基因總覽
RUNX family transcription factor 1 是由 RUNX1 編碼的蛋白質,屬於 RUNX 家族轉錄因子。其蛋白質包含 Runt 結構域,並可與非 DNA 結合調控次單元 CBFB 形成異源二聚體 core-binding factor(CBF)。RUNX1 也有不同異構型,這些形式在靶基因結合能力及轉錄活性上有所差異;例如 AML-1G 的靶基因結合活性較高,而 AML-1L 可干擾 RUNX1 的轉錄活化作用。其主要角色涵蓋造血發育與免疫細胞相關的基因調控。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000675419 ★ | 34,787,801–35,049,302 | 9 |
| ENST00000344691 | 34,787,801–34,888,690 | 6 |
| ENST00000300305 | 34,787,801–35,049,344 | 8 |
| ENST00000399240 | 34,787,801–34,887,183 | 5 |
| ENST00000882527 | 34,787,801–35,049,344 | 7 |
| ENST00001131757 | 34,787,801–35,049,334 | 9 |
| ENST00000358356 | 34,821,279–34,888,690 | 5 |
| ENST00001105581 | 34,833,122–35,049,344 | 6 |
| ENST00000399237 | 34,834,410–34,889,790 | 5 |
| ENST00000455571 | 34,880,606–35,049,298 | 4 |
| ENST00000475045 | 34,887,046–36,004,667 | 13 |
| ENST00000416754 | 34,892,925–35,049,270 | 3 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RUNX1 透過 Runt 結構域辨識調控區中的核心 DNA 序列,主要為 5'-TGTGGT-3',較少見的序列為 5'-TGCGGT-3',藉此調節靶基因轉錄。RUNX1 可與 CBFB 組成 CBF;CBFB 本身不結合 DNA,但能以變構方式提升 RUNX1 對特定序列的 DNA 結合能力。此複合體可結合多種增強子與啟動子,包括 T-cell receptor 增強子,以及 LCK、IL3 和 GM-CSF 啟動子;對部分結合位點的描述屬於可能性。RUNX1 亦可與 ELF4 協同活化 IL-3 啟動子,並與 ELF2 協同活化 BLK 啟動子;另有資料指出它會抑制依賴 KAT6B 的轉錄活化,此項作用為相似性推論。
RUNX1 對正常造血發育不可或缺,也參與未成熟 T 細胞前驅細胞的譜系決定。在細胞毒性 CD8+ T 細胞發育期間,CBF 複合體會結合 ZBTB7B 基因座中的 RUNX 結合序列,抑制 ZBTB7B 轉錄。此沉默作用有助於細胞毒性 T 細胞分化;CBF 在該沉默區的結合,也對招募可促成表觀遺傳修飾的核內蛋白質複合體十分重要。
在調節性 T 細胞中,RUNX1 與 FOXP3 協同,參與控制細胞無反應狀態及抑制功能。在一般 T 細胞中,RUNX1 可促進 IL2 與 IFNG 表現,同時下調 TNFRSF18、IL2RA 和 CTLA4;在 T-helper 17 細胞中,則正向調節 RORC 表現。這些作用顯示 RUNX1 的轉錄調控因細胞類型而異,涉及免疫細胞分化與功能維持。
RUNX1 異構型亦會影響作用強度。AML-1G 對靶基因的結合活性較高,且對 TCR-beta-E2 與 RAG-1 靶位點的結合親和力,是其他異構型的三倍;但在嗜中性球終末分化情境中,其作用較弱。AML-1L 則會干擾 RUNX1 的轉錄活化能力。
Promoter 與基因調控
>RUNX1 ENST00000675419 GRCh38 chr21:35049202-35050302 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCTTTCTAAGGTAGAGGACGCGCTATATAATATTCATTAGTCAGCCCCAGGAGAAGTGTCTCCTCCTGGT TCCCCTTCTATTGTGGCATCCTCATGTGCTCAAAGTGTAGTTTTACCTACAGGTGTAAATTAGCCTATTG ATTTGAATTGAACTAGAGAAAGGCAATACAGGGAGCTTTCCCAAGTGACAATACAAATAAACATCTGCAG AGTAACCACTGCTTTGTCCCAAATACAGAAATTCTCTCTGCTTTGTTTTCCTTTAGCTTCCTAATTTGTG TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAAGACTGTACTATGATTTTATCTCTTTACTGA AAGAGATACATACTAAAGTTGTCCATTTAGGGGGAATAAAACCACATAATTTTGGTTTCATTAAAACAGT CCTTTTATTTCAAAAGTAAAATTCTTTCCCTTTCCCAGGCTTTAAAATACCTGTGAGTTGCCAGCCCGTT GTAGGGGTCAGACTCTCACCAAAACATTTCTTTTTATTTATTTTTCCCTTTTATAGTTTCACTTATGCCA TGATAGACGTTACCAAGGACTTAACTCTCCCGGAGCTGATGCCTAGCATTTTAAATGATGGGATCCACAT CCTGTCGGAGCAGCGGCTTGATGCCAGCGTTGAATTACTATTGAATAAGCAGCAATGAAATCTTTATCAA AATAATCAGTAGTTCCAAAAACCACAAATAACAACAGGAGCCGAGTTGTACTAAATCAGCAAAGACCATT GAGATATAATAAGTGACTGAGTCACTTTTTTCTACATCCCCCCCTCTTGCAAAGTCTACTCGGCTATTTT CTTGCACAGCCTGGGGGAGGGCAGGTGGAGGGAAGGAAGGGCATTGCTCAGAAAAGAAAAAAAAAAATTG ACATCACTTAAGTCACATGATTGGCAAGAACCAATTGAGATGGGCTGTGGAAAGGGGAACAGTTAAATTT GTAATTTGGGTTGTGTGAAAACTTCTTTGGGCCTCATAAACAACCACAGAACCACAAGTTGGGTAGCCTG GCAGTGTCAGAAGTCTGAACCCAGCATAGTGGTCAGCAGGCAGGACGAATC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RUNX1_3 ↗ | 21:34,888,006 | 負股 | 34,887,996–34,888,055 |
