基因總覽
RPS6KA2(ribosomal protein S6 kinase A2)是蛋白質編碼基因,產物屬於 protein kinase 超級家族中的 AGC Ser/Thr protein kinase 家族,並歸於 S6 kinase 亞家族。這種蛋白質具有絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶活性,主要作為 ERK 訊號下游的訊號傳遞分子。其功能涉及細胞受到促有絲分裂刺激或壓力時的反應,也與轉錄、轉譯及細胞命運相關。蛋白質序列包含兩個 Protein kinase 區域及一段 AGC-kinase C-terminal 區域,呈現其激酶家族成員的結構特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000265678 ★ | 166,409,364–166,627,251 | 21 |
| ENST00000714395 | 166,409,364–166,692,843 | 21 |
| ENST00000510118 | 166,409,364–166,862,556 | 23 |
| ENST00000503859 | 166,409,364–166,862,556 | 22 |
| ENST00000481261 | 166,409,364–166,544,690 | 21 |
| ENST00000405189 | 166,409,364–166,542,450 | 21 |
| ENST00000907313 | 166,409,364–166,627,282 | 19 |
| ENST00000907314 | 166,409,364–166,627,255 | 20 |
| ENST00000907315 | 166,409,364–166,627,255 | 20 |
| ENST00000907316 | 166,409,364–166,627,255 | 19 |
| ENST00000907317 | 166,409,364–166,627,227 | 19 |
| ENST00000907318 | 166,409,364–166,627,185 | 21 |
顯示 12/31 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPS6KA2 的蛋白質產物是絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,作用於 ERK 訊號(MAPK1/ERK2 與 MAPK3/ERK1)的下游。其催化反應可將 ATP 的磷酸基轉移至蛋白質中的絲胺酸或蘇胺酸殘基,生成磷酸化蛋白質、ADP 與 H⁺。因此,RPS6KA2 能藉由蛋白質磷酸化傳遞訊號,連結上游 ERK 活性與下游細胞反應。
在促有絲分裂刺激或細胞承受壓力時,RPS6KA2 參與轉錄因子的活化;此外也調節轉譯。這些作用使其參與細胞增殖、存活與分化等過程。來源指出其與上述細胞反應相關,但未進一步列出受磷酸化的特定轉錄因子或轉譯標的,因此不宜由此推定具體靶分子或更細部的調控路徑。
RPS6KA2 的功能也可能依細胞情境而有不同意義:來源提出,在上皮性卵巢癌細胞中,它可能具有腫瘤抑制因子的功能。這項描述限於該細胞背景,且以「可能」表述,並未支持將此作用泛化至其他細胞或直接視為確立的腫瘤抑制機制。
Promoter 與基因調控
>RPS6KA2 ENST00000265678 GRCh38 chr6:166627151-166628251 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGCTGCAGCCCTTGGTGAGCATTTCTAGGAAAAAAAAGAAAAAAGTGTTTCCCTTTAAGGCGGATCCCGA GCGGCGCTGCCGCCAGCAGCGGGTCTGAGGGCCTTGCCCTAGACCCAGGTCACCCCGCCCGGGTATTCCC AGCGCGGGCCCTGATAAGCCATCTGTGTAGACGTTTCCTAGAGCGGGACCGGCTGCGGAGGGCGGATGCG TCTTTGTTCTGCAGCCGCGGGAGGGAGGCGCCCCGAGGGCTGCCTGAGCCCCCGCCCTCGGGCGCCTTTG TCCGCTCCGGCGGAGGGAAGGCGCCGGTTCCGCGGAGGGCGGCTCCTGGCCGAGCTGCAGGGCCCGCTGG CAGGCGGCGGTCCCTCGCTCGCTGTGCCGCTGAGGTTTTGGCTGCGTTTGCTGATCAACAATTAAAGTTT GGTTCGGCAGAGAAAAACATGATGACAAAGTGTGCATAGGGATGTTTTAAGGAAGGAAAACATAATGACG GCCCCAAGCTGGAAGAAAGAGCAGCCGGGCCGAAGTTGCGTGACAGGAACGCCCGCGACTGCGCGGCTCC GGAGCAGCTGCACAACTCGCCCGGGCCGGGAGCTGTCCCGGGCCGAGGCTCATTAGGTATGCGGCGGCTG CGGGCACTGATTGGCGGGCAGTGCTGTGGGCGGGGCCGTGGGCGGAACCGCGTGGGGGCGGGGCTGCACG GAGCTGGTTCTTGTAGGAAGGAGTAGAAAGAGGAGGAGGGATGGGCACCTGGAACCACAGGGCGGCGCTG ATGATTGGAGGTATCGGCAGAGGCGGGGCTCTCCCGGGCGGGGCGGTGGGCTCTCATTGGCAGTGCTGGT GGTGGGTGGGAACGGGAGGGGTGGTGAGCGCTGATTGGCCGTAGTGGCGGGGCGGGGCGGAGGAGGAGGA GGTGTGCGTGCCGGGGCGCGGAGCGGCGGGCGCTGATTGGTGGTAGTGGTGGTGGGCGTGGTGTAGGCGT GGCGCGTGGCCGGCGCTGGTACTCGCAGGGGAGGCGGAGAAGGAGGCGGAGGGAGCGATTGTGGCCCCGG CCGCGGTGGCCGGCGCGGCCTGCCCTTTGTGACCGCAGCTCGCGCCCCACG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPS6KA2_2 ↗ | 6:166,423,984 | 負股 | 166,423,974–166,424,033 |
| RPS6KA2_1 ↗ | 6:166,627,251 | 負股 | 166,627,241–166,627,300 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:733 aa
RPS6KA2 蛋白質長 733 個胺基酸,屬於 protein kinase 超級家族、AGC Ser/Thr protein kinase 家族的 S6 kinase 亞家族。序列註解包含兩個 Protein kinase 區域,分別位於第 59–318 與第 415–672 個胺基酸;第 319–388 個胺基酸則為 AGC-kinase C-terminal 區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未提供其在兩處之間移動的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 9 個夥伴
