基因總覽
RPL7 是蛋白質編碼基因,其產物 ribosomal protein L7 屬於大型核糖體次單元。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責細胞內蛋白質合成。現有資料支持 ribosomal protein L7 是此核糖體次單元的組成成分,並指出它與翻譯裝置的調節有關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000352983 ★ | 73,290,242–73,293,633 | 7 |
| ENST00001128449 | 73,276,478–73,294,339 | 5 |
| ENST00001128450 | 73,276,478–73,294,339 | 4 |
| ENST00001133632 | 73,290,242–73,294,339 | 7 |
| ENST00000396467 | 73,290,284–73,293,633 | 6 |
| ENST00000863689 | 73,290,544–73,294,339 | 6 |
| ENST00001101494 | 73,290,641–73,294,339 | 4 |
| ENST00000863690 | 73,290,644–73,294,339 | 7 |
| ENST00000396466 | 73,291,040–73,295,789 | 6 |
| ENST00000396465 | 73,291,042–73,294,438 | 6 |
| ENST00000435330 | 73,291,783–73,292,922 | 4 |
| ENST00000431653 | 73,291,816–73,293,342 | 4 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ribosomal protein L7 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體由 RNA 與蛋白質構成,負責在細胞內合成蛋白質,因此 RPL7 產物位於執行蛋白質合成的核糖體結構中。
除作為核糖體組成成分外,ribosomal protein L7 也被描述為具有調節翻譯裝置的作用。資料指出,它可結合 28S rRNA 與 mRNA 中富含 G 的結構,顯示其與核糖體 RNA 及訊息 RNA 的特定序列結構有關聯;來源未進一步界定這些結合在細胞內的具體作用方式。
在無細胞翻譯實驗中,ribosomal protein L7 可抑制 mRNA 的翻譯。這項觀察支持它具有影響翻譯活性的能力,但來源未說明此抑制作用在細胞中的條件或生理意義,也未提供其調節特定 mRNA 或蛋白質產量的證據。
Promoter 與基因調控
>RPL7 ENST00000352983 GRCh38 chr8:73293533-73294633 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCTTGCAAGTCAGAGCGCTCCGGGCCGGCTCTGAGCGGGCTCCACGCTCCGCGCTATATAACCCCGCGAC CGGGAAGAGCCCGCGCCAGCCTCGGCATCGGCCCTCCCTCCGCCCGGCCTCCCCGCCCCCGGGCGCACCC CGCCCCCGGCCCAGCCCCCAGCCCGCCAGCCGTCCGCGGAGCCGAGCCGGGTAGCCCCTCTCACACGGCC GTGGCCGCAACCTCAGCCCTCCTCGCACCTCCCTTCGCAGCTCACGCCCCCTCCCGTGGGGTGTCCTGGC CTCCGCCTGCCGAGCTCGGCAGTCAGCAGAGCCCCGGCCATCCTCCTCCGGCCGTCCGGTCCCCACTGGT CCCTGGCTAGCCACTTTTCGTAAGCTAGAGCACTCCAGACCGCCCCGCCTGCGATCAGGCGCTGCGGAAG ACAGCCCTGTGGGCTGGAGCGACGACAAGGACCTCGCGGAGCGGCGAAAGGGGTGTAGTCTGCGACTACC GCGGCAGGGAGCCGGGAGGGCGGCCAAAAGTGACTTCGAATTGCAGCTAGCCGTTTGGAACGTGGCCCAA GAGGCTCTCATTTTCCTGGCTGGAACCGTCGCCGCGGTGCTTGCCTGCGGTCCTGGTCAGCCGTTGCCCT CCCGCCGGGCGGGCGAAGACTGGTGCATGCTGGGATTTGTAGTTCGTCCCCATGAGGCTCGTCCTGGGAA CATTATGGGGAGGAACGGAGCCTAATCCTGTCAGCGCAGCCTGGGGATTAGGACCCGGAGTTGCCAAGGT GTCAGCACTCTTTGCTCTTGAATTGATTAAAAAGTCTAATCAAATGCATATATTTTCTTCAAACAAGTTT TACCCGAAAGTTTGTTGAAAGAGGCTAAATCAGGGAGTTCTTTGCGTCTGCAAGGCGGCTTTTTAGTTCT GGATTCTTTTCCGGCTTATTCTAAGACACCTATGAGTCGTGGGGCTTCTCTCGCGAAGTCTTTAAGTGGA CAGTACGCATGCGCCAACTTCCTCTTTTTCCGGCTGGAACCATGGAGGGTGTAGAGTGAGTTGCTTCTGG TCCTCTTGAGAATCCTTCTCCATCTCCAGAGCCAGATACTTTTTGTGTCAC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPL7_2 ↗ | 8:73,291,041 | 負股 | 73,291,031–73,291,090 |
| RPL7_1 ↗ | 8:73,293,632 | 負股 | 73,293,622–73,293,681 |
| RPL7_3 ↗ | 8:73,293,943 | 負股 | 73,293,933–73,293,992 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR8_5M8GBT · CTCF_binding_site · 73292646–73292667 · regulatory
ENSR8_9344GP · promoter · 73293623–73294123 · regulatory
ENSR8_5M8GLR · CTCF_binding_site · 73294363–73294384 · regulatory
ENSR8_8466XR · promoter · 73294428–73294612 · regulatory
ENSR8_5M8GPT · CTCF_binding_site · 73295023–73295044 · regulatory
ENSR8_9344HC · promoter · 73295779–73296262 · regulatory
ENSR8_9344HK · promoter · 73296673–73297026 · regulatory
