演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RSPH1FLJ32753

radial spoke head component 1

RSPH1 編碼 radial spoke head component 1,是軸絲徑向輻射複合體的組成部分,與精子及纖毛的運動相關。

Homo sapiens21q22.3UniProt Q8WYR4
OFFICIAL SYMBOL
RSPH1
CHROMOSOME
21
UNIPROT
Q8WYR4
PDB / ALPHAFOLD
8J07
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RSPH1(radial spoke head component 1)是位於人類第 21 號染色體、屬於蛋白質編碼基因的基因。其產物參與軸絲徑向輻射複合體;這類複合體與精子及纖毛的運動有關。蛋白質長 309 個胺基酸,序列中註記有六段 MORN 重複區,以及位於兩端的無序區域。現有資料未提供更完整的家族分類或結構解析,因此不據此推定其他結構或作用。

Official symbol
RSPH1
Gene name
radial spoke head component 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12371
UniProt
Q8WYR4
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FLJ32753RSP44RSPH10ACILD24TSGA2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2121q22.3
chr21 · 46,709,983 bp · GRCh38chr21p13 · 1–3100000 · gvarchr21p12 · 3100001–7000000 · stalkchr21p11.2 · 7000001–10900000 · gvarchr21p11.1 · 10900001–12000000 · acenchr21q11.1 · 12000001–13000000 · acenchr21q11.2 · 13000001–15000000 · gnegchr21q21.1 · 15000001–22600000 · gpos100chr21q21.2 · 22600001–25500000 · gnegchr21q21.3 · 25500001–30200000 · gpos75chr21q22.11 · 30200001–34400000 · gnegchr21q22.12 · 34400001–36400000 · gpos50chr21q22.13 · 36400001–38300000 · gnegchr21q22.2 · 38300001–41200000 · gpos50chr21q22.3 · 41200001–46709983 · gnegRSPH1pq1 bp46,709,983 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr21:42,472,486–42,496,366
Gene span
23,881 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000291536 ★42,472,486–42,496,2249
ENST0000085651742,472,486–42,496,3664
ENST0000085651842,472,486–42,496,3297
ENST0000085651942,472,486–42,496,3668
ENST0000085652042,472,486–42,496,3664
ENST0000085652142,472,486–42,496,3293
ENST0000093694942,472,486–42,496,3665
ENST0000113142342,472,486–42,496,3669
ENST0000039835242,472,697–42,496,1868
ENST0000112757642,495,855–42,496,3292

顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RSPH1 是軸絲徑向輻射複合體的組成部分。此類複合體參與精子與纖毛的運動,來源資料指出其對這些運動具有重要作用。現有功能註解未進一步說明 RSPH1 如何在複合體內作用,也未提供更細的分子機制或其他生物學過程,因此不宜延伸推論。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 42496224 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RSPH1 ENST00000291536 GRCh38 chr21:42496124-42497224 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACAACAAATAACACAGCTTTGCAGTCTGGGATGATGGCAGAGGAAATGGGAGATGTGAGGGGCCTTCGGC
AGGCGGAGTGCGTCAGGTAAAGCAGATTTCCAAGCCTGCACGTGTACATGCGTGTGCGTCTGTGATTGTG
TGGGTGTGTGACAGTGTAGGGGAGCCAGGAGCGAGAGGAGAGGACGGCGATCGTAGGGGACACCTGAGAG
TCAGAGGCCCGAGGGGGCTGGGACTCATGTCGAGGTCGGGGAAGGATGTAAAACCCGGACGGACATCACT
GTAGGCCGCACCTGCTGAGAGGCCAGAGCTGCCTCCTTGAGAGTGAAGTTGTTTACAGACAAGAGAAGAG
ATCTTGGCGGACACATCACAGCTAGCCGCGAATCCCGAAGGGTCAGCAGAGCCTAGAAAGGTAAGTGGGG
GTGGGCAGCATCCCCGGAGGGGCCTGCGAGGCCTGGGGGCGGAAGGGAGCGGGCAGTGCCCGCACTGGGC
AGGGGTGAAACCCTCTCGAGAGTTGGCCCGGACGCGTTTCCCGCGTCCTTCCTCTTGAGGGCCCAGTACC
CAGGTGGCTCCTCGTTGTGGCGTCACAGAACAGCCGACAAAAGTGATGGATTTCAGGGGCCAGCGACGGC
GAGGTCCAGGTCAGAGAGCCGGTGGGCAGCCAGGCACAGAACCCGCTCAGGCCCTGCCCAGTCCCCGCCC
CCTCGCTTCCCGAGCAGTGATTGGCCGAAGCGGCCCCTCGTTGCTATGACGGCACCAGAGTGCTGCCACT
GGCTCCACCTCGTCCCTTCCGCCCCGCCCCTCCGTATTCCCGGGCGGTGATTGGTCGAGGTGCCCTTCCC
GTTGCTATGACAGTACGCAAAGGCTGCCAGTGGCTCCTCCCGCTTCGTCCGCGTCGCCTGTCCCCGCTCC
CCATCTTCCGGGCTGGGAGGGAGGCGGGACCGGCCGCGTCTCCATGGCGACGCGGGACGCGGCGGTGGAG
GCGGTTGCTACCCACCTGCTAGAGGCGCTGCGGCTGTGATCCAGGCTGGGGCGAGACCATGTCGGACCTG
GGCTCGGAGGAGTTGGAGGAGGAGGGAGAGAATGATATTGGGGTGAGAGCT
RSPH1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RSPH1_1 ↗21:42,496,271負股42,496,261–42,496,320
RSPH1_2 ↗21:42,497,058負股42,497,048–42,497,107