- APPP05067 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BRAFP15056 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CSNK2BP67870 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- KLF11O14901 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAPK1P28482 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
- PRKCEQ02156 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SCRIBQ14160 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- SHANK1Q9Y566 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- YWHAEP62258 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
在靜止細胞中,RPS6KA2 可與 MAPK1/ERK2 或 MAPK3/ERK1 形成複合體;促有絲分裂刺激後,複合體會短暫解離,此項描述為相似性推論。RPS6KA2 也與 FBXO5 互作;兩者合作促使早期胚胎卵裂球停滯於中期,並增加及穩定 FBXO5 與 CDC20 的互作。後述互作與功能關係同樣標示為相似性推論。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPS6KA2 是絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,作用於 ERK(MAPK1/ERK2 與 MAPK3/ERK1)訊號下游,參與促有絲分裂刺激及壓力誘發的轉錄因子活化,也調節轉譯,並參與細胞增殖、存活與分化。在上皮性卵巢癌細胞中,它可能具有腫瘤抑制因子功能。 | 含實驗來源 | 證據與來源Serine/threonine-protein kinase that acts downstream of ERK (MAPK1/ERK2 and MAPK3/ERK1) signaling and mediates mitogenic and stress-induced activation of transcription factors, regulates translation, and mediates cellular proliferation, survival, and differentiation. May function as tumor suppressor in epithelial ovarian cancer cells PMID 16878154 ↗ · PMID 7623830 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | 靜止細胞中,RPS6KA2 可與 MAPK1/ERK2 或 MAPK3/ERK1 形成複合體;促有絲分裂刺激後會短暫解離,此關係為相似性推論。RPS6KA2 亦與 FBXO5 互作,兩者合作促使早期胚胎卵裂球停滯於中期,並增加及穩定 FBXO5 與 CDC20 的互作;這些描述同樣根據相似性推論。 | 推論支持 | 證據與來源Forms a complex with either MAPK1/ERK2 or MAPK3/ERK1 in quiescent cells. Transiently dissociates following mitogenic stimulation (By similarity). Interacts with FBXO5; cooperate to induce the metaphase arrest of early blastomeres; increases and stabilizes interaction of FBXO5 with CDC20 (By similarity) |
| 細胞定位 | RPS6KA2 蛋白質定位於細胞核及細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACTCGCAGGGGAGGCGGAGAAGGAGGCGGAGGGAGCGATT40GTGGCCCCGGCCGCGGTGGCCGGCGCGGCCTGCCCTTTGT80GACCGCAGCTCGCGCCCCACGCCCCGCGCCCATGGCCGCC120GTGCCGGGCTCCCTGGCCACGCGTGCCCGCCCGCGGACCT160GAGCCCCGCGCCTGGGATGCCGGGGATGCGCGTCCCCCGG200CCCTGCGGCTGCTCCGGGCTGGGCGCGGGGCGATGGACCT240GAGCATGAAGAAGTTCGCCGTGCGCAGGTTCTTCTCTGTG280TACCTGCGCAGGAAGTCGCGCTCCAAGAGCTCCAGCCTGA320GCCGGCTCGAGGAAGAAGGCGTCGTGAAGGAGATAGACAT360CAGCCATCATGTGAAGGAGGGCTTTGAGAAGGCAGATCCT400TCCCAGTTTGAGCTGCTGAAGGTTTTAGGACAAGGATCCT440ATGGAAAGGTGTTCCTGGTGAGGAAGGTGAAGGGGTCCGA480CGCTGGGCAGCTCTACGCCATGAAGGTCCTTAAGAAAGCC520ACCCTAAAAGTTCGGGACCGAGTGAGATCGAAGATGGAGA560GAGACATCTTGGCAGAAGTGAATCACCCCTTCATTGTGAA600GCTTCATTATGCCTTTCAGACGGAAGGAAAGCTCTACCTG640ATCCTGGACTTCCTGCGGGGAGGGGACCTCTTCACCCGGC680TCTCCAAAGAGGTCATGTTCACGGAGGAGGATGTCAAGTT720CTACCTGGCTGAGCTGGCCTTGGCTTTAGACCATCTCCAC760AGCCTGGGGATCATCTACAGAGATCTGAAGCCTGAGAACA800TCCTCCTGGATGAAGAGGGGCACATTAAGATCACAGATTT840CGGCCTGAGTAAGGAGGCCATTGACCACGACAAGAGAGCG880TACTCCTTCTGCGGGACGATCGAGTACATGGCGCCCGAGG920TGGTGAACCGGCGAGGACACACGCAGAGTGCCGACTGGTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。