演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RXRANR2B1

retinoid X receptor alpha

RXRA 編碼 retinoid X receptor alpha,屬核內荷爾蒙受體家族,能與多種核受體形成異源二聚體並參與配體依賴的基因轉錄調控。

Homo sapiens9q34.2UniProt P19793
OFFICIAL SYMBOL
RXRA
CHROMOSOME
9
UNIPROT
P19793
PDB / ALPHAFOLD
3DZU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RXRA 是蛋白質編碼基因,其產物為 retinoid X receptor alpha,屬於核內荷爾蒙受體家族的 NR2 亞家族。這類受體可作為轉錄因子,並透過與其他核受體組成二聚體參與基因表現調節。retinoid X receptor alpha 具有核受體 DNA 結合區與配體結合區,另含可調節活性的區段;其構造也包括鉸鏈區及核定位訊號。這些特徵使它具備辨識調控 DNA、與配體及其他分子作用的基礎。以下功能說明著重於其受體活性如何依配體與二聚體夥伴而改變。

Official symbol
RXRA
Gene name
retinoid X receptor alpha
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10477
UniProt
P19793
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
NR2B1RXRalphaRXR-alpha

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99q34.2
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegRXRApq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr9:134,317,098–134,440,585
Gene span
123,488 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000481739 ★134,326,455–134,440,58510
ENST00001126702134,326,455–134,440,58311
ENST00000672570134,379,295–134,440,58510
ENST00000649020134,386,122–134,401,8822

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

retinoid X receptor alpha 是 retinoic acid 的受體及轉錄因子。它可形成同源二聚體,也能與 retinoic acid receptors(RARs)等核受體形成異源二聚體;配體包括 all-trans retinoic acid 與 9-cis retinoic acid,其中 9-cis retinoic acid 是 retinoid X receptors(RXRs)的高親和力配體。受體二聚體在配體作用下辨識目標反應序列並調節基因表現,將配體訊號連結至不同生物過程中的轉錄反應。

RAR/RXR 異源二聚體可結合 retinoic acid response elements(RARE)。這些序列包含串聯排列的 5'-AGGTCA-3' 位點,依排列方式稱為 DR1 至 DR5。配體會改變受體所招募的轉錄調節因子:缺乏配體時,RXR-RAR 異源二聚體與含有轉錄共抑制因子的多蛋白複合體結合,促進組蛋白去乙醯化與染色質凝縮,抑制轉錄;配體結合後,共抑制因子解離,並招募共活化因子,使轉錄活化。

retinoid X receptor alpha 也可作為多種核受體的共同異源二聚體夥伴,包括 RARA、RARB 與 PPARA。RXRA/RARB 二聚體的作用方向取決於所結合 RARE DNA 元件的情境,可抑制或活化轉錄。RXRA/PPARA 二聚體則是 PPARA 調控脂肪酸氧化相關基因(如 ACOX1)及 P450 系統基因所需。與 RARA 協同時,RXRA 也能增強 RARA 對 RARE 的結合,並正向調節 microRNA-10a;在血管內皮細胞中,這與抑制脈動剪切應力引發的 GATA6/VCAM1 訊號反應相關。

