演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPS3FLJ26283

ribosomal protein S3

RPS3 編碼 ribosomal protein S3,是小型核糖體次單元的組成蛋白;來源亦記載其參與 DNA 修復、轉錄調控及細胞凋亡等作用。

Homo sapiens11q13.4UniProt P23396
OFFICIAL SYMBOL
RPS3
CHROMOSOME
11
UNIPROT
P23396
PDB / ALPHAFOLD
22TU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPS3 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 ribosomal protein S3。其產物屬於 universal ribosomal protein uS3 家族,並構成小型核糖體次單元。核糖體是由 RNA 與蛋白質組成的大型核糖核蛋白複合體,負責細胞內蛋白質合成;RPS3 因此具有核糖體成員的基本身分。除核糖體角色外,來源也記載此蛋白質具有多種非核糖體相關功能,包括參與 DNA 修復、轉錄調控、細胞週期相關事件及細胞凋亡。其蛋白質序列包含 KH type-2 結構域,另有一段被註記為無序區域。這些資訊描述其家族歸屬、組成身分與序列特徵;各項細胞作用及其條件另於功能段落說明。

Official symbol
RPS3
Gene name
ribosomal protein S3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10420
UniProt
P23396
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FLJ26283FLJ27450MGC87870S3uS3

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q13.4
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegRPS3pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr11:75,394,327–75,422,304
Gene span
27,978 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000531188 ★75,399,518–75,406,9077
ENST0000094308575,394,327–75,405,6908
ENST0000053016475,399,490–75,403,9454
ENST0000027857275,399,490–75,405,6887
ENST0000053444075,399,490–75,405,6806
ENST0000052744675,399,490–75,422,2807
ENST0000052660875,399,490–75,404,8686
ENST0000052485175,399,490–75,404,9946
ENST0000086214975,399,490–75,405,6827
ENST0000086215075,399,490–75,405,6827
ENST0000092239475,399,490–75,415,3167
ENST0000092239575,399,490–75,414,6517

顯示 12/78 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RPS3 除了構成小型核糖體次單元,也被報告具有內切核酸酶活性,參與受損 DNA 的修復。它可廣泛切割含有改變鹼基的 DNA 磷酸二酯鍵,且對超螺旋 DNA 的切割效率高於鬆弛型 DNA。RPS3 對常見氧化損傷 8-oxoG 有高結合親和力;另有研究指出,它對完整 DNA 與受損 DNA 的結合親和力相近。這些結果呈現其與 DNA 的多種作用特性,不能簡化為只辨識受損 DNA。

在鹼基切除修復相關反應中,RPS3 可刺激 OGG1 的 N-糖基化酶活性,並增強 UNG1 的尿嘧啶切除活性;它也會促進 APEX1 切割 DNA 磷酸二酯骨架。若 RPS3 位於粒線體,來源記載其可降低細胞 ROS 水平與粒線體 DNA 損傷;然而,在暴露於過氧化氫的細胞中,也有其負向調節 DNA 修復的報告,顯示作用方向與條件相關。

RPS3 也參與轉錄調控。作為 NF-kappa-B p65-p50 複合體的一員,它可結合 RELA/p65,增強該複合體與 DNA 的結合並促進標的基因轉錄。此外,RPS3 結合自身的 cognate mRNA,會抑制自身翻譯;它也可結合 TP53/p53,保護其免於 MDM2 介導的泛素化。

