演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPLP2P2

ribosomal protein lateral stalk subunit P2

RPLP2 編碼 ribosomal protein lateral stalk subunit P2,屬於真核生物核糖體蛋白 P1/P2 家族,參與蛋白質合成的延長階段。

Homo sapiens11p15.5UniProt P05387
OFFICIAL SYMBOL
RPLP2
CHROMOSOME
11
UNIPROT
P05387
PDB / ALPHAFOLD
4BEH
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPLP2 是蛋白質編碼基因,其產物正式名稱為 ribosomal protein lateral stalk subunit P2,屬於真核生物核糖體蛋白 P1/P2 家族。這項來源將其主要角色概括為參與蛋白質合成的延長階段;其延長作用的細節不在此處展開。蛋白質序列長度為 115 個胺基酸,其中第 78 至 115 位被註記為無序區。它也會與 P1 形成異源二聚體,位於大型核糖體次單元的側柄。

Official symbol
RPLP2
Gene name
ribosomal protein lateral stalk subunit P2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10377
UniProt
P05387
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
P2RPP2MGC71408LP2D11S2243E

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111p15.5
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegRPLP2pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr11:799,414–812,891
Gene span
13,478 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000321153 ★809,967–812,8765
ENST00000960563799,414–812,8915
ENST00000718237805,438–812,8915
ENST00000852318809,284–812,8915
ENST00000852319809,284–812,8825
ENST00000929541809,284–812,8835
ENST00000929542809,284–812,8915
ENST00000929543809,284–812,8835
ENST00000929544809,284–812,8914
ENST00000929546809,284–812,8915
ENST00000929547809,284–812,8915
ENST00000929548809,284–812,8785

顯示 12/32 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RPLP2 的產物參與蛋白質合成的延長階段。現有功能資料指出其在這個步驟中具有重要角色,但未進一步描述其分子作用方式、參與的具體反應或對合成速率的影響,因此不宜據此延伸推論其他機制或功能。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 809967 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPLP2 ENST00000321153 GRCh38 chr11:808967-810067 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGTGCTCGCCCGGGATATTGGCAGGGATGGCTCCTTCTCATCTCTCAGCTCAAGCTTTCTCAGGCTGCCC
AGAGGACCAAGTCTCCCTCTGTCCCTGTCCTTCGGATCGCCTCCCTATTCACCTCCTGCGTCCTCGCACA
AGAACTCAAGTCCTTAGGAGGCAGGGCCAACCCTGTTCCCTCCCAGGACCCGAGAATGTAGCGGGGTCCC
TGAGGTGCTGATGTCCACATGGACACCGAGGTCAGTTCCGGGCCAAAGCGGCCAGCGCAGGGGCTGACCA
CTCAGACCTCACTCCTCGCAGGGGTGAGCGGGCGACGCTGCCTCACGTCATTGTCCTGCCCTCCAAGGCC
CGCGCTCGTCCTCTGACAGGATGCCCTGACACCGCAGTGCGGGGGCGGCCTCCCAGATAGGGCCGCAGTC
GCTAAGTCCGAGGCGGCTGGCTCACCTCACTGAGCCCGGCTGGACGTGGGACCACCGGTCGCCGCGGCCA
GGGAACCACCAAGGAGTCAAGGCGAGCCTACCGCCAGCAGCTTCTGCCCGGGCCCACGCGCCGTTCCGGG
TAGGCCCGCGGCGCAGGCCACTTCCGGCAGCGGTGCACCATGGGACTTGCAGTTCGCTGGCAAAGGTTGA
GTCCCGGGCGTGGCGGCCGCGCTCCATGTTGGGAGCTGTAGGCGCCGCGTGGCATGCTGGGGGTGCTAGG
TACCGAAGGCAGATGCCGTCCCTTTGGACTCGCTTCGTCCAACGCCCCCACGAGTTTCGGTGGCCCTTCG
CCCCACGCTATAAGAGCAGTCACTTCCGGAACTGCTGCCCTTCGCCTTTGCCGCGAAAAGTGCCTGACGG
GGGCTGGGAAGGGGGAGGGGGAAGGAGTCAACGACTCCCTCCCCGTCGTCATTGGCTGAGCGCCTCGTGA
CGTCACTCTGAGGCGCCTCATGCGGCGCCGCGCACGGGTCCCAGAGCCTTCTGGGTAGCGGTTTAACCCC
GCCTCTTGCGTCGGCGCCTTCCTTTTCCTCCCTGTCGCCACCGAGGTCGCACGCGTGAGACTTCTCCGCC
GCCTCCGCCGCAGACGCCGCCGCGTGAGTGTGGTGACCGGGCCCGGGGTGC
RPLP2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPLP2_2 ↗11:809,624正股809,575–809,634
RPLP2_1 ↗11:809,968正股809,919–809,978

