演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RRM2FLJ25102

ribonucleotide reductase regulatory subunit M2

RRM2(ribonucleotide reductase regulatory subunit M2)是核糖核苷二磷酸還原酶小鏈家族的蛋白質,參與提供 DNA 合成所需的前驅物。

Homo sapiens2p25.1UniProt P31350
OFFICIAL SYMBOL
RRM2
CHROMOSOME
2
UNIPROT
P31350
PDB / ALPHAFOLD
2UW2
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RRM2 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 ribonucleotide reductase regulatory subunit M2。其產物屬於 ribonucleoside diphosphate reductase small chain family,並與大型次單元共同構成由一個大型次單元和一個小型次單元組成的異源二聚體。來源所述的基本角色是提供 DNA 合成所需的前驅物;它也被記載具有抑制 Wnt signaling 的作用。蛋白質長度為 389 個胺基酸,並含有 Cy 基序。這些資訊概述其家族歸屬、分子組成與主要角色;核糖核苷酸轉換的反應方式則見功能說明。

Official symbol
RRM2
Gene name
ribonucleotide reductase regulatory subunit M2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10452
UniProt
P31350
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FLJ25102C2orf48

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22p25.1
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegRRM2pq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr2:10,120,698–10,213,114
Gene span
92,417 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000304567 ★10,122,739–10,131,41410
ENST0000064119810,120,698–10,131,41811
ENST0000036056610,122,316–10,131,41810
ENST0000086914410,122,316–10,129,9677
ENST0000093174810,122,316–10,131,41910
ENST0000093174910,122,316–10,131,4149
ENST0000093175010,122,316–10,131,08210
ENST0000093175110,122,316–10,129,80010
ENST0000107275410,122,316–10,148,17711
ENST0000093174710,122,334–10,131,41411
ENST0000061515210,123,171–10,131,4148

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RRM2 參與生成 DNA 合成所需的前驅物。它催化相應核糖核苷酸轉換為去氧核糖核苷酸,提供合成 DNA 所需的材料;來源也記載 RRM2 可抑制 Wnt signaling,但未進一步說明此作用的分子機制或條件。

反應描述指出,去氧核糖核苷 5′-二磷酸與水參與反應,產物包括核糖核苷 5′-二磷酸;硫氧還蛋白則由二硫鍵形式轉為二硫醇形式。這項反應資訊補充了核糖核苷酸還原過程中的氧化還原伴隨變化。來源未提供更多反應步驟或其調控方式,因此不宜據此推演其他機制。

RRM2 每個次單元可結合 2 個鐵離子。這是來源明確記載的結合數量,並未說明鐵離子在反應中的具體作用。上述核糖核苷酸轉換、硫氧還蛋白狀態變化及鐵離子結合,共同界定了來源支持的功能資訊範圍。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 10122739 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RRM2 ENST00000304567 GRCh38 chr2:10121739-10122839 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCACAGTTTGCAATTCTTAAGG
CAAGGGTGACAATAGGGGTCAGGGGTCTGACAGGAGACAGGATTTCTGTGGAAAACTGCACCAAGGGCCT
TCTCGCCATGTCCCGTAGTTTGAAGGTTTACAAAGGACTGCACATTTTACATGAGTCATCTCAACGAACG
CTCTCCTCACCGCATTAACAGTCCACGCGGTTACGAGTCCCATTTTACTCACGGGGACACCGAATCTGTA
AGAAGCCTGGTCGCTTGTCCCAGCAAAACGAGCCACGGGGCTCAGCGGCCCTAACTTTTAGGCTGTAGGG
TCCTCGCCGACCACCCCGCCAAAATGTCAGGCCTCGGGGCCCTTGCACCCCCACCGCAGGGACACGGATC
GAAAGGGTCGCAGCAACGCCTCCCCCGCACCCAGGAGCGTTTTCCAGGCCTTTGCACCAACCTCGTTGGC
TAAGCCCCCTGCCCGGCGGCGGCCCGGCTGGGAGGAGGTGCTTTCGGGAGGCGGGGCCGCGGCCCGGGGA
TCCTCTCGCGCCCGCGGGCTCCAATCGCTGCTCCTCACGCAATCCTAAACGGTTCCCGGGCGAACCGGGG
CCCGCGCGCGCCAAGGCCGCCGAGACCCTCAGGGGCTGCGGCCCTGGTCCCGCGGGACCTGTGGGGGCCT
GGGCGGCGGCGCCCCCGACCCAGCCAGCGGACGGGCCGGGGGGGGAACCGGGAGGTCCCGGGGGGCGTCC
ACGGGGGTGTCCCCGGGGGTCTCCGGAAGGCGCCGGCGGAGGCTCCCGCGCTGCGCTTGAAAATCGCGCG
CGGCCCCGCGGCCAGCCTGGGTAGGGGCAAGGCGCAGCCAATGGGAAGGGTCGGAGGCATGGCACAGCCA
ATGGGAAGGGCCGGGGCACCAAAGCCAATGGGAAGGGCCGGGAGCGCGCGGCGCGGGAGATTTAAAGGCT
GCTGGAGTGAGGGGTCGCCCGTGCACCCTGTCCCAGCCGTCCTGTCCTGGCTGCTCGCTCTGCTTCGCTG
CGCCTCCACTATGCTCTCCCTCCGTGTCCCGCTCGCGCCCATCACGGACCC
RRM2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RRM2_1 ↗2:10,122,739正股10,122,690–10,122,749
RRM2_2 ↗2:10,122,970正股10,122,921–10,122,980
RRM2_3 ↗2:10,123,240正股10,123,191–10,123,250