| RUNX1_1 ↗ | 21:34,888,693 | 負股 | 34,888,683–34,888,742 |
| RUNX1_2 ↗ | 21:35,049,277 | 負股 | 35,049,267–35,049,326 |
| RUNX1_4 ↗ | 21:35,984,710 | 負股 | 35,984,700–35,984,759 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR21_9HWKF · enhancer · 35045184–35045466 · regulatory
ENSR21_B8XRC · enhancer · 35045687–35046644 · regulatory
ENSR21_D3PXM · enhancer · 35046843–35049291 · regulatory
ENSR21_5B8KQJ · CTCF_binding_site · 35048914–35048935 · regulatory
ENSR21_B8XRS · promoter · 35049292–35049834 · regulatory
ENSR21_C5GWJ · enhancer · 35050126–35051924 · regulatory
ENSR21_5B8L74 · CTCF_binding_site · 35051406–35051427 · regulatory
ENSR21_832SBK · enhancer · 35053386–35053613 · regulatory
· motif · 35045087–35045099 · motif
· motif · 35045183–35045198 · motif
· motif · 35045188–35045200 · motif
· motif · 35045256–35045269 · motif
· motif · 35045459–35045472 · motif
· motif · 35045459–35045472 · motif
· motif · 35045629–35045641 · motif
· motif · 35045645–35045667 · motif
· motif · 35045645–35045667 · motif
· motif · 35046024–35046041 · motif
· motif · 35046495–35046512 · motif
· motif · 35047111–35047120 · motif
· motif · 35048916–35048932 · motif
· motif · 35049094–35049107 · motif
· motif · 35049182–35049190 · motif
· motif · 35049182–35049197 · motif
· motif · 35049331–35049344 · motif
· motif · 35049569–35049584 · motif
· motif · 35049576–35049584 · motif
· motif · 35050500–35050510 · motif
· motif · 35050670–35050682 · motif
· motif · 35051007–35051022 · motif
· motif · 35051165–35051176 · motif
· motif · 35051408–35051424 · motif
· motif · 35051475–35051492 · motif
· motif · 35051545–35051558 · motif
Phorbol myristate acetate(PMA)可上調 RUNX1。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:453 aa
RUNX1 蛋白質長 453 個胺基酸,含有位於第 50–178 個胺基酸的 Runt 結構域。序列註解標示多段無序區,分別位於 1–26、171–195、209–252 與 404–445。另有註解指出,第 80–84、135–143 與 168–177 位胺基酸區段參與 DNA 作用;第 291–371 位區段與 KAT6A 作用,第 307–400 位區段與 KAT6B 作用,而第 362–402 位區段與 FOXP3 作用。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 24 個夥伴
- CBFBQ13951 · UniProt INTERACTION · 7 experiments · 2 筆來源紀錄
- CDK6Q00534 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- ELF2Q15723 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- HIPK2Q9H2X6 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- HMGA2P52926 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TAL1P17542 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YAP1P46937 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TLE1Q04724 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
- 3bP59633 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- groP16371 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- BAG3O95817 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BAG4O95429 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCNKO75909-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM222BQ8WU58 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FBXO17Q96EF6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GCC1Q96CN9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HGSO14964 