演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RTN4NSP-CL

reticulon 4

RTN4 編碼 reticulon 4,具有多種異構型,參與內質網膜形態調節,並在神經系統、血管與免疫相關過程中發揮不同作用。

Homo sapiens2p16.1UniProt Q9NQC3
OFFICIAL SYMBOL
RTN4
CHROMOSOME
2
UNIPROT
Q9NQC3
PDB / ALPHAFOLD
2G31
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

reticulon 4 是由 RTN4 編碼的蛋白質,屬於 reticulon 家族,具有多種異構型。其蛋白質含 Reticulon 結構域,並具有兩段跨膜螺旋;此拓樸特色與其位於內質網膜相符。不同異構型的功能可能有所不同,來源指出差異主要可能與各異構型在組織中的表現特性有關。除內質網相關角色外,來源也描述其在神經系統、血管與免疫相關細胞中的功能,顯示其作用範圍依異構型及生物學情境而異。

Official symbol
RTN4
Gene name
reticulon 4
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14085
UniProt
Q9NQC3
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
NSP-CLKIAA0886NOGOASYNOGOANOGOBNOGOC

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22p16.1
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegRTN4pq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr2:54,971,931–55,112,621
Gene span
140,691 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000337526 ★54,972,189–55,050,4519
ENST0000039460954,971,931–55,010,4497
ENST0000040524054,971,931–55,046,8869
ENST0000035737654,971,931–55,049,1989
ENST0000031761054,971,931–55,050,5727
ENST0000035773254,971,931–55,050,5728
ENST0000039461154,971,931–55,050,5989
ENST0000040490954,971,931–55,050,8289
ENST0000085250854,971,931–55,050,5729
ENST0000085250954,971,931–55,050,5727
ENST0000093858754,971,931–55,050,5729
ENST0000095190654,971,931–55,050,5729

顯示 12/25 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RTN4 參與內質網(ER)管狀結構的形成與穩定,並藉由促進管狀 ER 生成調節 ER 膜形態。來源也指出它會影響核膜擴張、核孔複合體形成,以及核內膜蛋白質的適當定位;這些作用可能因異構型而異,且差異主要與組織表現特性有關。

在神經系統發育期間,RTN4 是神經突起生長的調節因子,可抑制軸突彼此黏附與生長,同時促進神經突起分枝,並調節神經突起束化、分枝和延伸。在成年中樞神經系統(CNS),它與降低生長、穩定神經連結及限制可塑性有關。來源另指出,RTN4 可能透過含 RTN4R 與 LINGO1 的受體複合體調節皮質神經元的徑向遷移。於腦微血管內皮細胞,RTN4 抑制細胞擴展、遷移與萌芽,並以依賴 ROCK pathway 的方式促使 lamellipodia 和 filopodia 回縮;它也被描述為中樞神經系統血管新生的負向調節因子。

RTN4 在內皮細胞與血管平滑肌細胞中具有作用,並調節血管重塑:它促進內皮細胞遷移,卻抑制血管平滑肌細胞遷移。它可抑制 SPTLC1;SPTLC1 是從頭鞘脂生合成途徑的限速酵素,因此 RTN4 會調節內皮細胞 sphingosine-1-phosphate(S1P)的生成,並與血管功能及血壓相關。免疫方面,RTN4 有助於巨噬細胞歸巢及其細胞激素/趨化因子基因表現,涉及血管新生、動脈生成與組織修復;它也介導 ICAM1 誘發的白血球跨內皮遷移與急性發炎。對核酸感知型 TLR(例如 TLR9)引發的免疫反應,RTN4 是必要因子之一,並有助於 TLR9 正確定位至內溶酶體;它也參與對 LPS 的免疫反應。