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR21_BBFP5 · enhancer · 42495353–42496175 · regulatory

ENSR21_9LTFD · promoter · 42496176–42496549 · regulatory

ENSR21_66ZXDJ · CTCF_binding_site · 42496478–42496534 · regulatory

ENSR21_BBFP9 · enhancer · 42496550–42497297 · regulatory

ENSR21_838PWW · enhancer · 42499927–42500081 · regulatory

ENSR21_9LTGP · enhancer · 42500799–42501076 · regulatory

· motif · 42495918–42495934 · motif

· motif · 42495918–42495934 · motif

· motif · 42496238–42496255 · motif

· motif · 42496263–42496278 · motif

· motif · 42496263–42496278 · motif

· motif · 42496285–42496295 · motif

· motif · 42496370–42496385 · motif

· motif · 42496370–42496385 · motif

· motif · 42496424–42496434 · motif

· motif · 42496468–42496481 · motif

· motif · 42496468–42496481 · motif

· motif · 42496471–42496486 · motif

· motif · 42496471–42496486 · motif

· motif · 42496480–42496496 · motif

· motif · 42496515–42496531 · motif

· motif · 42496523–42496533 · motif

· motif · 42496637–42496650 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:309 aa

1 aa309 aa功能區域重複區
依 Q8WYR4 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

RSPH1 蛋白長 309 個胺基酸。序列註記有六段 MORN 重複區,分別位於第 20–43、44–66、67–89、90–112、113–135 與 159–181 位胺基酸。第 1–42 位及第 222–309 位被預測為無序區域。

重複區MORN 120–43 aa
重複區MORN 244–66 aa
重複區MORN 367–89 aa
重複區MORN 490–112 aa
重複區MORN 5113–135 aa
重複區MORN 6159–181 aa
功能區域Disordered1–42 aa
功能區域Disordered222–309 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8J07…

PDB · 8J07

EM · 4.10 A · A/B/C/D/a/b/c/d=1-309

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Chromosome;Cytoplasm, cytoskeleton, cilium axoneme;Cytoplasm, cytoskeleton, flagellum axoneme

資料列出 RSPH1 位於細胞質、纖毛軸絲及鞭毛軸絲;在晚期精母細胞、次級精母細胞與圓形精子細胞中亦見於細胞質。 減數分裂期間,RSPH1 會聚集於中期染色體周圍。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Chromosome。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FLJ32753RSPH1MORN3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

依相似性推定,RSPH1 是軸絲 RS1 與 RS2 複合體的成分;所列組成包含 RSPH1、RSPH3、RSPH9 等輻射頭蛋白,以及纖毛特異的 RSPH4A 或精子特異的 RSPH6A。資料亦依相似性記載 RSPH1 與 RSPH3B、RSPH4A、RSPH6A、DNAH12 及 CFAP65 有互作,但未說明這些互作的性質。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

RSPH1 變異與原發性纖毛運動障礙 24(CILD24)相關。患者的運動纖毛異常,可反覆發生呼吸道感染,進而伴隨慢性發炎與支氣管擴張;資料指出 CILD24 患者未觀察到內臟反位。RSPH1 突變所致表型包括輻射體及軸絲中央微管對的缺陷。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RSPH1 是軸絲徑向輻射複合體的組成部分;該複合體對精子與纖毛的運動具有重要作用。來源未進一步描述 RSPH1 的分子作用方式。含實驗來源
證據與來源

Functions as part of axonemal radial spoke complexes that play an important part in the motility of sperm and cilia

