基因總覽
RPS18 是蛋白質編碼基因，其產物名稱為 ribosomal protein S18，屬於 universal ribosomal protein uS13 family。來源將此蛋白質描述為小型核糖體次單元的組成成分；核糖體則是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體。現有資料未提供其胺基酸序列、結構域或其他結構特色，因此不進一步推定。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000439602 ★ | 33,272,075–33,276,511 | 6 |
| ENST00000893314 | 33,271,730–33,276,509 | 6 |
| ENST00000940273 | 33,271,730–33,276,508 | 5 |
| ENST00000940274 | 33,271,730–33,276,507 | 5 |
| ENST00000940275 | 33,271,730–33,276,508 | 6 |
| ENST00000940276 | 33,271,730–33,276,507 | 4 |
| ENST00000978660 | 33,271,730–33,276,504 | 5 |
| ENST00001010371 | 33,271,730–33,276,509 | 6 |
| ENST00001010377 | 33,271,730–33,276,506 | 5 |
| ENST00001067310 | 33,271,730–33,276,511 | 6 |
| ENST00001101115 | 33,271,730–33,276,511 | 5 |
| ENST00001101119 | 33,271,730–33,276,510 | 4 |
顯示 12/24 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPS18 的產物是小型核糖體次單元的組成成分。核糖體是大型核糖核蛋白複合體，由 RNA 與蛋白質構成，負責在細胞內合成蛋白質。依據現有資料，RPS18 所支持的功能描述限於其作為該次單元成分，以及核糖體參與蛋白質合成；來源未詳述 RPS18 的個別分子作用方式或其對合成過程的具體影響。
Promoter 與基因調控
>RPS18 ENST00000439602 GRCh38 chr6:33271075-33272175 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTTCTATCACACCTCTGGGGAACCCCAGGCTTTCTAGAAATGTCAAAACACATAGTGTTTACCTGCATGC CAGGTGCAATCTTACACATATTCATCTAATCCTAACGACGATGTATACAATAGGTTCTATCTTCCTCACC TTAAAGGTGTGAGAAATGATGGCACAGAGAAGCTGGTTAACTTGCCCAAGGGCACACAGCGTGTAAGTGG CAGAGATAGAACTCAGGCAGTCTGGCTTCAGAGGCCATGTTCTTAACCTTTACACTATACTACTTCGTGA CTCTACCCCAAAATGTGGAGTGAAGTTGAAATTTTGTGCCCCAGAACATGAGTTTCAGCCACTAGGGTCC CGCTCAGGGTCGGGTCTGATCACAGGGAAGGGTACGGGGAGCCAAACAGGTAATATCACGGGTAGCAGCC AAGTTCCCACCCTTGTGCCTAAACCCAGCTCAGGTCTTTCTGAAGCTAGGAGCACCGGAACTACGGAGGA GAAACAGCTCCGCGCTCTCACCAGCGGGCCCTCTTCCTCCTCCATATCTGAGGTCCCAGCCCGCAACACC AGTTCCCGGGCCGCAGCCGCCATGGTCGCAGCGGCGGCCATTCCCCGCAGCCTCACTTCCGGCAACTGTC AGTCCCGGCGAGTCCGTTCCCCGGAGTGGAGCTACAAGTCCCAAAGGGTCTTCCTCAGCGCGAAATCGTT CCCAGATATTTGAGTTAAGTTGTTTGACTCCAGCTGTCCCCTTTCAGCTCTAACCACTTCACCCAACTGC AAATGGAAATATGGAAGTCTGAAACACAAACTAGCCCCGGAACCTTCGCTGTTCTCTTACCTATGAACCT TACGAACTGTAAAGAAAGGCGCACCGGAAGTTGTGGTACCCAAGCCATACTCTCATAAATCCAGCCAGGT CGCGCTGAAACAGTTTCCGGAAGCACTTCTCCTAGATCGCACCGCCTCTTCCTCCTGGAAGCTATATAAT GATATCGCGTCACTTCCGCTCTCTCTTCCACAGGAGGCCTACACGCCGCCGCTTGTGCTGCAGCCATGGT AAGACTGGAATCCGTGCCGTGATCCAGCGGCATCGCAGCTCGGGCAAGGAA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPS18_1 ↗ | 6:33,272,077 | 正股 | 33,272,028–33,272,087 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_8ZF5L · promoter · 33271866–33272085 · regulatory
ENSR6_C5B5W · enhancer · 33272086–33273723 · regulatory
ENSR6_9H7L3 · enhancer · 33274400–33274718 · regulatory
ENSR6_73XSFG · enhancer · 33275595–33275694 · regulatory
