基因總覽
RPLP2 是蛋白質編碼基因,其產物正式名稱為 ribosomal protein lateral stalk subunit P2,屬於真核生物核糖體蛋白 P1/P2 家族。這項來源將其主要角色概括為參與蛋白質合成的延長階段;其延長作用的細節不在此處展開。蛋白質序列長度為 115 個胺基酸,其中第 78 至 115 位被註記為無序區。它也會與 P1 形成異源二聚體,位於大型核糖體次單元的側柄。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000321153 ★ | 809,967–812,876 | 5 |
| ENST00000960563 | 799,414–812,891 | 5 |
| ENST00000718237 | 805,438–812,891 | 5 |
| ENST00000852318 | 809,284–812,891 | 5 |
| ENST00000852319 | 809,284–812,882 | 5 |
| ENST00000929541 | 809,284–812,883 | 5 |
| ENST00000929542 | 809,284–812,891 | 5 |
| ENST00000929543 | 809,284–812,883 | 5 |
| ENST00000929544 | 809,284–812,891 | 4 |
| ENST00000929546 | 809,284–812,891 | 5 |
| ENST00000929547 | 809,284–812,891 | 5 |
| ENST00000929548 | 809,284–812,878 | 5 |
顯示 12/32 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPLP2 的產物參與蛋白質合成的延長階段。現有功能資料指出其在這個步驟中具有重要角色,但未進一步描述其分子作用方式、參與的具體反應或對合成速率的影響,因此不宜據此延伸推論其他機制或功能。
Promoter 與基因調控
>RPLP2 ENST00000321153 GRCh38 chr11:808967-810067 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGTGCTCGCCCGGGATATTGGCAGGGATGGCTCCTTCTCATCTCTCAGCTCAAGCTTTCTCAGGCTGCCC AGAGGACCAAGTCTCCCTCTGTCCCTGTCCTTCGGATCGCCTCCCTATTCACCTCCTGCGTCCTCGCACA AGAACTCAAGTCCTTAGGAGGCAGGGCCAACCCTGTTCCCTCCCAGGACCCGAGAATGTAGCGGGGTCCC TGAGGTGCTGATGTCCACATGGACACCGAGGTCAGTTCCGGGCCAAAGCGGCCAGCGCAGGGGCTGACCA CTCAGACCTCACTCCTCGCAGGGGTGAGCGGGCGACGCTGCCTCACGTCATTGTCCTGCCCTCCAAGGCC CGCGCTCGTCCTCTGACAGGATGCCCTGACACCGCAGTGCGGGGGCGGCCTCCCAGATAGGGCCGCAGTC GCTAAGTCCGAGGCGGCTGGCTCACCTCACTGAGCCCGGCTGGACGTGGGACCACCGGTCGCCGCGGCCA GGGAACCACCAAGGAGTCAAGGCGAGCCTACCGCCAGCAGCTTCTGCCCGGGCCCACGCGCCGTTCCGGG TAGGCCCGCGGCGCAGGCCACTTCCGGCAGCGGTGCACCATGGGACTTGCAGTTCGCTGGCAAAGGTTGA GTCCCGGGCGTGGCGGCCGCGCTCCATGTTGGGAGCTGTAGGCGCCGCGTGGCATGCTGGGGGTGCTAGG TACCGAAGGCAGATGCCGTCCCTTTGGACTCGCTTCGTCCAACGCCCCCACGAGTTTCGGTGGCCCTTCG CCCCACGCTATAAGAGCAGTCACTTCCGGAACTGCTGCCCTTCGCCTTTGCCGCGAAAAGTGCCTGACGG GGGCTGGGAAGGGGGAGGGGGAAGGAGTCAACGACTCCCTCCCCGTCGTCATTGGCTGAGCGCCTCGTGA CGTCACTCTGAGGCGCCTCATGCGGCGCCGCGCACGGGTCCCAGAGCCTTCTGGGTAGCGGTTTAACCCC GCCTCTTGCGTCGGCGCCTTCCTTTTCCTCCCTGTCGCCACCGAGGTCGCACGCGTGAGACTTCTCCGCC GCCTCCGCCGCAGACGCCGCCGCGTGAGTGTGGTGACCGGGCCCGGGGTGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPLP2_2 ↗ | 11:809,624 | 正股 | 809,575–809,634 |
| RPLP2_1 ↗ | 11:809,968 | 正股 | 809,919–809,978 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_8M93 · promoter · 805221–805448 · regulatory
ENSR11_C46B · enhancer · 805449–806645 · regulatory
ENSR11_9BN4 · promoter · 808806–809306 · regulatory
ENSR11_9BN9 · promoter · 809477–809977 · regulatory
ENSR11_575X6 · CTCF_binding_site · 810242–810263 · regulatory
ENSR11_9BNN · enhancer · 810948–811323 · regulatory
ENSR11_5767H · CTCF_binding_site · 811822–811843 · regulatory