其功能亦延伸至其他生物過程。RXRA 促進巨噬細胞吞噬髓鞘碎片及髓鞘再生;在病毒感染反應中,可能藉由負向調節第一型 IFN 等抗病毒基因的轉錄,參與降低先天免疫反應。它也可透過抑制 ITPR2 基因表現調節鈣訊號,進而控制細胞老化。另有資料指出,RXRA 可能促進 VDR 與 NR4A1 等二聚體夥伴進入細胞核。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 134326455 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RXRA ENST00000481739 GRCh38 chr9:134325455-134326555 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCCCGAGACGGCGGGCGGCGGGCGGCGCGCGGCGGAGGCGGCCCGAGCTGTCCCGGGGCAGGAGTGCTTC
CTTTCGTTTTCAAACAAATCGTGAATTTAAAAGTCAGGCAGAGAACTACCCAGGGTATAAAAATAGCCAC
CGGCCACAAAGTCTGTGTCCAACTCCGGGCAGCGCCTGCCCAGCCTGGTGCCTTTGAAGAGGGGTCCCAG
GAGTGCGGGTCGATGAGGAGGCGAAGCGCGCACCCCTCCTCGTTCCCGGTGGGCTCGTGGGTCTCTCCGT
GGGGGTAGGGCGTGAAAGTGTGGGGTGGACCGGGGGTAGCGTCCGGAAGACGAAACCTTCCCCGGACGAG
GAGCTTGTCCTCTGCCGTTGGGGCACATCGCCACTCCCGGGCCTCAGTTTCCCCACGTGTCCGCCGCGGC
GGGGTGCGAGGTATGGGTGCCGCGGCCATCCCGCCCGGCTCTGCGCTTGCCTGGCCCGGGCCGGGGTCCC
CTCGCGGCCACCGCCCGGCCGCTTTGTGTGGCCGCGCAGACAATGGCCCGGCCGCTGGGCTCCCGGCCCG
GCTCTCCGCCTCCTCCGGGCCCTTGCGCGCAAGTGTGTGTGTGCGCGAGTGTGTGGCGGGCCCGGGGAGG
GAGTTCTGCTCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCGCTCCCTCTGCGCCCCGCCCCCTCCCACGCCGCCTCCTCG
CGGCTCCCGGGAACCCCTGGCGGAGGCGAACTCGCAAGTTTGCACGGCGCTCTCAACTCGGCGGCCGGGC
GGGCGGCGATCGCGGGGCGGCGGCGGCGGAGGGGGGCGCGCTCCGGGCGGGGCTGGGCGGGCGGGGCGCG
GGCCGAGCGGTGGCGGCGGCGCTGCGCCGAGTCAGCGCCCGTCGCGGGCCCCCCGCCACCCCCCCGCCGG
CGCCGCAGCGCCGCGGTCGGAGCGGGGCGCGGGCGCGCGGCGGCGGGGGCGCGGGCCGGGCGCGCGCGGC
GGCGGCGCGCAGACACAAGTAGTTTACATTGTTGGGCGACTTTTGCAACAACTCGCCGCGCCGCGGCCTC
CGCGCGCCGCCGCCGCCACCGCAGCCGCCGGCTCCCCGCCGCCCGGGCCCG
RXRA 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RXRA_1 ↗9:134,326,502正股134,326,453–134,326,512

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_CHBTQ · enhancer · 134323664–134324964 · regulatory

ENSR9_536L383 · CTCF_binding_site · 134323919–134323943 · regulatory

ENSR9_536L38W · CTCF_binding_site · 134324106–134324127 · regulatory

ENSR9_93ZBJJ · promoter · 134325965–134326465 · regulatory

ENSR9_536L3LB · CTCF_binding_site · 134326141–134326162 · regulatory

ENSR9_536L3RK · CTCF_binding_site · 134327274–134327295 · regulatory

ENSR9_536L483 · CTCF_binding_site · 134329757–134329778 · regulatory

· motif · 134322010–134322025 · motif

· motif · 134322010–134322025 · motif

· motif · 134322011–134322025 · motif

· motif · 134322100–134322113 · motif

· motif · 134322144–134322157 · motif

· motif · 134323428–134323443 · motif

· motif · 134323428–134323443 · motif

· motif · 134323810–134323820 · motif

· motif · 134323873–134323888 · motif

· motif · 134323921–134323937 · motif

· motif · 134323924–134323940 · motif

· motif · 134324076–134324086 · motif

· motif · 134324078–134324088 · motif

· motif · 134324085–134324100 · motif

· motif · 134324106–134324116 · motif

· motif · 134324108–134324124 · motif

· motif · 134326095–134326108 · motif

· motif · 134326101–134326114 · motif

· motif · 134326128–134326141 · motif

· motif · 134326134–134326147 · motif

· motif · 134326143–134326159 · motif

· motif · 134326171–134326184 · motif

· motif · 134326238–134326251 · motif

· motif · 134326241–134326254 · motif

· motif · 134327276–134327292 · motif

· motif · 134329086–134329099 · motif

· motif · 134329086–134329100 · motif

· motif · 134329086–134329101 · motif

· motif · 134329186–134329196 · motif

· motif · 134329759–134329775 · motif

RXRA 的表現受生理條件影響:老化與其下調相關,而脈動剪切應力會誘導其表現。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:462 aa

