基因總覽
RPL4 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 ribosomal protein L4。其產物屬於 universal ribosomal protein uL4 family，並構成大型核糖體次單元。核糖體是由 RNA 與蛋白質組成的大型核糖核蛋白複合體，負責在細胞中合成蛋白質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000307961 ★ | 66,498,015–66,504,855 | 10 |
| ENST00001132542 | 66,498,015–66,504,869 | 10 |
| ENST00001072700 | 66,498,468–66,504,869 | 10 |
| ENST00000912452 | 66,498,958–66,504,869 | 10 |
| ENST00001072706 | 66,498,963–66,504,869 | 5 |
| ENST00001102402 | 66,498,963–66,504,869 | 6 |
| ENST00000856033 | 66,499,315–66,504,869 | 10 |
| ENST00000912453 | 66,499,315–66,504,869 | 8 |
| ENST00001102399 | 66,499,315–66,504,869 | 7 |
| ENST00001102400 | 66,499,315–66,504,869 | 7 |
| ENST00001102403 | 66,499,315–66,504,869 | 6 |
| ENST00001102404 | 66,499,315–66,504,869 | 6 |
顯示 12/41 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPL4 的產物是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體由 RNA 與蛋白質構成，是細胞合成蛋白質的核糖核蛋白複合體；因此，RPL4 所屬的核糖體次單元參與這項細胞蛋白質合成工作。現有資料支持其作為次單元成分及核糖體整體功能的描述，未提供 RPL4 個別分子作用方式或其他特定生物學過程的細節。
Promoter 與基因調控
>RPL4 ENST00000307961 GRCh38 chr15:66504755-66505855 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTTTTCAAAATGCAACACACCAATCTGCTATCATTACAATTGTAGCTGATGTGGCAACTACCTCGAATAA TAGAGATTAACAGACTAACACCACATTTCATTCTTAGGAGTCAACAAGGCTTTAAACAGGGGAAGGATGC CAACACCTAGTTTTCCGTATCCCGGGTGGTGCCTCTACTTATGGCAAGTGTGTCCATCAGCAGAAAGAAT AAATCGCCTCTTGGAACACTTGCCACCTTCCATCTCGTTTGATGACGTACACGTTTTCTCCTGAGACAAG CAAGCTCCCACACGGTCAACCCCACACCGGAGCCGAGAACCGGCCTCTCCCCAACTCCTGGACCCCAGGA AAGCTGGCAAAGCGCTGATCCCCAGAGTGGCAAGAGGCTTAGGGCGGGGATCCAGACACCCAGGGAAAGA AGTGCTGTCCCAGGACCCCAGCCAAAAGAAGAGACTAGACTCACTGAAGGAGACGAGAATAAAAGTCCTC TGCTGCGCAGTTCAGCCGCTCCCACATCCCGCCCCAATGTGAGAGCGGTACCGGAACCGCCAAACTGAAC TGCGCGCCGGACCGGCGACGTCAGGGGTCATGGCCCCGCCCCGCCGGGACTATTTTGACCACCCCCTACA ATAAGTCCTGTTTGTCCGCAAAGTTAAACTTTCGTTTCAAGCCACCCAGAGCTATTTACTATGTCAATAG TCTTCAACTTCCGTCTGCAATAATTAAAATAAGAGCAGTGGTTGGGGAGAAGATACCTCGACTCGCGAGA GTTGGCCTCGCCCCCTATGGATTATTCCGCAAAAAGGAGTCCCTATTTTCTAAGAATTATTATTACGTTT GGAAGAAAATAGATACCGTAATTTCCCACAAATAAAGAAATAACACTCTCGTTTTTACTTTTGTAGTGTG GTAGAGAGATATTTTTTGTATCCGTGTTGGTTCTTAGGCGGGGCAAGGTGGGGCGGTCAAGGGGAAGGTG ACATATACAGCGGGAGTGGTAAGCACTTCCTTTTCCTGTGGCAGCAGCCGGGCTGAGAGGAGCGTGGCTG TCTCCTCTCTCCGCCATGGTGAGTGGAAGTTCTCTTGGCTGGCCTTACCCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPL4_1 ↗ | 15:66,504,846 | 負股 | 66,504,836–66,504,895 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR15_C8L6R · enhancer · 66503796–66504844 · regulatory
ENSR15_9ZDPD · promoter · 66504845–66505336 · regulatory
ENSR15_BH7CQ · enhancer · 66505337–66506105 · regulatory
· motif · 66500576–66500588 · motif
· motif · 66500578–66500593 · motif
· motif · 66504344–66504355 · motif
· motif · 66504787–66504797 · motif
· motif · 66504839–66504852 · motif
· motif · 66504856–66504866 · motif