· motif · 73292126–73292137 · motif
· motif · 73292648–73292664 · motif
· motif · 73293313–73293324 · motif
· motif · 73293625–73293638 · motif
· motif · 73293627–73293638 · motif
· motif · 73293627–73293638 · motif
· motif · 73293639–73293650 · motif
· motif · 73293639–73293650 · motif
· motif · 73293666–73293677 · motif
· motif · 73293852–73293863 · motif
· motif · 73294088–73294103 · motif
· motif · 73294137–73294154 · motif
· motif · 73294365–73294381 · motif
· motif · 73295025–73295041 · motif
· motif · 73295798–73295811 · motif
· motif · 73295798–73295811 · motif
· motif · 73296259–73296274 · motif
· motif · 73296259–73296274 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:248 aa
ribosomal protein L7 長 248 個胺基酸,屬於 universal ribosomal protein uL30 家族。其序列第 7 至 54 個胺基酸區段包含四個串聯重複,每個重複長 12 個胺基酸;資料未另行註明這些重複的功能。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 ribosomal protein L7 的定位記載於細胞質,未提供定位變動條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- IPO5O00410 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- NEDD8Q15843 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
ribosomal protein L7 是大型核糖體次單元的組成成分。資料另記載其可形成同源二聚體,並與 DHX33 互作;未提供這些互作的具體條件或功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ribosomal protein L7 是大型核糖體次單元的組成成分;核糖體是由 RNA 與蛋白質構成、負責細胞內蛋白質合成的大型複合體。它可結合 28S rRNA 與 mRNA 中富含 G 的結構,並具有調節翻譯裝置的作用;在無細胞系統中,ribosomal protein L7 會抑制 mRNA 翻譯。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell. Binds to G-rich structures in 28S rRNA and in mRNAs. Plays a regulatory role in the translation apparatus; inhibits cell-free translation of mRNAs PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ · PMID 12962325 ↗ |
| 交互作用 | ribosomal protein L7 是大型核糖體次單元的組成成分。資料也記載它可形成同源二聚體,並與 DHX33 互作;未提供互作條件或其功能後果。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. Homodimer. Interacts with DHX33 PMID 23636399 ↗ · PMID 26100019 ↗ · PMID 32669547 ↗ · PMID 12962325 ↗ |
| 細胞定位 | ribosomal protein L7 的細胞內定位記載為細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CCTCTTTTTCCGGCTGGAACCATGGAGGGTGTAGAAGAGA40AGAAGAAGGAGGTTCCTGCTGTGCCAGAAACCCTTAAGAA80AAAGCGAAGGAATTTCGCAGAGCTGAAGATCAAGCGCCTG120AGAAAGAAGTTTGCCCAAAAGATGCTTCGAAAGGCAAGGA160GGAAGCTTATCTATGAAAAAGCAAAGCACTATCACAAGGA200ATATAGGCAGATGTACAGAACTGAAATTCGAATGGCGAGG240ATGGCAAGAAAAGCTGGCAACTTCTATGTACCTGCAGAAC280CCAAATTGGCGTTTGTCATCAGAATCAGAGGTATCAATGG320AGTGAGCCCAAAGGTTCGAAAGGTGTTGCAGCTTCTTCGC360CTTCGTCAAATCTTCAATGGAACCTTTGTGAAGCTCAACA400AGGCTTCGATTAACATGCTGAGGATTGTAGAGCCATATAT440TGCATGGGGGTACCCCAATCTGAAGTCAGTAAATGAACTA480ATCTACAAGCGTGGTTATGGCAAAATCAATAAGAAGCGAA520TTGCTTTGACAGATAACGCTTTGATTGCTCGATCTCTTGG560TAAATACGGCATCATCTGCATGGAGGATTTGATTCATGAG600ATCTATACTGTTGGAAAACGCTTCAAAGAGGCAAATAACT640TCCTGTGGCCCTTCAAATTGTCTTCTCCACGAGGTGGAAT680GAAGAAAAAGACCACCCATTTTGTAGAAGGTGGAGATGCT720GGCAACAGGGAGGACCAGATCAACAGGCTTATTAGAAGAA760TGAACTAAGGTGTCTACCATGATTATTTTTCTAAGCTGGT800TGGTTAATAAACAGTACCTGCTCTCAAATTGAAATATATT840GTTGTATTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTGTTAGCCTGCCT880CTGTCTTCCCTTAACTACTGTGGCAAGTGTGGTGTGTGAT920AAAATTAAGCCAAATCAACAGCCCATTTCGTGCAAAATCA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。