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_962FQ · enhancer · 10118151–10118515 · regulatory

ENSR2_54D8Z4 · CTCF_binding_site · 10118313–10118334 · regulatory

ENSR2_962GD · promoter · 10120208–10120708 · regulatory

ENSR2_8B2WX · enhancer · 10120709–10120837 · regulatory

ENSR2_C3258 · promoter · 10121838–10123181 · regulatory

ENSR2_54DB3N · CTCF_binding_site · 10124706–10124727 · regulatory

· motif · 10118315–10118331 · motif

· motif · 10118423–10118431 · motif

· motif · 10119104–10119117 · motif

· motif · 10119104–10119118 · motif

· motif · 10119752–10119774 · motif

· motif · 10119752–10119774 · motif

· motif · 10120212–10120222 · motif

· motif · 10120277–10120287 · motif

· motif · 10120311–10120321 · motif

· motif · 10120354–10120364 · motif

· motif · 10120359–10120369 · motif

· motif · 10120592–10120605 · motif

· motif · 10120817–10120830 · motif

· motif · 10120905–10120914 · motif

· motif · 10120905–10120914 · motif

· motif · 10120905–10120914 · motif

· motif · 10120905–10120914 · motif

· motif · 10120977–10120992 · motif

· motif · 10120977–10120992 · motif

· motif · 10121094–10121104 · motif

· motif · 10121543–10121554 · motif

· motif · 10121602–10121615 · motif

· motif · 10121821–10121833 · motif

· motif · 10121823–10121830 · motif

· motif · 10121823–10121836 · motif

· motif · 10121929–10121937 · motif

· motif · 10121955–10121972 · motif

· motif · 10122261–10122270 · motif

· motif · 10122774–10122790 · motif

· motif · 10122934–10122954 · motif

· motif · 10123106–10123123 · motif

· motif · 10123160–10123171 · motif

· motif · 10123372–10123383 · motif

· motif · 10124708–10124724 · motif

· motif · 10126802–10126808 · motif

在 doxorubicin、camptothecin、UV-C、methyl methanesulfonate、nocodazole 或 gamma-irradiation 誘發 DNA 損傷後,RRM2 的表現上調。來源未進一步說明各種處理所引發的調控途徑。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:389 aa

1 aa389 aa基序
依 P31350 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

RRM2 蛋白質長 389 個胺基酸,屬於 ribonucleoside diphosphate reductase small chain family。其第 49 至 51 位胺基酸區段標註為 Cy 基序;來源未提供此基序的其他結構或功能細節。

基序Cy49–51 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2UW2…

PDB · 2UW2

X-ray · 2.80 A · A=60-389

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus

RRM2 在 S 期細胞中位於細胞質;在 G2 期細胞中則可能位於細胞核。 此定位資訊呈現隨細胞週期階段而異的情形,核內定位以可能性表述。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FLJ25102RRM2CCNFFZR1RRM1SDCBP
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RRM2 與大型次單元組成異源二聚體。另在 G2 期及有絲分裂早期,RRM2 會透過 Cy 基序,並在 Thr-33 磷酸化的條件下與 CCNF 互作;來源將此互作限定於這兩個細胞週期階段。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RRM2 提供 DNA 合成所需的前驅物,並催化相應核糖核苷酸生成去氧核糖核苷酸。來源另記載它可抑制 Wnt signaling,但未說明此抑制作用的機制或條件。資料庫紀錄
證據與來源