其他來源所述功能包括:RTN4 可能透過調節肝細胞增殖參與肝臟再生;與 Bcl-xl 和 Bcl-2 結合並使其由粒線體轉至內質網後,降低兩者的抗凋亡活性。RTN4 也調節缺氧條件下心肌細胞凋亡。異構型 B 與異構型 C 分別被報告可抑制 BACE1 活性及 amyloid precursor protein 加工。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 55050451 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RTN4 ENST00000337526 GRCh38 chr2:55050351-55051451 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTTATTCCTGCATATCAAACCAATGACTATGGGGCTTCCTGACTCCCAGAAAGCCTGAATCATCCGAAAT
GTTGACTCATGAACCTAAGGTGACTGAAATGTAACGTGAACCAAATTAGCTTTCCAAGGCATCTTTGTAT
TTCCACTTTCCTGTCTCCCCGCTGCCTCTCTCTTTGGGTGACTCACTCTCTTACCATGTAAGAGTCCAGC
AGGCAAGGCCCCAAACTCTCTTTGGAAGAAGAGCAGACTTTCAAATGGTCGGCCCCAGATCCCTAGTTAA
TTCAGCACAGCTGTTTTCCTCCCAATTTCGGGGGCTGCGGTTTAGACTGAGTGAGCCTAACTGTCAAAAA
ACAATTTTTTTCTTATTTTAGGGTGGTAGTAGTAGTGATGTAGTTTGGAACTTTGAGTGAACAAATAATC
TTTTATTTCAAAAATCTTTAAAAATCCTTAGGGCCCACTTCCCAGTCCCGCTAATACCTTTCTCCAGTCG
GGTTTCTTCCTTTCCCGGGAGGAAAGTTTCCACTCTCAGTTCCCCCAGGATAACGCCCTTCCGGTGGCGC
GCCAGAAACCGCGCCGACCCCTCCCAGCCAGCAGCCCGCCCCCTTTCCCAGTGCTCTAACGACATACGGA
CGCCAGCTGCGGGCAAGGCCAAGACCCCACCCCAACTCACGGTTACCCAAAGTGGGGGTGGAGCTCCCAG
CTCTCAGCCCCGCCCATTGAACGCAATCCCAGCCGGTAAGAGAGAGGAAGTGCCGTAGTCCCCACCCACT
TTCATCTCCTTCCCTTTCTGTTGGCCCGGCTGGTCGCCTATCTTCTCGATCCTGTAGCCGATTGGCTCTC
TCCCTCCCGCGCCAGTCCCTGCCCTCCCCTGGGGAGGGTGAGTCACGCCAAACTGGGCGGAGAGTCCGCT
GGCCTCACTCCTAGCTCATCTGGGCGGCGGCGGCAAGTGGGGACAGGGCGGGTGGCGCATCACCGGCGCG
GAGGCAGGAGGAGCAGTCTCATTGTTCCGGGAGCCGTCACCACAGTAGGTCCCTCGGCTCAGTCGGCCCA
GCCCCTCTCAGTCCTCCCCAACCCCCACAACCGCCCGCGGCTCTGAGACGC
RTN4 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RTN4_3 ↗2:55,010,272負股55,010,262–55,010,321
RTN4_1 ↗2:55,050,451負股55,050,441–55,050,500

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_9RSWN · enhancer · 55045785–55046257 · regulatory

