演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPLP1LP1

ribosomal protein lateral stalk subunit P1

RPLP1 編碼 ribosomal protein lateral stalk subunit P1,屬於真核生物核糖體蛋白質 P1/P2 家族,並在蛋白質合成延伸階段扮演重要角色。

Homo sapiens15q23UniProt P05386
OFFICIAL SYMBOL
RPLP1
CHROMOSOME
15
UNIPROT
P05386
PDB / ALPHAFOLD
4BEH
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPLP1 是蛋白質編碼基因,其產物名稱為 ribosomal protein lateral stalk subunit P1。此蛋白質屬於真核生物核糖體蛋白質 P1/P2 家族,長度為 114 個胺基酸。序列註解指出,第 69 至 114 個胺基酸構成一段無序區域。這些資訊描述其家族歸屬與基本序列特徵;其參與蛋白質合成的作用另於功能段說明。

Official symbol
RPLP1
Gene name
ribosomal protein lateral stalk subunit P1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10372
UniProt
P05386
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
LP1P1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1515q23
chr15 · 101,991,189 bp · GRCh38chr15p13 · 1–4200000 · gvarchr15p12 · 4200001–9700000 · stalkchr15p11.2 · 9700001–17500000 · gvarchr15p11.1 · 17500001–19000000 · acenchr15q11.1 · 19000001–20500000 · acenchr15q11.2 · 20500001–25500000 · gnegchr15q12 · 25500001–27800000 · gpos50chr15q13.1 · 27800001–30000000 · gnegchr15q13.2 · 30000001–30900000 · gpos50chr15q13.3 · 30900001–33400000 · gnegchr15q14 · 33400001–39800000 · gpos75chr15q15.1 · 39800001–42500000 · gnegchr15q15.2 · 42500001–43300000 · gpos25chr15q15.3 · 43300001–44500000 · gnegchr15q21.1 · 44500001–49200000 · gpos75chr15q21.2 · 49200001–52600000 · gnegchr15q21.3 · 52600001–58800000 · gpos75chr15q22.1 · 58800001–59000000 · gnegchr15q22.2 · 59000001–63400000 · gpos25chr15q22.31 · 63400001–66900000 · gnegchr15q22.32 · 66900001–67000000 · gpos25chr15q22.33 · 67000001–67200000 · gnegchr15q23 · 67200001–72400000 · gpos25chr15q24.1 · 72400001–74900000 · gnegchr15q24.2 · 74900001–76300000 · gpos25chr15q24.3 · 76300001–78000000 · gnegchr15q25.1 · 78000001–81400000 · gpos50chr15q25.2 · 81400001–84700000 · gnegchr15q25.3 · 84700001–88500000 · gpos50chr15q26.1 · 88500001–93800000 · gnegchr15q26.2 · 93800001–98000000 · gpos50chr15q26.3 · 98000001–101991189 · gnegRPLP1pq1 bp101,991,189 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr15:69,452,656–69,456,205
Gene span
3,550 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000260379 ★69,452,818–69,456,2054
ENST0000035779069,452,656–69,456,2053
ENST0000056027469,452,656–69,456,2052
ENST0000085970169,452,656–69,456,2054
ENST0000091144669,452,656–69,455,5544
ENST0000091144769,452,656–69,456,2054
ENST0000091145169,452,656–69,455,5462
ENST0000091145469,452,656–69,455,5464
ENST0000109162169,452,656–69,455,5544
ENST0000109162369,452,656–69,455,5534
ENST0000109162569,452,656–69,456,2053
ENST0000109162669,452,656–69,456,2054

顯示 12/31 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RPLP1 的產物在蛋白質合成的延伸階段扮演重要角色。此來源指出其功能與蛋白質合成中的特定階段相關,但未進一步說明其分子作用方式、參與的具體步驟或對合成效率的影響,因此不宜據此推演更詳細的機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 69452818 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPLP1 ENST00000260379 GRCh38 chr15:69451818-69452918 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AAAGAAGGTGCCCCCCCCCCACCAAAAAAAAAGATATATATACATAGAACTAACTTTCCGGTAAACTAAG
CAAATTCCACGAGGAATGCAAAGATGACCATTTTTGAAGGTAGGAATTTAAATTGGGTTTAGATAACAAA
TAACGGGTTGTAGACAGCTTACCCATAATCCCTCCTTCCCCCAAGCACTAGGCAGTGAAGTTAGACTTCT
GGATTCCACCTCCACGCTCACCGCGCGGCACTATGCAATCTTCGGTTAGTTACCAGGTCTAAGTTAGGCT
TCTGGATTCCAACTCCACGCTCCACCGCGCGGAACTATGCAATCTTGAGTTAGCTACCGGGTCTAAGTTA
GGCTTCTAGATTCCAAATCCACGCTCCACTGCGCGGTAACTACATAATCTTGGGCTAGTTTACCAGCTCT
AAGACTTAATTTTGCCATATGCAAGATGGAGATAACATCCAACTCCTGGTGTGTGAGGATTACGTGAATC
CTTGCAGAATGTGGCTCAGTGCCTGGGACATAGTAAGCGCTCTACGGCTTCTGCTAGCATAACGCTGTTA
GTTTCTCTCATCCTCCTACATCTACCTATCTCAACCAAGGTCCTGCGCTAAGCAGGGGCCTCCAAGCTGG
GACGCAGCCCTTACTCTCAGGGTCAGCGCCGGCTGGGAAGGCCGCGACCTAACCAGGAGATTACGAACAA
TGTCACCAGGGCCACAGCGGAGCTCCTGCCAAGTCAAGCAACTCATGGAACCAACGGAGGCGAAGTCCGA
ATACCTAGGCAACCCTAACCTAAAAGTGTTTTTAACGTTCTCAGGTCCTATAATTTACCCAAATAAAGTG
GGACCGTATTTGCAGGCGCTGAGAAACTTTCTCAACAGTAAGAACCAATCAGGCGCAGTGCGCAGGCGCC
TTCAGTGGGTCCTGGGTCCGCCTCTTCCGCCCGGTGCGGGCGCCGATTGGTCCGCGTGGACACATAAGAG
GCTGCGTATAGGCGCGAGAGCCCCTTTCCTCAGCTGCCGCCAAGGTGCTCGGTCCTTCCGAGGAAGCTAA
GGCTGCGTTGGGGTGAGGCCCTCACTTCATCCGGCGACTAGCACCGCGTCC
RPLP1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPLP1_1 ↗15:69,452,820正股69,452,771–69,452,830