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NFKBIDQ8NI38 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OLIG3Q7RTU3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SNRPCP09234 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TEAD2Q15562-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TEAD4Q15561 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- TEKT5Q96M29 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VPS37CA5D8V6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
RUNX1 可單體方式經 Runt 結構域結合 DNA,並與 CBFB 形成異源二聚體;二聚化會增強 DNA 結合。AML-1L 既不能結合 DNA,也不能與 CBFB 二聚化。RUNX1 還與 TLE1、ALYREF/THOC4、ELF 家族成員、SPI1、KAT6A、KAT6B、SUV39H1、YAP1、HIPK2、CDK6、FOXP3、TBX21 與 DPF2 有互作紀錄。部分互作與功能效應相關:SUV39H1 會削弱 RUNX1 的轉錄活化與 DNA 結合能力;ELF2 的 NERF-1a 異構型可能抑制 RUNX1 介導的轉錄活化;CDK6 的互作則會抑制髓系分化並降低其轉錄活化能力。另有資料記載 PRMT5、RUNX1 與 CBFB 同處於一個複合體。
疾病與遺傳關聯
RUNX1 相關染色體異常與多種白血病或骨髓疾病有關。t(8;21)(q22;q22) 形成 RUNX1T1 相關異常,與 M2 型急性骨髓性白血病相關;t(3;21)(q26;q22) 與 EAP 或 MECOM 的異常則被列為治療相關骨髓增生不良症候群及慢性骨髓性白血病的原因。另有資料記載 t(12;21)(p13;q22) 與 TEL 相關的融合,在兒童急性淋巴性白血病中被發現。其他記錄包括急性白血病中的 MACROD1-RUNX1 融合、治療相關骨髓惡性腫瘤中的 RUNX1-CBFA2T3 融合、慢性骨髓單核球性白血病相關的 inv(21)(q21;q22) 與 USP16,以及急性骨髓性白血病中的 t(20;21)(q11;q22) 與 CBFA2T2。家族性血小板疾病合併骨髓惡性腫瘤則由影響 RUNX1 的變異所致,屬常染色體顯性疾病,具有血小板質與量異常,並有發展為急性骨髓性白血病的傾向。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 15 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RUNX1 經 Runt 結構域辨識調控區中的核心 DNA 序列,主要為 5'-TGTGGT-3',較少見 5'-TGCGGT-3',並與不結合 DNA 的 CBFB 組成 CBF;CBFB 可增強 RUNX1 的序列特異性結合。此複合體調控多種啟動子與增強子,並參與正常造血、T 細胞譜系決定及免疫功能;部分作用標示為可能或依相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Forms the heterodimeric complex core-binding factor (CBF) with CBFB. RUNX members modulate the transcription of their target genes through recognizing the core consensus binding sequence 5'-TGTGGT-3', or very rarely, 5'-TGCGGT-3', within their regulatory regions via their runt domain, while CBFB is a non-DNA-binding regulatory subunit that allosterically enhances the sequence-specific DNA-binding capacity of RUNX. The heterodimers bind to the core site of a number of enhancers and promoters, including murine leukemia virus, polyomavirus enhancer, T-cell receptor enhancers, LCK, IL3 and GM-CSF promoters (Probable). Essential for the development of normal hematopoiesis. Acts synergistically with ELF4 to transactivate the IL-3 promoter and with ELF2 to transactivate the BLK promoter. Inhibits KAT6B-dependent transcriptional activation (By similarity). Involved in lineage commitment of immature T cell precursors. CBF complexes repress ZBTB7B transcription factor during cytotoxic (CD8+) T cell development. They bind to RUNX-binding sequence within the ZBTB7B locus acting as transcriptional silencer and allowing for cytotoxic T cell differentiation. CBF complexes binding to the transcriptional silencer is essential for recruitment of nuclear protein complexes that catalyze epigenetic modifications to establish epigenetic ZBTB7B silencing (By similarity). Controls the anergy and suppressive function of regulatory T-cells (Treg) by associating with FOXP3. Activates the expression of IL2 and IFNG and down-regulates the expression of TNFRSF18, IL2RA and CTLA4, in conventional T-cells. Positively regulates the expression of RORC in T-helper 17 cells (By similarity) PMID 10207087 ↗ · PMID 11965546 ↗ · PMID 14970218 ↗ · PMID 17377532 ↗ · PMID 17431401 ↗ |