ENSR2_9RSWS · enhancer · 55046418–55046875 · regulatory

ENSR2_9RSWZ · promoter · 55046876–55047264 · regulatory

ENSR2_C7GH4 · enhancer · 55047416–55049187 · regulatory

ENSR2_5GXL3J · CTCF_binding_site · 55048573–55048594 · regulatory

ENSR2_9RSXM · promoter · 55049188–55049688 · regulatory

ENSR2_5GXL8T · CTCF_binding_site · 55049718–55049739 · regulatory

ENSR2_9RSXZ · promoter · 55050441–55050798 · regulatory

ENSR2_9RSZ5 · promoter · 55050818–55051318 · regulatory

ENSR2_BDWZP · enhancer · 55051887–55052590 · regulatory

ENSR2_BDX23 · enhancer · 55054168–55054808 · regulatory

· motif · 55045503–55045514 · motif

· motif · 55045620–55045632 · motif

· motif · 55045950–55045961 · motif

· motif · 55046184–55046196 · motif

· motif · 55046629–55046642 · motif

· motif · 55046629–55046642 · motif

· motif · 55047109–55047121 · motif

· motif · 55047111–55047118 · motif

· motif · 55047111–55047126 · motif

· motif · 55047282–55047291 · motif

· motif · 55047615–55047628 · motif

· motif · 55047674–55047686 · motif

· motif · 55047677–55047684 · motif

· motif · 55047860–55047873 · motif

· motif · 55047917–55047933 · motif

· motif · 55048575–55048591 · motif

· motif · 55048626–55048643 · motif

· motif · 55048635–55048650 · motif

· motif · 55048669–55048678 · motif

· motif · 55048669–55048678 · motif

· motif · 55048918–55048935 · motif

· motif · 55049138–55049146 · motif

· motif · 55049507–55049523 · motif

· motif · 55049507–55049523 · motif

· motif · 55049516–55049525 · motif

· motif · 55049516–55049525 · motif

· motif · 55049720–55049736 · motif

· motif · 55050137–55050146 · motif

· motif · 55050234–55050249 · motif

· motif · 55050376–55050386 · motif

· motif · 55050396–55050406 · motif

· motif · 55050575–55050588 · motif

· motif · 55050575–55050588 · motif

· motif · 55050576–55050589 · motif

· motif · 55050576–55050589 · motif

· motif · 55050683–55050693 · motif

· motif · 55050735–55050745 · motif

· motif · 55050758–55050768 · motif

· motif · 55050760–55050770 · motif

· motif · 55050788–55050798 · motif

· motif · 55050849–55050859 · motif

· motif · 55050897–55050906 · motif

· motif · 55051129–55051137 · motif

· motif · 55051129–55051144 · motif

· motif · 55051129–55051146 · motif

· motif · 55051369–55051383 · motif

· motif · 55052091–55052102 · motif

· motif · 55052288–55052305 · motif

· motif · 55052297–55052305 · motif

· motif · 55052297–55052312 · motif

· motif · 55052338–55052347 · motif

· motif · 55052338–55052349 · motif

· motif · 55054509–55054521 · motif

· motif · 55054759–55054772 · motif

· motif · 55054762–55054774 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1192 aa

1 aa1192 aa結構域功能區域跨膜區拓樸區域
依 Q9NQC3 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

來源所列蛋白質長度為 1,192 個胺基酸。第 1–1,018 位及第 1,155–1,192 位為細胞質區域;第 1,019–1,039 位與第 1,134–1,154 位各有一段跨膜螺旋,中間第 1,040–1,133 位為腔內區域。Reticulon 結構域位於第 1,005–1,192 位。另有三段被註記為無序區:第 1–204 位、第 427–458 位及第 722–762 位。

拓樸區域Cytoplasmic1–1018 aa
跨膜區Helical1019–1039 aa
拓樸區域Lumenal1040–1133 aa
跨膜區Helical1134–1154 aa
拓樸區域Cytoplasmic1155–1192 aa
結構域Reticulon1005–1192 aa
功能區域Disordered1–204 aa
功能區域Disordered427–458 aa
功能區域Disordered722–762 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2G31…

PDB · 2G31

NMR · - · A=1055-1114

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Endoplasmic reticulum membrane;Cell membrane;Synapse;Cell junction

