演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPS14EMTB

ribosomal protein S14

RPS14 編碼 ribosomal protein S14,屬於 universal ribosomal protein uS11 family,是小型核糖體次單元的組成成分,也參與真核小型核糖體次單元前體的形成。

Homo sapiens5q33.1UniProt P62263
OFFICIAL SYMBOL
RPS14
CHROMOSOME
5
UNIPROT
P62263
PDB / ALPHAFOLD
22TU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPS14 是蛋白質編碼基因,產物名稱為 ribosomal protein S14,屬於 universal ribosomal protein uS11 family。它是核糖體小型次單元的組成成分;核糖體則是由 RNA 與蛋白質構成、負責細胞內蛋白質合成的大型核糖核蛋白複合體。除成熟核糖體相關角色外,ribosomal protein S14 也屬於小型次單元 processome 的成分;該 processome 是真核小型核糖體次單元形成過程中的早期前體複合體。這些資訊界定了它與核糖體及其生合成的關聯,但不代表它單獨執行整個複合體的工作。

Official symbol
RPS14
Gene name
ribosomal protein S14
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10387
UniProt
P62263
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
EMTBS14uS11

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 55q33.1
chr5 · 181,538,259 bp · GRCh38chr5p15.33 · 1–4400000 · gnegchr5p15.32 · 4400001–6300000 · gpos25chr5p15.31 · 6300001–9900000 · gnegchr5p15.2 · 9900001–15000000 · gpos50chr5p15.1 · 15000001–18400000 · gnegchr5p14.3 · 18400001–23300000 · gpos100chr5p14.2 · 23300001–24600000 · gnegchr5p14.1 · 24600001–28900000 · gpos100chr5p13.3 · 28900001–33800000 · gnegchr5p13.2 · 33800001–38400000 · gpos25chr5p13.1 · 38400001–42500000 · gnegchr5p12 · 42500001–46100000 · gpos50chr5p11 · 46100001–48800000 · acenchr5q11.1 · 48800001–51400000 · acenchr5q11.2 · 51400001–59600000 · gnegchr5q12.1 · 59600001–63600000 · gpos75chr5q12.2 · 63600001–63900000 · gnegchr5q12.3 · 63900001–67400000 · gpos75chr5q13.1 · 67400001–69100000 · gnegchr5q13.2 · 69100001–74000000 · gpos50chr5q13.3 · 74000001–77600000 · gnegchr5q14.1 · 77600001–82100000 · gpos50chr5q14.2 · 82100001–83500000 · gnegchr5q14.3 · 83500001–93000000 · gpos100chr5q15 · 93000001–98900000 · gnegchr5q21.1 · 98900001–103400000 · gpos100chr5q21.2 · 103400001–105100000 · gnegchr5q21.3 · 105100001–110200000 · gpos100chr5q22.1 · 110200001–112200000 · gnegchr5q22.2 · 112200001–113800000 · gpos50chr5q22.3 · 113800001–115900000 · gnegchr5q23.1 · 115900001–122100000 · gpos100chr5q23.2 · 122100001–127900000 · gnegchr5q23.3 · 127900001–131200000 · gpos100chr5q31.1 · 131200001–136900000 · gnegchr5q31.2 · 136900001–140100000 · gpos25chr5q31.3 · 140100001–145100000 · gnegchr5q32 · 145100001–150400000 · gpos75chr5q33.1 · 150400001–153300000 · gnegchr5q33.2 · 153300001–156300000 · gpos50chr5q33.3 · 156300001–160500000 · gnegchr5q34 · 160500001–169000000 · gpos100chr5q35.1 · 169000001–173300000 · gnegchr5q35.2 · 173300001–177100000 · gpos25chr5q35.3 · 177100001–181538259 · gnegRPS14pq1 bp181,538,259 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr5:150,429,756–150,449,952
Gene span
20,197 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000407193 ★150,442,635–150,449,7395
ENST00001110274150,429,756–150,449,7645
ENST00000401695150,442,635–150,449,7135
ENST00000922452150,442,635–150,449,7415
ENST00001136138150,442,635–150,449,7645
ENST00000922453150,443,149–150,449,7645
ENST00001039170150,443,177–150,449,7645
ENST00000922454150,443,805–150,449,7165
ENST00000922459150,444,224–150,449,7085
ENST00001061572150,444,224–150,449,7645
ENST00001061619150,444,226–150,449,7135
ENST00000922455150,444,229–150,449,9525

顯示 12/45 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ribosomal protein S14 是小型核糖體次單元的組成成分。核糖體是細胞內負責合成蛋白質的大型核糖核蛋白複合體,因此 RPS14 的來源註解將其定位在蛋白質合成相關的核糖體組成中;來源未進一步說明它在成熟核糖體中的個別分子作用。

