演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPS26S26

ribosomal protein S26

RPS26 編碼核糖體小次單位蛋白質,是 40S 小次單位的組成成分;核糖體負責細胞內蛋白質合成。

Homo sapiens12q13.2UniProt P62854
OFFICIAL SYMBOL
RPS26
CHROMOSOME
12
UNIPROT
P62854
PDB / ALPHAFOLD
22TU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPS26 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 ribosomal protein S26。其產物屬於真核生物核糖體蛋白 eS26 家族,並是核糖體小次單位的組成成分。此蛋白質長 115 個胺基酸;序列註解指出其第 85 至 115 個胺基酸區域為無序區。核糖體是由 RNA 與蛋白質組成的大型核糖核蛋白複合體,負責細胞內蛋白質合成。

Official symbol
RPS26
Gene name
ribosomal protein S26
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10414
UniProt
P62854
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
S26eS26

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1212q13.2
chr12 · 133,275,309 bp · GRCh38chr12p13.33 · 1–3200000 · gnegchr12p13.32 · 3200001–5300000 · gpos25chr12p13.31 · 5300001–10000000 · gnegchr12p13.2 · 10000001–12600000 · gpos75chr12p13.1 · 12600001–14600000 · gnegchr12p12.3 · 14600001–19800000 · gpos100chr12p12.2 · 19800001–21100000 · gnegchr12p12.1 · 21100001–26300000 · gpos100chr12p11.23 · 26300001–27600000 · gnegchr12p11.22 · 27600001–30500000 · gpos50chr12p11.21 · 30500001–33200000 · gnegchr12p11.1 · 33200001–35500000 · acenchr12q11 · 35500001–37800000 · acenchr12q12 · 37800001–46000000 · gpos100chr12q13.11 · 46000001–48700000 · gnegchr12q13.12 · 48700001–51100000 · gpos25chr12q13.13 · 51100001–54500000 · gnegchr12q13.2 · 54500001–56200000 · gpos25chr12q13.3 · 56200001–57700000 · gnegchr12q14.1 · 57700001–62700000 · gpos75chr12q14.2 · 62700001–64700000 · gnegchr12q14.3 · 64700001–67300000 · gpos50chr12q15 · 67300001–71100000 · gnegchr12q21.1 · 71100001–75300000 · gpos75chr12q21.2 · 75300001–79900000 · gnegchr12q21.31 · 79900001–86300000 · gpos100chr12q21.32 · 86300001–88600000 · gnegchr12q21.33 · 88600001–92200000 · gpos100chr12q22 · 92200001–95800000 · gnegchr12q23.1 · 95800001–101200000 · gpos75chr12q23.2 · 101200001–103500000 · gnegchr12q23.3 · 103500001–108600000 · gpos50chr12q24.11 · 108600001–111300000 · gnegchr12q24.12 · 111300001–111900000 · gpos25chr12q24.13 · 111900001–113900000 · gnegchr12q24.21 · 113900001–116400000 · gpos50chr12q24.22 · 116400001–117700000 · gnegchr12q24.23 · 117700001–120300000 · gpos50chr12q24.31 · 120300001–125400000 · gnegchr12q24.32 · 125400001–128700000 · gpos50chr12q24.33 · 128700001–133275309 · gnegRPS26pq1 bp133,275,309 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr12:56,041,351–56,044,697
Gene span
3,347 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000646449 ★56,041,918–56,044,6974
ENST0000035646456,041,351–56,044,6975
ENST0000092548656,041,808–56,044,6974
ENST0000109799656,041,808–56,044,6973
ENST0000109799856,041,808–56,043,8253
ENST0000055236156,041,881–56,044,6975

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RPS26 的產物是核糖體小次單位的組成成分。核糖體由 RNA 與蛋白質構成,是細胞合成蛋白質所需的大型核糖核蛋白複合體;因此,RPS26 蛋白質的來源支持角色,是作為這個蛋白質合成複合體的一部分。

