演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RSPH6ARSP4

radial spoke head 6 homolog A

RSPH6A 是 radial spoke head 6 homolog A,屬於鞭毛 radial spoke RSP4/6 家族,參與精子鞭毛軸絲中的 radial spoke 複合體。

Homo sapiens19q13.3UniProt Q9H0K4
OFFICIAL SYMBOL
RSPH6A
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q9H0K4
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RSPH6A(radial spoke head 6 homolog A)是蛋白質編碼基因,其產物屬於鞭毛 radial spoke RSP4/6 家族。它是精子鞭毛軸絲 radial spoke 複合體的一員;來源指出,RSPH6A 是精子特異性的 spoke head 成分,與纖毛特異性的 RSPH4A 相區別。此蛋白質的基本特徵可由其家族歸屬及在 radial spoke 複合體中的位置來描述;現有資料未提供更詳細的結構域或分子結構說明。

Official symbol
RSPH6A
Gene name
radial spoke head 6 homolog A
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14241
UniProt
Q9H0K4
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
RSP4RSP6RSPH4BRSHL1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.3
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25RSPH6Apq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:45,795,713–45,815,308
Gene span
19,596 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000221538 ★45,795,713–45,815,3086
ENST0000060018845,795,713–45,810,9315
ENST0000059705545,795,765–45,815,3086

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RSPH6A 是精子鞭毛軸絲中 radial spoke 複合體的組成成分。這類複合體與精子鞭毛運動有關,來源將其描述為鞭毛拍動調節所需的結構之一。

精子鞭毛具有三組 radial spokes,分別為 RS1、RS2 和 RS3。這三組結構共同參與調節鞭毛的拍動;資料指出它們對此調節不可或缺,但未進一步說明 RSPH6A 單獨如何影響拍動,也未提供其作用步驟或調控方向的細節。

因此,現有資料支持的功能重點是:RSPH6A 作為 radial spoke 複合體的一員,參與與精子鞭毛運動相關的結構系統,而鞭毛拍動的調節依賴三組 radial spokes。資料未描述特定實驗條件、單獨改變 RSPH6A 的結果,或由此推導的其他生物學效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 45815308 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RSPH6A ENST00000221538 GRCh38 chr19:45815208-45816308 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTGCCCCTTCCTCCCCATGCTCTTGGTGAAGAACTCAAAGACCACCTCAGGGTGGTTCCTTCTCTTTCCG
GCCGTCCTCTGAGCCACCCACCTCTGAGCTTCTGTGTGGCCCTCCCTATCCCCAGGATGATCTGGAGCCC
CTGACCTTGGCCCCGGCCCCAGCACCCCGGCCCCCTCAGGACCTCATCGGCCTGCGACTGGCCCAGGAGA
AGGCCTTAAAGCGGCAGCTGGAGGAGGAACAGAAGCTGAAGCCGGGAGGAGTGGGAGCCCCCTCCTCTTC
CTCCCCCTCTCCCTCTCCGTCGGCCCGGCCAGGCCCGCCCCCGTCTGAGGAAGCCATGGATTTCCGGGAG
GAGGGGCCTGAGTGCGAGACCCCGGGCATCTTCATCAGCATGGATGACGACTCGGGGCTGACCGAGGCCG
CGCTGTTGGACTCTAGTCTCGAGGGCCCCCTACCCAAGGTAGGGAGAGCAGCCTCCGCTGCGAAGGAAGA
AGCCGGATCTGGGCCGGGGTGAAGGTGGGGGAGGAGGGGCCATCAGGGGGCAGGGCCTGAAGGGGAGCGT
GGAGGTGACCGCGCCCTCCACCCGGCTGCCCTTTCCTTCCCCGGTCACCAGGAGACGGCAGCGGGCGGGC
TGACCTTGAAGGAGGAGCGGAGCCCCCAGACCCTCGCACCTGTTGGAGAAGATGCTATGAAGACTCCCAG
CCCGGCTGCCGAGGACGCCAGGGAACCCGAGGCCAAGGGGAACAGCTGACGGGGCTCGAGGGGGAAAGGG
GGTGGGACAGGGACTCGGGGCTGGGGGACGGGGCGGGGCTTGACCTGCGGGTGCTTTGCCTTAAAAAGAA
ATAAAAGATGTGAACTTGGGCAAGTTACTGAAAAGAAAAAAAAAAAGGGATGGCGGGCCTGGGGCGCGGG
TGCCGTCTCGAGTCTGGCGCGACGTCCACCGTGGGGCTGCGCGGGATCGGGAGTGCGCGCCCAGAGCCTG
CGCGGAACCCACCCTGGCCCGCTCCCCGCGCCCTCCACGGGTAACGGCCCCCTCTCTCGGTGCTCAGAAA
CCGGCGGTGTCGACAGGTGGCTCTCGCTTGGCCTCCTTGTCTGCAAGCCTT
RSPH6A 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RSPH6A_1 ↗19:45,815,345負股45,815,335–45,815,394

