCACTCTTTCAGCGGAATGTATCTAA440CATGCTTGACTACATCAAGATCCCAGACAGACAAACTTGC480CTTTGATGTAGGTCTACGGGAACATGCCACAGGAGAAGCC520TGTTGGTGGACTATACATCCTGCTTCCAAACAGAGGTCCG560AAGGAGAGAAAGTTCGAATTGGCGATGACCTCATCCTCGT600CAGCGTGTCCTCTGAAAGATACCTTCATCTCTCAGTATCA640AATGGTAACATACAAGTGGATGCCTCCTTTATGCAAACAC680TCTGGAATGTACATCCTACGTGCTCAGGAAGTAGCATCGA720AGAAGGATACCTACTTGGTGGGCATGTAGTACGTCTTTTC760CATGGTCATGATGAATGTTTGACGATACCATCTACAGACC800AGAATGATTCCCAGCACAGGAGGATATTCTACGAAGCTGG840GGGAGCTGGGACTCGAGCCAGGTCTCTTTGGAGAGTGGAA880CCCCTTCGGATAAGCTGGAGTGGCAGTAACATCAGATGGG920GCCAGGCTTTCCGACTCCGGCATCTCACCACAGGCCACTA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。