演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPS24S24

ribosomal protein S24

RPS24 編碼 ribosomal protein S24,屬於真核生物 eS24 家族,是小型核糖體次單元的組成蛋白,也參與 40S 次單元的生成。

Homo sapiens10q22.3UniProt P62847
OFFICIAL SYMBOL
RPS24
CHROMOSOME
10
UNIPROT
P62847
PDB / ALPHAFOLD
22TU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPS24 是蛋白質編碼基因,其產物 ribosomal protein S24 屬於真核生物核糖體蛋白 eS24 家族。它是小型核糖體次單元的組成成員;核糖體則是由 RNA 與蛋白質構成、負責細胞內蛋白質合成的大型核糖核蛋白複合體。RPS24 蛋白長 133 個胺基酸,序列第 92 至 133 位被註記為無序區域。這些資料界定了其家族歸屬、基本分子性質與在核糖體中的位置;其參與核糖體生成的具體作用,另於功能說明。

Official symbol
RPS24
Gene name
ribosomal protein S24
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10411
UniProt
P62847
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
S24eS24

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1010q22.3
chr10 · 133,797,422 bp · GRCh38chr10p15.3 · 1–3000000 · gnegchr10p15.2 · 3000001–3800000 · gpos25chr10p15.1 · 3800001–6600000 · gnegchr10p14 · 6600001–12200000 · gpos75chr10p13 · 12200001–17300000 · gnegchr10p12.33 · 17300001–18300000 · gpos75chr10p12.32 · 18300001–18400000 · gnegchr10p12.31 · 18400001–22300000 · gpos75chr10p12.2 · 22300001–24300000 · gnegchr10p12.1 · 24300001–29300000 · gpos50chr10p11.23 · 29300001–31100000 · gnegchr10p11.22 · 31100001–34200000 · gpos25chr10p11.21 · 34200001–38000000 · gnegchr10p11.1 · 38000001–39800000 · acenchr10q11.1 · 39800001–41600000 · acenchr10q11.21 · 41600001–45500000 · gnegchr10q11.22 · 45500001–48600000 · gpos25chr10q11.23 · 48600001–51100000 · gnegchr10q21.1 · 51100001–59400000 · gpos100chr10q21.2 · 59400001–62800000 · gnegchr10q21.3 · 62800001–68800000 · gpos100chr10q22.1 · 68800001–73100000 · gnegchr10q22.2 · 73100001–75900000 · gpos50chr10q22.3 · 75900001–80300000 · gnegchr10q23.1 · 80300001–86100000 · gpos100chr10q23.2 · 86100001–87700000 · gnegchr10q23.31 · 87700001–91100000 · gpos75chr10q23.32 · 91100001–92300000 · gnegchr10q23.33 · 92300001–95300000 · gpos50chr10q24.1 · 95300001–97500000 · gnegchr10q24.2 · 97500001–100100000 · gpos50chr10q24.31 · 100100001–101200000 · gnegchr10q24.32 · 101200001–103100000 · gpos25chr10q24.33 · 103100001–104000000 · gnegchr10q25.1 · 104000001–110100000 · gpos100chr10q25.2 · 110100001–113100000 · gnegchr10q25.3 · 113100001–117300000 · gpos75chr10q26.11 · 117300001–119900000 · gnegchr10q26.12 · 119900001–121400000 · gpos50chr10q26.13 · 121400001–125700000 · gnegchr10q26.2 · 125700001–128800000 · gpos50chr10q26.3 · 128800001–133797422 · gnegRPS24pq1 bp133,797,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr10:78,033,723–78,056,813
Gene span
23,091 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000372360 ★78,033,863–78,040,6976
ENST0000043527578,033,723–78,040,7136
ENST0000061386578,033,723–78,040,7165
ENST0000064544078,033,723–78,040,7017
ENST0000046471678,033,723–78,040,6968
ENST0000036083078,033,723–78,040,6977
ENST0000044069278,033,723–78,056,8135
ENST0000091344878,033,723–78,055,4807
ENST0000091344978,033,723–78,040,7036
ENST0000091345078,033,723–78,040,6986
ENST0000091345178,033,723–78,040,6976
ENST0000091345278,033,723–78,040,6977

顯示 12/43 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RPS24 的產物是小型核糖體次單元的組成蛋白。核糖體負責細胞內蛋白質合成,而 RPS24 也參與核糖體形成過程,不只存在於成熟核糖體中。

在核糖體生成期間,RPS24 是小型次單元過程體(small subunit processome,SSU processome)的一員。這個過程體是最早形成的真核生物小型核糖體次單元前驅結構;RPS24 對前體 rRNA(pre-rRNA)的加工,以及 40S 核糖體次單元的成熟皆為必需。

SSU processome 在核仁組裝時,多種核糖體生合成因子、RNA 伴護蛋白與核糖體蛋白會共同結合新生的 pre-rRNA,協同促成 RNA 摺疊、修飾、構形重排與切割。過程中也會透過 RNA exosome 對前核糖體 RNA 進行標的性降解。來源將 RPS24 列為此組裝過程的一員,但未進一步指明它在各項 RNA 處理步驟中的個別作用。

