演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RSPH14RTDR1

radial spoke head 14 homolog

RSPH14 編碼 radial spoke head 14 homolog,屬於鞭毛放射輻條 RSP14 家族,是軸絲放射輻條複合體的組成成員,與精子及纖毛的運動功能相關。

Homo sapiens22q11.22-q11.23UniProt Q9UHP6
OFFICIAL SYMBOL
RSPH14
CHROMOSOME
22
UNIPROT
Q9UHP6
PDB / ALPHAFOLD
8J07
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RSPH14 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 radial spoke head 14 homolog。其蛋白質屬於 flagellar radial spoke RSP14 family,定位於軸絲放射輻條相關組成中。序列註解顯示,蛋白質包含八個連續排列的 ARM 重複區,分布於序列的大部分範圍。現有資料支持其作為放射輻條複合體成員的基本定位,並指出該複合體與精子及纖毛運動有關;資料未提供更細緻的分子作用機制。

Official symbol
RSPH14
Gene name
radial spoke head 14 homolog
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13437
UniProt
Q9UHP6
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
RTDR1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2222q11.22-q11.23
chr22 · 50,818,468 bp · GRCh38chr22p13 · 1–4300000 · gvarchr22p12 · 4300001–9400000 · stalkchr22p11.2 · 9400001–13700000 · gvarchr22p11.1 · 13700001–15000000 · acenchr22q11.1 · 15000001–17400000 · acenchr22q11.21 · 17400001–21700000 · gnegchr22q11.22 · 21700001–23100000 · gpos25chr22q11.23 · 23100001–25500000 · gnegchr22q12.1 · 25500001–29200000 · gpos50chr22q12.2 · 29200001–31800000 · gnegchr22q12.3 · 31800001–37200000 · gpos50chr22q13.1 · 37200001–40600000 · gnegchr22q13.2 · 40600001–43800000 · gpos50chr22q13.31 · 43800001–48100000 · gnegchr22q13.32 · 48100001–49100000 · gpos50chr22q13.33 · 49100001–50818468 · gnegRSPH14pq1 bp50,818,468 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr22:23,059,415–23,145,021
Gene span
85,607 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000216036 ★23,059,415–23,141,9907
ENST0000113160523,059,415–23,142,0937
ENST0000042121323,124,227–23,134,0742
ENST0000043906423,131,177–23,138,9143
ENST0000112983223,133,576–23,142,0934
ENST0000109709623,135,967–23,142,0934
ENST0000045275723,135,993–23,140,3003
ENST0000040687623,136,198–23,145,0214

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RSPH14 是軸絲放射輻條複合體的組成成員。這類複合體與精子及纖毛的運動有重要關聯,因此 RSPH14 所屬的細胞結構位於這些運動系統的功能脈絡中。現有資料指出其參與放射輻條複合體,但未詳述 RSPH14 單獨如何影響纖毛或精子的運動,也未提供特定分子機制或實驗條件。

放射輻條複合體 1(RS1)包含多種組成蛋白。其輻條頭部至少有 RSPH1、RSPH3、RSPH9,以及纖毛特異性的 RSPH4A 或精子特異性的 RSPH6A;輻條柄部則包含 RSPH14、DNAJB13、DYDC1、ROPN1L 與 NME5,另有錨定蛋白 IQUB。這項組成描述顯示,RSPH14 位於 RS1 的柄部,而不同細胞結構中的輻條頭部成員有所區別。

