演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPL7humL7-1

ribosomal protein L7

RPL7 編碼 ribosomal protein L7,為大型核糖體次單元的組成成分;核糖體負責細胞內蛋白質合成。

Homo sapiens8q21.11UniProt P18124
OFFICIAL SYMBOL
RPL7
CHROMOSOME
8
UNIPROT
P18124
PDB / ALPHAFOLD
22TU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPL7 是蛋白質編碼基因,其產物 ribosomal protein L7 屬於大型核糖體次單元。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責細胞內蛋白質合成。現有資料支持 ribosomal protein L7 是此核糖體次單元的組成成分,並指出它與翻譯裝置的調節有關。

Official symbol
RPL7
Gene name
ribosomal protein L7
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10363
UniProt
P18124
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
humL7-1L7uL30

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88q21.11
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegRPL7pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr8:73,276,478–73,295,789
Gene span
19,312 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000352983 ★73,290,242–73,293,6337
ENST0000112844973,276,478–73,294,3395
ENST0000112845073,276,478–73,294,3394
ENST0000113363273,290,242–73,294,3397
ENST0000039646773,290,284–73,293,6336
ENST0000086368973,290,544–73,294,3396
ENST0000110149473,290,641–73,294,3394
ENST0000086369073,290,644–73,294,3397
ENST0000039646673,291,040–73,295,7896
ENST0000039646573,291,042–73,294,4386
ENST0000043533073,291,783–73,292,9224
ENST0000043165373,291,816–73,293,3424

顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ribosomal protein L7 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體由 RNA 與蛋白質構成,負責在細胞內合成蛋白質,因此 RPL7 產物位於執行蛋白質合成的核糖體結構中。

除作為核糖體組成成分外,ribosomal protein L7 也被描述為具有調節翻譯裝置的作用。資料指出,它可結合 28S rRNA 與 mRNA 中富含 G 的結構,顯示其與核糖體 RNA 及訊息 RNA 的特定序列結構有關聯;來源未進一步界定這些結合在細胞內的具體作用方式。

在無細胞翻譯實驗中,ribosomal protein L7 可抑制 mRNA 的翻譯。這項觀察支持它具有影響翻譯活性的能力,但來源未說明此抑制作用在細胞中的條件或生理意義,也未提供其調節特定 mRNA 或蛋白質產量的證據。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 73293633 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPL7 ENST00000352983 GRCh38 chr8:73293533-73294633 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCTTGCAAGTCAGAGCGCTCCGGGCCGGCTCTGAGCGGGCTCCACGCTCCGCGCTATATAACCCCGCGAC
CGGGAAGAGCCCGCGCCAGCCTCGGCATCGGCCCTCCCTCCGCCCGGCCTCCCCGCCCCCGGGCGCACCC
CGCCCCCGGCCCAGCCCCCAGCCCGCCAGCCGTCCGCGGAGCCGAGCCGGGTAGCCCCTCTCACACGGCC
GTGGCCGCAACCTCAGCCCTCCTCGCACCTCCCTTCGCAGCTCACGCCCCCTCCCGTGGGGTGTCCTGGC
CTCCGCCTGCCGAGCTCGGCAGTCAGCAGAGCCCCGGCCATCCTCCTCCGGCCGTCCGGTCCCCACTGGT
CCCTGGCTAGCCACTTTTCGTAAGCTAGAGCACTCCAGACCGCCCCGCCTGCGATCAGGCGCTGCGGAAG
ACAGCCCTGTGGGCTGGAGCGACGACAAGGACCTCGCGGAGCGGCGAAAGGGGTGTAGTCTGCGACTACC
GCGGCAGGGAGCCGGGAGGGCGGCCAAAAGTGACTTCGAATTGCAGCTAGCCGTTTGGAACGTGGCCCAA
GAGGCTCTCATTTTCCTGGCTGGAACCGTCGCCGCGGTGCTTGCCTGCGGTCCTGGTCAGCCGTTGCCCT
CCCGCCGGGCGGGCGAAGACTGGTGCATGCTGGGATTTGTAGTTCGTCCCCATGAGGCTCGTCCTGGGAA
CATTATGGGGAGGAACGGAGCCTAATCCTGTCAGCGCAGCCTGGGGATTAGGACCCGGAGTTGCCAAGGT
GTCAGCACTCTTTGCTCTTGAATTGATTAAAAAGTCTAATCAAATGCATATATTTTCTTCAAACAAGTTT
TACCCGAAAGTTTGTTGAAAGAGGCTAAATCAGGGAGTTCTTTGCGTCTGCAAGGCGGCTTTTTAGTTCT
GGATTCTTTTCCGGCTTATTCTAAGACACCTATGAGTCGTGGGGCTTCTCTCGCGAAGTCTTTAAGTGGA
CAGTACGCATGCGCCAACTTCCTCTTTTTCCGGCTGGAACCATGGAGGGTGTAGAGTGAGTTGCTTCTGG
TCCTCTTGAGAATCCTTCTCCATCTCCAGAGCCAGATACTTTTTGTGTCAC
RPL7 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPL7_2 ↗8:73,291,041負股73,291,031–73,291,090
RPL7_1 ↗8:73,293,632負股73,293,622–73,293,681
RPL7_3 ↗8:73,293,943負股73,293,933–73,293,992

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_5M8GBT · CTCF_binding_site · 73292646–73292667 · regulatory