PMID 23993197 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用依相似性推定,RSPH1 是軸絲 RS1、RS2 複合體的成分,複合體包含多種輻射頭與輻射柄蛋白;RSPH4A 為纖毛特異成分,RSPH6A 為精子特異成分,IQUB 是 RS1 特異錨定蛋白。另依相似性記載其與 RSPH3B、RSPH4A、RSPH6A、DNAH12 及 CFAP65 互作。推論支持
證據與來源

Component of the axonemal radial spoke 1 (RS1) and 2 (RS2) complexes, at least composed of spoke head proteins RSPH1, RSPH3, RSPH9 and the cilia-specific component RSPH4A or sperm-specific component RSPH6A, spoke stalk proteins RSPH14, DNAJB13, DYDC1, ROPN1L and NME5, and the RS1 complex-specific anchor protein IQUB (By similarity). Interacts with RSPH3B (By similarity). Interacts with RSPH4A (By similarity). Interacts with RSPH6A (By similarity). Interacts with DNAH12 (By similarity). Interacts with CFAP65 (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RSPH1 被記載於細胞質、纖毛軸絲及鞭毛軸絲;在晚期精母細胞、次級精母細胞與圓形精子細胞中位於細胞質,並於減數分裂期間聚集在中期染色體周圍。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Chromosome; Cytoplasm, cytoskeleton, cilium axoneme; Cytoplasm, cytoskeleton, flagellum axoneme; Cytoplasmic in late spermatocytes, secondary spermatocytes and round spermatids. Gathered around metaphase chromosomes during meiotic divisions

PMID 23993197 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯RSPH1 變異可導致原發性纖毛運動障礙 24(CILD24),其特徵包括運動纖毛異常,以及因呼吸纖毛缺陷而反覆感染、慢性發炎和支氣管擴張;患者未觀察到內臟反位。RSPH1 突變表型包括輻射體與軸絲中央微管對缺陷。含實驗來源
證據與來源

Ciliary dyskinesia, primary, 24 CILD24 A disorder characterized by abnormalities of motile cilia. Respiratory infections leading to chronic inflammation and bronchiectasis are recurrent, due to defects in the respiratory cilia. Situs inversus is not observed in CILD24 patients. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry. RSPH1 mutations result in a primary ciliary diskinesia phenotype with defects of the radial spokes and the axonemal central pair of microtubules MIM: 615481

PMID 23993197 ↗ · PMID 25186273 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000291536 · 1,300 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAGGCGCTGCGGCTGTGATCCAGGCTGGGGCGAGACCAT40
41GTCGGACCTGGGCTCGGAGGAGTTGGAGGAGGAGGGAGAG80
81AATGATATTGGGGAATATGAGGGGGGTCGGAATGAGGCAG120
121GCGAAAGGCACGGACGTGGGAGGGCACGGCTACCCAACGG160
161GGACACCTACGAAGGGAGCTACGAATTCGGTAAAAGACAT200
201GGCCAGGGGATCTACAAATTTAAAAATGGTGCTCGATATA240
241TCGGAGAATATGTTAGAAATAAAAAGCACGGTCAAGGCAC280
281TTTTATATATCCAGATGGATCCAGATATGAAGGAGAGTGG320
321GCAAATGACCTGCGGCACGGCCATGGCGTATACTACTACA360
361TCAATAATGACACCTACACTGGAGAGTGGTTTGCTCATCA400
401AAGGCATGGGCAAGGCACCTATTTATACGCGGAGACGGGC440
441AGTAAGTATGTTGGCACCTGGGTGAACGGACAGCAGGAGG480
481GCACGGCCGAGCTCATTCACCTGAACCACAGGTACCAGGG520
521CAAGTTCTTGAACAAAAATCCTGTTGGCCCTGGAAAGTAT560
561GTATTTGATGTTGGGTGTGAACAACATGGTGAATATCGTT600
601TAACAGATATGGAAAGAGGAGAAGAGGAAGAGGAGGAAGA640
641ATTAGTAACTGTTGTTCCAAAATGGAAAGCTACCCAAATC680
681ACTGAATTGGCCCTGTGGACACCAACTCTCCCCAAAAAGC720
721CGACCTCTACGGATGGACCTGGCCAAGACGCTCCAGGAGC760
761TGAGAGTGCAGGAGAACCCGGGGAGGAGGCCCAGGCTCTG800
801CTGGAGGGCTTCGAGGGTGAGATGGACATGAGGCCTGGAG840
841ATGAAGATGCAGACGTCCTCCGGGAAGAGAGCCGGGAGTA880
881TGACCAGGAGGAGTTCCGCTATGACATGGATGAGGGAAAC920
921ATTAATTCTGAAGAAGAAGAAACTAGACAGTCAGACCTCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。