基因總覽
RPS6KB2 是蛋白質編碼基因,產物 ribosomal protein S6 kinase B2 長 482 個胺基酸,屬於 protein kinase 超家族中的 AGC Ser/Thr protein kinase 家族及 S6 kinase 亞家族。其蛋白質包含 protein kinase 結構域與 AGC-kinase C-terminal 區域,並有兩段被註記為無序的區域。這些特徵勾勒出其作為蛋白質激酶的基本性質;具體磷酸化標的與細胞功能見下文。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000312629 ★ | 67,428,494–67,435,401 | 15 |
| ENST00000875116 | 67,428,459–67,435,408 | 15 |
| ENST00000875117 | 67,428,459–67,435,408 | 15 |
| ENST00000875118 | 67,428,459–67,435,408 | 15 |
| ENST00000925337 | 67,428,459–67,435,408 | 15 |
| ENST00000925338 | 67,428,459–67,435,408 | 15 |
| ENST00000942409 | 67,428,459–67,435,408 | 15 |
| ENST00001005286 | 67,428,459–67,435,401 | 15 |
| ENST00001030260 | 67,428,459–67,435,408 | 15 |
| ENST00001144000 | 67,428,459–67,435,408 | 15 |
| ENST00000524934 | 67,428,494–67,431,403 | 5 |
| ENST00000420069 | 67,428,498–67,432,995 | 5 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPS6KB2 的產物具有蛋白質激酶活性,能催化蛋白質上的絲胺酸或蘇胺酸殘基磷酸化:反應中 ATP 提供磷酸基,產生磷酸化蛋白質、ADP 與 H⁺。資料指出,其特定標的是 ribosomal protein S6,顯示這項酵素作用並非僅以一般性的蛋白質磷酸化來描述。
在細胞訊號方面,ribosomal protein S6 kinase B2 被描述為可能作用於 mTOR 訊號下游,並在生長因子與營養物質的反應中,參與促進細胞增殖、細胞生長及細胞週期進程。這些作用將外界生長與營養相關訊號,連結到細胞生長狀態與週期活動的調節。
此路徑被描述為受 MEAK7 調控的替代途徑。現有資料支持其涉及的訊號位置、調控關係與細胞層級結果,但未提供更細的步驟或條件,因此不宜將其延伸為未記載的完整分子機制。
Promoter 與基因調控
>RPS6KB2 ENST00000312629 GRCh38 chr11:67427494-67428594 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAACCTCCCGAGTATCTGGGAGTACAGGTGCGCGCCACCACACCCGTC TAATTTTTTGTATTTATAGTAGAGGCAGAGTTTCATCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCCAACTTCTGACCT CAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCGAAAGTGTTGAGATTACAGGTGTGAGCCACCGCCTCCGGCCTGT TTGTTTTTTTGAGACAGGATCTCACTGTGTCACCCAGCCTGGAGTGCAGTGGCACCATCATAGCTCACTG TAACCTTGAACTCCTGGCCTCAAGTGATCCTCCCAACTTGGCTTCCCAAAGTGCTACGATTACAGGCGTG AGGCATCGTGTCCGGCCTCAACAACGTTTTTTGAAGTGTCTATTCTGTACCAGGTGCCTAAATGTGCTTA AATTAAGAAGGGAGTAAACGCCAACAAAATCCCATATTTACAGGTCTATCACTGACCCCCAAAACCCTAT TTAAGGCGGGAACCTGGCAACATAGCCTGGCAGTGAGCTGGCCACTCAGTAAATGCTCCGATTTGCAGGG TCCTCGAGCCAGAGGCACTTTGAGGAGACCCTGATGCAGCCGCCTCCCTTTCTGGAGTGAACCGAAAGCA ACGCGACCTGCCTTTCATCACGCAGCCGGCCTGGCAGTACCCGTCTCCAACAGGGCTGGGGATTGCATTT ACATTCACACCTGCATACACTTCCGACCCTGCTCCATCCAAACTCAAAACACCGTAGAACCAAAACGGGC TCCCAGAAAGCCTTGCTGGGAAGACCGAGGGTCCTGCGGAAAGGATTCTGCAGGCTGAAGGCTAGGCGCC TCGCCACTCTAGGACTACAATTCCCGAGAGGCCTTGCGACGGAAGCCATCTTTGTTCCCCACCAGGCTAA GCGATTTTCCGGAGGGGGAGTAAGATCCCTTGCGTCACCGGCGCGCGCAGCTGCCGTCGCGGAGAGATGA TGTTTAGGTCCGGGACTGTCAGTCAGTGCGCGGCCAGGTACGGGCCGACGGGCCCGCGGGGCCGGCGCCG CCATGGCGGCCGTGTTTGATTTGGATTTGGAGACGGAGGAAGGCAGCGAGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPS6KB2_1 ↗ | 11:67,428,494 | 正股 | 67,428,445–67,428,504 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_9ZQLH · promoter · 67428004–67428504 · regulatory
