演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPL8L8

ribosomal protein L8

RPL8(ribosomal protein L8)是大型核糖體次單元的組成蛋白,屬於普遍存在的核糖體蛋白 uL2 家族,參與細胞內蛋白質合成所需的核糖體複合體。

Homo sapiens8q24.3UniProt P62917
OFFICIAL SYMBOL
RPL8
CHROMOSOME
8
UNIPROT
P62917
PDB / ALPHAFOLD
22TU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPL8(ribosomal protein L8)是蛋白質編碼基因,其產物為核糖體蛋白,屬於 universal ribosomal protein uL2 家族。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體;RPL8 是大型核糖體次單元的組成成分。其蛋白質長度為 257 個胺基酸,序列中第 207 至 232 個胺基酸區段被註記為無序區。

Official symbol
RPL8
Gene name
ribosomal protein L8
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10368
UniProt
P62917
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
L8uL2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88q24.3
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegRPL8pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr8:144,789,765–144,793,502
Gene span
3,738 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000528957 ★144,789,769–144,792,3905
ENST00000394920144,789,769–144,792,3896
ENST00000527914144,789,769–144,793,5025
ENST00000262584144,789,769–144,793,5026
ENST00000913745144,789,769–144,792,3905
ENST00001100080144,789,769–144,792,3905
ENST00000533397144,789,809–144,792,1536
ENST00000532702144,790,355–144,792,3845

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RPL8 的產物是大型核糖體次單元的組成蛋白。核糖體本身是大型核糖核蛋白複合體,負責細胞內蛋白質的合成,因此 RPL8 參與構成執行此合成工作的核糖體。現有資料未進一步說明 RPL8 在核糖體中的分子作用方式或其對蛋白質合成各步驟的個別影響。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 144792390 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPL8 ENST00000528957 GRCh38 chr8:144792290-144793390 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCCGCCTTCACCTCCTTGCTGCCTCCCCACCCACGGCCTCGCGTGTGCTCGACAGTGCTCACTCAGCCAG
GGACTCTCTCCTGGAAAACCTCTTCCCCACCATCCCCCACCCGCGGCCTCGGGGTCCCACCCGTTAGGGG
CCCGATTCCGCGAAGCCCCTCTCCACAGCACGTACCGCAGGACACCCCCAGTCGGGCTGACTCTTTCCAG
CTCAGGCCCCCACAGCCCCTCCCAGCCTCCATTTCTTGCTCCTTCCCCACCTCTCCCGCACAGGGTTCTG
GTCAGGGTACGGTCCAGTCTCCCATTATTCGTCCACTCCGCAGCATGTGACCCAGCCCATCCCCGCTCCT
TCTTCCTCGACCCGGGACCCTCCAGCTTGGCCCTCCCCACTTCCTGGGCCGGCCGGCCCTCACCCTCGGC
AAGGATCCCGGGGCTCCTCTCCTCGACGCCCGACCTCTCCAAGGGCCTACAGTGGATAAGGTCCCCGCGT
CCAGAAGCGCCCGTTCATCAGGGAGACGGACATTTGCCACCTGCAAACCATGACGTTCCACGAGTGGGTC
CACGCGTCTCCCCTGCCCATCTCCTGCTCTGCACCAGCGAGAACCCCCTCGGCCTACACGGAAGCCCCTC
ACCAGGCAAGCCGGGAGCCCCAGACCCCGTGGCCCGGAGTGGGTCGCTCTGTGACACCCTGGACAGGTCA
CTCAACCACTTGGCGCCTCCTCGGCCACTCAGAAAACACCTGCCCTCCCGGAGACCCCGGTGAAAGCCGA
GCACTCCTGCACCCTCCTTCCGAGCCCACGCACACCAGGACACCTTCAGCCGCGTCTCCTGGTGCGCCTG
CGCGGGGGCCCTGGAGGAGGAGAAGTAGGCGGGGCCGGCGGCCGCTGGTGACTACAAGCCCCGGCGTGCA
CCGCGCTAGGCTGGCCGTGGCGCGCCCGGAAGGTGTCGCGGCCCTGGGCCCCGCCCCGGAAGATAAGGCC
GCTCGCTGACGCCGTGTTTCCTCTTTCGGCCGCGCTGGTGAACAGGTAGGTCATCCTTGCGGCCTTGCGG
CATGGGCAGTATCCGCCGCCATCCTCTTCCGTGAGGCGCGCTGAGACCCGG
RPL8 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPL8_2 ↗8:144,791,889負股144,791,879–144,791,938
RPL8_3 ↗8:144,792,134負股144,792,124–144,792,183
RPL8_1 ↗8:144,792,390負股144,792,380–144,792,439