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_5DQXSC · CTCF_binding_site · 45815176–45815197 · regulatory

ENSR19_BC4HD · promoter · 45815218–45815798 · regulatory

ENSR19_5DQXX3 · CTCF_binding_site · 45815763–45815784 · regulatory

ENSR19_5DQZ3T · CTCF_binding_site · 45816586–45816607 · regulatory

ENSR19_5DQZ73 · CTCF_binding_site · 45817275–45817296 · regulatory

ENSR19_5DQZ7H · CTCF_binding_site · 45817366–45817387 · regulatory

ENSR19_5DQZCR · CTCF_binding_site · 45818294–45818315 · regulatory

· motif · 45810429–45810440 · motif

· motif · 45810495–45810504 · motif

· motif · 45810495–45810504 · motif

· motif · 45810814–45810825 · motif

· motif · 45814154–45814165 · motif

· motif · 45815178–45815194 · motif

· motif · 45815765–45815781 · motif

· motif · 45816588–45816604 · motif

· motif · 45817277–45817293 · motif

· motif · 45817286–45817301 · motif

· motif · 45817368–45817384 · motif

· motif · 45817572–45817584 · motif

· motif · 45817574–45817589 · motif

· motif · 45817576–45817591 · motif

· motif · 45817576–45817591 · motif

· motif · 45817581–45817593 · motif

· motif · 45818296–45818312 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:717 aa

1 aa717 aa功能區域
依 Q9H0K4 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

RSPH6A 蛋白質長 717 個胺基酸,屬於鞭毛 radial spoke RSP4/6 家族。序列註解預測其有數段無序區域:第 1–65、503–523、563–588 及 672–717 個胺基酸。這些區域是序列特徵註解,來源未提供其具體結構或功能作用。

功能區域Disordered1–65 aa
功能區域Disordered503–523 aa
功能區域Disordered563–588 aa
功能區域Disordered672–717 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9H0K4…

AlphaFold · Q9H0K4

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytoskeleton, flagellum axoneme

RSPH6A 被標註於細胞質、細胞骨架及鞭毛軸絲。 資料未說明其在不同條件下的定位變化或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
RSP4RSPH6ALMO4SMYD1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RSPH6A 是軸絲 RS1 與 RS2 複合體的成分。所列複合體至少包含 spoke head 蛋白 RSPH1、RSPH3、RSPH9,以及精子特異性的 RSPH6A;spoke stalk 成分則包括 RSPH14、DNAJB13、DYDC1、ROPN1L 和 NME5,RS1 另有特異性的錨定蛋白 IQUB。資料另列出 RSPH6A 與 RSPH1、RSPH3B、RSPH4A、RSPH9 及 RSPH10B 的互作,但未進一步說明互作形式。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RSPH6A 是精子鞭毛軸絲 radial spoke 複合體的組成成分。三組 radial spokes(RS1、RS2、RS3)與精子鞭毛運動有關,且是調節鞭毛拍動所必需的結構;資料未說明 RSPH6A 單獨作用的細節。推論支持
證據與來源