由於資料將放射輻條複合體與精子及纖毛運動相連,RSPH14 的功能可定位於支持此類運動相關結構的複合體層級;但目前資訊不足以進一步界定它在組裝、訊號傳遞或運動調節中的具體作用,也不支持推論其缺失造成的結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 23141990 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RSPH14 ENST00000216036 GRCh38 chr22:23141890-23142990 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGGATAAAGAGGTAATAATTAGTGTTACAGAGCGCTCAGGCTTCATGAGCGAGGTGGCATTTGAGGGGTT
AAGAGAGAGTCTGGCATGGCTGGAGGAGGCCATCACCCAGGGACTGGAGCACTAGGCTAGGAGTTTGGAC
TCAGCCCTGAGACTAGTGGGGAGCCATGGAGGGTTTTATGCAGGTGGTGGCTGGGTCTGGCTTGCTTTTG
AGAACAGCTACGCTGGCCAGCAGTGTGTTGGGTCCACTGCAGAGGCTAACCTTTGTCATTACCAGGCGGT
CAGCCTGAAGAGCAAGGGGCATGGGCAGGGCTAGGCAGTCTTGAGATCAGGCCTATGTAATTTGGGGGAA
ACTGGCTGAGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCTAGCATTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCATCTG
AGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAG
CTGGGTGTGATGGCGGCCGCCTATAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTTAGGCAGGAGAATCACTTGCACCC
GGGTTGGGTGCGGTGGCGCGGAGTGGAGCGGAGGTTGCAGTGAGTCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGC
CTGCGTGAAAGAGCGAAACTCCGTCAAAAAAAAAAATTGGGAGAAACGACTGAACTTCTCTGAGGTTCTT
GTCTCTAAACTAGATGTTACCACCTTATGAATTTACTCTGAGGATCAGAGGCATGCAAAGTACCCAGTAC
AGAGAAGGGCGTAAATAAGTCACTTCCTTTCCCTTCTGTACTTTGAACAAAGCTGAGCTGCCTTTGGTCT
CCACAGCAACCCTGTAAATGATTGTTCCCGCTTTGCAGCCGGCCGCAGCCTTGGGCTGTTTGCGCCTGCG
CAGTGGGTGCTGATTATGTCGACCGCGGCGCCGCGGACGCTGCTGGAGTCGCCTGGCAACGATGTCGCCT
GGCAACTGAATAGGTTGGCCAGTGGCGCGGGCTACTGGAAGCAGAAAGGGCTGCGGAGGCAGGTGAGGCG
GCGGTGGTGGGCTAGGGGCCCGGGGACAGGGGGGCCCAGTGACCCACCCAG
RSPH14 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RSPH14_1 ↗22:23,142,072負股23,142,062–23,142,121

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR22_D35ZT · enhancer · 23137017–23139281 · regulatory

ENSR22_B6L23 · enhancer · 23141327–23141979 · regulatory

ENSR22_9C728 · promoter · 23141980–23142480 · regulatory

ENSR22_9C72F · enhancer · 23142620–23143018 · regulatory

ENSR22_9C732 · enhancer · 23144721–23145010 · regulatory

ENSR22_9C735 · promoter · 23145011–23145487 · regulatory

ENSR22_B6L2M · enhancer · 23145488–23146277 · regulatory

· motif · 23137238–23137246 · motif

· motif · 23137914–23137936 · motif

· motif · 23137914–23137936 · motif

· motif · 23137936–23137945 · motif

· motif · 23138042–23138053 · motif

· motif · 23138078–23138091 · motif

· motif · 23138080–23138091 · motif

· motif · 23138082–23138091 · motif

· motif · 23138127–23138139 · motif

· motif · 23138129–23138151 · motif

· motif · 23138129–23138151 · motif

· motif · 23138254–23138276 · motif

· motif · 23138254–23138276 · motif

· motif · 23138396–23138407 · motif

· motif · 23139209–23139222 · motif

· motif · 23139223–23139235 · motif

· motif · 23139226–23139233 · motif

· motif · 23139245–23139252 · motif

· motif · 23139405–23139420 · motif

· motif · 23139785–23139800 · motif

· motif · 23139785–23139800 · motif

· motif · 23140252–23140268 · motif

· motif · 23140257–23140272 · motif

· motif · 23141442–23141454 · motif

· motif · 23142079–23142090 · motif

· motif · 23142079–23142090 · motif

· motif · 23142171–23142186 · motif

· motif · 23142639–23142650 · motif

· motif · 23142640–23142651 · motif

· motif · 23143173–23143195 · motif

· motif · 23143173–23143195 · motif

· motif · 23145222–23145235 · motif

· motif · 23145251–23145264 · motif

· motif · 23146059–23146072 · motif

· motif · 23146059–23146072 · motif

· motif · 23146164–23146177 · motif

· motif · 23146272–23146288 · motif

· motif · 23146284–23146299 · motif

· motif · 23146286–23146299 · motif

· motif · 23146289–23146301 · motif

· motif · 23146292–23146299 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:348 aa

1 aa348 aa重複區
依 Q9UHP6 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

radial spoke head 14 homolog 長 348 個胺基酸,序列註解出八個 ARM 重複區:ARM 1 至 ARM 8,分別位於胺基酸 16–55、57–96、99–137、139–179、180–219、221–260、262–301 與 303–346。蛋白質歸屬於 flagellar radial spoke RSP14 family。

重複區ARM 116–55 aa
重複區ARM 257–96 aa
重複區ARM 399–137 aa
重複區ARM 4139–179 aa
重複區ARM 5180–219 aa
重複區ARM 6221–260 aa
重複區ARM 7262–301 aa
重複區ARM 8303–346 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8J07…

PDB · 8J07

EM · 4.10 A · T/t=1-348

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytoskeleton, flagellum axoneme