ENSR6_9H7LP · promoter · 33276633–33277133 · regulatory
· motif · 33271072–33271087 · motif
· motif · 33271072–33271087 · motif
· motif · 33271077–33271089 · motif
· motif · 33271147–33271162 · motif
· motif · 33271147–33271162 · motif
· motif · 33271206–33271228 · motif
· motif · 33271206–33271228 · motif
· motif · 33271218–33271230 · motif
· motif · 33271548–33271557 · motif
· motif · 33271649–33271659 · motif
· motif · 33271688–33271697 · motif
· motif · 33271688–33271699 · motif
· motif · 33271688–33271699 · motif
· motif · 33271741–33271754 · motif
· motif · 33271863–33271877 · motif
· motif · 33271935–33271946 · motif
· motif · 33271937–33271946 · motif
· motif · 33271998–33272009 · motif
· motif · 33271998–33272009 · motif
· motif · 33272000–33272009 · motif
· motif · 33272065–33272074 · motif
· motif · 33272065–33272076 · motif
· motif · 33272065–33272076 · motif
· motif · 33272320–33272333 · motif
· motif · 33272479–33272491 · motif
· motif · 33274024–33274030 · motif
· motif · 33274800–33274815 · motif
· motif · 33276329–33276340 · motif
· motif · 33276930–33276941 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：152 aa
ribosomal protein S18 屬於 universal ribosomal protein uS13 family。現有來源未提供其結構域、功能區域或序列註解資訊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源將 RPS18 蛋白質定位於細胞質；未提供其他定位條件或動態變化資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- CSNK2A1P68400 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- LRRK2Q5S007 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
RPS18 是小型核糖體次單元的組成成分。來源支持其為複合體成分，但未描述與特定分子的直接結合或其他功能性互作。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPS18 是小型核糖體次單元的組成成分。核糖體是大型核糖核蛋白複合體，負責在細胞內合成蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the small ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell PMID 23636399 ↗ |
| 交互作用 | RPS18 是小型核糖體次單元的組成成分；此資料描述其複合體成員身分，未指出與特定分子的直接結合。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | RPS18 蛋白質定位於細胞質；此項定位資料未提供其他條件或動態變化。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTCTCTTCCACAGGAGGCCTACACGCCGCCGCTTGTGCTG40CAGCCATGTCTCTAGTGATCCCTGAAAAGTTCCAGCATAT80TTTGCGAGTACTCAACACCAACATCGATGGGCGGCGGAAA120ATAGCCTTTGCCATCACTGCCATTAAGGGTGTGGGCCGAA160GATATGCTCATGTGGTGTTGAGGAAAGCAGACATTGACCT200CACCAAGAGGGCGGGAGAACTCACTGAGGATGAGGTGGAA240CGTGTGATCACCATTATGCAGAATCCACGCCAGTACAAGA280TCCCAGACTGGTTCTTGAACAGACAGAAGGATGTAAAGGA320TGGAAAATACAGCCAGGTCCTAGCCAATGGTCTGGACAAC360AAGCTCCGTGAAGACCTGGAGCGACTGAAGAAGATTCGGG400CCCATAGAGGGCTGCGTCACTTCTGGGGCCTTCGTGTCCG440AGGCCAGCACACCAAGACCACTGGCCGCCGTGGCCGCACC480GTGGGTGTGTCCAAGAAGAAATAAGTCTGTAGGCCTTGTC520TGTTAATAAATAGTTTATATACCTATGGC549cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。