ENSR11_576BF · CTCF_binding_site · 812456–812477 · regulatory
ENSR11_C46T · enhancer · 812983–814397 · regulatory
· motif · 805045–805058 · motif
· motif · 805145–805158 · motif
· motif · 805251–805264 · motif
· motif · 805289–805302 · motif
· motif · 805477–805490 · motif
· motif · 805493–805510 · motif
· motif · 805557–805566 · motif
· motif · 805875–805890 · motif
· motif · 805881–805893 · motif
· motif · 805883–805890 · motif
· motif · 805883–805898 · motif
· motif · 806150–806157 · motif
· motif · 806307–806314 · motif
· motif · 808558–808573 · motif
· motif · 808739–808756 · motif
· motif · 809204–809211 · motif
· motif · 809209–809218 · motif
· motif · 809241–809258 · motif
· motif · 809352–809365 · motif
· motif · 809545–809554 · motif
· motif · 809545–809556 · motif
· motif · 809545–809556 · motif
· motif · 809707–809720 · motif
· motif · 809757–809766 · motif
· motif · 809757–809768 · motif
· motif · 809757–809768 · motif
· motif · 809783–809794 · motif
· motif · 809805–809815 · motif
· motif · 809817–809827 · motif
· motif · 809871–809884 · motif
· motif · 809871–809884 · motif
· motif · 809925–809940 · motif
· motif · 809942–809952 · motif
· motif · 810021–810038 · motif
· motif · 810244–810260 · motif
· motif · 811626–811639 · motif
· motif · 811626–811639 · motif
· motif · 811824–811840 · motif
· motif · 812458–812474 · motif
· motif · 813490–813501 · motif
· motif · 813492–813501 · motif
· motif · 813839–813850 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:115 aa
RPLP2 蛋白屬於真核生物核糖體蛋白 P1/P2 家族,序列長度為 115 個胺基酸。其第 78 至 115 位區段被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- RPLP1P05386 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
RPLP2 與 P1 形成異源二聚體;此二聚體位於大型核糖體次單元的側柄。資料描述的是複合體組成與所在位置,未提供其他互作或功能關係細節。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPLP2 參與蛋白質合成的延長階段,來源指出它在此步驟具有重要角色,但未說明具體分子機制或作用細節。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | RPLP2 與 P1 形成異源二聚體,並位於大型核糖體次單元的側柄;此描述指出複合體組成及位置。 | 含實驗來源 | 證據與來源Heterodimer with P1 at the lateral ribosomal stalk of the large ribosomal subunit PMID 20385603 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CCTTTTCCTCCCTGTCGCCACCGAGGTCGCACGCGTGAGA40CTTCTCCGCCGCCTCCGCCGCAGACGCCGCCGCGATGCGC80TACGTCGCCTCCTACCTGCTGGCTGCCCTAGGGGGCAACT120CCTCCCCCAGCGCCAAGGACATCAAGAAGATCTTGGACAG160CGTGGGTATCGAGGCGGACGACGACCGGCTCAACAAGGTT200ATCAGTGAGCTGAATGGAAAAAACATTGAAGACGTCATTG240CCCAGGGTATTGGCAAGCTTGCCAGTGTACCTGCTGGTGG280GGCTGTAGCCGTCTCTGCTGCCCCAGGCTCTGCAGCCCCT320GCTGCTGGTTCTGCCCCTGCTGCAGCAGAGGAGAAGAAAG360ATGAGAAGAAGGAGGAGTCTGAAGAGTCAGATGATGACAT400GGGATTTGGCCTTTTTGATTAAATTCCTGCTCCCCTGCAA440ATAAAGCCTTTTTACACATCTC462cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。