RPS14 也參與小型次單元 processome。這個複合體是真核小型核糖體次單元形成的第一個前體,並在核仁中組裝。組裝期間,多種核糖體生合成因子、RNA 伴護蛋白及核糖體蛋白會與新生的 pre-rRNA 結合,協同處理其成熟所需的變化。

這些協同工作包括促進 RNA 摺疊、修飾與重排,以及進行切割;此外,RNA exosome 也會針對性降解前核糖體 RNA。來源描述的是多種成分共同參與的過程,並未將其中任一項 RNA 處理步驟單獨歸因於 RPS14。由此可見,RPS14 的已知角色涵蓋小型次單元的組成,以及其前體形成期間所屬的組裝複合體。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 150449739 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPS14 ENST00000407193 GRCh38 chr5:150449639-150450739 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACGAGGTCAGAAAATCCAGACCACCCTAGTCAACACGGTAAAACCCCGT
CTCTACTAATACACACACACAAAAAATTTGTCGGGCGTGGTGGCACGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGG
GAGGCTGAGGCAGAATAGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCGGTCAGCCGAGATTGCGCCACTGCACT
CCAGCCTTGGCTACAGAACAAGATTCGGTCGAAATATATACATGTATATTGTTATTAGAGGGCTATGTGG
AAGTAGCTATTAAACACGAGGGCTTTGAAGCTAGAATTCCAAACCCTTCTGCAAAGGTGTGCTCTCAGTT
AACATCCTTTATCTGTAAGAGGGAAATCAAAATTATTTGATAATGTCTTGAGGAGTAAATGAAGCAATGC
ATATAAACTGTTTAGCCCAGACCGGTCTGAAAATACATATTGAATAATTTATTCTTATTTTGCCCATTAT
ATAATATGCCAAAGTAAGTGATTACGGTGTGTTTTCCCCGACTATGTTGCCTAGGCTGGCCTCGAACTAC
TTGGACGAAGCGATCCTCAGCCTCCTGAGTAACTGGGACCACAGGCCGGCGCCACCCTAGCTTTAATTAA
GGCCGTTTTGTTGTTGTTATTCCCCTGCTCCACACAAGGGGCGCTGCCGCTCCAAGGCTGCCAGGGCGGG
AGTCAGGATGGCGGAAGTCTGTCTAGCCACGACCACCGCCATCATGGAATACAGGCCCACCTCACCCCGC
GGGTGTAGCCGCTTCGTACTGTCGCTTAGGCCGACCCGCTCGCAGCGACAACCAGCCCTCTACCTCTTTT
CGCTCTCCCTTAAGTAATAAACCGTCTTTCCTTATGACGAGTCTTAAACTCTTTGGGAGGAATAATGCCG
GCGTCTTCCGGAACCCGACCTCGCCCCGTGACCTCAGAGGTATACTTCCGGGACACGGAAGTGACCCCCG
TCGCTCCGCCCCCTCCCACTCTCTCTTTCCGGTGTGGAGTCTGGAGACGACGTGCAGGTAGGAGGCCCGG
GCGCGACAATCGGGGGGCATCCTGCGGCGAGGGGACCCTGTGGGGCTTGGG
RPS14 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPS14_1 ↗5:150,449,737負股150,449,727–150,449,786

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR5_947PBL · enhancer · 150448404–150448902 · regulatory

ENSR5_947PBQ · promoter · 150448903–150449403 · regulatory

ENSR5_7BSTBM · promoter · 150449681–150449784 · regulatory

ENSR5_B34T6H · enhancer · 150449785–150450498 · regulatory

ENSR5_947PD9 · enhancer · 150454271–150454608 · regulatory

· motif · 150448517–150448528 · motif

· motif · 150449566–150449575 · motif

· motif · 150449610–150449621 · motif

· motif · 150449727–150449736 · motif

· motif · 150449741–150449751 · motif

· motif · 150449747–150449757 · motif

· motif · 150449762–150449769 · motif

· motif · 150449767–150449776 · motif

· motif · 150449767–150449778 · motif

· motif · 150449767–150449778 · motif

· motif · 150449776–150449787 · motif

· motif · 150449776–150449787 · motif

· motif · 150449778–150449787 · motif

· motif · 150449793–150449805 · motif

· motif · 150449795–150449808 · motif

· motif · 150449795–150449810 · motif

· motif · 150449996–150450006 · motif

· motif · 150449999–150450016 · motif

· motif · 150450004–150450014 · motif

· motif · 150450021–150450032 · motif

· motif · 150450021–150450032 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:151 aa

1 aa151 aa功能區域
依 P62263 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ribosomal protein S14 長 151 個胺基酸,歸屬於 universal ribosomal protein uS11 family。序列註解將第 131 至 151 位胺基酸標示為無序區;此區域特徵來自預測性資料庫註解,來源未提供其他結構域或功能區域資訊。

