基因總覽
RPS6KA4 的正式名稱為 ribosomal protein S6 kinase A4，屬於蛋白質激酶超家族中的 AGC Ser/Thr protein kinase family，並歸在 S6 kinase subfamily。其蛋白質具有絲胺酸／蘇胺酸激酶活性，可在細胞接收生長或壓力刺激後，參與轉錄因子的調節；也與染色質蛋白磷酸化及發炎相關基因的調控相連。蛋白質序列包含兩個 Protein kinase 區域、一個 AGC-kinase C-terminal 區域，以及一段與核內標的定位和 MAPK14 結合有關的區域。這些特徵概括了其激酶家族身分與蛋白質架構；各刺激條件下的作用方式則見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000334205 ★ | 64,359,162–64,372,215 | 17 |
| ENST00000528057 | 64,359,142–64,372,215 | 17 |
| ENST00000891458 | 64,359,142–64,372,215 | 16 |
| ENST00000891459 | 64,359,142–64,372,215 | 17 |
| ENST00000891460 | 64,359,142–64,372,215 | 17 |
| ENST00000891461 | 64,359,142–64,372,215 | 17 |
| ENST00000891462 | 64,359,142–64,372,215 | 17 |
| ENST00000891463 | 64,359,142–64,372,215 | 16 |
| ENST00000891464 | 64,359,142–64,372,215 | 16 |
| ENST00000891465 | 64,359,142–64,372,215 | 16 |
| ENST00000891466 | 64,359,142–64,372,215 | 16 |
| ENST00000891467 | 64,359,142–64,372,215 | 17 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPS6KA4 是絲胺酸／蘇胺酸蛋白激酶，可將 ATP 的磷酸基轉移至蛋白質中的絲胺酸或蘇胺酸殘基。細胞受到促有絲分裂或壓力刺激時，例如 UV-C irradiation、epidermal growth factor（EGF）或 anisomycin，RPS6KA4 會磷酸化轉錄因子 CREB1 與 ATF1，參與刺激引發的轉錄調控。
RPS6KA4 也會依刺激條件調節染色質相關蛋白。促有絲分裂刺激、壓力刺激或 EGF 可促使其磷酸化組蛋白 H3 的 Ser-10，進而促進多個即時早期基因的轉錄活化，包括原癌基因 c-fos/FOS 與 c-jun/JUN；它也可能磷酸化組蛋白 H3 的 Ser-28。此外，RPS6KA4 介導促有絲分裂與壓力刺激所引發的 HMGN1/HMG14 磷酸化。
在 TNF 刺激下，RPS6KA4 對轉錄因子 RELA 轉錄活性的調控具有必要作用。於 lipopolysaccharide 刺激的初代巨噬細胞中，RPS6KA4 位於 Toll-like receptor TLR4 下游，並限制促發炎細胞激素的產生。此作用可能是透過 CREB1 與 ATF1 促進 MAP kinase phosphatase DUSP1 和抗發炎細胞激素 IL10 的轉錄；來源將此機制表述為可能的作用方式。
Promoter 與基因調控
>RPS6KA4 ENST00000334205 GRCh38 chr11:64358162-64359262 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCTTGAGTTCCTCCTCCTCTCAGCCAGGGCTTCACAGGACAGGGGCGTGGGGTGGACACCCTGGCCTCTC CAGCTGGCAGAGGAGCTGAGAGCCCCTCCCACCGGCCTCAGGGTGTGGGGCCTCATGGCTGTCCCACTCT GCTAGGTGGCCCCATTGGTGGTCAGGAAGGGAAAGGCAGGAAGAAGACGGAGCAGGGGCTCAGGAGGACC AGTCAGCAGGGGCCCTGGGCCTCATGGGGAGAGGGGGCAGCCCCGTGTGGCACTGACATCTCTTCTTGAG GCCTGCTCAGGGCTCTAAGCTGGGTACTGCACCAGGCTAGGAGACAACAGGAGCAGAACACGTGAGGTGC GCATGGCACCTGGTGGGCTCTGCACGGTGACTGGGGGCTGAAGTGCTTCTGCAGGCACCCCCGACAGAAA GCTGGTCAGAAAACTGGCCACTCCTCTCCTTGCCATGGGGTCCCAGGCCGGGCTCCAGCCCCCTCTTGGT GATGAGGCTCCTCCTTGCAAAGGCCAGTCCTCTGGGGAGAGGGGCCCTGCTGGCCACCCCCAGGACGATG GAGTGGGGTGGGCTCCACTGCCTGAGAGTTGGGTGACTTCCAGGATCCAGACCCCCTCTCAGCCTGCCCA GCACCAGGCACCTCGTCCCCCACCTTGGGGCACAGACTCCTAATGTCCTCCAGCCACTGGCTGCAGCCGG CATTCCCGGGCAGATTCCTGGCTTGGGGACTAATGCCCCAGAGGCTCCAGGTTACCCACGGGCTCAGGGA TGGCTCCCACGGGGTGTTTCCAGTTCCCGGGAGAGTCGAGTAAGGTCCCGGAGCGCACGGCCCTGAGGCC TGGCCTGGGGGCTCGGGAGACAGGGCGGCCCCAGCCGGCCGCCCACCGGCAGCCCGGCGCTGTCACGTTC CAGCCGCCTGACTCAGGCCGCGCAGGGCGGGGAGCCGGGAGGCGGTGCCGGCGCCCGCCTCGGCCCCGGA GGCGGCACCAGGAAGCGCCCGCCCCGGCCGGAGCCGCCATGTAACCGGCGCCGCCCGGAGCCCGAGCCGC GCGGGCCCCAGCGACCCGCCCGCCATGGGGGACGAGGACGACGATGAGAGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPS6KA4_1 ↗ | 11:64,359,171 | 正股 | 64,359,122–64,359,181 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_5K5NSW · CTCF_binding_site · 64355227–64355248 · regulatory