1 aa462 aa結構域DNA 結合功能區域鋅指
依 P19793 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

retinoid X receptor alpha 長 462 個胺基酸。其核受體 DNA 結合區位於第 135–200 個胺基酸,含兩個 NR C4-type 鋅指;NR LBD 位於第 227–458 位。蛋白質另有 N 端調節區、鉸鏈區及核定位訊號;第 348–368 位區段與核輸出所需功能相關。

結構域NR LBD227–458 aa
DNA 結合區Nuclear receptor135–200 aa
鋅指NR C4-type135–155 aa
鋅指NR C4-type171–195 aa
功能區域Modulating1–134 aa
功能區域Disordered1–107 aa
功能區域Nuclear localization signal160–165 aa
功能區域Hinge201–224 aa
功能區域Disordered206–228 aa
功能區域Required for nuclear export348–368 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 3DZU…

PDB · 3DZU

X-ray · 3.20 A · A=11-462

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Cytoplasm;Mitochondrion

retinoid X receptor alpha 可見於細胞核、細胞質與粒線體。 維生素 D3 或脈動剪切應力與核內定位增加相關;與 VDR 作用可能增強其核定位。 與 NR4A1 作用時則可轉位至粒線體。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 17 個夥伴 · 最多顯示 50 個
NR2B1RXRABHLHE40FUSMED1MED25NCOA1NCOA2NR1H2NR1H3PIK3R1PPARGRARASTAT1VDRCxadrNcoa6THRAQ03463
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 17 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RXRA 可形成同源二聚體,並與 RARA、RARB、PPARA、PPARG、NR1H4 及 NR4A1 等形成異源二聚體;部分二聚體的形成或 DNA 結合會受配體影響。它也與共活化因子及共抑制因子等多種蛋白質互作。微生物感染時,RXRA 可透過 DNA 結合區與 HCV core protein 互作;該作用會增強 RXRA/RARA 與 RXRA/PPARA 異源二聚體的轉錄活性。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能retinoid X receptor alpha 是 retinoic acid 受體及轉錄因子,可形成同源或異源二聚體,並在配體作用下結合目標反應序列以調節基因表現。RAR/RXR 可辨識 RARE;配體會改變共抑制因子與共活化因子的招募。它亦參與核受體轉錄調控、巨噬細胞髓鞘碎片吞噬與再生、病毒感染時的先天免疫調節,以及鈣訊號和細胞老化。含實驗來源
證據與來源

Receptor for retinoic acid that acts as a transcription factor. Forms homo- or heterodimers with retinoic acid receptors (RARs) and binds to target response elements in response to their ligands, all-trans or 9-cis retinoic acid, to regulate gene expression in various biological processes. The RAR/RXR heterodimers bind to the retinoic acid response elements (RARE) composed of tandem 5'-AGGTCA-3' sites known as DR1-DR5 to regulate transcription. The high affinity ligand for retinoid X receptors (RXRs) is 9-cis retinoic acid. In the absence of ligand, the RXR-RAR heterodimers associate with a multiprotein complex containing transcription corepressors that induce histone deacetylation, chromatin condensation and transcriptional suppression. On ligand binding, the corepressors dissociate from the receptors and coactivators are recruited leading to transcriptional activation. Serves as a common heterodimeric partner for a number of nuclear receptors, such as RARA, RARB and PPARA. The RXRA/RARB heterodimer can act as a transcriptional repressor or transcriptional activator, depending on the RARE DNA element context. The RXRA/PPARA heterodimer is required for PPARA transcriptional activity on fatty acid oxidation genes such as ACOX1 and the P450 system genes. Together with RARA, positively regulates microRNA-10a expression, thereby inhibiting the GATA6/VCAM1 signaling response to pulsatile shear stress in vascular endothelial cells. Acts as an enhancer of RARA binding to RARE DNA element. May facilitate the nuclear import of heterodimerization partners such as VDR and NR4A1. Promotes myelin debris phagocytosis and remyelination by macrophages. Plays a role in the attenuation of the innate immune system in response to viral infections, possibly by negatively regulating the transcription of antiviral genes such as type I IFN genes. Involved in the regulation of calcium signaling by repressing ITPR2 gene expression, thereby controlling cellular senescence