在有絲分裂期間,RPS3 透過調節微管聚合參與紡錘體形成與染色體移動。來源亦記載其參與細胞凋亡:它可促進 CASP8 活化;在神經元中,RPS3 與 E2F1 互作並協同提高促凋亡蛋白 BCL2L11/BIM 與 HRK/Dp5 的表現。受到紫外線照射後,RPS3 與 TRADD 互作,並經由 caspase 依賴的 JNK 活化誘導凋亡。這些功能分別涉及 DNA 處理、轉錄、細胞分裂與細胞命運,並依其所在細胞環境或刺激而呈現不同作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 75399518 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPS3 ENST00000531188 GRCh38 chr11:75398518-75399618 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCAGCTACTCAGGAGGCCAAGGCAGAAGAATCACTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGGGAGCTGAGA
TCGTACTACTGCACTCCAGCTTGGGCAACCGGAGAGAAAAGAAAGAAAGGAGAGAAAGAGAGAGAGAAAG
AGAGAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGGCGGGCCCATGGGACCTTCTGGGACTTCTGTTACAAATT
GTAATGGACTTGATGAAAGTAAGGTGGGGTAAATGAGAACAACATAAAGGACACAGAACGCAGTCCCTAG
GACACTTAGTAAGTATCAGGTTTTATTATTATCATTTGGAATGGAGGAAATGGGTACAGACTGGGGGACA
TGAGTTGTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTGGTCCAGGCTAGAGT
GCAGTGGTAGGATCTTGGCCCACTGCAACCTCCATCTCCCAGGTCCAAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTC
CCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCCCGACACCACTCCCAGCTAATTTTTCTATTTTTAGTAGAGACGGGG
TTTCACCATGTTCGCCAGGCTAATCTCGAACTCCTGACCTCAAGTAATCCGCCCGCCTTGGCCTCCCAAA
GAGGAGTCTTAAATGAGTTTCACTGAGGGATTTCAGCAGATTTTCATTACAGTGTCCACCCTGAAAGTGT
AGGGGCCAGAGTTCCACGCTGGTTAATCTCTCTTGCTGTGTGAACTTATACCTGTAATTTCCACCTCTGC
ACCTCACATTGCTTGTTTTGAAACTATGAGAATTGAACTCTAAGGTCCCCTGAAGTTTAGAAGTCCTGCT
GGATGAAGCCCCTTTCCTGTTCCTGCCTACATTCTTCTTTCCCTGGACGCCTTACTTACGTAAAAACTAC
ATTTCCCATGAGCACCCACAGGCGTGCACGCAGCGCAGCCCTCCGTCGTCGCTCGCGCCCTTTATACTCA
CTTCCGCCCGCGAGCCACTTCCTTTCCTTTCAGCGGAGCGCGGCGGCAAGATGGCAGTGCAAATATCCAA
GAAGAGGAAGGTGAGCCTCTGGGGACTGGGTTCGGAGAACGACGGCGCCGC
RPS3 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPS3_1 ↗11:75,399,519正股75,399,470–75,399,529

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_BJZ2G · promoter · 75399028–75399553 · regulatory

ENSR11_C9H2B · enhancer · 75399554–75401443 · regulatory

ENSR11_934X43 · enhancer · 75403120–75403385 · regulatory

ENSR11_76FPCN · enhancer · 75404388–75404511 · regulatory

· motif · 75396027–75396036 · motif

· motif · 75396027–75396036 · motif

· motif · 75399254–75399269 · motif

· motif · 75399254–75399269 · motif

· motif · 75399496–75399505 · motif

· motif · 75399496–75399507 · motif

· motif · 75399566–75399579 · motif

· motif · 75399581–75399594 · motif

· motif · 75399581–75399594 · motif

· motif · 75401628–75401639 · motif

· motif · 75403031–75403042 · motif

· motif · 75403274–75403282 · motif

· motif · 75403278–75403289 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:243 aa

1 aa243 aa結構域功能區域
依 P23396 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

RPS3 蛋白質長 243 個胺基酸,屬於 universal ribosomal protein uS3 家族。序列第 21–92 位註記有 KH type-2 結構域;第 214–243 位則被標示為無序區域。

結構域KH type-221–92 aa
功能區域Disordered214–243 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 22TU…

PDB · 22TU

EM · 3.00 A · SD=1-243

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus;Nucleus, nucleolus;Mitochondrion inner membrane;Cytoplasm, cytoskeleton, spindle

