基因總覽
RPS8 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 ribosomal protein S8。其產物屬於真核生物核糖體蛋白 eS8 家族，並是小型核糖體次單元的組成成員。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體，負責細胞內蛋白質的合成；RPS8 因此屬於核糖體蛋白質群的一員。現有資料亦將其列為小型核糖體次單元前體組裝複合體的組成成員。蛋白質序列長 208 個胺基酸，N 端第 1 至 27 位被註記為無序區域。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000396651 ★ | 44,775,540–44,778,779 | 6 |
| ENST00000932905 | 44,775,304–44,778,779 | 7 |
| ENST00000372209 | 44,775,362–44,778,779 | 6 |
| ENST00000932906 | 44,775,362–44,778,779 | 6 |
| ENST00000932907 | 44,775,362–44,778,779 | 4 |
| ENST00000932908 | 44,775,362–44,778,779 | 6 |
| ENST00000932909 | 44,775,362–44,778,779 | 4 |
| ENST00001099318 | 44,775,362–44,778,779 | 3 |
| ENST00001099321 | 44,775,362–44,778,779 | 4 |
| ENST00001099322 | 44,775,362–44,778,740 | 6 |
| ENST00001099324 | 44,775,362–44,778,779 | 5 |
| ENST00001099325 | 44,775,362–44,778,779 | 6 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPS8 的產物是小型核糖體次單元的組成成員。核糖體是大型核糖核蛋白複合體，負責在細胞中合成蛋白質；來源資料支持 RPS8 參與這個複合體，但未提供其在成熟核糖體中的特定分子作用方式。
RPS8 也屬於小型次單元加工體（SSU processome），這是最先形成的小型真核核糖體次單元前體。該複合體在核仁組裝時，多種核糖體生合成因子、RNA 分子伴護蛋白及核糖體蛋白會與新生的前體核糖體 RNA（pre-rRNA）結合並協同作用。
這些組裝因子共同促進 RNA 摺疊、修飾、構形重排與切割，也參與由 RNA 外切體進行的前體核糖體 RNA 定向降解。現有資料將 RPS8 定位為此組裝複合體的成員，並未單獨指出它負責上述哪一項加工步驟，也未提供其對特定加工結果的直接影響。因此，來源所支持的功能重點是 RPS8 同時屬於成熟小型核糖體次單元與其前體組裝相關複合體。
Promoter 與基因調控
>RPS8 ENST00000396651 GRCh38 chr1:44774540-44775640 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTTTGTTTTGTTTTGAGACGGAGTTTCGCTCTGTCGCCAGACTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCA CTGCAACCTCCAGCTCCCTGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTGAGTAGCTGGGATTACAGG TGTGCGTCACCATGCTCAACTAAATTTTGTATTTTTTTAGTAGACACGCGGTTTCACCATGTTGGCCAGG CTGGTCTCGAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCCGCCTCCCAAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTG AGCCACCGCGCCAGGCCTAAAAATTTTTTTTAATTAAAAAATAGATATCCTTCTAGCTCAGAAAAGTTAG CTGATCCCTCCTTTATACTCTCTTCCTAAGTTCCGTTCATTCTGGTGGCTTTAATTACCATTTATAAGCC AACGATTCCCAAAATAACATCTTCGGTGCAGATCCCTTATAAGGATGACCAGTCATTAATATTCAGCTTC CTATCTGTTAGTCCCACTCAACATGACTTAGCAAGATCTCAAAATGAACGTGTCCAGAACAGCTCCTACC TTAGCCTACCCCATCTCAGTAAATGGCCCCAATATTTATCCGATTGATCAAGTGACAATCTTAGGAATCC TTGACACCGCCCTCTCCCTCAATCCCCATGTCCAATCTACCACCAAACCCTTCAAAACAAAACCCAAGTC CACACTCGTTTCCAATTCCATTGCCTTCCACTCTTTTTCAACGCAGCCGCACCCACATCTCATCCTAAAC GACCGCAGCAGCCTCTGAAACTAGTCTAAACACGCCCAGATCTGCCGACGCCGCAGACCCCCTTCCCCCA GCCCAGGGTCGGAGGCGAGTCGCCGGGGGTCGGCAGAGGTCAGCAGCCTGCGAGACCCTCCTAGGCTCGT GGCCCTAGGCGCGGCAGCTGACACGTAAGTCTCGTCGCCCGACGTTGTTTCGGCGCTCAGAAACAACGTA AAGTAAAGGGGCGGGGCAGCGTTTTACAAACCGAACCGTGAATCTTTGCGGTTTCTCTTTCCAGCCAGCG CCGAGCGATGGGTGAGTGTCGCTCTGCATTGAGGCGGGTGAAGGGAGGTTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPS8_1 ↗ | 1:44,775,574 | 正股 | 44,775,525–44,775,584 |