異構型 A、B 與 C 均定位於內質網膜。 異構型 A 分布於 ER 管狀網絡,並與 TMEM33 共定位於 ER 薄片;異構型 B 主要位於 ER 管與薄片邊緣。 ICAM1 接合後,異構型 B 會重新分布至內皮細胞連接處,並在該處與 CDH5 互作。 異構型 C 的來源定位資訊僅指出其位於內質網膜。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Synapse;Cell junction。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 12 個夥伴 · 最多顯示 50 個
NSP-CLRTN4ARL6IP1CERT1DERL2NCK2RTN2RTN3SNX1SNX15SYT16ZFYVE21ATL1BACE1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 12 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RTN4 可形成同源二聚體,並與 RTN4R、ATL1、TMEM170A、RTN4IP1、CNTNAP1、REEP5、PANTS、GPR50、RTN3、NGBR、SPTLC1、GRAMD4、CDH5、BACE1、BACE2、RETREG3、TMEM33、BAD/Bcl-xl 及 BCL2 互作;其中部分互作僅有相似性證據。與 PANTS 的互作會增強 RTN4 對 AMPA receptor 聚集的抑制;與 Bcl-xl、BCL2 的結合則與其亞細胞定位改變相關。來源另明確指出 RTN4 與 RTN4R 結合,其餘列述為互作關係,未一概指定為直接結合。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

11 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 11 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RTN4 促進內質網管狀結構形成與穩定,並藉由促進管狀內質網生成調節內質網膜形態。它也影響核膜擴張、核孔複合體形成及核內膜蛋白質的適當定位。各異構型可能具有不同功能,差異主要可能取決於其組織表現特性。含實驗來源
證據與來源

Required to induce the formation and stabilization of endoplasmic reticulum (ER) tubules. They regulate membrane morphogenesis in the ER by promoting tubular ER production. They influence nuclear envelope expansion, nuclear pore complex formation and proper localization of inner nuclear membrane proteins. However each isoform have specific functions mainly depending on their tissue expression specificities (Probable)

PMID 24262037 ↗ · PMID 25612671 ↗ · PMID 26906412 ↗ · PMID 27619977 ↗ · PMID 27786289 ↗

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功能RTN4 調節發育中的神經突起生長,可抑制軸突間黏附與生長,同時促進神經突起分枝,並調節神經突起束化、分枝和延伸;在成年中樞神經系統中則與降低生長、穩定神經連結及限制可塑性有關。它可能經由含 RTN4R 與 LINGO1 的受體複合體調節皮質神經元徑向遷移。RTN4 也抑制腦微血管內皮細胞擴展、遷移與萌芽,並以依賴 ROCK pathway 的方式使 lamellipodia 和 filopodia 回縮。含實驗來源
證據與來源

Developmental neurite growth regulatory factor with a role as a negative regulator of axon-axon adhesion and growth, and as a facilitator of neurite branching. Regulates neurite fasciculation, branching and extension in the developing nervous system. Involved in down-regulation of growth, stabilization of wiring and restriction of plasticity in the adult CNS. Regulates the radial migration of cortical neurons via an RTN4R-LINGO1 containing receptor complex (By similarity). Acts as a negative regulator of central nervous system angiogenesis. Inhibits spreading, migration and sprouting of primary brain microvascular endothelial cells (MVECs). Also induces the retraction of MVECs lamellipodia and filopodia in a ROCK pathway-dependent manner (By similarity)

PMID 10667797 ↗ · PMID 11201742 ↗ · PMID 19699797 ↗

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功能RTN4 主要在內皮細胞與血管平滑肌細胞中發揮作用,也可能參與免疫調節。它促進內皮細胞遷移、抑制血管平滑肌細胞遷移,並透過抑制限速酵素 SPTLC1 調節內皮細胞鞘脂生合成及 S1P 生成,進而關聯血管功能與血壓。RTN4 有助於巨噬細胞歸巢、細胞激素/趨化因子基因表現、白血球跨內皮遷移及急性發炎,也參與 TLR9 等核酸感知型 TLR 與 LPS 引發的免疫反應。它可能透過調節肝細胞增殖參與肝臟再生;與 Bcl-xl、Bcl-2 結合並使其由粒線體轉至內質網後,會降低其抗凋亡活性。異構型 C 可抑制 BACE1 活性與 amyloid precursor protein 加工。含實驗來源
證據與來源

