基因總覽
RPS6 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 ribosomal protein S6。其產物屬於真核生物核糖體蛋白 eS6 家族，為 40S 小型核糖體次單元的組成蛋白。除了成熟核糖體中的角色，ribosomal protein S6 也屬於小型次單元加工體（SSU processome）的組成部分，與核糖體生成過程相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000380394 ★ | 19,375,715–19,380,236 | 6 |
| ENST00001127730 | 19,200,287–19,380,283 | 5 |
| ENST00001127731 | 19,200,287–19,380,283 | 2 |
| ENST00001133420 | 19,375,715–19,380,283 | 6 |
| ENST00000919419 | 19,376,240–19,380,283 | 5 |
| ENST00000919422 | 19,376,243–19,380,283 | 6 |
| ENST00000996204 | 19,376,253–19,380,283 | 6 |
| ENST00000889072 | 19,376,255–19,380,283 | 6 |
| ENST00000889073 | 19,376,255–19,380,283 | 6 |
| ENST00000889074 | 19,376,255–19,380,283 | 6 |
| ENST00000889075 | 19,376,255–19,380,283 | 6 |
| ENST00000919420 | 19,376,255–19,380,283 | 6 |
顯示 12/57 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPS6 的產物是 40S 小型核糖體次單元的組成蛋白，並與選擇性翻譯特定類別的 mRNA 有關。透過這種選擇性翻譯，ribosomal protein S6 參與細胞生長與增殖的調控；來源指出其作用涉及特定 mRNA 類別，並未將其概括為對所有 mRNA 翻譯的普遍調控。
在核糖體生成方面，ribosomal protein S6 也是小型次單元加工體（SSU processome）的成員。SSU processome 是真核生物小型核糖體次單元的第一個前驅結構，其組裝發生於核仁。組裝期間，多種核糖體生成因子、RNA 伴護蛋白與核糖體蛋白會與新生的前核糖體 RNA（pre-rRNA）結合，協同進行 RNA 摺疊、修飾、重排與切割。
這個加工過程也包含由 RNA 外切體（RNA exosome）對前核糖體 RNA 進行標的性降解。來源描述的是多種因子共同參與 SSU processome 組裝與 RNA 處理；因此，ribosomal protein S6 在此脈絡中的角色，是作為加工體成員參與小型次單元生成，而非單獨執行其中所有 RNA 處理步驟。
Promoter 與基因調控
>RPS6 ENST00000380394 GRCh38 chr9:19380136-19381236 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTTAACAGGGTACAGGGTTTTCTTTTAGGATGATGAAAATGTTTTGGAACTGTATCGATAGAGATGGTGG TTGTACAGCATTGTGAATGTACTAAATGCCACTGAATTGTTCACTTTAAAATGACTAGTTATGTCAATTT CACCTCAACAAAAAAATGACACACAGTACTCAGATTTTAAAAAGCATCATTTCACCAAGATTCCATGAAT TAATGTGAGATGATCAAAGAGGATTCAGTAGAATCGTTCAACTTCGAATGTAAAACAGTCCTAAACTCAA ACCTTTGTGACACTAAAGTGGGGAGATGGTATGTGATAGTTTTAGATAGTAAAAATTATTCTTGTTTACT TGGTCTCGAACTCGAACTTTTTTGAGGCGGAGTCTCTCTCTGTCGCCTGGGCTGCAGTGCAGTGGTGCGA TCTGGACTCATTGCAACCTCCGCCTCTTGGGCTCAAGCGATTGTCGTGCCTCAGCCTCCCTAGTAACTGG GACTACAGTCGCCCCCCACCACGCCTGGCTATTTTACCTATTTTTGGCTATTTTACCTATTTTTATTAGA GACGGAGTTTCGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTAAGATGATCCGCCCGCCTCGGCC TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCTTGCCCTCCTATTTTGGTACCGTCAG ATGCAAAGTGCCTGGGACAGAAGTGGGGCTCCGCTGGCGCCCAGCTCCAAAACCCAGGCAGCGTGGAAAA GACTAGACAGGGAAGGGGTTAGCCCTCAGAATTACACGCGGGTTTGCCTTACCAGACTACCACCACTGGC ACAACCTCAGACCCACACCCAACCGACTTTACCTCCCAGGCCCTGATTAATCTCGCCCGGAAGTACCGCC CACCCATGCTCACTTCCGCTATCCCGTACTTCTGCTCATCTCGCGAGAACTGAAAGCGCCTATGTGACCT GCGCTAAGCGGAAGTTGGCCCTCTTTTCCGTGGCGCCTCGGAGGCGTTCAGCTGCTTCAAGATGAAGGTA GGTGATGGTGGCGAGTGTTAGACTGGGTTTGGGGAACGTGAATCGAGTCCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPS6_1 ↗ | 9:19,380,236 | 負股 | 19,380,226–19,380,285 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR9_99NM8 · promoter · 19374961–19375461 · regulatory
ENSR9_99NMD · enhancer · 19375462–19375815 · regulatory
ENSR9_B5SST · promoter · 19380188–19380726 · regulatory
· motif · 19375374–19375386 · motif
· motif · 19377529–19377544 · motif
· motif · 19377529–19377544 · motif
· motif · 19377880–19377895 · motif
· motif · 19378349–19378358 · motif
· motif · 19378938–19378946 · motif
· motif · 19379817–19379828 · motif
· motif · 19379948–19379964 · motif
· motif · 19380206–19380228 · motif
· motif · 19380206–19380228 · motif
· motif · 19380241–19380250 · motif
· motif · 19380241–19380252 · motif
· motif · 19380241–19380252 · motif
· motif · 19380241–19380254 · motif
· motif · 19380303–19380316 · motif
· motif · 19380305–19380316 · motif