| RPS8_3 ↗ | 1:44,777,824 | 正股 | 44,777,775–44,777,834 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_BBTWW · promoter · 44775050–44775583 · regulatory
ENSR1_83BJNT · enhancer · 44775584–44775799 · regulatory
ENSR1_BBTX2 · promoter · 44775800–44776572 · regulatory
ENSR1_9MQW6 · enhancer · 44779810–44780252 · regulatory
ENSR1_C6FZC · enhancer · 44780454–44781651 · regulatory
· motif · 44773428–44773440 · motif
· motif · 44773430–44773437 · motif
· motif · 44773430–44773445 · motif
· motif · 44775245–44775265 · motif
· motif · 44775309–44775326 · motif
· motif · 44775338–44775348 · motif
· motif · 44775357–44775372 · motif
· motif · 44775413–44775425 · motif
· motif · 44775415–44775422 · motif
· motif · 44775460–44775473 · motif
· motif · 44775460–44775473 · motif
· motif · 44775526–44775536 · motif
· motif · 44775562–44775582 · motif
· motif · 44775565–44775573 · motif
· motif · 44775568–44775588 · motif
· motif · 44775690–44775700 · motif
· motif · 44775754–44775767 · motif
· motif · 44775754–44775767 · motif
· motif · 44775796–44775811 · motif
· motif · 44775824–44775840 · motif
· motif · 44775824–44775840 · motif
· motif · 44775860–44775869 · motif
· motif · 44775860–44775869 · motif
· motif · 44776098–44776109 · motif
· motif · 44776098–44776109 · motif
· motif · 44776100–44776109 · motif
· motif · 44776904–44776916 · motif
· motif · 44776906–44776913 · motif
· motif · 44776906–44776921 · motif
· motif · 44777321–44777328 · motif
· motif · 44778831–44778844 · motif
· motif · 44779034–44779042 · motif
· motif · 44779135–44779147 · motif
· motif · 44779580–44779595 · motif
· motif · 44779585–44779597 · motif
· motif · 44779588–44779595 · motif
· motif · 44780161–44780176 · motif
· motif · 44780161–44780176 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：208 aa
ribosomal protein S8 長 208 個胺基酸，屬於真核生物核糖體蛋白 eS8 家族。序列註解指出，第 1 至 27 位胺基酸屬於無序區域；資料未列出其他結構域或功能區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 RPS8 產物定位於細胞質、核仁及膜／脂質錨定相關位置，並指出它可見於含有未翻譯 mRNA 的細胞質 mRNP 顆粒。 來源未說明不同位置之間的轉換條件或動態，也未提供異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- DLG2Q15700 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RPS11P62280 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
