基因總覽
RS1 是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因，正式名稱為 retinoschisin 1。其產物為 224 個胺基酸的分泌型蛋白質 Retinoschisin，具有 N 端訊號序列及 F5/8 type C 結構域。這些特徵界定了其蛋白質基本性質；其與視網膜結構及功能的關係見下方功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000379984 ★ | 18,639,688–18,672,108 | 6 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Retinoschisin 與視網膜的正常結構及功能有關。來源指出，RS1 是維持視網膜正常結構和功能所必需的；但所提供資料並未進一步界定這項需求涉及哪些細胞類型或具體生理步驟，因此不宜將其延伸解讀為某一特定細胞機制已獲證實。
在分子作用方面，Retinoschisin 可結合帶負電荷的膜脂質，包括 phosphatidylserine 與 phosphoinositides。這項膜脂結合資訊標示為依相似性推定（By similarity），應保留其推論性質，不能視為此處直接證實的結合機制。來源也未說明兩類脂質各自的作用差異或其結合對視網膜功能的具體影響。
Retinoschisin 可能參與視網膜中的細胞間黏附。提出的方式是：位於相鄰兩個細胞表面的八聚體彼此進行同源交互作用，從而可能促進細胞間黏附。此功能描述使用「可能」表述，應理解為潛在作用，而非已確立的唯一機制。結合現有資料，RS1 產物與視網膜維持正常結構及功能相關，並可能透過膜脂結合與相鄰細胞表面八聚體間的交互作用參與其中；來源不足以據此補充更廣泛的訊號路徑或其他生物學角色。
Promoter 與基因調控
>RS1 ENST00000379984 GRCh38 chrX:18672008-18673108 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TATCATCATCTTACAGATGAGAAAGTTTAGGCGCAGAGATATTAATAACTTGCCCTGAGGTCACAATGTA ACAAGTGCTAGTGCTGCGATTTGGCACCCAGTCTGGGTTGGCAGTCTGTGCTCTTAAACCTACCAGGCTG CACTCATCTCTTGATTTACTTAACCAGCCCCCTAACCTTGGCCATTTAGATTGTTTCCAATTTGTTGTTG TTAAAAGTAACACAGCAATGCACAGCTTTGTGTTAACTGTCCTCCCACCACCACCAAATTTAGCATTTTC CTGAGTGAATAGGTGTGCACATGATGCCTAGTTGCTTTCAAAGAGGGGAATCCATGACATTTTCATACAA TTCGAGAATGTTAGTGCTTATGTGGCAGGAAATTGTTCAAGGTCACCCCCTAAAAAATGATGGCGAAGAA AGGACGAAAACCTGAGACTTCTGGTTGTAGTTCTCTCCCTCCATTGCTTCCCTTACATTAAGATAGAATG AACAGTATGGGCCGGGCGCAGTGGCTGACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGAT CACCTGAGGTCAGGAGTCCGAGACCAGCCTGACTGACATGACGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAA AATTAGCTGGGCGTGGTGGCGTGAGCCTATAATCCCAGCTACTCGGAAGGCTGAGGCAGGAGACTAGATT GAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATGGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCG AAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACGAAAAGTATCTTCCTCGCGAACTGAATC TCAGTTGATGCTAGTATCTTCCATGAGACTTCCTTGTTGAGGCAGGTAACTCTGTGGGTTAACTTGATGG GGCTCAGCCAAAGACCTAAGAACTAAATGGATTAAGATGCTTAATGAGGCCAGGGCTCAACTTAATCCCC TGCTCCTGGGCCAGCTCTCCAGTTCAGTAAGGTAGAGCTTTGGCCGAGGACGAGGGGAAGATGTCACGCA AGATAGAAGGCTTTTTGTTATTACTTCTCTTTGGCTATGAAGGTATGTGCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RS1_1 ↗ | X:18,672,108 | 負股 | 18,672,098–18,672,157 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSRX_99F5F · enhancer · 18674146–18674418 · regulatory
ENSRX_99F5S · promoter · 18675419–18675919 · regulatory
ENSRX_99F65 · enhancer · 18676446–18676799 · regulatory