功能區域Disordered131–151 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 22TU…

PDB · 22TU

EM · 3.00 A · SO=1-151

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus, nucleolus

ribosomal protein S14 註記位於細胞質與細胞核核仁。 來源未提供不同定位出現的條件、定位變化或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
EMTBRPS14AK6KRR1PSMD9RPS3ATAF9
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RPS14 是小型核糖體次單元的組成成分,也屬於小型次單元 processome。後者由超過 70 種蛋白質及 RNA 伴護分子 small nucleolar RNA (snoRNA) U3 組成。來源支持其複合體成分關係,但未指出 RPS14 與特定成員之間的直接實體結合。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RPS14 是小型核糖體次單元的組成成分;核糖體是負責細胞內蛋白質合成的大型核糖核蛋白複合體。它也屬於真核小型次單元的第一個前體,即小型次單元 processome。該複合體在核仁組裝時,多種核糖體生合成因子、RNA 伴護蛋白與核糖體蛋白共同結合新生 pre-rRNA,協助其摺疊、修飾、重排與切割,並由 RNA exosome 針對性降解前核糖體 RNA。含實驗來源
證據與來源

Component of the small ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell. Part of the small subunit (SSU) processome, first precursor of the small eukaryotic ribosomal subunit. During the assembly of the SSU processome in the nucleolus, many ribosome biogenesis factors, an RNA chaperone and ribosomal proteins associate with the nascent pre-rRNA and work in concert to generate RNA folding, modifications, rearrangements and cleavage as well as targeted degradation of pre-ribosomal RNA by the RNA exosome

PMID 23636399 ↗ · PMID 34516797 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RPS14 是小型核糖體次單元的組成成分,也屬於小型次單元 processome。該 processome 由超過 70 種蛋白質及 RNA 伴護分子 small nucleolar RNA (snoRNA) U3 組成。含實驗來源
證據與來源

Component of the small ribosomal subunit. Part of the small subunit (SSU) processome, composed of more than 70 proteins and the RNA chaperone small nucleolar RNA (snoRNA) U3

PMID 23636399 ↗ · PMID 34516797 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RPS14 的細胞定位註記包括細胞質與細胞核核仁。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus, nucleolus

PMID 23636399 ↗ · PMID 34516797 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000407193 · 2,146 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTCTCTTTCCGGTGTGGAGTCTGGAGACGACGTGCAGAAA40
41TGGCACCTCGAAAGGGGAAGGAAAAGAAGGAAGAACAGGT80
81CATCAGCCTCGGACCTCAGGTGGCTGAAGGAGAGAATGTA120
121TTTGGTGTCTGCCATATCTTTGCATCCTTCAATGACACTT160
161TTGTCCATGTCACTGATCTTTCTGGCAAGGAAACCATCTG200
201CCGTGTGACTGGTGGGATGAAGGTAAAGGCAGACCGAGAT240
241GAATCCTCACCATATGCTGCTATGTTGGCTGCCCAGGATG280
281TGGCCCAGAGGTGCAAGGAGCTGGGTATCACCGCCCTACA320
321CATCAAACTCCGGGCCACAGGAGGAAATAGGACCAAGACC360
361CCTGGACCTGGGGCCCAGTCGGCCCTCAGAGCCCTTGCCC400
401GCTCGGGTATGAAGATCGGGCGGATTGAGGATGTCACCCC440
441CATCCCCTCTGACAGCACTCGCAGGAAGGGGGGTCGCCGT480
481GGTCGCCGTCTGTGAACAAGATTCCTCAAAATATTTTCTG520
521TTAATAAATTGCCTTCATGTAAACTGTTTCAACTCCAGCC560
561TTCTCTCCTTCATCAGGGGCTACTCAGGCATTTGATTTCT600
601TCCTCCTATTTGGCTTCTTGGGAGAAAGGAGCCTGAGGAG640
641AGCTGAGATCCTGGTGCTGCATTTGGGGTCTTTTCCATGC680
681TACTTGCGGCATTAAGTTGCCTTGGTCATCTAAAGCAGAC720
721CAAGGCGTTGGAGACCTCGTTTTGAGTGGAGATGCTGGTT760
761CTAAATATGGACCAATTCTTAAAGAGCCAGAGTGGGAACT800
801GTTGATCCAAGTGTAGCCTGAAGCGAAAGAGGAGCCTTCC840
841AGACCCATGCCATATATAAACACACGTGGGTGTGCATTCT880
881CCCCCCACACCTTCTGTGCAAAGCTGGGAGCTCACTCCAC920
921TGCGTCTTGCTTTTTTTCACTTGGCAGATCTTGGAGATTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。