基因總覽
RWDD2B 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 RWD domain containing 2B。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 21q21.3。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000493196 ★ | 29,004,384–29,019,349 | 5 |
| ENST00000929248 | 29,003,761–29,019,374 | 5 |
| ENST00001003515 | 29,003,761–29,019,374 | 3 |
| ENST00001131614 | 29,003,761–29,019,374 | 5 |
| ENST00001086925 | 29,005,759–29,019,374 | 3 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>RWDD2B ENST00000493196 GRCh38 chr21:29019249-29020349 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATATTTAGTATTGCTAAATGTCAATGTTTACAAATCTTATCTATGACATTTCTAAAATGAATATTATAAA GTGTATTGCATATAGTTGGATTGGGAAGAAAAACATTTCTAATTATTCTCCTGTCAGCATCTCCTTCAAA CTACCCTTTTATTAACAGGGATAGATATGCATTCACACGGTTCCTCCCAGCTTGGTTAATGGGCAAGAAC ACCTAAGATAGCCAAGGCCACCATGCATCCAGGCTCACATCTCCCTAATTGCCCTCCTCCATGATTCAGG GACAAGGAGGATCACCATCGTGTGGGAAGATACTAGAAATGTAGAATTTGGAACCCCACCCCTACCTACG GAATCCTGATCTGCACTTCAACAGGATCCCCGAACTATTCCTAGGCGCGTTCGAATTTGAGGAACATTAA CGGACCAATTCTTTGTCCCTGAAAAGTGCCCGTTATAGAGGCGGCCGCTGGGAAATGACAACGGGGTTGG CATGGAGAGGTATTAAGTAGAAAAACTCCGGCCGGGCACGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTGTG GGAGGCCGAGGCCGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCC ATTTCTACTGAAAAATACAAAAATTATCTGGGCATGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAG GCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGCTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACT CCAGCTTGAGAGACACAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGGAAGAAAGAAAGAAGAAGAAGAG AACTCTGCGACTGAAAAGTACCTAGCAGGGACAACGCATTCCCTACGTCCTTCCAAGTGCAGACACCAAC ACCGGCGGACGCGGCTCCCAACAGGCGAGCCCCAGCTTCCGGTCCGCGGCCTTGGACGCGCATGCGCCGC ATGCTTTTTTTTTTTTTTTCCGGTAGGTCGCCAGCTGAGGCGGTTTGTAAGTTTTGGGTCGCAGTATGCT AGAATTTTGAGGCTCCCTTCTGATGAAAATTGAGCTGTCCATGCAGCCATG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RWDD2B_1 ↗ | 21:29,019,349 | 負股 | 29,019,339–29,019,398 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR21_C4TQ5 · enhancer · 29017713–29019338 · regulatory
ENSR21_9FHZT · promoter · 29019339–29019839 · regulatory
ENSR21_B7QJ5 · promoter · 29024139–29024678 · regulatory
· motif · 29017707–29017722 · motif
· motif · 29017707–29017722 · motif
· motif · 29018582–29018597 · motif
· motif · 29018583–29018596 · motif
· motif · 29018583–29018596 · motif
· motif · 29019128–29019141 · motif
· motif · 29019372–29019383 · motif
· motif · 29019372–29019383 · motif
· motif · 29019388–29019403 · motif
· motif · 29019397–29019406 · motif
· motif · 29019868–29019883 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：319 aa
RWDD2B 的蛋白質長 319 個胺基酸，含有位於第 41 至 165 位的 RWD domain。
蛋白質三維結構
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
- DVL3Q92997 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EPB41P11171-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM163AQ96GL9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GADD45GO95257 · UniProt INTERACTION · 15 experiments
- IKZF1Q13422 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- KIAA1958Q8N8K9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT40Q6A162 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- KRTAP10-7P60409 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MEOX2Q6FHY5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PHC2Q8IXK0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM7Q9C029 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
CGGTAGGTCGCCAGCTGAGGCGGTTTGTAAGTTTTGGGTC40GCAGTATGCTAGAATTTTGAGGCTCCCTTCTGATGAAAAT80TGAGCTGTCCATGCAGCCATGGAACCCGGGTTACAGCAGT120GAGGGGGCCACGGCTCAAGAAACTTACACATGTCCAAAAA160TGATTGAGATGGAGCAGGCGGAGGCCCAGCTTGCTGAGTT200AGACCTGCTAGCCAGTATGTTCCCTGGTGAGAATGAGCTC240ATAGTGAATGACCAGCTGGCTGTAGCAGAACTGAAAGATT280GTATTGAAAAGAAGACAATGGAGGGGCGATCTTCAAAAGT320CTACTTTACTATCAATATGAACCTGGATGTATCTGACGAA360AAAATGGCGATGTTTTCTCTGGCCTGTATTCTTCCCTTTA400AATACCCGGCAGTTCTGCCTGAAATTACTGTCAGATCAGT440ATTATTGAGTAGATCCCAGCAGACTCAGCTGAACACAGAT480CTGACTGCATTCCTGCAAAAACATTGTCATGGAGATGTTT520GTATACTGAATGCCACAGAGTGGGTTAGAGAACACGCCTC560TGGCTATGTCAGCAGAGATACTTCATCTTCACCCACCACA600GGAAGCACAGTCCAGTCAGTTGACCTCATCTTCACGAGAC640TCTGGATCTACAGCCATCATATCTATAACAAATGCAAAAG680AAAGAATATTCTAGAGTGGGCAAAGGAGCTTTCCCTGTCT720GGGTTTAGCATGCCTGGAAAACCTGGTGTTGTTTGTGTGG760AAGGCCCACAAAGTGCCTGTGAAGAATTCTGGTCAAGACT800CAGAAAATTAAACTGGAAGAGAATTTTAATTCGCCATCGA840GAAGACATTCCTTTTGATGGTACAAATGATGAAACGGAAA880GACAAAGGAAATTTTCCATTTTTGAAGAAAAAGTGTTCAG920TGTTAATGGAGCCAGGGGAAACCACATGGACTTTGGTCAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。