現有資料未提供 RPS26 在核糖體中的具體分子作用方式,也未說明它如何影響翻譯的特定步驟或其他生物學過程。因此,能確定的功能範圍限於其小次單位組成成分身分,以及核糖體作為整體負責細胞蛋白質合成的角色。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 56041918 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPS26 ENST00000646449 GRCh38 chr12:56040918-56042018 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTAAAATAGAGAACAGAAAGATTAAGTAAAAATAAAGAATAGAACATACCAGCACACCTATGACAAGGGT
AAGTATCGTTTCATAAAGCTTGTGTTTCAGTTTTGCATGTGCATGTAATCGTGTTTGTGTGTGTACTGGG
TACCAATGTAAAATGTATTCGTGCTATGAATCTGGGTGAAAAACGTTTAAGTCATTAGTCCAGGCTATTC
CTCCATCCATTTGTTAGGTGACATACAGCATAGTACAGCGGAGCCAGAATACCTACTGCACGTCAGTTCT
TCAATCTTTTTTTTTAATTGATTTATTTATTTTTGAGACAGAGTTTCGATCTTTTTACCCAGGCTAGAGT
GCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGGAAACTCCGCCTCCCAGGTTCAAGATTCTCCTGTCTTAGCCTCCT
GAGTACCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCAGGCCGGGCTAAATTCTTCAATCTTTAAAGTGAGGATAAT
AATAGTAGCTACCTATAGGCTTGCTCAAAGTTAAATGAGTTAATATTTATAAAGACGCTTACCACAGGGC
CAGGCACTGTGCCAGAGATAAAAAGATGAATGAGAAATAGCCCCAGCCTCAATGCACTTCATTGTGGGAT
TTTCTCCATATTGGAAGGAGGGATTCACAAAATGCTTGTTTCCTCTCAGGCCTTCCTCTTCGTAATCCTA
CACCTACCTAGTAGAAGGACTGTCAGAGAAATGAGCCCAGGGCGTCCCCCGGTGGCGCAGCGCCGCCTTC
GGTCTAAGCACTTGGGGCAGGGGGGAAGGGGGGGAGGGGGGAGCCTCTTGGCTTCGCACTACAATTCCCA
CCAAGCATCTGTCCCTCTCTGGCCTCTAATAACGAGTGCGCCTTGTGGTCCAGCGTCTGGCAACTTTCAC
GCCTAGCGTCGCGTATACCGGAAAACTGCATCGTCCAGAATTGCTTCCGAGTCGGCGCGGCGCAAGGCTT
GCTGGGAGACACATAACCTCGATTTTCTTCCGCCATCCGGCTAAATAGTCCCATGTGCACTTTGTTCCAT
GGATAAATAAACACTAGGAACGCATTTCCACCCTAGATTTCAGCAGAAATG
RPS26 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPS26_1 ↗12:56,042,143正股56,042,094–56,042,153

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR12_9S8KL · promoter · 56040983–56041361 · regulatory

ENSR12_83MH6D · enhancer · 56041362–56041554 · regulatory

ENSR12_9S8KR · promoter · 56041555–56041928 · regulatory

ENSR12_5H6WC6 · CTCF_binding_site · 56041656–56041677 · regulatory

ENSR12_BF5BG · enhancer · 56045331–56045902 · regulatory

ENSR12_C7K6B · enhancer · 56046007–56047598 · regulatory

· motif · 56038199–56038214 · motif

· motif · 56038200–56038214 · motif

· motif · 56038201–56038214 · motif

· motif · 56038208–56038221 · motif

· motif · 56038420–56038435 · motif

· motif · 56038425–56038437 · motif

· motif · 56041243–56041257 · motif

· motif · 56041658–56041674 · motif

· motif · 56041717–56041727 · motif

· motif · 56041751–56041762 · motif

· motif · 56041793–56041808 · motif

· motif · 56041820–56041832 · motif

· motif · 56041922–56041933 · motif

· motif · 56041951–56041966 · motif

· motif · 56041952–56041966 · motif

· motif · 56042189–56042199 · motif

· motif · 56042291–56042308 · motif

· motif · 56042347–56042362 · motif

· motif · 56043408–56043417 · motif

· motif · 56043408–56043417 · motif

· motif · 56045107–56045122 · motif

· motif · 56045107–56045122 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:115 aa

1 aa115 aa功能區域
依 P62854 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

RPS26 蛋白質長 115 個胺基酸,屬於真核生物核糖體蛋白 eS26 家族。序列註解將第 85 至 115 個胺基酸標示為無序區;來源未提供其他結構域或功能區域資訊。

功能區域Disordered85–115 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 22TU…

PDB · 22TU

EM · 3.00 A · Sa=1-115

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytosol;Cytoplasm;Rough endoplasmic reticulum

RPS26 蛋白質位於細胞質與細胞質溶膠,並曾在細胞質多核糖體中檢出。 來源亦指出,與粗糙內質網相關的核糖體中可檢出此蛋白質,但這項定位是依相似性推定。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
S26RPS26OTX2SDCBPTSR2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RPS26 是 40S 小次單位的組成成分;此資料支持其參與該核糖體複合體,未提供與特定蛋白質直接結合的資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