RPS3 在正常細胞主要位於細胞質,少量位於細胞核;在發生凋亡的細胞中可轉移至細胞核,過氧化氫等 DNA 損傷因子也會誘發核轉位。 ROS 增加時,RPS3 會在粒線體累積;有絲分裂期間則定位於紡錘體,亦可見於含未翻譯 mRNA 的細胞質 mRNP 顆粒。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 14 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FLJ26283RPS3CSNK2A1HTTIKBKBLRRK2LTV1MDM2NEDD8NFKB1NFKBIAPPIDRELARPS10TP53YWHAZ
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 14 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RPS3 是 40S 小型核糖體次單元的組成部分,也曾被辨識於含未翻譯 mRNA 的 IGF2BP1 依賴性 mRNP 顆粒複合體。它與 OGG1、UNG、APEX1 等鹼基切除修復蛋白互作;其中與 OGG1、UNG 的互作分別增強其所述酶活性。RPS3 也與 RELA 結合並提高 NF-kappa-B p65-p50 複合體的 DNA 結合活性。其他互作包括 HNRPD、PRMT1、SUMO1、UBC9、CDK1、PRKCD、PKB/AKT、E2F1、HSP90、TOM70、NFKBIA、IKKB、MDM2、TP53 與 TRADD;部分互作伴隨 RPS3 的甲基化、SUMO 化或磷酸化,或影響其穩定性與轉位。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RPS3 是小型核糖體次單元的組成蛋白,並具有內切核酸酶活性,參與受損 DNA 修復;可廣泛切割含改變鹼基的 DNA,且較有效切割超螺旋 DNA。它對 8-oxoG 有高親和力,但也能以相近親和力結合完整與受損 DNA。RPS3 可刺激 OGG1、UNG1 與 APEX1 的相關活性;位於粒線體時可降低 ROS 與粒線體 DNA 損傷,但在過氧化氫暴露細胞中曾被報告負向調節 DNA 修復。它亦參與 NF-kappa-B 轉錄調控、自身翻譯抑制、TP53 保護、有絲分裂及凋亡相關作用。含實驗來源
證據與來源

Component of the small ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell. Has endonuclease activity and plays a role in repair of damaged DNA. Cleaves phosphodiester bonds of DNAs containing altered bases with broad specificity and cleaves supercoiled DNA more efficiently than relaxed DNA. Displays high binding affinity for 7,8-dihydro-8-oxoguanine (8-oxoG), a common DNA lesion caused by reactive oxygen species (ROS). Has also been shown to bind with similar affinity to intact and damaged DNA. Stimulates the N-glycosylase activity of the base excision protein OGG1. Enhances the uracil excision activity of UNG1. Also stimulates the cleavage of the phosphodiester backbone by APEX1. When located in the mitochondrion, reduces cellular ROS levels and mitochondrial DNA damage. Has also been shown to negatively regulate DNA repair in cells exposed to hydrogen peroxide. Plays a role in regulating transcription as part of the NF-kappa-B p65-p50 complex where it binds to the RELA/p65 subunit, enhances binding of the complex to DNA and promotes transcription of target genes. Represses its own translation by binding to its cognate mRNA. Binds to and protects TP53/p53 from MDM2-mediated ubiquitination. Involved in spindle formation and chromosome movement during mitosis by regulating microtubule polymerization. Involved in induction of apoptosis through its role in activation of CASP8. Induces neuronal apoptosis by interacting with the E2F1 transcription factor and acting synergistically with it to up-regulate pro-apoptotic proteins BCL2L11/BIM and HRK/Dp5. Interacts with TRADD following exposure to UV radiation and induces apoptosis by caspase-dependent JNK activation

PMID 14706345 ↗ · PMID 14988002 ↗ · PMID 15518571 ↗ · PMID 15707971 ↗ · PMID 17049931 ↗ · PMID 18045535 ↗ · PMID 18610840 ↗ · PMID 18973764 ↗ · PMID 19656744 ↗ · PMID 20217897 ↗ · PMID 20605787 ↗ · PMID 22510408 ↗ · PMID 23131551 ↗ · PMID 23636399 ↗ · PMID 23911537 ↗ · PMID 7775413 ↗ · PMID 8706699 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性2'-deoxyribonucleotide-(2'-deoxyribose 5'-phosphate)-2'-deoxyribonucleotide-DNA = a 3'-end 2'-deoxyribonucleotide-(2,3-dehydro-2,3-deoxyribose 5'-phosphate)-DNA + a 5'-end 5'-phospho-2'-deoxyribonucleoside-DNA + H(+)含實驗來源
證據與來源