RPS8 是小型核糖體次單元的組成成員，也屬於由 70 多種蛋白質及 RNA 分子伴護蛋白 snoRNA U3 構成的小型次單元加工體。另有資料指出，RPS8 出現在 IGF2BP1 依賴、含未翻譯 mRNA 的 mRNP 顆粒複合體中；此描述支持其複合體關聯，但未指出 RPS8 與 IGF2BP1 直接實體結合。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPS8 是小型核糖體次單元的成員；核糖體是負責細胞內蛋白質合成的大型核糖核蛋白複合體。RPS8 也屬於小型次單元加工體，這是小型真核核糖體次單元最先形成的前體。該加工體在核仁組裝時，多種生合成因子、RNA 分子伴護蛋白與核糖體蛋白協同處理新生 pre-rRNA，包括摺疊、修飾、重排、切割及定向降解。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the small ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell. Part of the small subunit (SSU) processome, first precursor of the small eukaryotic ribosomal subunit. During the assembly of the SSU processome in the nucleolus, many ribosome biogenesis factors, an RNA chaperone and ribosomal proteins associate with the nascent pre-rRNA and work in concert to generate RNA folding, modifications, rearrangements and cleavage as well as targeted degradation of pre-ribosomal RNA by the RNA exosome PMID 23636399 ↗ · PMID 34516797 ↗ |
| 交互作用 | RPS8 是小型核糖體次單元的組成成員，也參與小型次單元加工體；該加工體由 70 多種蛋白質及 RNA 分子伴護蛋白 snoRNA U3 構成。此外，RPS8 曾被鑑定於 IGF2BP1 依賴、含有未翻譯 mRNA 的 mRNP 顆粒複合體中；資料描述其複合體關聯，未明確指出直接結合。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the small ribosomal subunit. Identified in a IGF2BP1-dependent mRNP granule complex containing untranslated mRNAs. Part of the small subunit (SSU) processome, composed of more than 70 proteins and the RNA chaperone small nucleolar RNA (snoRNA) U3 PMID 17289661 ↗ · PMID 23636399 ↗ · PMID 34516797 ↗ |
| 細胞定位 | RPS8 產物的定位資料包括細胞質、膜／脂質錨定相關位置與核仁；此外，它也被定位於含未翻譯 mRNA 的細胞質 mRNP 顆粒。此項資料未說明各位置間轉換的條件或動態。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Membrane / Lipid-anchor; Nucleus, nucleolus; Localized in cytoplasmic mRNP granules containing untranslated mRNAs PMID 17289661 ↗ · PMID 23636399 ↗ · PMID 34516797 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GTTTTACAAACCGAACCGTGAATCTTTGCGGTTTCTCTTT40CCAGCCAGCGCCGAGCGATGGGCATCTCTCGGGACAACTG80GCACAAGCGCCGCAAAACCGGGGGCAAGAGAAAGCCCTAC120CACAAGAAGCGGAAGTATGAGTTGGGGCGCCCAGCTGCCA160ACACCAAGATTGGCCCCCGCCGCATCCACACAGTCCGTGT200GCGGGGAGGTAACAAGAAATACCGTGCCCTGAGGTTGGAC240GTGGGGAATTTCTCCTGGGGCTCAGAGTGTTGTACTCGTA280AAACAAGGATCATCGATGTTGTCTACAATGCATCTAATAA320CGAGCTGGTTCGTACCAAGACCCTGGTGAAGAATTGCATC360GTGCTCATCGACAGCACACCGTACCGACAGTGGTACGAGT400CCCACTATGCGCTGCCCCTGGGCCGCAAGAAGGGAGCCAA440GCTGACTCCTGAGGAAGAAGAGATTTTAAACAAAAAACGA480TCTAAAAAAATTCAGAAGAAATATGATGAAAGGAAAAAGA520ATGCCAAAATCAGCAGTCTCCTGGAGGAGCAGTTCCAGCA560GGGCAAGCTTCTTGCGTGCATCGCTTCAAGGCCGGGACAG600TGTGGCCGAGCAGATGGCTATGTGCTAGAGGGCAAAGAGT640TGGAGTTCTATCTTAGGAAAATCAAGGCCCGCAAAGGCAA680ATAAATCCTTGTTTTGTCTTCACCCATGTAATAAAGGTGT720TTATTGTTTTGTTCCCACATTTATGTTGCCTGAATATATG760ACTGTTTTCTCTGCTTTA778cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。