RPS26 與 Diamond-Blackfan anemia 10(DBA10)相關。此病為常染色體顯性遺傳的先天性、非再生性低增生性貧血,通常在嬰兒早期發病,特徵包括中度至重度大球性貧血、紅芽球減少及惡性腫瘤風險增加。約 30–40% 患者有身材矮小或先天異常,常見於顱顏、拇指及泌尿生殖系統。來源指出,影響此基因的變異會造成此病。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RPS26 是核糖體小次單位的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責細胞內蛋白質合成。含實驗來源
證據與來源

Component of the small ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell

PMID 23636399 ↗ · PMID 25901680 ↗ · PMID 25957688 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RPS26 是 40S 小次單位的組成成分。含實驗來源
證據與來源

Component of the 40S small ribosomal subunit

PMID 23636399 ↗ · PMID 25901680 ↗ · PMID 25957688 ↗

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細胞定位RPS26 位於細胞質與細胞質溶膠,並在細胞質多核糖體中檢出;依相似性推定,與粗糙內質網相關的核糖體也含有此蛋白質。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm, cytosol; Cytoplasm; Rough endoplasmic reticulum; Detected on cytosolic polysomes. Detected in ribosomes that are associated with the rough endoplasmic reticulum (By similarity)

PMID 25957688 ↗ · PMID 23636399 ↗ · PMID 25901680 ↗

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疾病關聯RPS26 相關變異可造成 Diamond-Blackfan anemia 10(DBA10),此常染色體顯性遺傳疾病通常於嬰兒早期出現,屬先天性非再生性低增生性貧血,具有中至重度大球性貧血、紅芽球減少及惡性腫瘤風險增加等特徵。約 30–40% 患者有身材矮小或先天異常,常見異常涉及顱顏、拇指及泌尿生殖系統。含實驗來源
證據與來源

Diamond-Blackfan anemia 10 DBA10 An autosomal dominant form of Diamond-Blackfan anemia, a congenital non-regenerative hypoplastic anemia that usually presents early in infancy. Diamond-Blackfan anemia is characterized by a moderate to severe macrocytic anemia, erythroblastopenia, and an increased risk of malignancy. 30 to 40% of Diamond-Blackfan anemia patients present with short stature and congenital anomalies, the most frequent being craniofacial (Pierre-Robin syndrome and cleft palate), thumb and urogenital anomalies. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 613309

PMID 20116044 ↗ · PMID 24942156 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000646449 · 1,140 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GATTTTCTTCCGCCATCCGGCTAAATAGTCCCATGTGCAC40
41TTTGTTCCATGGATAAATAAACACTAGGAACGCATTTCCA80
81CCCTAGATTTCAGCAGAAATGCTGAATGTAAAGGAATATT120
121TGAGTAAAGTGAGTTGCCGTTCTTGAAGCCCGTCTCCTAA160
161GGATTCTCCCGGTGTCCGCGTAGGGATCTCATGCTATATA200
201GGAGGGCCCTGCCAGGCACCGTCTCCTCTCTCCGGTCCGT240
241GCCTCCAAGATGACAAAGAAAAGAAGGAACAATGGTCGTG280
281CCAAAAAGGGCCGCGGCCACGTGCAGCCTATTCGCTGCAC320
321TAACTGTGCCCGATGCGTGCCCAAGGACAAGGCCATTAAG360
361AAATTCGTCATTCGAAACATAGTGGAGGCCGCAGCAGTCA400
401GGGACATTTCTGAAGCGAGCGTCTTCGATGCCTATGTGCT440
441TCCCAAGCTGTATGTGAAGCTACATTACTGTGTGAGTTGT480
481GCAATTCACAGCAAAGTAGTCAGGAATCGATCTCGTGAAG520
521CCCGCAAGGACCGAACACCCCCACCCCGATTTAGACCTGC560
561GGGTGCTGCCCCACGTCCCCCACCAAAGCCCATGTAAGGA600
601GCTGAGTTCTTAAAGACTGAAGACAGGCTATTCTCTGGAG640
641AAAAATAAAATGGAAATTGTACTTAATATTGCATGTTAAG680
681TGTATCTGTGCCAGATAAGGTGGGGATTTTGTGTGTTAGA720
721CCAAGTGTGAAGTGACACACATTATTTTCATGGGGAAGAA760
761AGCTTATTCATGTAATTTAATTTTTTTCTTTTTTTTTTTT800
801TTTTTTTTGAGACGGAGTCTTTGTCGCCCAAGCTGAATTG840
841CAGTGGCGTGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGTCTCCCG880
881GGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCTTCTTGAGTAGCTG920
921GGATTACAGGTGTCTGCCACCATGCCTGGTTAATTTTTGT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。