演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPL7ASURF3

ribosomal protein L7a

RPL7A 編碼 ribosomal protein L7a,屬於真核生物核糖體蛋白 eL8 家族,是大型核糖體次單元的組成成員。

Homo sapiens9q34.2UniProt P62424
OFFICIAL SYMBOL
RPL7A
CHROMOSOME
9
UNIPROT
P62424
PDB / ALPHAFOLD
22TU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPL7A 是一個蛋白質編碼基因,其產物 ribosomal protein L7a 屬於真核生物核糖體蛋白 eL8 家族。它是大型核糖體次單元的組成部分;核糖體則是由 RNA 與蛋白質構成、負責在細胞內合成蛋白質的大型複合體。現有資料支持其核糖體組成角色,但未提供此蛋白質的序列長度、結構域或其他結構細節。

Official symbol
RPL7A
Gene name
ribosomal protein L7a
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10364
UniProt
P62424
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SURF3TRUPL7AeL8

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99q34.2
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegRPL7Apq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr9:133,347,950–133,351,435
Gene span
3,486 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000323345 ★133,348,218–133,351,4268
ENST00000901515133,348,194–133,351,4358
ENST00000901516133,348,194–133,351,4358
ENST00000930887133,348,194–133,351,4358
ENST00000930888133,348,194–133,351,4358
ENST00000930889133,348,194–133,351,4358
ENST00000930890133,348,194–133,351,4357
ENST00000930891133,348,194–133,351,4358
ENST00000930892133,348,194–133,351,4356
ENST00000930893133,348,194–133,351,4357
ENST00000983315133,348,194–133,351,4268
ENST00001064949133,348,194–133,351,4268

顯示 12/32 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RPL7A 的產物 ribosomal protein L7a 是大型核糖體次單元的組成成員。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的核糖核蛋白複合體,負責細胞內蛋白質的合成;因此,RPL7A 所支持的主要功能脈絡,是參與核糖體這套蛋白質合成機器的組成。現有資料未進一步說明它在核糖體中的具體位置或分子作用方式,也沒有描述其對翻譯步驟的個別影響。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 133348218 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPL7A ENST00000323345 GRCh38 chr9:133347218-133348318 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTAAAAAGTGGTCATTCCAACCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG
CAGGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACTAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCAACTCTACTAAAA
ATACAAAAATTAGCCGGGCGTGATGGCAGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGA
ATCGCTTGAACCCGGGAAGCACAGGTCGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGAC
AGGGGGAGACTACGTCTCCAAAAGAAAAAAAAAAGGGGGGTAATTCCACTCCCTCGCTTAACATCCCTCA
TGGTTCCCCGGTGCGCCGGGACAAGGGGCTCAAGTTCCGCGCCGCGCCTCTCGGCCTCTGCCCTCCAGCC
GCACTGGACGGCCTCGGCGCTGGAGTTGCCTGGCCCTGGGGCCGGGCCTTTGCGCGCGGTGCTCAGGGAG
GGCCCGGGGCCCCCTAGGTTCGGAGTCTGGCGCACGACCGAGCGGACTCCTGGACGCACTCGCATTGTTT
GTGCCCATTTTTGGCGGGGTGTGGGAAATAAGTCACACGCAGGAAAGGGGATCTCCGACCCCAGCGCCTA
CGCACCCACCCACCCCCACTCCCGCCCACACACCCACCCCCCCTCCATCCCCACCCCCCACCACACCCTC
ATACCCGCCCCAGCGCCCGCACACCAGACGCCGCGTCCGCCGGGTCGGCCTAGGGCGGGGTGGTCAAGTG
CCTCTGCGACCCGCACTTTCCCGCGTCTCTCCCACGGCCTGGCCCTCCCGCCGCAGTCTCTCTTCCCCGC
CGCGCCGCGGTCCGAAAACCTAGTCAGCCGCCGCAGCCTCTCGGCCCCGCCTCGATTTTTAGCTTTATAG
GAATGCTGTTGCTTTAAATCCGAAATCCCGTGCCGGTATCAACTCTCGCGATCTCCGAGGCCGCATACAT
ATTACCCACAATTCCCTTTCCTTTCTCTCTCCTCCCGCCGCCCAAGATGGTGAGTGAGCTGTAGTTCCGT
GGCACTATAGCCAGGTTCCGGCTGTATCCGCTGCCATCCTCCTCCAGGCGC
RPL7A 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPL7A_1 ↗9:133,348,222正股133,348,173–133,348,232

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_CH893 · enhancer · 133346385–133347692 · regulatory

