演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPS6KA6RSK4

ribosomal protein S6 kinase A6

RPS6KA6 編碼一種持續具有活性的絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,其活性不依賴生長因子;它可能參與 p53/TP53 相關的細胞生長停滯訊號。

Homo sapiensXq21.1UniProt Q9UK32
OFFICIAL SYMBOL
RPS6KA6
CHROMOSOME
X
UNIPROT
Q9UK32
PDB / ALPHAFOLD
6G76
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPS6KA6(ribosomal protein S6 kinase A6)是蛋白質編碼基因,產物屬於絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶。資料指出,此激酶具有不依賴生長因子的活性。現有來源未提供足以進一步說明其家族分類或整體結構特色的資料。

Official symbol
RPS6KA6
Gene name
ribosomal protein S6 kinase A6
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10435
UniProt
Q9UK32
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
RSK4

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome XXq21.1
chrX · 156,040,895 bp · GRCh38chrXp22.33 · 1–4400000 · gnegchrXp22.32 · 4400001–6100000 · gpos50chrXp22.31 · 6100001–9600000 · gnegchrXp22.2 · 9600001–17400000 · gpos50chrXp22.13 · 17400001–19200000 · gnegchrXp22.12 · 19200001–21900000 · gpos50chrXp22.11 · 21900001–24900000 · gnegchrXp21.3 · 24900001–29300000 · gpos100chrXp21.2 · 29300001–31500000 · gnegchrXp21.1 · 31500001–37800000 · gpos100chrXp11.4 · 37800001–42500000 · gnegchrXp11.3 · 42500001–47600000 · gpos75chrXp11.23 · 47600001–50100000 · gnegchrXp11.22 · 50100001–54800000 · gpos25chrXp11.21 · 54800001–58100000 · gnegchrXp11.1 · 58100001–61000000 · acenchrXq11.1 · 61000001–63800000 · acenchrXq11.2 · 63800001–65400000 · gnegchrXq12 · 65400001–68500000 · gpos50chrXq13.1 · 68500001–73000000 · gnegchrXq13.2 · 73000001–74700000 · gpos50chrXq13.3 · 74700001–76800000 · gnegchrXq21.1 · 76800001–85400000 · gpos100chrXq21.2 · 85400001–87000000 · gnegchrXq21.31 · 87000001–92700000 · gpos100chrXq21.32 · 92700001–94300000 · gnegchrXq21.33 · 94300001–99100000 · gpos75chrXq22.1 · 99100001–103300000 · gnegchrXq22.2 · 103300001–104500000 · gpos50chrXq22.3 · 104500001–109400000 · gnegchrXq23 · 109400001–117400000 · gpos75chrXq24 · 117400001–121800000 · gnegchrXq25 · 121800001–129500000 · gpos100chrXq26.1 · 129500001–131300000 · gnegchrXq26.2 · 131300001–134500000 · gpos25chrXq26.3 · 134500001–138900000 · gnegchrXq27.1 · 138900001–141200000 · gpos75chrXq27.2 · 141200001–143000000 · gnegchrXq27.3 · 143000001–148000000 · gpos100chrXq28 · 148000001–156040895 · gnegRPS6KA6pq1 bp156,040,895 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chrX:84,058,346–84,206,356
Gene span
148,011 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000262752 ★84,058,350–84,188,19922
ENST0000062034084,058,346–84,186,14122
ENST0000091141884,058,350–84,188,47621
ENST0000091141984,058,350–84,188,47616
ENST0000091142084,058,350–84,188,47622
ENST0000113482584,058,350–84,188,47622
ENST0000110623584,094,036–84,188,47621

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RPS6KA6 的產物是一種持續具有活性的絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶。其激酶活性不依賴生長因子,與需要生長因子刺激才啟動的活性不同;來源未進一步說明其活性調控方式或特定的生長因子條件。

此酵素可催化蛋白質上的絲胺酸或蘇胺酸殘基磷酸化。反應中,ATP 提供磷酸基,底物分別轉變為磷酸化的絲胺酸或蘇胺酸蛋白質,同時生成 ADP 與 H⁺。這些反應描述了其激酶活性的基本化學形式,來源未列出具體底物或受調控的下游蛋白質。