ENSR11_5K5P4M · CTCF_binding_site · 64356683–64356704 · regulatory
ENSR11_BGQT7 · promoter · 64358658–64359172 · regulatory
ENSR11_5K5PP4 · CTCF_binding_site · 64360232–64360253 · regulatory
· motif · 64354172–64354187 · motif
· motif · 64354180–64354187 · motif
· motif · 64354180–64354195 · motif
· motif · 64354262–64354269 · motif
· motif · 64354342–64354355 · motif
· motif · 64354445–64354452 · motif
· motif · 64354506–64354518 · motif
· motif · 64355037–64355044 · motif
· motif · 64355080–64355087 · motif
· motif · 64355121–64355128 · motif
· motif · 64355229–64355245 · motif
· motif · 64355367–64355380 · motif
· motif · 64355404–64355417 · motif
· motif · 64355409–64355421 · motif
· motif · 64355513–64355524 · motif
· motif · 64356685–64356701 · motif
· motif · 64358498–64358507 · motif
· motif · 64358498–64358507 · motif
· motif · 64358954–64358967 · motif
· motif · 64358954–64358967 · motif
· motif · 64359065–64359081 · motif
· motif · 64359065–64359081 · motif
· motif · 64359147–64359158 · motif
· motif · 64359173–64359183 · motif
· motif · 64359229–64359239 · motif
· motif · 64359431–64359447 · motif
· motif · 64359688–64359701 · motif
· motif · 64359688–64359701 · motif
· motif · 64360234–64360250 · motif
· motif · 64360274–64360285 · motif
· motif · 64360329–64360345 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：772 aa
Ribosomal protein S6 kinase A4 長 772 個胺基酸，屬於 AGC Ser/Thr protein kinase family 的 S6 kinase subfamily。序列含兩個 Protein kinase 區域（第 33–301 與 411–674 位），以及 AGC-kinase C-terminal 區域（第 302–371 位）。C 端第 725–772 位區域與核內標的定位及 MAPK14 結合有關；蛋白質另有註記為無序的區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源將 RPS6KA4 定位於細胞核，未提供不同刺激條件或異構型之間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- MAPK14Q16539 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- KLF11O14901 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
在靜止細胞中，RPS6KA4 可與 MAPK1/ERK2 或 MAPK3/ERK1 形成複合體；促有絲分裂刺激後，複合體會短暫解離。RPS6KA4 也與 MAPK14/p38-alpha 有關聯。活化的 RPS6KA4 則會與 NF-kappa-B p65 subunit RELA 結合並使其磷酸化。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPS6KA4 是絲胺酸／蘇胺酸蛋白激酶，參與生長刺激或壓力引發的 CREB1、ATF1 磷酸化，以及 RELA 轉錄活性調控。它可磷酸化組蛋白 H3 的 Ser-10，促進即時早期基因轉錄，也可能作用於 Ser-28，並介導 HMGN1/HMG14 磷酸化。在 lipopolysaccharide 刺激的初代巨噬細胞中，它位於 TLR4 下游以限制促發炎細胞激素；此作用可能涉及 CREB1、ATF1 誘導 DUSP1 與 IL10 轉錄。 | 含實驗來源 | 證據與來源Serine/threonine-protein kinase that is required for the mitogen or stress-induced phosphorylation of the transcription factors CREB1 and ATF1 and for the regulation of the transcription factor RELA, and that contributes to gene activation by histone phosphorylation and functions in the regulation of inflammatory genes. Phosphorylates CREB1 and ATF1 in response to mitogenic or stress stimuli such as UV-C irradiation, epidermal growth factor (EGF) and anisomycin. Plays an essential role in the control of RELA transcriptional activity in response to TNF. Phosphorylates 'Ser-10' of histone H3 in response to mitogenics, stress stimuli and EGF, which results in the transcriptional activation of several immediate early genes, including proto-oncogenes c-fos/FOS and c-jun/JUN. May also phosphorylate 'Ser-28' of histone H3. Mediates the mitogen- and stress-induced phosphorylation of high mobility group protein 1 (HMGN1/HMG14). In lipopolysaccharide-stimulated primary macrophages, acts downstream of the Toll-like receptor TLR4 to limit the production of pro-inflammatory cytokines. Functions probably by inducing transcription of the MAP kinase phosphatase DUSP1 and the anti-inflammatory cytokine interleukin 10 (IL10), via CREB1 and ATF1 transcription factors PMID 11035004 ↗ · PMID 12773393 ↗ · PMID 9792677 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 靜止細胞中的 RPS6KA4 可與 MAPK1/ERK2 或 MAPK3/ERK1 形成複合體，促有絲分裂刺激後此複合體會短暫解離。RPS6KA4 也與 MAPK14/p38-alpha 有關聯；活化後則會結合 NF-kappa-B p65 subunit RELA，並使 RELA 磷酸化。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Forms a complex with either MAPK1/ERK2 or MAPK3/ERK1 in quiescent cells which transiently dissociates following mitogenic stimulation. Also associates with MAPK14/p38-alpha. Activated RPS6KA4 associates with and phosphorylates the NF-kappa-B p65 subunit RELA |
| 細胞定位 | RPS6KA4 的細胞內定位為細胞核。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCCCCGGCCGGAGCCGCCATGTAACCGGCGCCGCCCGGAG40CCCGAGCCGCGCGGGCCCCAGCGACCCGCCCGCCATGGGG80GACGAGGACGACGATGAGAGCTGCGCCGTGGAGCTGCGGA120TCACAGAAGCCAACCTGACCGGGCACGAGGAGAAGGTGAG160CGTGGAGAACTTCGAGCTGCTCAAGGTGCTGGGCACGGGA200GCCTACGGCAAGGTGTTCCTGGTGCGGAAGGCGGGCGGGC240ACGACGCGGGGAAGCTGTACGCCATGAAGGTGCTGCGCAA280GGCGGCGCTGGTGCAGCGCGCCAAGACGCAAGAGCACACG320CGCACCGAGCGCTCGGTGCTGGAGCTGGTGCGCCAGGCGC360CCTTCCTGGTCACGCTGCACTACGCTTTCCAGACGGATGC400CAAGCTGCACCTCATCCTGGACTATGTGAGCGGCGGGGAG440ATGTTCACCCACCTCTACCAGCGCCAGTACTTCAAGGAGG480CTGAGGTGCGCGTGTATGGGGGTGAGATCGTGCTGGCCCT520GGAACACCTGCACAAGCTCGGCATCATTTACCGAGACCTG560AAACTGGAGAATGTGCTGCTGGACTCCGAGGGCCACATTG600TCCTCACGGACTTCGGGCTGAGCAAGGAGTTCCTGACGGA640GGAGAAAGAGCGGACCTTCTCCTTCTGTGGCACCATCGAG680TACATGGCCCCCGAAATCATCCGTAGCAAGACGGGGCATG720GCAAGGCTGTGGACTGGTGGAGCCTGGGCATCTTGCTCTT760CGAGCTGCTGACGGGGGCCTCGCCCTTCACCCTGGAGGGC800GAGAGGAACACGCAGGCTGAGGTGTCTCGACGGATCCTGA840AGTGCTCCCCTCCCTTCCCCCCTCGGATCGGGCCCGTGGC880GCAGGACCTGCTGCAGCGGCTGCTTTGTAAGGATCCTAAG920AAGCGATTGGGCGCGGGGCCCCAGGGGGCACAAGAAGTCC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。