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:257 aa

1 aa257 aa功能區域
依 P62917 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

RPL8 蛋白長 257 個胺基酸,屬於 universal ribosomal protein uL2 家族。其第 207 至 232 個胺基酸區段被註記為無序區。

功能區域Disordered207–232 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 22TU…

PDB · 22TU

EM · 3.00 A · LA=1-257

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

RPL8 的細胞定位註記為細胞質。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
L8RPL8MAP3K14
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RPL8 是大型核糖體次單元的組成成分。另有資料指出它與 CRY1 互作,但此互作註記依據相似性推定(By similarity),不應視為此處所列的直接實驗證實。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RPL8 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質組成的大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質;此敘述將 RPL8 的複合體組成角色與核糖體的整體功能相連結。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ · PMID 12962325 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RPL8 是大型核糖體次單元的組成成分;此外,資料記載 RPL8 與 CRY1 互作,但該互作依據為相似性推定(By similarity),其證據性質不同於大型核糖體次單元組成成分的註記。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit. Interacts with CRY1 (By similarity)

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ · PMID 12962325 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RPL8 的細胞內定位記載為細胞質;此註記提供其所在細胞區域,未進一步描述定位變化的條件或動態。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm

PMID 23636399 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000528957 · 1,070 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTCTTTCGGCCGCGCTGGTGAACAGGTAGGTCATCCTTGC40
41GGCCTTGCGGCATGGGCAGTATCCGCCGCCATCCTCTTCC80
81GTGAGGCGCGCTGAGACCCGGACCGGCCCTCCTGAGAGGA120
121TGCCGGTGCGGGCGCCCGCGGAGAGGGTAGGGAGTGGTGG160
161GCGCGGCGGCCTCGGGGGCGGGGTCCCGGAAAGCCGGGCT200
201GGCGGGGGTACCCGGGCCGCCCGGCCGCGCTAATCGTGAG240
241TCGCCCCCAGGACCCGTCGCCATGGGCCGTGTGATCCGTG280
281GACAGAGGAAGGGCGCCGGGTCTGTGTTCCGCGCGCACGT320
321GAAGCACCGTAAAGGCGCTGCGCGCCTGCGCGCCGTGGAT360
361TTCGCTGAGCGGCACGGCTACATCAAGGGCATCGTCAAGG400
401ACATCATCCACGACCCGGGCCGCGGCGCGCCCCTCGCCAA440
441GGTGGTCTTCCGGGATCCGTATCGGTTTAAGAAGCGGACG480
481GAGCTGTTCATTGCCGCCGAGGGCATTCACACGGGCCAGT520
521TTGTGTATTGCGGCAAGAAGGCCCAGCTCAACATTGGCAA560
561TGTGCTCCCTGTGGGCACCATGCCTGAGGGTACAATCGTG600
601TGCTGCCTGGAGGAGAAGCCTGGAGACCGTGGCAAGCTGG640
641CCCGGGCATCAGGGAACTATGCCACCGTTATCTCCCACAA680
681CCCTGAGACCAAGAAGACCCGTGTGAAGCTGCCCTCCGGC720
721TCCAAGAAGGTTATCTCCTCAGCCAACAGAGCTGTGGTTG760
761GTGTGGTGGCTGGAGGTGGCCGAATTGACAAACCCATCTT800
801GAAGGCTGGCCGGGCGTACCACAAATATAAGGCAAAGAGG840
841AACTGCTGGCCACGAGTACGGGGTGTGGCCATGAATCCTG880
881TGGAGCATCCTTTTGGAGGTGGCAACCACCAGCACATCGG920
921CAAGCCCTCCACCATCCGCAGAGATGCCCCTGCTGGCCGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。