RPS6KA6 可能參與 p53/TP53 依賴的細胞生長停滯訊號。此描述指出的是可能參與訊號傳遞,並未提供足以界定其作用步驟或因果方向的細節,因此不能據此推定它如何影響 p53/TP53 或細胞生長停滯。

此外,來源指出 RPS6KA6 在胚胎發育期間可能具有抑制作用,但未明確說明抑制的對象、作用機制或發育階段。這項功能描述保留為可能的作用,不延伸為已確立的胚胎發育機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 84188199 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPS6KA6 ENST00000262752 GRCh38 chrX:84188099-84189199 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTTAAACTTTCAGCTCTGAAGTGTTTTGATGAGAAGCATCTTGATTATCCCCCGTATAAGATTATACTT
TATCTCTGTTATATCGCCAGCTCCCAGTACAATGTGTGGCTTAGAGTAGCGAAGTAGTAAAGCTCGCTTT
GAAGAAGGTACTAAAAACTATGATTATTGTCACTACAGACCCAACATTCTCAGAGGGGGCTGGAGGATGG
GCTAGCTTCGGAATCATGCCTTTGTTGCCACAAGTGGAGTTCATTAAGTGGCATATGTTTGCCTGTGTGT
GTGCATGTGTGAAGAGAAACATTGTGTGTTATCAATAGTGTGAAGGCAACCAGCAGGAGCATCCTGAGAG
GGACAAGTAAGGTGGGGGCTAGAGAGGACAGGTATATTTATTTTTTTAAATGGGGGTTATCCTGCCTTTA
CCTTCTAGGAGGATAATGTATGATGTACTAAAATCCCTGCCCTAGTATTTGTCACTAAGTATCGAAATGG
GCGTGGTTTGGCATATAAGACACCTGCTCTTCGTGAGCCCTGCAAAGAGATACTCTTGGAGTCCTACCCT
TACCCTGATTCCTCAAGTGCTCTGGAGGGTCCCCCAGTTCCAGCATCCTTTTTGAGAATCCTGCCGCCCG
CCAGCAATGCTGCTCCGTGGACTTGAGAGGGCCTGCTGAGCATGTGTGAAGAGCGCTGCGCATGCTCCGT
GGAGTGGGCAGGTTTACCGAGGCGCTAGCAGGGGCTTTTACTACTGTTCAGTCGCCTCCCCAGCCCAGCA
CGCCCCCCTCCCCTCTATCCCACCACCCACCACGCGGTCCCCCGCATCCACCCCGCCCCTCTATCCCGCC
CCCTTCACCCCAAGCTGGGGAATCTCCATTGACGTTTGGGTGACGCCGCTGTGCCGCCGCCGTGGGGGGG
TCCAGGCGCCGCACAGGTAACGCCGCCGCTGCCGCCATATTGACAGAGCAGGGAGCGGGGAGGGGACCCG
AGGAAGTGGGGTGTTGGGGGAGTCACCACCGAGCGGCTGTCGTTGTGGTGGCAGTGGTGAGCGCGAGCCG
AGCGGCAGCTCTTGGAGAGGCAGCACAGAGTTGTCTTCTCTATGGGAATCA
RPS6KA6 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPS6KA6_1 ↗X:84,188,013負股84,188,003–84,188,062
RPS6KA6_2 ↗X:84,188,181負股84,188,171–84,188,230

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSRX_5PRMBS · CTCF_binding_site · 84186814–84186835 · regulatory

ENSRX_CBCJX · enhancer · 84187026–84188188 · regulatory

ENSRX_5PRMHX · CTCF_binding_site · 84187925–84187946 · regulatory

ENSRX_938F84 · promoter · 84188189–84188689 · regulatory

· motif · 84186816–84186832 · motif

· motif · 84187927–84187943 · motif

· motif · 84188250–84188260 · motif

· motif · 84188502–84188513 · motif

· motif · 84188502–84188513 · motif

· motif · 84188522–84188533 · motif

· motif · 84188522–84188533 · motif

· motif · 84189335–84189349 · motif

· motif · 84189336–84189349 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:745 aa

1 aa745 aa結構域功能區域
依 Q9UK32 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Ribosomal protein S6 kinase alpha-6 長 745 個胺基酸,屬於 AGC Ser/Thr protein kinase family 的 S6 kinase subfamily。其註解包含兩個 Protein kinase 區域,分別位於胺基酸 73–330 與 426–683;胺基酸 331–400 為 AGC-kinase C-terminal 區域。N 端胺基酸 1–28 標示為無序區。