ENSR8_9344GP · promoter · 73293623–73294123 · regulatory

ENSR8_5M8GLR · CTCF_binding_site · 73294363–73294384 · regulatory

ENSR8_8466XR · promoter · 73294428–73294612 · regulatory

ENSR8_5M8GPT · CTCF_binding_site · 73295023–73295044 · regulatory

ENSR8_9344HC · promoter · 73295779–73296262 · regulatory

ENSR8_9344HK · promoter · 73296673–73297026 · regulatory

· motif · 73292126–73292137 · motif

· motif · 73292648–73292664 · motif

· motif · 73293313–73293324 · motif

· motif · 73293625–73293638 · motif

· motif · 73293627–73293638 · motif

· motif · 73293627–73293638 · motif

· motif · 73293639–73293650 · motif

· motif · 73293639–73293650 · motif

· motif · 73293666–73293677 · motif

· motif · 73293852–73293863 · motif

· motif · 73294088–73294103 · motif

· motif · 73294137–73294154 · motif

· motif · 73294365–73294381 · motif

· motif · 73295025–73295041 · motif

· motif · 73295798–73295811 · motif

· motif · 73295798–73295811 · motif

· motif · 73296259–73296274 · motif

· motif · 73296259–73296274 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:248 aa

1 aa248 aa功能區域重複區
依 P18124 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ribosomal protein L7 長 248 個胺基酸,屬於 universal ribosomal protein uL30 家族。其序列第 7 至 54 個胺基酸區段包含四個串聯重複,每個重複長 12 個胺基酸;資料未另行註明這些重複的功能。

重複區17–18 aa
重複區219–30 aa
重複區331–42 aa
重複區443–54 aa
功能區域4 X 12 AA tandem repeats7–54 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 22TU…

PDB · 22TU

EM · 3.00 A · LF=1-248

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

資料將 ribosomal protein L7 的定位記載於細胞質,未提供定位變動條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
humL7-1RPL7IPO5NEDD8
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ribosomal protein L7 是大型核糖體次單元的組成成分。資料另記載其可形成同源二聚體,並與 DHX33 互作;未提供這些互作的具體條件或功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ribosomal protein L7 是大型核糖體次單元的組成成分;核糖體是由 RNA 與蛋白質構成、負責細胞內蛋白質合成的大型複合體。它可結合 28S rRNA 與 mRNA 中富含 G 的結構,並具有調節翻譯裝置的作用;在無細胞系統中,ribosomal protein L7 會抑制 mRNA 翻譯。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell. Binds to G-rich structures in 28S rRNA and in mRNAs. Plays a regulatory role in the translation apparatus; inhibits cell-free translation of mRNAs

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ · PMID 12962325 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ribosomal protein L7 是大型核糖體次單元的組成成分。資料也記載它可形成同源二聚體,並與 DHX33 互作;未提供互作條件或其功能後果。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit. Homodimer. Interacts with DHX33

PMID 23636399 ↗ · PMID 26100019 ↗ · PMID 32669547 ↗ · PMID 12962325 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ribosomal protein L7 的細胞內定位記載為細胞質。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm

PMID 23636399 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000352983 · 1,233 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1CCTCTTTTTCCGGCTGGAACCATGGAGGGTGTAGAAGAGA40
41AGAAGAAGGAGGTTCCTGCTGTGCCAGAAACCCTTAAGAA80
81AAAGCGAAGGAATTTCGCAGAGCTGAAGATCAAGCGCCTG120
121AGAAAGAAGTTTGCCCAAAAGATGCTTCGAAAGGCAAGGA160
161GGAAGCTTATCTATGAAAAAGCAAAGCACTATCACAAGGA200
201ATATAGGCAGATGTACAGAACTGAAATTCGAATGGCGAGG240
241ATGGCAAGAAAAGCTGGCAACTTCTATGTACCTGCAGAAC280
281CCAAATTGGCGTTTGTCATCAGAATCAGAGGTATCAATGG320
321AGTGAGCCCAAAGGTTCGAAAGGTGTTGCAGCTTCTTCGC360
361CTTCGTCAAATCTTCAATGGAACCTTTGTGAAGCTCAACA400
401AGGCTTCGATTAACATGCTGAGGATTGTAGAGCCATATAT440
441TGCATGGGGGTACCCCAATCTGAAGTCAGTAAATGAACTA480
481ATCTACAAGCGTGGTTATGGCAAAATCAATAAGAAGCGAA520
521TTGCTTTGACAGATAACGCTTTGATTGCTCGATCTCTTGG560
561TAAATACGGCATCATCTGCATGGAGGATTTGATTCATGAG600
601ATCTATACTGTTGGAAAACGCTTCAAAGAGGCAAATAACT640
641TCCTGTGGCCCTTCAAATTGTCTTCTCCACGAGGTGGAAT680
681GAAGAAAAAGACCACCCATTTTGTAGAAGGTGGAGATGCT720
721GGCAACAGGGAGGACCAGATCAACAGGCTTATTAGAAGAA760
761TGAACTAAGGTGTCTACCATGATTATTTTTCTAAGCTGGT800
801TGGTTAATAAACAGTACCTGCTCTCAAATTGAAATATATT840
841GTTGTATTTGTGATTTGTTGTTGTTGTTGTTAGCCTGCCT880
881CTGTCTTCCCTTAACTACTGTGGCAAGTGTGGTGTGTGAT920
921AAAATTAAGCCAAATCAACAGCCCATTTCGTGCAAAATCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。