| 功能 | AML-1G 異構型對靶基因的結合活性較高,對 TCR-beta-E2 與 RAG-1 靶位點的結合親和力是其他異構型的三倍;但在嗜中性球終末分化的情境中,其作用較弱。 | 推論支持 | 證據與來源Isoform AML-1G shows higher binding activities for target genes and binds TCR-beta-E2 and RAG-1 target site with threefold higher affinity than other isoforms. It is less effective in the context of neutrophil terminal differentiation |
| 功能 | RUNX1 的 AML-1L 異構型會干擾 RUNX1 的轉錄活化作用。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | RUNX1 可單體方式透過 Runt 結構域結合 DNA,亦可與 CBFB 組成異源二聚體,且二聚化會提升 DNA 結合;AML-1L 無法結合 DNA 或二聚化。RUNX1 與多種蛋白質互作,其中部分關係伴隨轉錄、DNA 結合或分化效應;另有資料記載 PRMT5、RUNX1 與 CBFB 同處於複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Heterodimer with CBFB. RUNX1 binds DNA as a monomer and through the Runt domain. DNA-binding is increased by heterodimerization. Isoform AML-1L can neither bind DNA nor heterodimerize. Interacts with TLE1 and ALYREF/THOC4. Interacts with ELF1, ELF2 and SPI1. Interacts via its Runt domain with the ELF4 N-terminal region. Interaction with ELF2 isoform 2 (NERF-1a) may act to repress RUNX1-mediated transactivation. Interacts with KAT6A and KAT6B. Interacts with SUV39H1, leading to abrogation of transactivating and DNA-binding properties of RUNX1. Interacts with YAP1. Interacts with HIPK2 (By similarity). Interaction with CDK6 prevents myeloid differentiation, reducing its transcription transactivation activity. Found in a complex with PRMT5, RUNX1 and CBFB. Interacts with FOXP3. Interacts with TBX21 (By similarity). Interacts with DPF2 PMID 10207087 ↗ · PMID 10545320 ↗ · PMID 10856244 ↗ · PMID 11276260 ↗ · PMID 11742995 ↗ · PMID 11965546 ↗ · PMID 12377125 ↗ · PMID 12917624 ↗ · PMID 14970218 ↗ · PMID 16652147 ↗ · PMID 17377532 ↗ · PMID 17431401 ↗ · PMID 18280240 ↗ · PMID 28533407 ↗ · PMID 9119228 ↗ · PMID 9751710 ↗ |
| 細胞定位 | RUNX1 定位於細胞核。 | 資料庫紀錄 | |
| 調控 | Phorbol myristate acetate(PMA)會上調 RUNX1。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | 涉及 RUNX1/AML1 的染色體異常被列為 M2 型急性骨髓性白血病的原因;相關異常為 t(8;21)(q22;q22),並涉及 RUNX1T1。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源A chromosomal aberration involving RUNX1/AML1 is a cause of M2 type acute myeloid leukemia (AML-M2). Translocation t(8;21)(q22;q22) with RUNX1T1 |
| 疾病關聯 | 涉及 RUNX1/AML1 的染色體異常被列為治療相關骨髓增生不良症候群的原因;相關異常為 t(3;21)(q26;q22),並涉及 EAP 或 MECOM。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源A chromosomal aberration involving RUNX1/AML1 is a cause of therapy-related myelodysplastic syndrome (T-MDS). Translocation t(3;21)(q26;q22) with EAP or MECOM |
| 疾病關聯 | 涉及 RUNX1/AML1 的染色體異常被列為慢性骨髓性白血病的原因;相關異常為 t(3;21)(q26;q22),並涉及 EAP 或 MECOM。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源A chromosomal aberration involving RUNX1/AML1 is a cause of chronic myelogenous leukemia (CML). Translocation t(3;21)(q26;q22) with EAP or MECOM |
