基因總覽
RPL41 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 ribosomal protein L41。其產物屬於真核核糖體蛋白 eS32 家族，是一種短小的核糖體蛋白，序列長度為 25 個胺基酸；資料註解指出，整段序列屬於無序區域。來源將它列為小型核糖體次單元的可能組成成分，並將核糖體描述為細胞內負責合成蛋白質的大型核糖核蛋白複合體。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000546591 ★ | 56,116,633–56,117,967 | 3 |
| ENST00000501597 | 56,116,585–56,117,832 | 4 |
| ENST00000945892 | 56,116,632–56,117,829 | 3 |
| ENST00001003506 | 56,116,632–56,117,825 | 3 |
| ENST00001104965 | 56,116,632–56,117,829 | 3 |
| ENST00001133865 | 56,116,632–56,117,967 | 3 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPL41 的產物被註記為可能是小型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體，負責在細胞中合成蛋白質；因此，這項註記將 RPL41 連結至核糖體相關的蛋白質合成過程。不過，來源以「可能」描述其小型次單元成分身分，並未將此點表述為確定結論。
除核糖體相關資訊外，RPL41 也被報告會與 protein kinase CKII 的 beta subunit 互作，並刺激 CKII 對 DNA topoisomerase II alpha 的磷酸化。這指出它與 CKII 及其底物之間存在一項功能關係：在所述情境中，RPL41 促進 CKII 對 DNA topoisomerase II alpha 的磷酸化。來源未進一步交代此作用的細胞條件、分子機制或生物學後果，因此不宜延伸推論其影響範圍。
Promoter 與基因調控
>RPL41 ENST00000546591 GRCh38 chr12:56115633-56116733 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GATATTTTGCTTCGGGCATCGTGGGGGAAGACCATAATCAGCTATTTTATTCTTGAAATTTAGGAAAAAT AATTGCTCTATCTTAAACAGTGAGAAAATATTTTTTGAAGTATGGCAGCTTTCCCGAATCCCCACTTTAT ATCTTCCTATGTTCTGAAATCTTAGGACCTTCGATGGTTCCGGAATCGAATCACCCTGCAGCAATTTATT TTAGAAAATAAGGCAAACCGGCTGGGCGCGGTGGTTCATGCTTGTAATCCCAGCACTTTGAGAGGCCGAG GCGGGCGGATCGCTTGAGCTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGGCAACACAGCGAAACCTCGTCTCTACTA AAAATACAAAAATTAGCCAAGTGGCGCGCGCCTGTTGTCCCAGCTGCTCGGGAAGCTGAGGCGGGAGAAT CGCTTGTATTCAGGAGGCGGAAATTGCGGTGAGCCGAGATCGCGTCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAC AGTGAGATCCTGTCTCAAAAAAGAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAA AGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAGGCAAACCAGTAAAACAAGAATTTCTGTA CAGTCCGCGCCTATCCATAGCAAAATGGAGGACTTCTCCAGGGAACTGCAACTCCCAAGAAGCAATGCGA GGGAAGGTGGCGGTCACTATTTTTTCCCCGTCTGCACCTCTAGGTCCAATATTGGAAATAGGTGCTGACG TTTAAATAACACAGCGTCCTCATACTAAATCTGGGGGGGAACTGGTAACTCGAAAACCAAATACTCGGTC TTCCGAAAGAACTAACTCAACCTACCCTTCTACAAGAGGGTCCGAAAACCACTGTTACGCCCATTGGGTA GCCCCGCCCTTGGGGGGGGCAAAGGGCGTGAAAGCGGAAGTGACGACACCCGGCGCTCCATTAAATAGCC GTAGACGGAACTTCGCCTTTCTCTCGGCCTTAGCGCCATTTTTTTGGGTGAGTGTTTTTTGGTTCCTGCG TTGGGATTCCGTGTACAATCCATAGACATCTGACCTCGGCACTTAGCATCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPL41_1 ↗ | 12:56,116,633 | 正股 | 56,116,584–56,116,643 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR12_BF5NN · promoter · 56116100–56116643 · regulatory
ENSR12_C7KCF · enhancer · 56116644–56117949 · regulatory
ENSR12_9S9DT · promoter · 56117950–56118276 · regulatory
ENSR12_5H7DGT · CTCF_binding_site · 56118277–56118298 · regulatory
ENSR12_D4R6R · enhancer · 56118277–56120503 · regulatory
ENSR12_5H7DNM · CTCF_binding_site · 56119523–56119544 · regulatory
· motif · 56113622–56113636 · motif
· motif · 56114588–56114599 · motif
· motif · 56116285–56116295 · motif
· motif · 56116295–56116308 · motif
· motif · 56116295–56116308 · motif
· motif · 56116543–56116553 · motif
· motif · 56116557–56116570 · motif
· motif · 56116557–56116571 · motif
· motif · 56116557–56116572 · motif