Functions as part of radial spoke complexes in the axoneme of sperm flagella that play an important part in motility. The triple radial spokes (RS1, RS2 and RS3) are required to modulate beating of the sperm flagellum

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RSPH6A 是軸絲 RS1、RS2 複合體的成分,並為其中的精子特異性 spoke head 蛋白;複合體另含多種 spoke head、spoke stalk 蛋白,RS1 還有特異性錨定蛋白 IQUB。資料亦列出 RSPH6A 與 RSPH1、RSPH3B、RSPH4A、RSPH9 及 RSPH10B 互作。推論支持
證據與來源

Component of the axonemal radial spoke 1 (RS1) and 2 (RS2) complexes, at least composed of spoke head proteins RSPH1, RSPH3, RSPH9 and the cilia-specific component RSPH4A or sperm-specific component RSPH6A, spoke stalk proteins RSPH14, DNAJB13, DYDC1, ROPN1L and NME5, and the RS1 complex-specific anchor protein IQUB. Interacts with RSPH1. Interacts with RSPH3B. Interacts with RSPH4A. Interacts with RSPH9. Interacts with RSPH10B

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RSPH6A 的定位標註包括細胞質、細胞骨架及鞭毛軸絲;資料未提供定位變化條件或異構型差異。推論支持
證據與來源

Cytoplasm, cytoskeleton, flagellum axoneme

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000221538 · 2,442 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GCTCCCCGCGCCCTCCACGGGTAACGGCCCCCTCTCTCGG40
41TGCTCAGAAACCGGCGGTGTCGACAGGTGGCTCTCGCTTG80
81GCCTCCTTGTCTGCAAGCCTTTCTCCTAGAGATCTGTGCC120
121TCCTGGCGAACCATGGGAGACCTGCCGCCCTACCCTGAGC160
161GCCCTGCCCAGCAGCCTCCGGGCCGGAGGACTTCTCAGGC200
201CTCCCAGAGGCGGCACAGTCGGGACCAAGCTCAGGCCCTG240
241GCAGCGGACCCCGAGGAGAGGCAGCAGATACCTCCAGACG280
281CCCAGCGAAACGCCCCTGGTTGGTCACAGAGGGGCAGCCT320
321GTCCCAACAGGAGAACTTGCTGATGCCCCAGGTCTTCCAG360
361GCTGAGGAAGCCCGGCTGGGTGGCATGGAGTACCCATCTG400
401TGAACACGGGCTTTCCCTCAGAGTTCCAGCCTCAGCCTTA440
441CTCTGATGAAAGCAGGATGCAGGTCGCCGAGCTCACCACC480
481AGCCTAATGCTGCAGCGGCTCCAGCAGGGCCAAAGCAGCC520
521TGTTCCAGCAACTGGACCCCACCTTCCAGGAGCCCCCAGT560
561CAACCCCTTGGGCCAGTTCAACCTCTACCAGACAGACCAG600
601TTCTCTGAAGGTGCCCAGCACGGGCCTTACATAAGGGATG640
641ACCCTGCCCTTCAGTTCTTGCCCTCTGAGCTGGGCTTCCC680
681ACACTACAGTGCCCAGGTGCCTGAGCCCGAGCCTCTGGAG720
721CTGGCCGTGCAGAACGCCAAGGCCTACCTGCTGCAGACCA760
761GCATCAATTGCGACCTCAGCCTGTACGAGCACCTGGTGAA800
801TCTGCTGACCAAGATCCTGAACCAGCGGCCTGAGGACCCC840
841TTGTCTGTCCTGGAGTCTCTGAACCGCACCACGCAGTGGG880
881AGTGGTTCCACCCCAAGCTGGACACGCTGCGGGACGACCC920
921CGAGATGCAGCCCACCTACAAGATGGCGGAGAAACAGAAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。