Mainly function in endothelial cells and vascular smooth muscle cells, is also involved in immune system regulation (Probable). Modulator of vascular remodeling, promotes the migration of endothelial cells but inhibits the migration of vascular smooth muscle cells. Regulates endothelial sphingolipid biosynthesis with direct effects on vascular function and blood pressure. Inhibits serine palmitoyltransferase, SPTLC1, the rate-limiting enzyme of the novo sphingolipid biosynthetic pathway, thereby controlling production of endothelial sphingosine-1-phosphate (S1P). Required to promote macrophage homing and functions such as cytokine/chemokine gene expression involved in angiogenesis, arteriogenesis and tissue repair. Mediates ICAM1 induced transendothelial migration of leukocytes such as monocytes and neutrophils and acute inflammation. Necessary for immune responses triggered by nucleic acid sensing TLRs, such as TLR9, is required for proper TLR9 location to endolysosomes. Also involved in immune response to LPS. Plays a role in liver regeneration through the modulation of hepatocytes proliferation (By similarity). Reduces the anti-apoptotic activity of Bcl-xl and Bcl-2. This is likely consecutive to their change in subcellular location, from the mitochondria to the endoplasmic reticulum, after binding and sequestration. With isoform C, inhibits BACE1 activity and amyloid precursor protein processing

PMID 11126360 ↗ · PMID 16965550 ↗

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功能RTN4 可能調節缺氧條件下的心肌細胞凋亡。異構型 B 可抑制 BACE1 活性及 amyloid precursor protein 加工。含實驗來源
證據與來源

Regulates cardiomyocyte apoptosis upon hypoxic conditions (By similarity). With isoform B, inhibits BACE1 activity and amyloid precursor protein processing

PMID 16965550 ↗

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交互作用RTN4 與 RTN4R 結合,也與 ATL1、TMEM170A 互作;此外,RTN4IP1 的互作關係具有相似性證據。含實驗來源
證據與來源

Binds to RTN4R. Interacts with ATL1. Interacts with TMEM170A. Interacts with RTN4IP1 (By similarity)

PMID 19052207 ↗ · PMID 19665976 ↗ · PMID 26906412 ↗

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交互作用RTN4 可能以反式方式與 CNTNAP1 互作,並與 REEP5、GPR50 互作。它也與突觸可塑性調節因子 PANTS 互作;此互作會增強 RTN4 介導的 AMPA receptor 聚集抑制。含實驗來源
證據與來源

Interacts in trans with CNTNAP1 (By similarity). Interacts with REEP5. Interacts with synaptic plasticity regulator PANTS; the interaction results in enhanced RTN4-mediated inhibition of AMPA receptor clustering (By similarity). Interacts with GPR50

PMID 19699797 ↗ · PMID 32075961 ↗

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交互作用RTN4 可形成同源二聚體,並與 BAD/Bcl-xl、BCL2、RTN3、NGBR、CDH5、BACE1、BACE2、REEP5 及 RETREG3 互作;與 SPTLC1、GRAMD4 的互作具有相似性證據。含實驗來源
證據與來源

Homodimer. Interacts with BAD/Bcl-xl and BCL2. Interact with RTN3. Interacts with NGBR. Interacts with SPTLC1 (By similarity). Interacts with GRAMD4 (By similarity). Interacts with CDH5. Interacts with BACE1 and BACE2. Interacts with REEP5. Interacts with RETREG3

PMID 12811824 ↗ · PMID 15286784 ↗ · PMID 16835300 ↗ · PMID 16965550 ↗ · PMID 16979658 ↗ · PMID 21183689 ↗ · PMID 27786289 ↗ · PMID 32075961 ↗ · PMID 33826365 ↗

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交互作用RTN4 與 BACE1、BACE2 及 TMEM33 互作。含實驗來源
證據與來源

Interacts with BACE1 and BACE2. Interacts with TMEM33

PMID 15286784 ↗ · PMID 16965550 ↗ · PMID 25612671 ↗

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細胞定位異構型 A 透過兩個推定的跨膜區域錨定於內質網膜,並分布於 ER 管狀網絡;它也與 TMEM33 共定位於 ER 薄片。來源另列出細胞膜與突觸定位。含實驗來源
證據與來源