RSPH14 的定位註解包括細胞質、細胞骨架與鞭毛軸絲。 資料未提供定位隨條件改變的資訊,也未區分異構型的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 39 個夥伴 · 最多顯示 50 個
RTDR1RSPH14ABI2AGAP1ALS2CLAP1M1AP2M1AP3M1BPIFA1CCDC102BCDR2CNTROBCOG6FHL3GABPB1GOLGA2JUPKASH5KIFC3KRT15KRT31KRT40KRT75KRT76LZTS1MNS1PIBF1POLR1CRELRPH3ALRSPH3SEPTIN12TCF4TRAF2TRIM27TRIM50TRIM69TRIM7VPS9D1ZNF474ZNF629
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 39 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RSPH14 是軸絲放射輻條複合體 1(RS1)的組成成員,位於輻條柄部。RS1 至少還包含柄部蛋白 DNAJB13、DYDC1、ROPN1L、NME5,錨定蛋白 IQUB,以及輻條頭部蛋白 RSPH1、RSPH3、RSPH9;頭部另依細胞類型包含纖毛特異性的 RSPH4A 或精子特異性的 RSPH6A。資料描述的是複合體組成,未逐一指出各蛋白與 RSPH14 之間的直接結合。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RSPH14 是軸絲放射輻條複合體的組成部分;此類複合體對精子與纖毛的運動具有重要作用。推論支持
證據與來源

Functions as part of axonemal radial spoke complexes that play an important part in the motility of sperm and cilia

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RSPH14 是軸絲放射輻條複合體 1(RS1)的組成成員,位於輻條柄部。RS1 至少包含頭部蛋白 RSPH1、RSPH3、RSPH9,以及纖毛特異性的 RSPH4A 或精子特異性的 RSPH6A;柄部蛋白還有 DNAJB13、DYDC1、ROPN1L、NME5,並含錨定蛋白 IQUB。推論支持
證據與來源

Component of the axonemal radial spoke complex 1 (RS1), at least composed of spoke head proteins RSPH1, RSPH3, RSPH9 and the cilia-specific component RSPH4A or sperm-specific component RSPH6A, spoke stalk proteins RSPH14, DNAJB13, DYDC1, ROPN1L and NME5, and the anchor protein IQUB

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RSPH14 的定位註解包括細胞質、細胞骨架與鞭毛軸絲。推論支持
證據與來源

Cytoplasm, cytoskeleton, flagellum axoneme

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000216036 · 1,188 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTGGCGCGGGCTACTGGAAGCAGAAAGGGCTGCGGAGGC40
41AGTGAGTGGTTTCTGCAGAGCTTCATTTGGAAAGGCCTCT80
81GTAGTTGGGGAAAGATGGCCCATTCCCAGAACTCCTTGGA120
121GCTTCCCATTAACATCAATGCCACCCAGATTACCACTGCC160
161TATGGCCATCGGGCCCTGCCCAAGCTGAAGGAGGAGCTGC200
201AGTCAGAGGACCTCCAGACGAGGCAGAAAGCCCTCATGGC240
241CTTGTGTGACCTCATGCATGACCCCGAGTGTATCTACAAG280
281GCCATGAACATAGGCTGTATGGAGAACCTGAAAGCTTTGC320
321TGAAGGATAGCAACAGTATGGTGCGCATAAAGACCACCGA360
361GGTGCTCCACATCACGGCAAGCCATAGCGTGGGCAGATAC400
401GCCTTTCTAGAGCACGACATCGTCCTTGCCCTGTCCTTCC440
441TGCTGAATGACCCCAGCCCAGTCTGCCGGGGGAACCTGTA480
481CAAGGCATACATGCAGCTGGTCCAGGTGCCTAGAGGGGCC520
521CAAGAGATCATCAGCAAAGGTCTGATTTCCTCACTGGTAT560
561GGAAGCTGCAGGTGGAGGTGGAGGAGGAGGAGTTCCAGGA600
601GTTCATCCTGGACACACTGGTCCTCTGCCTGCAGGAGGAT640
641GCCACCGAGGCCCTGGGCAGCAATGTGGTGCTTGTCCTGA680
681AGCAGAAGCTCCTCAGCGCCAACCAGAACATCCGCAGCAA720
721GGCCGCCCGTGCGCTCCTTAATGTCAGCATATCTCGAGAG760
761GGCAAGAAACAGGTGTGTCATTTTGACGTCATCCCCATCC800
801TGGTCCATCTGCTGAAAGACCCAGTGGAGCATGTGAAGTC840
841TAACGCTGCCGGTGCCCTGATGTTCGCCACAGTGATCACT880
881GAAGGGAAGTATGCGGCCCTGGAGGCACAAGCCATCGGCC920
921TGCTCCTGGAGCTGCTGCACTCCCCCATGACCATAGCGCG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。