· motif · 67426908–67426921 · motif
· motif · 67426908–67426921 · motif
· motif · 67428194–67428206 · motif
· motif · 67428353–67428366 · motif
· motif · 67428353–67428366 · motif
· motif · 67428400–67428411 · motif
· motif · 67428544–67428554 · motif
· motif · 67432610–67432632 · motif
· motif · 67432610–67432632 · motif
· motif · 67433014–67433023 · motif
· motif · 67433110–67433119 · motif
· motif · 67433248–67433261 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:482 aa
ribosomal protein S6 kinase B2 長 482 個胺基酸,屬於 protein kinase 超家族、AGC Ser/Thr protein kinase 家族及 S6 kinase 亞家族。其 protein kinase 結構域位於第 67–328 位,AGC-kinase C-terminal 區域位於第 329–399 位。第 1–26 位與第 407–482 位被註記為無序區;第 471–477 位另有 nuclear localization signal。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ribosomal protein S6 kinase B2 被註記位於細胞質與細胞核。 現有資料未提供其在不同條件下的定位變化,也未指出異構型間的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ribosomal protein S6 kinase B2 特異性磷酸化 ribosomal protein S6。它似乎作用於 mTOR 訊號下游,回應生長因子與營養物質,促進細胞增殖、細胞生長及細胞週期進程;此作用屬於受 MEAK7 調控的替代途徑。 | 含實驗來源 | 證據與來源Phosphorylates specifically ribosomal protein S6. Seems to act downstream of mTOR signaling in response to growth factors and nutrients to promote cell proliferation, cell growth and cell cycle progression in an alternative pathway regulated by MEAK7 PMID 29750193 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | ribosomal protein S6 kinase B2 的細胞內定位註記為細胞質與細胞核。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGTCAGTGCGCGGCCAGGTACGGGCCGACGGGCCCGCGGG40GCCGGCGCCGCCATGGCGGCCGTGTTTGATTTGGATTTGG80AGACGGAGGAAGGCAGCGAGGGCGAGGGCGAGCCAGAGCT120CAGCCCCGCGGACGCATGTCCCCTTGCCGAGTTGAGGGCA160GCTGGCCTAGAGCCTGTGGGACACTATGAAGAGGTGGAGC200TGACTGAGACCAGCGTGAACGTTGGCCCAGAGCGCATCGG240GCCCCACTGCTTTGAGCTGCTGCGTGTGCTGGGCAAGGGG280GGCTATGGCAAGGTGTTCCAGGTGCGAAAGGTGCAAGGCA320CCAACTTGGGCAAAATATATGCCATGAAAGTCCTAAGGAA360GGCCAAAATTGTGCGCAATGCCAAGGACACAGCACACACA400CGGGCTGAGCGGAACATTCTAGAGTCAGTGAAGCACCCCT440TTATTGTGGAACTGGCCTATGCCTTCCAGACTGGTGGCAA480ACTCTACCTCATCCTTGAGTGCCTCAGTGGTGGCGAGCTC520TTCACGCATCTGGAGCGAGAGGGCATCTTCCTGGAAGATA560CGGCCTGCTTCTACCTGGCTGAGATCACGCTGGCCCTGGG600CCATCTCCACTCCCAGGGCATCATCTACCGGGACCTCAAG640CCCGAGAACATCATGCTCAGCAGCCAGGGCCACATCAAAC680TGACCGACTTTGGACTCTGCAAGGAGTCTATCCATGAGGG720CGCCGTCACTCACACCTTCTGCGGCACCATTGAGTACATG760GCCCCTGAGATTCTGGTGCGCAGTGGCCACAACCGGGCTG800TGGACTGGTGGAGCCTGGGGGCCCTGATGTACGACATGCT840CACTGGATCGCCGCCCTTCACCGCAGAGAACCGGAAGAAA880ACCATGGATAAGATCATCAGGGGCAAGCTGGCACTGCCCC920CCTACCTCACCCCAGATGCCCGGGACCTTGTCAAAAAGTT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。