Isoform A; Endoplasmic reticulum membrane / Multi-pass membrane protein; Cell membrane / Multi-pass membrane protein / Cytoplasmic side; Synapse; Anchored to the membrane of the endoplasmic reticulum (ER) through 2 putative transmembrane domains. Localizes throughout the ER tubular network. Co-localizes with TMEM33 at the ER sheets

PMID 25612671 ↗ · PMID 26906412 ↗ · PMID 27619977 ↗ · PMID 27786289 ↗

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細胞定位異構型 B 主要位於內質網管狀結構及薄片邊緣。ICAM1 接合後,它會重新分布至內皮細胞連接處,並在該處與 CDH5 互作。來源另列出細胞膜與細胞連接處定位。含實驗來源
證據與來源

Isoform B; Endoplasmic reticulum membrane / Multi-pass membrane protein; Cell membrane / Multi-pass membrane protein / Extracellular side; Cell junction; Mainly located on endoplasmic reticulum tubules and sheet edges. Upon ICAM1 engagement, redistributed toward endothelial junctions where interacts with CDH5

PMID 27786289 ↗ · PMID 15034570 ↗ · PMID 21183689 ↗

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細胞定位異構型 C 定位於內質網膜。含實驗來源
證據與來源

Isoform C; Endoplasmic reticulum membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 25612671 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 11 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000337526 · 4,697 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1ATTGTTCCGGGAGCCGTCACCACAGTAGGTCCCTCGGCTC40
41AGTCGGCCCAGCCCCTCTCAGTCCTCCCCAACCCCCACAA80
81CCGCCCGCGGCTCTGAGACGCGGCCCCGGCGGCGGCGGCA120
121GCAGCTGCAGCATCATCTCCACCCTCCAGCCATGGAAGAC160
161CTGGACCAGTCTCCTCTGGTCTCGTCCTCGGACAGCCCAC200
201CCCGGCCGCAGCCCGCGTTCAAGTACCAGTTCGTGAGGGA240
241GCCCGAGGACGAGGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAAGAGGAG280
281GACGAGGACGAAGACCTGGAGGAGCTGGAGGTGCTGGAGA320
321GGAAGCCCGCCGCCGGGCTGTCCGCGGCCCCAGTGCCCAC360
361CGCCCCTGCCGCCGGCGCGCCCCTGATGGACTTCGGAAAT400
401GACTTCGTGCCGCCGGCGCCCCGGGGACCCCTGCCGGCCG440
441CTCCCCCCGTCGCCCCGGAGCGGCAGCCGTCTTGGGACCC480
481GAGCCCGGTGTCGTCGACCGTGCCCGCGCCATCCCCGCTG520
521TCTGCTGCCGCAGTCTCGCCCTCCAAGCTCCCTGAGGACG560
561ACGAGCCTCCGGCCCGGCCTCCCCCTCCTCCCCCGGCCAG600
601CGTGAGCCCCCAGGCAGAGCCCGTGTGGACCCCGCCAGCC640
641CCGGCTCCCGCCGCGCCCCCCTCCACCCCGGCCGCGCCCA680
681AGCGCAGGGGCTCCTCGGGCTCAGTGGATGAGACCCTTTT720
721TGCTCTTCCTGCTGCATCTGAGCCTGTGATACGCTCCTCT760
761GCAGAAAATATGGACTTGAAGGAGCAGCCAGGTAACACTA800
801TTTCGGCTGGTCAAGAGGATTTCCCATCTGTCCTGCTTGA840
841AACTGCTGCTTCTCTTCCTTCTCTGTCTCCTCTCTCAGCC880
881GCTTCTTTCAAAGAACATGAATACCTTGGTAATTTGTCAA920
921CAGTATTACCCACTGAAGGAACACTTCAAGAAAATGTCAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。