基因總覽
RPS11 是蛋白質編碼基因，其產物 ribosomal protein S11 屬於 universal ribosomal protein uS17 family。它是小型核糖體次單元的組成成分；核糖體則是由 RNA 與蛋白質構成、負責細胞內蛋白質合成的大型核糖核蛋白複合體。RPS11 的來源資料也將其列為小型核糖體次單元 processome 的一部分，這是小型真核核糖體次單元形成過程中的前驅組裝體。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000270625 ★ | 49,496,434–49,499,708 | 5 |
| ENST00000596873 | 49,496,233–49,498,251 | 4 |
| ENST00000599561 | 49,496,233–49,499,903 | 5 |
| ENST00000912774 | 49,496,233–49,499,903 | 5 |
| ENST00001006808 | 49,496,233–49,499,903 | 4 |
| ENST00001080184 | 49,496,233–49,499,903 | 5 |
| ENST00001080187 | 49,496,233–49,499,903 | 5 |
| ENST00001080188 | 49,496,233–49,499,903 | 5 |
| ENST00001080192 | 49,496,233–49,499,903 | 5 |
| ENST00001080202 | 49,496,233–49,499,903 | 5 |
| ENST00001080203 | 49,496,233–49,499,903 | 4 |
| ENST00001105414 | 49,496,233–49,499,903 | 4 |
顯示 12/25 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPS11 的產物 ribosomal protein S11 是小型核糖體次單元的組成成分。核糖體負責在細胞內合成蛋白質，因此 RPS11 所屬的次單元屬於蛋白質合成所需核糖體結構的一部分。
除成熟核糖體次單元外，RPS11 也參與小型核糖體次單元 processome。這個 processome 是小型真核核糖體次單元形成時的第一個前驅組裝體；其組裝發生於核仁，並涉及新生的前體核糖體 RNA（pre-rRNA）。
在 processome 組裝期間，多種核糖體生合成因子、RNA 分子伴侶及核糖體蛋白會與新生 pre-rRNA 結合並協同作用。這些組分共同促成 RNA 摺疊、修飾、構形重排與切割；此外，RNA exosome 也會參與對前核糖體 RNA 的標的性降解。來源資料將 RPS11 列為該組裝體的成員，但未提供其在上述各項 RNA 處理步驟中的個別作用細節。
Promoter 與基因調控
>RPS11 ENST00000270625 GRCh38 chr19:49495434-49496534 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCGCCACCATGCCCGACTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGC GTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGTCCTCAGGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAA AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGAGCCCGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTGATACGGA GTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGTCTGTCGGCCAGGCTGGAGTGCCATGGCGCGATCTCAGCTCACTGCA ACCTTCGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTTCCAAGTAGCTGGGATTACAGGGGCCCG CCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTGTT GAACCCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCTTAGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCACC GCGCTAGGCCGAGAGTAACTTTCACTGCACCTCTGAAAGTTCGTGGGCAGCTCCTGCCCCTAACAAAGAT GGCGACGCCGCCACACATGCTCCTAGCACTCCCCGGCCGCCCACCCTTCAAAAAGATGGCAGCCGCCTCA TCCGGTTTGAAGGCTGAACGAACAGAGCCACGCGGTATCCAAATCCCACGGGAGCCTACGCCACGCCGAA ACAGGATGGACTCCGTACGACTCTCGCGATAATACGGGCGGGCTGAAGGCTGGTCACATCTTCCCTGCCT AAATAATCGCGCCCGGCGTTGTGGGGCCTAAGACTCTCGCGAGACACCGTCTAGCACTTCCCGCCCGTCA GTCCTTCACAGTGCCCGAATCGCCCGCTGGTTTAAGTGCAGCCTGTCAATCAGAGCAGCTCTCGAGGCCC CGCCCAAGGCCGTGCTGCGTTTCTCCTTACGTCACTTCCTCTCCAGCCCCTGCGTAATCGATAAGGAAAC CCGGACGCTGCTGCCCCTTTCTTTTTTTCAGGCGGCCGGGAAGATGGCGGACATTCAGGTGCGGACTCGG GGTTGGATGCCAGGGTGCGGGGTCCGCCTTGGCCTTCAGGGGCGCGTCCGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPS11_1 ↗ | 19:49,496,443 | 正股 | 49,496,394–49,496,453 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_BCS7W · promoter · 49495942–49496464 · regulatory
· motif · 49492570–49492587 · motif
· motif · 49492600–49492613 · motif
· motif · 49492889–49492906 · motif
· motif · 49492898–49492906 · motif
· motif · 49493746–49493768 · motif
· motif · 49493746–49493768 · motif
· motif · 49495805–49495816 · motif
· motif · 49496105–49496118 · motif
· motif · 49496105–49496118 · motif
· motif · 49496367–49496380 · motif
· motif · 49496422–49496435 · motif
· motif · 49496455–49496465 · motif