| 疾病關聯 | 涉及 RUNX1/AML1 的染色體異常曾在兒童急性淋巴性白血病中發現,為 t(12;21)(p13;q22) 並涉及 TEL;此染色體易位使 TEL 的 3' 端與 AML-1H 的替代 5' 外顯子融合。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源A chromosomal aberration involving RUNX1/AML1 is found in childhood acute lymphoblastic leukemia (ALL). Translocation t(12;21)(p13;q22) with TEL. The translocation fuses the 3'-end of TEL to the alternate 5'-exon of AML-1H |
| 疾病關聯 | 涉及 RUNX1 的染色體異常曾在急性白血病中發現;t(11,21)(q13;q22) 會形成 MACROD1-RUNX1 融合蛋白。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源A chromosomal aberration involving RUNX1 is found in acute leukemia. Translocation t(11,21)(q13;q22) that forms a MACROD1-RUNX1 fusion protein |
| 疾病關聯 | 家族性血小板疾病合併骨髓惡性腫瘤是常染色體顯性疾病,特徵包括血小板質與量異常,並有發展為急性骨髓性白血病的傾向;此疾病由影響 RUNX1 的基因變異所致。 | 含實驗來源 | 證據與來源Familial platelet disorder with associated myeloid malignancy FPDMM Autosomal dominant disease characterized by qualitative and quantitative platelet defects, and propensity to develop acute myelogenous leukemia. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 601399 PMID 10508512 ↗ |
| 疾病關聯 | 涉及 RUNX1/AML1 的染色體異常曾在治療相關骨髓惡性腫瘤中發現;t(16;21)(q24;q22) 會形成 RUNX1-CBFA2T3 融合蛋白。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源A chromosomal aberration involving RUNX1/AML1 is found in therapy-related myeloid malignancies. Translocation t(16;21)(q24;q22) that forms a RUNX1-CBFA2T3 fusion protein |
| 疾病關聯 | 涉及 RUNX1/AML1 的染色體異常被列為慢性骨髓單核球性白血病的原因;相關異常為與 USP16 有關的 inv(21)(q21;q22)。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源A chromosomal aberration involving RUNX1/AML1 is a cause of chronic myelomonocytic leukemia. Inversion inv(21)(q21;q22) with USP16 |
| 疾病關聯 | 涉及 RUNX1/AML1 的染色體異常曾在急性骨髓性白血病中發現;t(20;21)(q11;q22) 與 CBFA2T2 有關。 | 含實驗來源 | 證據與來源A chromosomal aberration involving RUNX1/AML1 is found in acute myeloid leukemia. Translocation t(20;21)(q11;q22) with CBFA2T2 PMID 20520637 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACTTCTTTGGGCCTCATAAACAACCACAGAACCACAAGTT40GGGTAGCCTGGCAGTGTCAGAAGTCTGAACCCAGCATAGT80GGTCAGCAGGCAGGACGAATCACACTGAATGCAAACCACA120GGGTTTCGCAGCGTGGTAAAAGAAATCATTGAGTCCCCCG160CCTTCAGAAGAGGGTGCATTTTCAGGAGGAAGCGATGGCT200TCAGACAGCATATTTGAGTCATTTCCTTCGTACCCACAGT240GCTTCATGAGAGAATGCATACTTGGAATGAATCCTTCTAG280AGACGTCCACGATGCCAGCACGAGCCGCCGCTTCACGCCG320CCTTCCACCGCGCTGAGCCCAGGCAAGATGAGCGAGGCGT360TGCCGCTGGGCGCCCCGGACGCCGGCGCTGCCCTGGCCGG400CAAGCTGAGGAGCGGCGACCGCAGCATGGTGGAGGTGCTG440GCCGACCACCCGGGCGAGCTGGTGCGCACCGACAGCCCCA480ACTTCCTCTGCTCCGTGCTGCCTACGCACTGGCGCTGCAA520CAAGACCCTGCCCATCGCTTTCAAGGTGGTGGCCCTAGGG560GATGTTCCAGATGGCACTCTGGTCACTGTGATGGCTGGCA600ATGATGAAAACTACTCGGCTGAGCTGAGAAATGCTACCGC640AGCCATGAAGAACCAGGTTGCAAGATTTAATGACCTCAGG680TTTGTCGGTCGAAGTGGAAGAGGGAAAAGCTTCACTCTGA720CCATCACTGTCTTCACAAACCCACCGCAAGTCGCCACCTA760CCACAGAGCCATCAAAATCACAGTGGATGGGCCCCGAGAA800CCTCGAAGACATCGGCAGAAACTAGATGATCAGACCAAGC840CCGGGAGCTTGTCCTTTTCCGAGCGGCTCAGTGAACTGGA880GCAGCTGCGGCGCACAGCCATGAGGGTCAGCCCACACCAC920CCAGCCCCCACGCCCAACCCTCGTGCCTCCCTGAACCACT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。