因此,RPS24 涉及小型核糖體次單元由前驅物形成與成熟的過程,並作為成熟小型次單元的成分參與核糖體功能。現有資料支持其在 pre-rRNA 加工及 40S 次單元成熟中的必要性,但沒有詳述其特定分子作用方式。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 78033863 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPS24 ENST00000372360 GRCh38 chr10:78032863-78033963 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCTGGTATCGAACTTCTGACCTCAGGTCATCTACCTGCTTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTATAGGCG
TGAGCCACTGCCCCTGGCTTCCAATTTTTTTTTCCTTTTTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTCTGAGAC
GGATTTTCGCTCCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATCTCGGCCCACTGCAACCTTTGCTTCC
CGGGTTCTGGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCACGCCCC
GCTAATTTTGTATTTTGTATTTATTTATTTATTTATTTTCGTAGATACGTGGTTTCGCCATGTTGGCCAG
GCTGGTATCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTTGCCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCG
TGGCCATCGCGCCCGGCCAAATATTTTTCAAAATCTAATTTTGCATAATGACCAAGATTTGCAGAAAAAT
ACAAATTAAAGAGATCTTTTAAAGTAAAGATTCGTCATAAAAGTCACAGAAATAATACTCATGAATAATA
AATTAGAATGGGCAATGTTAAGTACTTGAAATAACAAAGGTTTTAGAGTCAGGGTTTCTGCAGTTTCCCT
AGCCATATAACGAGGAGACTGTTAGAGAGGATATCCTAAAATGCTTTCCAAGTTTACCCACCTCTAACTC
GGAAGAAGGCAATTTAAACTAATTTGGTTTACCGGAATTCAAATACGTACAATTCAACATAATGAATTGA
ACTGAAATTGAACACCTGCTTGCGTAAACCTAGTCGGCTCGAGTTGTTCTGGTTCTGGATTGGTCAGTCT
AGAGTTCCAGGGGTGTGGCCAAAAGTCTGTGAGGCGGGGCCGTAGGCAGCCTAAATCAGGCATCGGCGCG
GTCAGCCTCGTGGCGCGCCCACGCCCCCACGCCGGCTCTTCCCGGGGTCCTTCCGTGCGCGTTGATATGA
TTGGCCGGCGAATCGTGGTTCTCTTTTCCTCCTTGGCTGTCTGAAGATAGATCGCCATCATGGTGAGTCT
CCCTGGGCCCGTGCAGTCATCTGCCGCGTATCCGAGCCATCCGTGGTCCCT
RPS24 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPS24_1 ↗10:78,033,863正股78,033,814–78,033,873

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR10_BKH4W · enhancer · 78028524–78029504 · regulatory

ENSR10_935Z83 · promoter · 78029505–78030005 · regulatory

ENSR10_5NCJKD · CTCF_binding_site · 78029641–78029664 · regulatory

ENSR10_5NCJLK · CTCF_binding_site · 78029899–78029920 · regulatory

ENSR10_BKH5K · promoter · 78033270–78033873 · regulatory

ENSR10_C9Q3S · enhancer · 78033874–78034948 · regulatory

ENSR10_5NCKCH · CTCF_binding_site · 78034201–78034222 · regulatory

ENSR10_849XM3 · enhancer · 78038221–78038403 · regulatory

· motif · 78029090–78029104 · motif

· motif · 78029230–78029242 · motif

· motif · 78029299–78029314 · motif

· motif · 78029302–78029314 · motif

· motif · 78029305–78029312 · motif

· motif · 78029306–78029319 · motif

· motif · 78029312–78029327 · motif

· motif · 78029386–78029395 · motif

· motif · 78029401–78029418 · motif

· motif · 78029543–78029552 · motif

· motif · 78029598–78029607 · motif

· motif · 78029598–78029609 · motif

· motif · 78029598–78029609 · motif

· motif · 78029619–78029639 · motif

· motif · 78029643–78029659 · motif

· motif · 78029645–78029661 · motif

· motif · 78029901–78029917 · motif

· motif · 78030255–78030266 · motif

· motif · 78033643–78033652 · motif

· motif · 78033733–78033746 · motif

· motif · 78033786–78033799 · motif

· motif · 78033792–78033805 · motif

· motif · 78033892–78033902 · motif

· motif · 78034203–78034219 · motif

· motif · 78034229–78034242 · motif

· motif · 78034332–78034341 · motif

· motif · 78034557–78034572 · motif

· motif · 78036283–78036296 · motif

· motif · 78036283–78036296 · motif

· motif · 78036524–78036539 · motif

· motif · 78036529–78036541 · motif

· motif · 78036532–78036539 · motif

· motif · 78036532–78036547 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:133 aa

1 aa133 aa功能區域
依 P62847 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ribosomal protein S24 長 133 個胺基酸,屬於真核生物核糖體蛋白 eS24 家族。其第 92 至 133 位胺基酸被註記為無序區域;來源未提供其他結構域或功能區域資訊。