結構域Protein kinase 173–330 aa
結構域AGC-kinase C-terminal331–400 aa
結構域Protein kinase 2426–683 aa
功能區域Disordered1–28 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6G76…

PDB · 6G76

X-ray · 3.00 A · A/B=48-349

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytosol;Nucleus

RPS6KA6 主要位於細胞質,另有細胞核定位的註記。 來源未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
RSK4RPS6KA6SPRED2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

在血清飢餓細胞中,RPS6KA6 與 MAPK3/ERK1 形成複合體;同一條件下,來源指出它不與 MAPK9 或 MAPK14 形成複合體。這些資料描述的是複合體形成情形,未提供其他功能關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RPS6KA6 是持續具有活性的絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,其激酶活性不依賴生長因子。它可能參與 p53/TP53 依賴的細胞生長停滯訊號,並可能在胚胎發育期間發揮抑制作用;來源未詳述相關機制。含實驗來源
證據與來源

Constitutively active serine/threonine-protein kinase that exhibits growth-factor-independent kinase activity and that may participate in p53/TP53-dependent cell growth arrest signaling and play an inhibitory role during embryogenesis

PMID 15042092 ↗ · PMID 15632195 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)資料庫紀錄
證據與來源

L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)資料庫紀錄
證據與來源

L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用在血清飢餓細胞中,RPS6KA6 與 MAPK3/ERK1 形成複合體;在相同細胞條件下,來源指出 RPS6KA6 不與 MAPK9 或 MAPK14 形成複合體。資料庫紀錄
證據與來源

Forms a complex with MAPK3/ERK1 but not with MAPK9 or MAPK14 in serum-starved cells

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RPS6KA6 的定位註記包括細胞質、細胞溶質與細胞核,並指出其主要位於細胞質。來源未說明這些定位是否隨條件改變。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm, cytosol; Nucleus; Predominantly cytosolic

PMID 15632195 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000262752 · 8,465 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTCACCACCGAGCGGCTGTCGTTGTGGTGGCAGTGGTGA40
41GCGCGAGCCGAGCGGCAGCTCTTGGAGAGGCAGCACAGAG80
81TTGTCTTCTCTATGGGAATCACCGGGCGGCGGCGGCGGCG120
121ACCCCCAGCTCCCAGCCTCTGAGAGACCCGGCGGCGAGGG160
161CAGCGCTCGCTGAAGGCGGGGCTGGGGGTCGCGGCGGCGG200
201CGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGGCCAGTTCAATAGACA240
241GGATGCGCGGCCGCGCCAGCGGTAGGCGGCAGCTCCTGTT280
281TGAGTGCTCCTGAAGGGGAGATGCTACCATTCGCTCCTCA320
321GGACGAGCCCTGGGACCGAGAAATGGAAGTGTTCAGCGGC360
361GGCGGCGCGAGCAGCGGCGAGGTAAATGGTCTTAAAATGG400
401TTGATGAGCCAATGGAAGAGGGAGAAGCAGATTCTTGTCA440
441TGATGAAGGAGTTGTTAAAGAAATCCCTATTACTCATCAT480
481GTTAAGGAAGGCTATGAGAAAGCAGATCCTGCACAGTTTG520
521AGTTGCTCAAGGTTCTTGGTCAGGGGTCATTTGGAAAGGT560
561TTTTCTTGTTAGAAAGAAGACCGGTCCTGATGCTGGGCAG600
601CTCTATGCAATGAAGGTGTTAAAAAAAGCCTCTTTAAAAG640
641TTCGAGACAGAGTTCGGACAAAGATGGAGAGGGATATACT680
681GGTGGAAGTAAATCATCCATTTATTGTCAAATTGCACTAT720
721GCCTTTCAGACTGAAGGGAAACTGTACTTAATACTGGATT760
761TTCTCAGGGGAGGAGATGTTTTCACAAGATTATCCAAAGA800
801GGTTCTGTTTACAGAGGAAGATGTGAAATTCTACCTCGCA840
841GAACTGGCCCTTGCTTTGGATCATCTGCACCAATTAGGAA880
881TTGTTTATAGAGACCTGAAGCCAGAAAACATTTTGCTTGA920
921TGAAATAGGACATATCAAATTAACAGATTTTGGACTCAGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。