· motif · 18667570–18667583 · motif
· motif · 18668617–18668629 · motif
· motif · 18668886–18668897 · motif
· motif · 18674695–18674705 · motif
· motif · 18674984–18674995 · motif
· motif · 18675027–18675036 · motif
· motif · 18675054–18675070 · motif
· motif · 18675065–18675072 · motif
· motif · 18675263–18675274 · motif
· motif · 18675263–18675274 · motif
· motif · 18675265–18675274 · motif
· motif · 18675402–18675417 · motif
· motif · 18675668–18675677 · motif
· motif · 18675668–18675677 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：224 aa
Retinoschisin 全長為 224 個胺基酸。其第 1–23 位標註為訊號序列，第 63–219 位包含 F5/8 type C 結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Retinoschisin 為分泌型蛋白質，也可位於細胞膜外側，作為周邊膜蛋白與膜相關聯。 它能結合含 phosphatidylserine 的脂質膜並部分嵌入脂雙層；此脂質結合需要 Ca(2+)。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
Retinoschisin 可形成由四個同源二聚體組成、以二硫鍵連結的同源八聚體。八聚體呈扁平齒輪狀，直徑約 14 nm；兩個八聚體還可堆疊組成十六聚體。這些描述涉及蛋白質自身組裝，不等同於與其他蛋白質的結合證據。
疾病與遺傳關聯
影響 RS1 的變異會造成 X-linked juvenile retinoschisis。此玻璃體視網膜營養不良以黃斑病變及視網膜表層分裂為特徵；幾乎所有病例都有黃斑變化，眼底可見放射狀排列、呈輻條輪狀的視網膜內中心凹黃斑囊腫，多數病例缺乏中心凹反光。約半數病例另有雙側周邊視網膜分裂，常位於下顳側。可能伴隨斜視、眼球震顫、軸性遠視、色覺缺損或中心凹異位；重要併發症包括玻璃體出血、視網膜剝離及新生血管性青光眼。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Retinoschisin 可結合帶負電荷的膜脂質，例如 phosphatidylserine 與 phosphoinositides；此結合依相似性推定。它也可能透過相鄰細胞表面八聚體之間的同源交互作用，參與視網膜細胞間黏附。RS1 對維持視網膜正常結構與功能是必需的。 | 含實驗來源 | 證據與來源Binds negatively charged membrane lipids, such as phosphatidylserine and phosphoinositides (By similarity). May play a role in cell-cell adhesion processes in the retina, via homomeric interaction between octamers present on the surface of two neighboring cells. Required for normal structure and function of the retina PMID 19093009 ↗ · PMID 27114531 ↗ |
| 交互作用 | Retinoschisin 可組成由四個同源二聚體構成的同源八聚體，亞基之間以二硫鍵連結。此八聚體呈扁平齒輪狀，直徑約 14 nm；兩個八聚體可堆疊形成十六聚體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homooctamer of 4 homodimers; disulfide-linked. The homooctamer has a flat, cogwheel structure with a diameter of about 14 nm. Two stacked octamers can assemble to form a hexadecamer PMID 15644328 ↗ · PMID 19849666 ↗ · PMID 26812435 ↗ · PMID 27114531 ↗ · PMID 27798099 ↗ |
| 細胞定位 | Retinoschisin 是分泌型蛋白質，也位於細胞膜外側，作為周邊膜蛋白存在。它會結合含 phosphatidylserine 的脂質膜，並部分嵌入脂雙層；此脂質結合需要 Ca(2+)。 | 含實驗來源 | 證據與來源Secreted; Cell membrane / Peripheral membrane protein / Extracellular side; Binds to phosphatidylserine-containing lipid membranes and embeds itself partially into the lipid bilayer. Lipid-binding requires the presence of Ca(2+) ions PMID 10915776 ↗ · PMID 19849666 ↗ · PMID 26812435 ↗ |