2'-deoxyribonucleotide-(2'-deoxyribose 5'-phosphate)-2'-deoxyribonucleotide-DNA = a 3'-end 2'-deoxyribonucleotide-(2,3-dehydro-2,3-deoxyribose 5'-phosphate)-DNA + a 5'-end 5'-phospho-2'-deoxyribonucleoside-DNA + H(+)

PMID 7775413 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RPS3 是 40S 小型核糖體次單元成員,也出現在含未翻譯 mRNA 的 IGF2BP1 依賴性 mRNP 顆粒及 HCV IRES 介導的翻譯複合體中。來源記載它與多種蛋白質互作;部分互作會促成 RPS3 甲基化、SUMO 化或磷酸化,並可能影響其穩定性、定位或轉錄作用。RPS3 與 OGG1、UNG 的互作分別提高相關切除活性;與 RELA 的互作增強 NF-kappa-B p65-p50 複合體 DNA 結合。它也與 E2F1、TP53、MDM2、TRADD 等互作,涉及來源所述的轉錄、泛素化或凋亡關係;部分效應具有明確條件,例如 E2F1 互作發生於缺乏神經生長因子時。含實驗來源
證據與來源

Component of the 40S small ribosomal subunit. Identified in a IGF2BP1-dependent mRNP granule complex containing untranslated mRNAs. Interacts with HNRPD. Interacts with PRMT1; the interaction methylates RPS3. Interacts with SUMO1; the interaction sumoylates RPS3. Interacts with UBC9. Interacts with CDK1; the interaction phosphorylates RPS3. Interacts with PRKCD; the interaction phosphorylates RPS3. Interacts with PKB/AKT; the interaction phosphorylates RPS3. Interacts with E2F1; the interaction occurs in the absence of nerve growth factor and increases transcription of pro-apoptotic proteins BCL2L11/BIM and HRK/Dp5. Interacts with the base excision repair proteins APEX1 and OGG1; interaction with OGG1 increases OGG1 N-glycosylase activity. Interacts with UNG; the interaction increases the uracil excision activity of UNG1. Interacts with HSP90; the interaction prevents the ubiquitination and proteasome-dependent degradation of RPS3 and is suppressed by increased ROS levels. Interacts with TOM70; the interaction promotes translocation of RPS3 to the mitochondrion. Interacts (via N-terminus) with RELA (via N-terminus); the interaction enhances the DNA-binding activity of the NF-kappa-B p65-p50 complex. Interacts with NFKBIA; the interaction is direct and may bridge the interaction between RPS3 and RELA. Interacts with IKKB; the interaction phosphorylates RPS3 and enhances its translocation to the nucleus. Interacts (via KH domain) with MDM2 and TP53. Interacts with TRADD. Interacts (via N-terminus) with E.coli O157:H7 (strain EDL933) nleH1 and nleH2; the interaction with nleH1 inhibits phosphorylation by IKKB, reduces RPS3 nuclear abundance and inhibits transcriptional activation by the NF-kappa-B p65-p50 complex. Interacts with ASCC3. Identified in a HCV IRES-mediated translation complex, at least composed of EIF3C, IGF2BP1, RPS3 and HCV RNA-replicon. Interacts with CRY1 (By similarity). Interacts (when monoubiquitinated at Lys-214) with RIOK3