· motif · 19380305–19380316 · motif
· motif · 19380307–19380316 · motif
· motif · 19380319–19380332 · motif
· motif · 19380332–19380341 · motif
· motif · 19380332–19380343 · motif
· motif · 19380332–19380343 · motif
· motif · 19380659–19380669 · motif
· motif · 19380680–19380691 · motif
· motif · 19381642–19381664 · motif
· motif · 19381642–19381664 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：249 aa
ribosomal protein S6 長 249 個胺基酸，屬於真核生物核糖體蛋白 eS6 家族。序列第 217 至 249 位被註記為無序區；此區域註解依據 MobiDB-lite。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ribosomal protein S6 的定位記錄包括細胞質，以及細胞核中的核仁。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- NCBP1Q09161 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NPM1P06748 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PASKQ96RG2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NP0DTC9 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
RPS6 的產物是小型核糖體次單元的組成部分，也屬於 SSU processome。該加工體由 70 多種蛋白質及 RNA 伴護分子小核仁 RNA（snoRNA）U3 組成；來源支持其複合體成員身分，未提供與個別分子的直接結合資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ribosomal protein S6 是 40S 小型核糖體次單元的組成蛋白，並透過選擇性翻譯特定類別的 mRNA，參與細胞生長與增殖的調控。它也是小型次單元加工體（SSU processome）的一員；該加工體是小型真核核糖體次單元的第一個前驅結構。在核仁組裝時，多種核糖體生成因子、RNA 伴護蛋白與核糖體蛋白會共同處理新生 pre-rRNA，包括摺疊、修飾、重排、切割，以及由 RNA 外切體進行標的性降解。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the 40S small ribosomal subunit. Plays an important role in controlling cell growth and proliferation through the selective translation of particular classes of mRNA. Part of the small subunit (SSU) processome, first precursor of the small eukaryotic ribosomal subunit. During the assembly of the SSU processome in the nucleolus, many ribosome biogenesis factors, an RNA chaperone and ribosomal proteins associate with the nascent pre-rRNA and work in concert to generate RNA folding, modifications, rearrangements and cleavage as well as targeted degradation of pre-ribosomal RNA by the RNA exosome PMID 17220279 ↗ · PMID 23636399 ↗ · PMID 34516797 ↗ · PMID 8706699 ↗ |
| 交互作用 | ribosomal protein S6 是小型核糖體次單元的組成成員，也屬於 SSU processome。此加工體由 70 多種蛋白質及 RNA 伴護分子小核仁 RNA（snoRNA）U3 組成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the small ribosomal subunit. Part of the small subunit (SSU) processome, composed of more than 70 proteins and the RNA chaperone small nucleolar RNA (snoRNA) U3 PMID 23636399 ↗ · PMID 34516797 ↗ |
| 細胞定位 | ribosomal protein S6 的定位記錄包括細胞質，以及細胞核中的核仁。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTCTTTTCCGTGGCGCCTCGGAGGCGTTCAGCTGCTTCAA40GATGAAGCTGAACATCTCCTTCCCAGCCACTGGCTGCCAG80AAACTCATTGAAGTGGACGATGAACGCAAACTTCGTACTT120TCTATGAGAAGCGTATGGCCACAGAAGTTGCTGCTGACGC160TCTGGGTGAAGAATGGAAGGGTTATGTGGTCCGAATCAGT200GGTGGGAACGACAAACAAGGTTTCCCCATGAAGCAGGGTG240TCTTGACCCATGGCCGTGTCCGCCTGCTACTGAGTAAGGG280GCATTCCTGTTACAGACCAAGGAGAACTGGAGAAAGAAAG320AGAAAATCAGTTCGTGGTTGCATTGTGGATGCAAATCTGA360GCGTTCTCAACTTGGTTATTGTAAAAAAAGGAGAGAAGGA400TATTCCTGGACTGACTGATACTACAGTGCCTCGCCGCCTG440GGCCCCAAAAGAGCTAGCAGAATCCGCAAACTTTTCAATC480TCTCTAAAGAAGATGATGTCCGCCAGTATGTTGTAAGAAA520GCCCTTAAATAAAGAAGGTAAGAAACCTAGGACCAAAGCA560CCCAAGATTCAGCGTCTTGTTACTCCACGTGTCCTGCAGC600ACAAACGGCGGCGTATTGCTCTGAAGAAGCAGCGTACCAA640GAAAAATAAAGAAGAGGCTGCAGAATATGCTAAACTTTTG680GCCAAGAGAATGAAGGAGGCTAAGGAGAAGCGCCAGGAAC720AAATTGCGAAGAGACGCAGACTTTCCTCTCTGCGAGCTTC760TACTTCTAAGTCTGAATCCAGTCAGAAATAAGATTTTTTG800AGTAACAAATAAATAAGATCAGACTCTGATCTCTGTTGAC840TTTTCATTGCTGATAGAAAACTACATAAATGAAGAGAGGG880AAAGTTAGGTCATAGAAAATGGGGATATGTATATATGGTA920TTCCAATGGTGGATAAAGTCAGACCTATTGTGTGTGGTAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。