| 疾病關聯 | 影響 RS1 的變異會造成 X-linked juvenile retinoschisis，這是一種以黃斑病變及視網膜表層分裂為特徵的玻璃體視網膜營養不良。幾乎所有病例都有黃斑變化，常見放射狀中心凹黃斑囊腫與中心凹反光缺失；約半數有雙側下顳側周邊視網膜分裂。其他表現包括斜視、眼球震顫、軸性遠視、色覺缺損及中心凹異位；重要併發症為玻璃體出血、視網膜剝離和新生血管性青光眼。 | 含實驗來源 | 證據與來源Retinoschisis juvenile X-linked 1 XLRS1 A vitreo-retinal dystrophy characterized by macular pathology and by splitting of the superficial layer of the retina. Macular changes are present in almost all cases. In the fundi, radially oriented intraretinal foveomacular cysts are seen in a spoke-wheel configuration, with the absence of foveal reflex in most cases. In addition, approximately half of cases have bilateral peripheral retinoschisis in the inferotemporal part of the retina. Aside from the typical fundus appearance, strabismus, nystagmus, axial hyperopia, defective color vision and foveal ectopy can be present. The most important complications are vitreous hemorrhage, retinal detachment, and neovascular glaucoma. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 312700 PMID 10079181 ↗ · PMID 10220153 ↗ · PMID 10234514 ↗ · PMID 10450864 ↗ · PMID 10533068 ↗ · PMID 17304551 ↗ · PMID 17615541 ↗ · PMID 17631851 ↗ · PMID 19093009 ↗ · PMID 19849666 ↗ · PMID 27798099 ↗ · PMID 9326935 ↗ · PMID 9618178 ↗ · PMID 9760195 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTTCAGTAAGGTAGAGCTTTGGCCGAGGACGAGGGGAAG40ATGTCACGCAAGATAGAAGGCTTTTTGTTATTACTTCTCT80TTGGCTATGAAGCCACATTGGGATTATCGTCTACCGAGGA120TGAAGGCGAGGACCCCTGGTACCAAAAAGCATGCAAGTGC160GATTGCCAAGGAGGACCCAATGCTCTGTGGTCTGCAGGTG200CCACCTCCTTGGACTGTATACCAGAATGCCCATATCACAA240GCCTCTGGGTTTCGAGTCAGGGGAGGTCACACCGGACCAG280ATCACCTGCTCTAACCCGGAGCAGTATGTGGGCTGGTATT320CTTCGTGGACTGCAAACAAGGCCCGGCTCAACAGTCAAGG360CTTTGGGTGTGCCTGGCTCTCCAAGTTCCAGGACAGTAGC400CAGTGGTTACAGATAGATCTGAAGGAGATCAAAGTGATTT440CAGGGATCCTCACCCAGGGGCGCTGTGACATCGATGAGTG480GATGACCAAGTACAGCGTGCAGTACAGGACCGATGAGCGC520CTGAACTGGATTTACTACAAGGACCAGACTGGAAACAACC560GGGTCTTCTATGGCAACTCGGACCGCACCTCCACGGTTCA600GAACCTGCTGCGGCCCCCCATCATCTCCCGCTTCATCCGC640CTCATCCCGCTGGGCTGGCACGTCCGCATTGCCATCCGGA680TGGAGCTGCTGGAGTGCGTCAGCAAGTGTGCCTGATGCCT720GCCTCAGCTCGGCGCCTGCCAGGGGGTGACTGGCACAGAG760CGGGCCGTAGGGGACCCCCTCACACACCACCGAGATGGAC800AGGGCTATATTTCGCAAAGCAATTGTAACTGCAGTGCTGG840GTAGATAATTTTTTTTTTTTTAAGATATAGCTTTCTGATT880TCAATGAAATAAAAATGAACTTATTCCCCACTCAGGGCCA920GAGAAAGTCAGAACAAAGAAAATGTCCCCGAAACGAATTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。