PMID 10195690 ↗ · PMID 10874028 ↗ · PMID 11162439 ↗ · PMID 11915042 ↗ · PMID 12145331 ↗ · PMID 1310260 ↗ · PMID 15509776 ↗ · PMID 16107141 ↗ · PMID 17761950 ↗ · PMID 18800767 ↗ · PMID 19167885 ↗ · PMID 20215566 ↗ · PMID 25417649 ↗ · PMID 26463675 ↗ · PMID 28167758 ↗ · PMID 29021580 ↗ · PMID 30216632 ↗ · PMID 37478846 ↗ · PMID 9267036 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RXRA 可形成同源二聚體,並與多種核受體及轉錄調節蛋白互作。與 RARA 的異源二聚體參與配體依賴的受體轉錄活性,且其關聯可受脈動剪切應力增強;與 PPARA 的二聚體則是 PPARA 轉錄活性所需。與 NR1H4 的二聚化可提高對共活化因子 LXXLL 基序的結合親和力;RXRA 也能以配體依賴方式與 MED1、NCOA1 互作。含實驗來源
證據與來源

Homodimer. Heterodimer (via C-terminus) with RARA; required for ligand-dependent retinoic acid receptor transcriptional activity; association with RARA is enhanced by pulsatile shear stress. Heterodimer with PPARA (via the leucine-like zipper in the LBD); the interaction is required for PPARA transcriptional activity. Heterodimerizes with PPARG. Heterodimerizes (via NR LBD) with RARB. Heterodimerizes with NR1H4; the heterodimerization enhances the binding affinity for LXXLL motifs from coactivators. Interacts with NCOA3 and NCOA6 coactivators. Interacts with coactivator FAM120B (By similarity). Interacts with coactivator PELP1, SENP6, SFPQ, DNTTIP2 and RNF8. Interacts with PRMT2. Interacts with ASXL1 (By similarity). Interacts with BHLHE40/DEC1, BHLHE41/DEC2, NCOR1 and NCOR2. Interacts in a ligand-dependent fashion with MED1 and NCOA1. Interacts with VDR. Interacts with EP300; the interaction is decreased by 9-cis retinoic acid. Heterodimer (via C-terminus) with NR4A1 (via DNA-binding domain); DNA-binding of the heterodimer is enhanced by 9-cis retinoic acid. NR4A1 competes with EP300 for interaction with RXRA and thereby attenuates EP300 mediated acetylation of RXRA. In the absence of hormonal ligand, interacts with TACC1. Interacts ith IGFBP3

PMID 10195690 ↗ · PMID 10567404 ↗ · PMID 10669605 ↗ · PMID 10698945 ↗ · PMID 10874028 ↗ · PMID 10882139 ↗ · PMID 11259580 ↗ · PMID 11698662 ↗ · PMID 11915042 ↗ · PMID 12039952 ↗ · PMID 14981089 ↗ · PMID 15047147 ↗ · PMID 15509776 ↗ · PMID 16574651 ↗ · PMID 16912044 ↗ · PMID 17761950 ↗ · PMID 19786558 ↗ · PMID 20078863 ↗ · PMID 28167758 ↗ · PMID 28698609 ↗ · PMID 29021580 ↗ · PMID 30275017 ↗ · PMID 9267036 ↗