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_8M93 · promoter · 805221–805448 · regulatory

ENSR11_C46B · enhancer · 805449–806645 · regulatory

ENSR11_9BN4 · promoter · 808806–809306 · regulatory

ENSR11_9BN9 · promoter · 809477–809977 · regulatory

ENSR11_575X6 · CTCF_binding_site · 810242–810263 · regulatory

ENSR11_9BNN · enhancer · 810948–811323 · regulatory

ENSR11_5767H · CTCF_binding_site · 811822–811843 · regulatory

ENSR11_576BF · CTCF_binding_site · 812456–812477 · regulatory

ENSR11_C46T · enhancer · 812983–814397 · regulatory

· motif · 805045–805058 · motif

· motif · 805145–805158 · motif

· motif · 805251–805264 · motif

· motif · 805289–805302 · motif

· motif · 805477–805490 · motif

· motif · 805493–805510 · motif

· motif · 805557–805566 · motif

· motif · 805875–805890 · motif

· motif · 805881–805893 · motif

· motif · 805883–805890 · motif

· motif · 805883–805898 · motif

· motif · 806150–806157 · motif

· motif · 806307–806314 · motif

· motif · 808558–808573 · motif

· motif · 808739–808756 · motif

· motif · 809204–809211 · motif

· motif · 809209–809218 · motif

· motif · 809241–809258 · motif

· motif · 809352–809365 · motif

· motif · 809545–809554 · motif

· motif · 809545–809556 · motif

· motif · 809545–809556 · motif

· motif · 809707–809720 · motif

· motif · 809757–809766 · motif

· motif · 809757–809768 · motif

· motif · 809757–809768 · motif

· motif · 809783–809794 · motif

· motif · 809805–809815 · motif

· motif · 809817–809827 · motif

· motif · 809871–809884 · motif

· motif · 809871–809884 · motif

· motif · 809925–809940 · motif

· motif · 809942–809952 · motif

· motif · 810021–810038 · motif

· motif · 810244–810260 · motif

· motif · 811626–811639 · motif

· motif · 811626–811639 · motif

· motif · 811824–811840 · motif

· motif · 812458–812474 · motif

· motif · 813490–813501 · motif

· motif · 813492–813501 · motif

· motif · 813839–813850 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:115 aa

1 aa115 aa功能區域
依 P05387 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

RPLP2 蛋白屬於真核生物核糖體蛋白 P1/P2 家族,序列長度為 115 個胺基酸。其第 78 至 115 位區段被註記為無序區。

功能區域Disordered78–115 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 4BEH…

PDB · 4BEH

NMR · - · B=1-115

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
P2RPLP2RPLP1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RPLP2 與 P1 形成異源二聚體;此二聚體位於大型核糖體次單元的側柄。資料描述的是複合體組成與所在位置,未提供其他互作或功能關係細節。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RPLP2 參與蛋白質合成的延長階段,來源指出它在此步驟具有重要角色,但未說明具體分子機制或作用細節。資料庫紀錄
證據與來源

Plays an important role in the elongation step of protein synthesis

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RPLP2 與 P1 形成異源二聚體,並位於大型核糖體次單元的側柄;此描述指出複合體組成及位置。含實驗來源
證據與來源

Heterodimer with P1 at the lateral ribosomal stalk of the large ribosomal subunit

PMID 20385603 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000321153 · 462 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCTTTTCCTCCCTGTCGCCACCGAGGTCGCACGCGTGAGA40
41CTTCTCCGCCGCCTCCGCCGCAGACGCCGCCGCGATGCGC80
81TACGTCGCCTCCTACCTGCTGGCTGCCCTAGGGGGCAACT120
121CCTCCCCCAGCGCCAAGGACATCAAGAAGATCTTGGACAG160
161CGTGGGTATCGAGGCGGACGACGACCGGCTCAACAAGGTT200
201ATCAGTGAGCTGAATGGAAAAAACATTGAAGACGTCATTG240
241CCCAGGGTATTGGCAAGCTTGCCAGTGTACCTGCTGGTGG280
281GGCTGTAGCCGTCTCTGCTGCCCCAGGCTCTGCAGCCCCT320
321GCTGCTGGTTCTGCCCCTGCTGCAGCAGAGGAGAAGAAAG360
361ATGAGAAGAAGGAGGAGTCTGAAGAGTCAGATGATGACAT400
401GGGATTTGGCCTTTTTGATTAAATTCCTGCTCCCCTGCAA440
441ATAAAGCCTTTTTACACATCTC462

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。