PMID 15518571 ↗ · PMID 16314389 ↗ · PMID 17289661 ↗ · PMID 18045535 ↗ · PMID 18973764 ↗ · PMID 19059439 ↗ · PMID 19460357 ↗ · PMID 19541769 ↗ · PMID 19656744 ↗ · PMID 20041225 ↗ · PMID 20605787 ↗ · PMID 21399639 ↗ · PMID 21871177 ↗ · PMID 21968017 ↗ · PMID 22510408 ↗ · PMID 23636399 ↗ · PMID 23911537 ↗ · PMID 24423872 ↗ · PMID 24457201 ↗ · PMID 28757607 ↗ · PMID 39947182 ↗ · PMID 39947183 ↗ · PMID 8706699 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RPS3 在正常細胞主要位於細胞質,少量存在於細胞核;在發生凋亡的細胞中可轉位至細胞核,過氧化氫等 DNA 損傷因子也會誘發核轉位。ROS 增加時,RPS3 會在粒線體累積;有絲分裂期間可定位於紡錘體,並可出現在含未翻譯 mRNA 的細胞質 mRNP 顆粒。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus; Nucleus, nucleolus; Mitochondrion inner membrane / Peripheral membrane protein; Cytoplasm, cytoskeleton, spindle; In normal cells, located mainly in the cytoplasm with small amounts in the nucleus but translocates to the nucleus in cells undergoing apoptosis (By similarity). Nuclear translocation is induced by DNA damaging agents such as hydrogen peroxide. Accumulates in the mitochondrion in response to increased ROS levels. Localizes to the spindle during mitosis. Localized in cytoplasmic mRNP granules containing untranslated mRNAs

PMID 16314389 ↗ · PMID 17289661 ↗ · PMID 17560175 ↗ · PMID 18045535 ↗ · PMID 20217897 ↗ · PMID 21871177 ↗ · PMID 23636399 ↗ · PMID 19460357 ↗ · PMID 23911537 ↗ · PMID 23131551 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000531188 · 2,059 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCTTTCCTTTCAGCGGAGCGCGGCGGCAAGATGGCAGTGC40
41AAATATCCAAGAAGAGGAAGTTTGTCGCTGATGGCATCTT80
81CAAAGCTGAACTGAATGAGTTTCTTACTCGGGAGCTGGCT120
121GAAGATGGCTACTCTGGAGTTGAGGTGCGAGTTACACCAA160
161CCAGGACAGAAATCATTATCTTAGCCACCAGAACACAGAA200
201TGTTCTTGGTGAGAAGGGCCGGCGGATTCGGGAACTGACT240
241GCTGTAGTTCAGAAGAGGTTTGGCTTTCCAGAGGGCAGTG280
281TAGAGCTTTATGCTGAAAAGGTGGCCACTAGAGGTCTGTG320
321TGCCATTGCCCAGGCAGAGTCTCTGCGTTACAAACTCCTA360
361GGAGGGCTTGCTGTGCGGAGGGCCTGCTATGGTGTGCTGC400
401GGTTCATCATGGAGAGTGGGGCCAAAGGCTGCGAGGTTGT440
441GGTGTCTGGGAAACTCCGAGGACAGAGGGCTAAATCCATG480
481AAGTTTGTGGATGGCCTGATGATCCACAGCGGAGACCCTG520
521TTAACTACTACGTTGACACTGCTGTGCGCCACGTGTTGCT560
561CAGACAGGGTGTGCTGGGCATCAAGGTGAAGATCATGCTG600
601CCCTGGGACCCAACTGGTAAGATTGGCCCTAAGAAGCCCC640
641TGCCTGACCACGTGAGCATTGTGGAACCCAAAGATGAGAT680
681ACTGCCCACCACCCCCATCTCAGAACAGAAGGGTGGGAAG720
721CCAGAGCCGCCTGCCATGCCCCAGCCAGTCCCCACAGCAT760
761AACAGGGTCTCCTTGGCAGCTGTATTCTGGAGTCTGGATG800
801TTGCTCTCTAAAGACCTTTAATAAAATTTTGTACAAAGAC840
841ACAAGGTCTGACTAGACTGTTCAGTATTCAGACTGAGGGG880
881CATGTTGGCCTCTGGAGCATTACATATCTTCTTGGTTTTA920
921ACCATACTTGTGGTATTTGCAAGGGCCAGAACAGTAAGAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。