功能區域Disordered92–133 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 22TU…

PDB · 22TU

EM · 3.00 A · SY=1-133

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus, nucleolus

RPS24 的定位記錄包括細胞質與細胞核核仁;來源未提供其定位變化條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
S24RPS24
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RPS24 是小型核糖體次單元的組成成員,也屬於 SSU processome。該過程體由 70 多種蛋白質及 RNA 伴護分子小核仁 RNA(snoRNA)U3 組成;來源未指出 RPS24 與其中哪些成員直接結合。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

RPS24 相關基因變異與 Diamond-Blackfan anemia 3(DBA3)有關;來源將該疾病描述為常在嬰兒早期發病的常染色體顯性先天性低增生性貧血。其特徵包括中度至重度大球性貧血、紅系母細胞減少,以及白血病風險增加。約 30% 至 40% 的患者有身材矮小或先天異常,常見於顱顏、拇指及泌尿生殖系統;顱顏異常包括 Pierre-Robin syndrome 與腭裂。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RPS24 是小型核糖體次單元的組成蛋白;核糖體是細胞內負責蛋白質合成的大型核糖核蛋白複合體。RPS24 也是 SSU processome 的成員,對 pre-rRNA 加工及 40S 次單元成熟為必需。該過程體是最早的小型真核核糖體次單元前驅物,組裝時多種因子、RNA 伴護蛋白與核糖體蛋白共同處理新生 pre-rRNA,促進其摺疊、修飾、重排、切割及標的性降解。含實驗來源
證據與來源

Component of the small ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell. Required for processing of pre-rRNA and maturation of 40S ribosomal subunits. Part of the small subunit (SSU) processome, first precursor of the small eukaryotic ribosomal subunit. During the assembly of the SSU processome in the nucleolus, many ribosome biogenesis factors, an RNA chaperone and ribosomal proteins associate with the nascent pre-rRNA and work in concert to generate RNA folding, modifications, rearrangements and cleavage as well as targeted degradation of pre-ribosomal RNA by the RNA exosome

PMID 18230666 ↗ · PMID 23636399 ↗ · PMID 34516797 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RPS24 是小型核糖體次單元的組成成員,也屬於 SSU processome。該過程體由 70 多種蛋白質及 RNA 伴護分子小核仁 RNA(snoRNA)U3 組成;資料未指明 RPS24 與其中個別成員的直接結合關係。含實驗來源
證據與來源

Component of the small ribosomal subunit. Part of the small subunit (SSU) processome, composed of more than 70 proteins and the RNA chaperone small nucleolar RNA (snoRNA) U3

PMID 23636399 ↗ · PMID 34516797 ↗

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細胞定位RPS24 的細胞定位記錄為細胞質及細胞核核仁。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus, nucleolus

PMID 23636399 ↗ · PMID 34516797 ↗

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疾病關聯影響 RPS24 基因的變異與 Diamond-Blackfan anemia 3(DBA3)相關,該病為常染色體顯性先天性低增生性貧血,通常在嬰兒早期發病。患者可有中度至重度大球性貧血、紅系母細胞減少及白血病風險增加;30% 至 40% 患者有身材矮小或先天異常,常見部位包括顱顏、拇指與泌尿生殖系統。含實驗來源
證據與來源

Diamond-Blackfan anemia 3 DBA3 An autosomal dominant form of Diamond-Blackfan anemia, a congenital non-regenerative hypoplastic anemia that usually presents early in infancy. Diamond-Blackfan anemia is characterized by a moderate to severe macrocytic anemia, erythroblastopenia, and an increased risk of developing leukemia. 30 to 40% of Diamond-Blackfan anemia patients present with short stature and congenital anomalies, the most frequent being craniofacial (Pierre-Robin syndrome and cleft palate), thumb and urogenital anomalies. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 610629

PMID 17186470 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000372360 · 534 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTCTTTTCCTCCTTGGCTGTCTGAAGATAGATCGCCATCA40
41TGAACGACACCGTAACTATCCGCACTAGAAAGTTCATGAC80
81CAACCGACTACTTCAGAGGAAACAAATGGTCATTGATGTC120
121CTTCACCCCGGGAAGGCGACAGTGCCTAAGACAGAAATTC160
161GGGAAAAACTAGCCAAAATGTACAAGACCACACCGGATGT200
201CATCTTTGTATTTGGATTCAGAACTCATTTTGGTGGTGGC240
241AAGACAACTGGCTTTGGCATGATTTATGATTCCCTGGATT280
281ATGCAAAGAAAAATGAACCCAAACATAGACTTGCAAGACA320
321TGGCCTGTATGAGAAGAAAAAGACCTCAAGAAAGCAACGA360
361AAGGAACGCAAGAACAGAATGAAGAAAGTCAGGGGGACTG400
401CAAAGGCCAATGTTGGTGCTGGCAAAAAGTGAGCTGGAGA440
441TTGGATCACAGCCGAAGGAGTAAAGGTGCTGCAATGATGT480
481TAGCTGTGGCCACTGTGGATTTTTCGCAAGAACATTAATA520
521AACTAAAAACTTCA534

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。