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交互作用在微生物感染情境下,RXRA 可透過 DNA 結合區與 HCV core protein 互作;這項互作會增強 RXRA/RARA 及 RXRA/PPARA 異源二聚體的轉錄活性。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts (via the DNA binding domain) with HCV core protein; the interaction enhances the transcriptional activities of the RXRA/RARA and the RXRA/PPARA heterodimers

PMID 11915042 ↗

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細胞定位RXRA 可位於細胞核、細胞質與粒線體。維生素 D3 會增強其核定位;與異源二聚體夥伴 VDR 的互作可能提高核定位。與 NR4A1 互作時,RXRA 會轉位至粒線體;脈動剪切應力也會增加其核定位。含實驗來源
證據與來源

Nucleus; Cytoplasm; Mitochondrion; Localization to the nucleus is enhanced by vitamin D3. Nuclear localization may be enhanced by the interaction with heterodimerization partner VDR. Translocation to the mitochondrion upon interaction with NR4A1. Increased nuclear localization upon pulsatile shear stress

PMID 10874028 ↗ · PMID 11915042 ↗ · PMID 12145331 ↗ · PMID 15509776 ↗ · PMID 17761950 ↗ · PMID 28167758 ↗

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調控RXRA 受年齡與力學刺激相關條件調控:老化會使其下調,脈動剪切應力則會誘導其表現。含實驗來源
證據與來源

Down-regulated by aging. Induced by pulsatile shear stress

PMID 26463675 ↗ · PMID 28167758 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000481739 · 5,537 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGTTTACATTGTTGGGCGACTTTTGCAACAACTCGCCGCG40
41CCGCGGCCTCCGCGCGCCGCCGCCGCCACCGCAGCCGCCG80
81GCTCCCCGCCGCCCGGGCCCGGGCCGGCCGCGCCGGGGGC120
121CGCCGCGCCCGCCGCCCGCTGCCTGCGCCGCCGGCCGGGC160
161ATGAGTTAGTCGCAGACATGGACACCAAACATTTCCTGCC200
201GCTCGATTTCTCCACCCAGGTGAACTCCTCCCTCACCTCC240
241CCGACGGGGCGAGGCTCCATGGCTGCCCCCTCGCTGCACC280
281CGTCCCTGGGGCCTGGCATCGGCTCCCCGGGACAGCTGCA320
321TTCTCCCATCAGCACCCTGAGCTCCCCCATCAACGGCATG360
361GGCCCGCCTTTCTCGGTCATCAGCTCCCCCATGGGCCCCC400
401ACTCCATGTCGGTGCCCACCACACCCACCCTGGGCTTCAG440
441CACTGGCAGCCCCCAGCTCAGCTCACCTATGAACCCCGTC480
481AGCAGCAGCGAGGACATCAAGCCCCCCCTGGGCCTCAATG520
521GCGTCCTCAAGGTCCCCGCCCACCCCTCAGGAAACATGGC560
561TTCCTTCACCAAGCACATCTGCGCCATCTGCGGGGACCGC600
601TCCTCAGGCAAGCACTATGGAGTGTACAGCTGCGAGGGGT640
641GCAAGGGCTTCTTCAAGCGGACGGTGCGCAAGGACCTGAC680
681CTACACCTGCCGCGACAACAAGGACTGCCTGATTGACAAG720
721CGGCAGCGGAACCGGTGCCAGTACTGCCGCTACCAGAAGT760
761GCCTGGCCATGGGCATGAAGCGGGAAGCCGTGCAGGAGGA800
801GCGGCAGCGTGGCAAGGACCGGAACGAGAATGAGGTGGAG840
841TCGACCAGCAGCGCCAACGAGGACATGCCGGTGGAGAGGA880
881TCCTGGAGGCTGAGCTGGCCGTGGAGCCCAAGACCGAGAC920
921CTACGTGGAGGCAAACATGGGGCTGAACCCCAGCTCGCCG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。