· motif · 49496521–49496531 · motif
· motif · 49497346–49497359 · motif
· motif · 49497368–49497377 · motif
· motif · 49497797–49497808 · motif
· motif · 49497797–49497808 · motif
· motif · 49497799–49497808 · motif
· motif · 49497861–49497874 · motif
· motif · 49497876–49497889 · motif
· motif · 49497876–49497889 · motif
· motif · 49499836–49499849 · motif
· motif · 49499836–49499849 · motif
· motif · 49499862–49499884 · motif
· motif · 49499862–49499884 · motif
· motif · 49500073–49500084 · motif
· motif · 49500554–49500569 · motif
· motif · 49500590–49500599 · motif
· motif · 49501175–49501184 · motif
· motif · 49501292–49501299 · motif
· motif · 49501292–49501305 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：158 aa
ribosomal protein S11 屬於 universal ribosomal protein uS17 family。來源未提供其結構域、功能區域或序列註解的進一步資訊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ribosomal protein S11 的定位列為細胞質，以及細胞核中的核仁。 來源未說明定位是否會隨條件或異構型而改變。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- LRRK2Q5S007 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- MAP3K14Q99558 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PSME3IP1Q9GZU8 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RPS8P62241 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
RPS11 是小型核糖體次單元的組成成分，也屬於小型核糖體次單元 processome。該 processome 由 70 多種蛋白質及 RNA 分子伴侶 small nucleolar RNA (snoRNA) U3 組成；來源未指出 RPS11 與其中哪些成員有直接實體結合。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPS11 的產物是小型核糖體次單元的組成成分；核糖體是細胞內負責蛋白質合成的大型核糖核蛋白複合體。它也屬於小型核糖體次單元 processome，這是小型真核核糖體次單元形成時的第一個前驅組裝體。在核仁組裝期間，多種生合成因子、RNA 分子伴侶及核糖體蛋白協同處理新生 pre-rRNA，包括促進其摺疊、修飾、重排與切割，並由 RNA exosome 標的性降解前核糖體 RNA。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the small ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell. Part of the small subunit (SSU) processome, first precursor of the small eukaryotic ribosomal subunit. During the assembly of the SSU processome in the nucleolus, many ribosome biogenesis factors, an RNA chaperone and ribosomal proteins associate with the nascent pre-rRNA and work in concert to generate RNA folding, modifications, rearrangements and cleavage as well as targeted degradation of pre-ribosomal RNA by the RNA exosome PMID 23636399 ↗ · PMID 34516797 ↗ |
| 交互作用 | RPS11 是小型核糖體次單元的組成成分，也屬於小型核糖體次單元 processome。此 processome 由 70 多種蛋白質與 RNA 分子伴侶 small nucleolar RNA (snoRNA) U3 組成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the small ribosomal subunit. Part of the small subunit (SSU) processome, composed of more than 70 proteins and the RNA chaperone small nucleolar RNA (snoRNA) U3 PMID 23636399 ↗ · PMID 34516797 ↗ |
| 細胞定位 | 來源所列的細胞定位包括細胞質，以及細胞核內的核仁；資料未進一步描述定位變化的條件或異構型差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTTTTTTTCAGGCGGCCGGGAAGATGGCGGACATTCAGAC40TGAGCGTGCCTACCAAAAGCAGCCGACCATCTTTCAAAAC80AAGAAGAGGGTCCTGCTGGGAGAAACTGGCAAGGAGAAGC120TCCCGCGGTACTACAAGAACATCGGTCTGGGCTTCAAGAC160ACCCAAGGAGGCTATTGAGGGCACCTACATTGACAAGAAA200TGCCCCTTCACTGGTAATGTGTCCATTCGAGGGCGGATCC240TCTCTGGCGTGGTGACCAAGATGAAGATGCAGAGGACCAT280TGTCATCCGCCGAGACTATCTGCACTACATCCGCAAGTAC320AACCGCTTCGAGAAGCGCCACAAGAACATGTCTGTACACC360TGTCCCCCTGCTTCAGGGACGTCCAGATCGGTGACATCGT400CACAGTGGGCGAGTGCCGGCCTCTGAGCAAGACAGTGCGC440TTCAACGTGCTCAAGGTCACCAAGGCTGCCGGCACCAAGA480AGCAGTTCCAGAAGTTCTGAGGCTGGACATCGGCCCGCTC520CCCACAATGAAATAAAGTTATTTTCTCATTCCCAGGCCAG560ACTTGGGATCTTC573cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。