基因總覽
RPL39 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 ribosomal protein L39，位於 X 染色體的 Xq24 區域。其產物屬於真核生物核糖體蛋白 eL39 家族，並歸入大型核糖體次單元的成分。來源將此蛋白描述為 RNA 結合成分；核糖體則是由 RNA 與蛋白質構成、負責細胞內蛋白質合成的大型核糖核蛋白複合體。現有資料未提供此蛋白的序列長度或更細部的結構特色。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000361575 ★ | 119,786,504–119,791,630 | 3 |
| ENST00001089169 | 119,756,748–119,791,662 | 4 |
| ENST00000931583 | 119,786,497–119,791,662 | 3 |
| ENST00001089171 | 119,786,500–119,791,662 | 4 |
| ENST00000949343 | 119,786,504–119,791,662 | 3 |
| ENST00001095010 | 119,786,504–119,791,662 | 3 |
| ENST00001095011 | 119,786,504–119,791,662 | 3 |
| ENST00001136345 | 119,786,504–119,791,662 | 3 |
| ENST00001038511 | 119,786,506–119,791,662 | 4 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPL39 的產物是大型核糖體次單元中的 RNA 結合成分。核糖體由 RNA 與蛋白質組成，負責細胞內蛋白質的合成；RPL39 的功能描述因此將其定位為核糖體組成的一部分，並指出其具有 RNA 結合性質。來源未進一步說明其結合的 RNA 種類、作用方式，或對蛋白質合成各步驟的具體影響。
Promoter 與基因調控
>RPL39 ENST00000361575 GRCh38 chrX:119791530-119792630 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGCGCAATCTCGGCTCGCTGCAACCTCCGCCTTCAGGGTTCAAGAGATTCTCTTGTCTCAGCCCCCGCAG TAGCTGAGATTACAGGCGCCCGCCACCACGCCTGGTTAGTTTTTTTGTATTTTTAGTAGGGACGGGGTTT CACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTCGTTTCAAGTAATCCGCCCGCCTAGGCCTCCCAAAGTG CTGGGATTACAAGCGTGAGCCACCACGCCCAGCTTATTTTTATGTTTATTTTATTTACTCATCAAAAAGG AAAGGTTTTTGCTTTTAAATGGGGAAAAGGATGAAAATGGGGAACACTAGCATCCCAAACGCATGTTATT AATTATTGTACATCTTGCCAAAGGCGGGCTACAATGTCAGGCTGGACTTCTAGCAGCCAAGGAAGAGGTT CTGTCCCTAACTTTCTGAGTTGAAAACTTTGATTGGCAACCTTCCGCCTAGTCGAAAACCCCTAGGCTTA CATAAGCGTCCACGTGGTCCAACCCCCTCCAACTTCTCCGGCTTCCTCCGACACGACTGTCCCTTCCCAC ACCTCCCAGCCAGGCCGAAATGACTCGTAACCCTCTGGGAAAATGGCACTTACTCTCCGCCTGCCGAGCT CCGACCCGGCGTTCCGAGTCCCCGGCGCCCGGAGGTGACGGTCGCTTCCCCTGCCCTCCCTTAGGGTTAG TCCCGCCCAATCGGCTCCTTAATTTTTCGGAGGGGCTTCTACTTTGGCATTTATCACGGGCTGTCTGCCT CACTTACGAAGCAGGGTGCCCCTAGCACACTGCCGGGCCCCTGGGGGAACGCACTTAGGGAAGCGAAGCA AAGCTAACTGCATTTGGCAGAAACCAGCGCGCTTTCCCACGGCGCCACGGGAGCGCACCGCTAGACAGAG AAGGCACTAGAAGAGGCGGTCGGTGCATAGCGTCACCTCCTAAACTCCGCCCATCGGAAGCGCCTTCTAA GCTCGTTCTTCCGCCAGCTTCCCTCCTCTTCCTTTCTCCGCCATCGTGGTGTGTTCTTGACTCCGCTGCT CGCCATGGTAAGTCCATCGGCCCCCATCGGCCCCGGGGTGGCTTCCCAAAA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPL39_1 ↗ | X:119,791,625 | 負股 | 119,791,615–119,791,674 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSRX_BTQTW · enhancer · 119790749–119791619 · regulatory
ENSRX_5336QB8 · CTCF_binding_site · 119791050–119791071 · regulatory
ENSRX_93QJQZ · promoter · 119791620–119791990 · regulatory
ENSRX_BTQW3 · enhancer · 119791991–119792669 · regulatory
· motif · 119791052–119791068 · motif
· motif · 119791165–119791182 · motif
· motif · 119791605–119791615 · motif
· motif · 119791812–119791825 · motif
· motif · 119791812–119791825 · motif
· motif · 119791964–119791973 · motif
· motif · 119792064–119792073 · motif
· motif · 119792123–119792132 · motif
· motif · 119792123–119792132 · motif
· motif · 119792504–119792515 · motif
· motif · 119792842–119792853 · motif
· motif · 119792943–119792958 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
細胞內定位
RPL39 蛋白定位於細胞質。 來源未指出定位會隨條件或異構型而改變。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
RPL39 是大型核糖體次單元的組成成分。來源另註明它與 IMPACT 有互作，但此項關係標示為 By similarity，應視為相似性推定，而非此處直接證實的實體結合。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPL39 產物是大型核糖體次單元中的 RNA 結合成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體，負責細胞內蛋白質合成；來源未提供更具體的分子作用方式。 | 含實驗來源 | 證據與來源RNA-binding component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ · PMID 8764829 ↗ |
| 交互作用 | RPL39 是大型核糖體次單元的組成成分。來源另指出它與 IMPACT 互作，但此關係依相似性推定，未在此資料中作為直接實驗證實的結合描述。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. Interacts with IMPACT (By similarity) PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ |
| 細胞定位 | 來源將 RPL39 蛋白的細胞內定位標示為細胞質；此項資料未提供定位變化的條件、異構型差異或動態資訊。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CCCTCCTCTTCCTTTCTCCGCCATCGTGGTGTGTTCTTGA40CTCCGCTGCTCGCCATGTCTTCTCACAAGACTTTCAGGAT80TAAGCGATTCCTGGCCAAGAAACAAAAGCAAAATCGTCCC120ATTCCCCAGTGGATTCGGATGAAAACTGGAAATAAAATCA160GGTACAACTCCAAAAGGAGACATTGGAGAAGAACCAAGCT200GGGTCTATAAGGAATTGCACATGAGATGGCACACATATTT240ATGCTGTCTGAAGGTCACGATCATGTTACCATATCAAGCT280GAAAATGTCACCACTATCTGGAGATTTCGACGTGTTTTCC320TCTCTGAATCTGTTATGAACACGTTGGTTGGCTGGATTCA360GTAATAAATATGTAAGGCCTTTCTTTTTAA390cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。