· motif · 56116571–56116584 · motif
· motif · 56116573–56116584 · motif
· motif · 56116573–56116584 · motif
· motif · 56116575–56116584 · motif
· motif · 56116621–56116634 · motif
· motif · 56116643–56116653 · motif
· motif · 56116709–56116721 · motif
· motif · 56116712–56116719 · motif
· motif · 56116868–56116878 · motif
· motif · 56117956–56117964 · motif
· motif · 56118081–56118098 · motif
· motif · 56118161–56118172 · motif
· motif · 56118192–56118206 · motif
· motif · 56118230–56118244 · motif
· motif · 56118231–56118244 · motif
· motif · 56118233–56118244 · motif
· motif · 56118279–56118295 · motif
· motif · 56118496–56118511 · motif
· motif · 56118497–56118510 · motif
· motif · 56118497–56118510 · motif
· motif · 56118535–56118544 · motif
· motif · 56118552–56118568 · motif
· motif · 56119525–56119541 · motif
· motif · 56119567–56119574 · motif
· motif · 56119574–56119583 · motif
· motif · 56119574–56119583 · motif
· motif · 56119792–56119805 · motif
· motif · 56121116–56121129 · motif
· motif · 56121116–56121129 · motif
· motif · 56121400–56121413 · motif
· motif · 56121400–56121413 · motif
· motif · 56121437–56121452 · motif
· motif · 56121613–56121623 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：25 aa
RPL41 的蛋白質產物屬於真核核糖體蛋白 eS32 家族，長度為 25 個胺基酸。序列註解將第 1 至第 25 位全段標示為無序區域；來源未提供其他結構域或功能區域註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源將 RPL41 的細胞內定位列為細胞質；未提供定位改變條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- SDCBP2Q9H190 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
RPL41 被列為小型核糖體次單元的組成成分，但該資訊未描述特定結合夥伴。另有資料指出，RPL41 與 protein kinase CKII 的 beta subunit 互作，並刺激 CKII 磷酸化 DNA topoisomerase II alpha；此處支持的是互作及促進磷酸化的功能關係，未進一步說明是否形成特定複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPL41 可能是小型核糖體次單元的組成成分。核糖體是細胞內負責合成蛋白質的大型核糖核蛋白複合體；此外，RPL41 與 protein kinase CKII 的 beta subunit 互作，並刺激 CKII 磷酸化 DNA topoisomerase II alpha。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the small ribosomal subunit (Probable) (Ref.8). The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell. Interacts with the beta subunit of protein kinase CKII and stimulates phosphorylation of DNA topoisomerase II alpha by CKII PMID 23636399 ↗ · PMID 9299532 ↗ |
| 交互作用 | RPL41 是小型核糖體次單元的組成成分。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | RPL41 定位於細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTCTCGGCCTTAGCGCCATTTTTTTGGGTGAGTGTTTTTT40GGTTCCTGCGTTGGGATTCCGTGTACAATCCATAGACATC80TGACCTCGGCACTTAGCATCATCACAGCAAACTAACTGTA120GCCTTTCTCTCTTTCCCTGTAGAAACCTCTGCGCCATGAG160AGCCAAGTGGAGGAAGAAGCGAATGCGCAGGCTGAAGCGC200AAAAGAAGAAAGATGAGGCAGAGGTCCAAGTAAACCGCTA240GCTTGTTGCACCGTGGAGGCCACAGGAGCAGAAACATGGA280ATGCCAGACGCTGGGGATGCTGGTACAAGTTGTGGGACTG320CATGCTACTGTCTAGAGCTTGTCTCAATGGATCTAGAACT360TCATCGCCCTCTGATCGCCGATCACCTCTGAGACCCACCT400TGCTCATAAACAAAATGCCCATGTTGGTCCTCTGCCCTGG440ACCTGTGACATTCTGGACTATTTCTGTGTTTATTTGTGGC480CGAGTGTAACAACCATATAATAAATCACCTCTTCCGCTGT520TTTAGCTGAAGAATTAAATCATCTTGTCTATTATGTTTTT560TATGGTTCCATCGGGTGGGGGTTTTCTGTCATTAGAGTTT600GCCCTGTCACTACCTGTGCTATGGAGGGTATCAAAGCTAT640AAAGGCAACAGCCCGGGTTACGTGGTGTGGTTTGCA676cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。