· motif · 66504983–66504994 · motif
· motif · 66505104–66505115 · motif
· motif · 66505139–66505150 · motif
· motif · 66505139–66505150 · motif
· motif · 66505253–66505263 · motif
· motif · 66505259–66505272 · motif
· motif · 66505259–66505272 · motif
· motif · 66505262–66505274 · motif
· motif · 66505265–66505272 · motif
· motif · 66505266–66505279 · motif
· motif · 66505341–66505351 · motif
· motif · 66506106–66506122 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：427 aa
RPL4 產物長 427 個胺基酸，屬於 universal ribosomal protein uL4 family。序列註解指出第 369 至 427 位胺基酸為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RPL4 的細胞定位資料記載為細胞質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 14 experiments
- MAP3K14Q99558 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RPL14P50914 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- RPL18Q07020 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RPL18AQ02543 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RPL28P46779 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RPS20P60866 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
RPL4 是大型核糖體次單元的組成成分。資料指出它可能以低親和力結合 IPO9；另有 By similarity 的註記指出 RPL4 與 RBM3 互作，但未進一步說明互作方式。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPL4 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體，負責在細胞中合成蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ |
| 交互作用 | RPL4 是大型核糖體次單元的組成成分；資料指出它可能以低親和力結合 IPO9，並註記它與 RBM3 互作，此互作資訊依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. May bind IPO9 with low affinity. Interacts with RBM3 (By similarity) PMID 11823430 ↗ · PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ |
| 細胞定位 | RPL4 的細胞定位資料記載為細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AAGCACTTCCTTTTCCTGTGGCAGCAGCCGGGCTGAGAGG40AGCGTGGCTGTCTCCTCTCTCCGCCATGGCGTGTGCTCGC80CCACTGATATCGGTGTACTCCGAAAAGGGGGAGTCATCTG120GCAAAAATGTCACTTTGCCTGCTGTATTCAAGGCTCCTAT160TCGACCAGATATTGTGAACTTTGTTCACACCAACTTGCGC200AAAAACAACAGACAGCCCTATGCTGTCAGTGAATTAGCAG240GTCATCAGACTAGTGCTGAGTCTTGGGGTACTGGCAGAGC280TGTGGCTCGAATTCCCAGAGTTCGAGGTGGTGGGACTCAC320CGCTCTGGCCAGGGTGCTTTTGGAAACATGTGTCGTGGAG360GCCGAATGTTTGCACCAACCAAAACCTGGCGCCGTTGGCA400TCGTAGAGTGAACACAACCCAAAAACGATACGCCATCTGT440TCTGCCCTGGCTGCCTCAGCCCTACCAGCACTGGTCATGT480CTAAAGGTCATCGTATTGAGGAAGTTCCTGAACTTCCTTT520GGTAGTTGAAGATAAAGTTGAAGGCTACAAGAAGACCAAG560GAAGCTGTTTTGCTCCTTAAGAAACTTAAAGCCTGGAATG600ATATCAAAAAGGTCTATGCCTCTCAGCGAATGAGAGCTGG640CAAAGGCAAAATGAGAAACCGTCGCCGTATCCAGCGCAGG680GGCCCGTGCATCATCTATAATGAGGATAATGGTATCATCA720AGGCCTTCAGAAACATCCCTGGAATTACTCTGCTTAATGT760AAGCAAGCTGAACATTTTGAAGCTTGCTCCTGGTGGGCAT800GTGGGACGTTTCTGCATTTGGACTGAAAGTGCTTTCCGGA840AGTTAGATGAATTGTACGGCACTTGGCGTAAAGCCGCTTC880CCTCAAGAGTAACTACAATCTTCCCATGCACAAGATGATT920AATACAGATCTTAGCAGAATCTTGAAAAGCCCAGAGATCC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。