Provides the precursors necessary for DNA synthesis. Catalyzes the biosynthesis of deoxyribonucleotides from the corresponding ribonucleotides. Inhibits Wnt signaling

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分子活性a 2'-deoxyribonucleoside 5'-diphosphate + [thioredoxin]-disulfide + H2O = a ribonucleoside 5'-diphosphate + [thioredoxin]-dithiol推論支持
證據與來源

a 2'-deoxyribonucleoside 5'-diphosphate + [thioredoxin]-disulfide + H2O = a ribonucleoside 5'-diphosphate + [thioredoxin]-dithiol

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性RRM2 每個次單元可結合 2 個鐵離子。此敘述限定了每個次單元的結合數量,來源未進一步說明鐵離子的作用或結合條件。資料庫紀錄
證據與來源

Binds 2 iron ions per subunit.

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RRM2 與大型次單元組成異源二聚體。它也會在 G2 期及有絲分裂早期與 CCNF 互作;此互作涉及 Cy 基序,且以 Thr-33 已磷酸化為條件。含實驗來源
證據與來源

Heterodimer of a large and a small subunit. Interacts (via Cy motif and when phosphorylated at Thr-33) with CCNF; the interaction occurs exclusively in G2 and early M

PMID 22632967 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RRM2 在 S 期細胞中定位於細胞質;到了 G2 期細胞,則可能定位於細胞核。來源以可能性描述 G2 期的核內定位,並未將其表述為確定現象。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus; Localized to the cytoplasm in S phase cells. May localize to the nucleus in G2 phase cells

PMID 22632967 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控DNA 損傷誘發後,RRM2 的表現上調。列出的處理包括 doxorubicin、camptothecin、UV-C、methyl methanesulfonate、nocodazole 及 gamma-irradiation;來源未提供各處理的調控機制。含實驗來源
證據與來源

Up-regulated in response to DNA damage induced by doxorubicin, camptothecin, UV-C, methyl methanesulfonate, nocodazole, or gamma-irradiation

PMID 22632967 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000304567 · 3,258 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTGCACCCTGTCCCAGCCGTCCTGTCCTGGCTGCTCGCTC40
41TGCTTCGCTGCGCCTCCACTATGCTCTCCCTCCGTGTCCC80
81GCTCGCGCCCATCACGGACCCGCAGCAGCTGCAGCTCTCG120
121CCGCTGAAGGGGCTCAGCTTGGTCGACAAGGAGAACACGC160
161CGCCGGCCCTGAGCGGGACCCGCGTCCTGGCCAGCAAGAC200
201CGCGAGGAGGATCTTCCAGGAGCCCACGGAGCCGAAAACT240
241AAAGCAGCTGCCCCCGGCGTGGAGGATGAGCCGCTGCTGA280
281GAGAAAACCCCCGCCGCTTTGTCATCTTCCCCATCGAGTA320
321CCATGATATCTGGCAGATGTATAAGAAGGCAGAGGCTTCC360
361TTTTGGACCGCCGAGGAGGTGGACCTCTCCAAGGACATTC400
401AGCACTGGGAATCCCTGAAACCCGAGGAGAGATATTTTAT440
441ATCCCATGTTCTGGCTTTCTTTGCAGCAAGCGATGGCATA480
481GTAAATGAAAACTTGGTGGAGCGATTTAGCCAAGAAGTTC520
521AGATTACAGAAGCCCGCTGTTTCTATGGCTTCCAAATTGC560
561CATGGAAAACATACATTCTGAAATGTATAGTCTTCTTATT600
601GACACTTACATAAAAGATCCCAAAGAAAGGGAATTTCTCT640
641TCAATGCCATTGAAACGATGCCTTGTGTCAAGAAGAAGGC680
681AGACTGGGCCTTGCGCTGGATTGGGGACAAAGAGGCTACC720
721TATGGTGAACGTGTTGTAGCCTTTGCTGCAGTGGAAGGCA760
761TTTTCTTTTCCGGTTCTTTTGCGTCGATATTCTGGCTCAA800
801GAAACGAGGACTGATGCCTGGCCTCACATTTTCTAATGAA840
841CTTATTAGCAGAGATGAGGGTTTACACTGTGATTTTGCTT880
881GCCTGATGTTCAAACACCTGGTACACAAACCATCGGAGGA920
921GAGAGTAAGAGAAATAATTATCAATGCTGTTCGGATAGAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。