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR15_8435KT · enhancer · 69451472–69451602 · regulatory

ENSR15_BHR65 · promoter · 69452324–69452894 · regulatory

ENSR15_932KC6 · enhancer · 69455614–69455929 · regulatory

ENSR15_D5G37 · enhancer · 69456190–69458326 · regulatory

· motif · 69452716–69452727 · motif

· motif · 69452716–69452727 · motif

· motif · 69453016–69453033 · motif

· motif · 69453113–69453122 · motif

· motif · 69453113–69453124 · motif

· motif · 69453113–69453124 · motif

· motif · 69453214–69453231 · motif

· motif · 69453446–69453454 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:114 aa

1 aa114 aa功能區域
依 P05386 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ribosomal protein lateral stalk subunit P1 長 114 個胺基酸,屬於真核生物核糖體蛋白質 P1/P2 家族。序列第 69 至 114 個胺基酸被註解為無序區域。

功能區域Disordered69–114 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 4BEH…

PDB · 4BEH

NMR · - · A=1-114

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
LP1RPLP1CSNK2A1RPLP2SUOX
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RPLP1 與 RPLP2 形成異源二聚體,位於大型核糖體次單元的側向柄部。來源描述的是兩者組成二聚體及其所在位置,未提供其他結合或功能關係的細節。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RPLP1 在蛋白質合成的延伸階段扮演重要角色;來源未進一步列明其具體作用方式、作用對象或其他相關條件。資料庫紀錄
證據與來源

Plays an important role in the elongation step of protein synthesis

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RPLP1 與 RPLP2 形成異源二聚體,並位於大型核糖體次單元的側向柄部;此敘述未提供其他互作條件或功能細節。含實驗來源
證據與來源

Heterodimer with RPLP2 at the lateral ribosomal stalk of the large ribosomal subunit

PMID 22135285 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000260379 · 1,174 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCCCTTTCCTCAGCTGCCGCCAAGGTGCTCGGTCCTTCCG40
41AGGAAGCTAAGGCTGCGTTGGGGTGAGGCCCTCACTTCAT80
81CCGGCGACTAGCACCGCGTCCGGCAGCGCCAGCCCTACAC120
121TCGCCCGCGCCATGGCCTCTGTCTCCGAGCTCGCCTGCAT160
161CTACTCGGCCCTCATTCTGCACGACGATGAGGTGACAGTC200
201ACGGAGGATAAGATCAATGCCCTCATTAAAGCAGCCGGTG240
241TAAATGTTGAGCCTTTTTGGCCTGGCTTGTTTGCAAAGGC280
281CCTGGCCAACGTCAACATTGGGAGCCTCATCTGCAATGTA320
321GGGGCCGGTGGACCTGCTCCAGCAGCTGGTGCTGCACCAG360
361CAGGAGGTCCTGCCCCCTCCACTGCTGCTGCTCCAGCTGA400
401GGAGAAGAAAGTGGAAGCAAAGAAAGAAGAATCCGAGGAG440
441TCTGATGATGACATGGGCTTTGGTCTTTTTGACTAAACCT480
481CTTTTATAACATGTTCAATAAAAAGCTGAACTTTACTGCT520
521GTTGGTCTTGTCCATAGTTTTGGAATGTGCTCTGCAAAAA560
561TGGTCTGTTTTGTAATGTTGGCTTTCAGCCTATTCTGCCA600
601TGACACAGGCTGGATTTTCCCTGCCACCATTGCCGGATGT640
641GAGATTTAGACAATCCTGATGCTAACAAGAAGGCACCTCA680
681TGGTACAGTGTTGAAAACTGCACTGGGGTGGCAGGAGGAA720
721GGATCAGAGCAGATGCTTTGTCCAGGTTACCTGTGTAAAC760
761TTGATGATTATAAGGTGTGTCCCCTACACTGGGGGTGGAG800
801GGTAATACAGACCAGCTTTAGAAAGCCTCCTGGGTATTTA840
841CCCTATACAACCCTGCCTAAGAACGAACTTTGACGTATGC880
881TGAATGTTGACTGCTACATCCCAAGGTTGTAAAAAAACAA920
921GACTTAGCTATGTAATGTCTCACCAAATGTTTGGGAGTTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。