ENSR9_BZGJ8 · promoter · 133347693–133348228 · regulatory

ENSR9_536CSXG · CTCF_binding_site · 133348334–133348355 · regulatory

ENSR9_93XX3N · promoter · 133348432–133348932 · regulatory

ENSR9_85WT5P · enhancer · 133349164–133349347 · regulatory

ENSR9_536CTL6 · CTCF_binding_site · 133352163–133352184 · regulatory

ENSR9_536CTMG · CTCF_binding_site · 133352440–133352461 · regulatory

· motif · 133347298–133347310 · motif

· motif · 133347300–133347307 · motif

· motif · 133347300–133347315 · motif

· motif · 133347619–133347632 · motif

· motif · 133347840–133347853 · motif

· motif · 133347868–133347881 · motif

· motif · 133347921–133347934 · motif

· motif · 133348336–133348352 · motif

· motif · 133351114–133351125 · motif

· motif · 133351946–133351954 · motif

· motif · 133352165–133352181 · motif

· motif · 133352441–133352452 · motif

· motif · 133352442–133352458 · motif

· motif · 133353013–133353030 · motif

· motif · 133353015–133353030 · motif

· motif · 133353022–133353030 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:266 aa

ribosomal protein L7a 屬於真核生物核糖體蛋白 eL8 家族。現有資料沒有提供其序列長度、結構域、功能區域或序列註解等細節。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 22TU…

PDB · 22TU

EM · 3.00 A · LG=1-266

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

資料將 RPL7A 產物定位於細胞質;未提供其他定位或依條件改變的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SURF3RPL7ARPL36RPL7L1RSL1D1STAU1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RPL7A 是大型核糖體次單元的組成成員。它與 CRY1 的互作屬於相似性推定;另有資料指出 RPL7A 與 DICER1、AGO2、TARBP2、MOV10 及 EIF6 互作,這些分子共同形成大型 RNA-induced silencing complex(RISC)。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

資料指出,涉及 RPL7A 的染色體重組會活化 TRK 致癌基因的受體激酶結構域。此敘述描述特定重組事件與激酶結構域活化的關聯,未提供更進一步的疾病或變異證據。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RPL7A 產物是大型核糖體次單元的組成成員。核糖體是大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RPL7A 是大型核糖體次單元的組成成員;與 CRY1 的互作為相似性推定。資料亦指出它與 DICER1、AGO2、TARBP2、MOV10 及 EIF6 互作,這些分子共同形成大型 RNA-induced silencing complex(RISC)。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit. Interacts with CRY1 (By similarity). Interacts with DICER1, AGO2, TARBP2, MOV10 and EIF6; they form a large RNA-induced silencing complex (RISC)

PMID 17507929 ↗ · PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RPL7A 定位於細胞質。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm

PMID 23636399 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯涉及 RPL7A 的染色體重組會活化 TRK 致癌基因的受體激酶結構域。資料庫紀錄
證據與來源

Chromosomal recombination involving RPL7A activates the receptor kinase domain of the TRK oncogene

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000323345 · 887 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTTTCTCTCTCCTCCCGCCGCCCAAGATGCCGAAAGGAAA40
41GAAGGCCAAGGGAAAGAAGGTGGCTCCGGCCCCAGCTGTC80
81GTGAAGAAGCAGGAGGCTAAGAAAGTGGTGAATCCCCTGT120
121TTGAGAAAAGGCCTAAGAATTTTGGCATTGGACAGGACAT160
161CCAGCCCAAAAGAGACCTCACCCGCTTTGTGAAATGGCCC200
201CGCTATATCAGGTTGCAGCGGCAGAGAGCCATCCTCTATA240
241AGCGGCTGAAAGTGCCTCCTGCGATTAACCAGTTCACCCA280
281GGCCCTGGACCGCCAAACAGCTACTCAGCTGCTTAAGCTG320
321GCCCACAAGTACAGACCAGAGACAAAGCAAGAGAAGAAGC360
361AGAGACTGTTGGCCCGGGCCGAGAAGAAGGCTGCTGGCAA400
401AGGGGACGTCCCAACGAAGAGACCACCTGTCCTTCGAGCA440
441GGAGTTAACACCGTCACCACCTTGGTGGAGAACAAGAAAG480
481CTCAGCTGGTGGTGATTGCACACGACGTGGATCCCATCGA520
521GCTGGTTGTCTTCTTGCCTGCCCTGTGTCGTAAAATGGGG560
561GTCCCTTACTGCATTATCAAGGGAAAGGCAAGACTGGGAC600
601GTCTAGTCCACAGGAAGACCTGCACCACTGTCGCCTTCAC640
641ACAGGTGAACTCGGAAGACAAAGGCGCTTTGGCTAAGCTG680
681GTGGAAGCTATCAGGACCAATTACAATGACAGATACGATG720
721AGATCCGCCGTCACTGGGGTGGCAATGTCCTGGGTCCTAA760
761GTCTGTGGCTCGTATCGCCAAGCTCGAAAAGGCAAAGGCT800
801AAAGAACTTGCCACTAAACTGGGTTAAATGTACACTGTTG840
841AGTTTTCTGTACATAAAAATAATTGAAATAATACAAATTT880
881TCCTTCA887

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。