基因總覽
RPL38 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 ribosomal protein L38。其產物屬於真核生物核糖體蛋白 eL38 家族，並是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體，負責在細胞中合成蛋白質；因此，RPL38 的基本角色是作為核糖體組成的一部分。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000311111 ★ | 74,203,678–74,210,655 | 5 |
| ENST00000928109 | 74,202,841–74,209,880 | 6 |
| ENST00001092688 | 74,202,841–74,209,880 | 5 |
| ENST00000928110 | 74,203,184–74,209,880 | 6 |
| ENST00000928111 | 74,203,276–74,209,880 | 6 |
| ENST00001092689 | 74,203,276–74,209,877 | 6 |
| ENST00000439590 | 74,203,484–74,209,880 | 5 |
| ENST00000928112 | 74,203,484–74,209,898 | 5 |
| ENST00000928115 | 74,203,484–74,209,877 | 4 |
| ENST00001092693 | 74,203,484–74,209,898 | 5 |
| ENST00001129545 | 74,203,484–74,204,593 | 3 |
| ENST00000584577 | 74,203,662–74,209,898 | 5 |
顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPL38 的產物是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體本身是大型核糖核蛋白複合體，負責在細胞內合成蛋白質；因此，RPL38 所支持的功能背景是核糖體參與的蛋白質合成。現有資料僅指出其核糖體組成身分及核糖體的整體作用，未提供 RPL38 如何參與此過程的分子機制或其他特定生物學效應。
Promoter 與基因調控
>RPL38 ENST00000311111 GRCh38 chr17:74202678-74203778 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GATAACCGCAGGTTGCTCAGAGTCTAACCTAAAGGATGTTAGGGGGAGAAAGGAACGCTGCCCTCCCCAG GCTTCCCAAGCCTCCCCAGGAAGTGGCCGGAGCCTGGGCTGGGGAATCTGCCCAGCAGGGGTTCAACTCC TGAGTCCACCTCTCCCCTCTGGGGCCGCGGTGAGACCCCGCAAGAGCAGGAGCACTCCCACTCACCATCA GCCCTAGGGGTGAGACACTTAGCCAGGGGCAGCGCTGCGACAGCTTTTGGAAGTATTATTATTATTATCA TTATTGCTAGAGATGGGGGGGGGGAGGTCTTACTAGGTTGCCCAGGCTGCTCTCGAACTCCTGGCCTCAA GCGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCCCAGTGCTGGGGTTATAAGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCTTAACT TGCTTTCATTGTACACCAATTCCTAAGGGAATTGGAAGCAGCAAGCAGGAACGCTCCCTCTTATGGAAAG AAGAGCCCAGGGCCCTGGTCATGACAGGTTCAGGTGCCAAAAAGGAGACGGGAAGAAAACGTGAGGCGCC AGAACAACAGGTTCTACAAGGTGCACACGAGGGTCCCTGCCATTGAATGAAGAATTTTCTGTGTGGATGC CCCTGCGCAGGTCCAATGAAAGCCGTGGAGAATAAGCGTTAGCTCTTCAAACTGAATCTGAGCTAAAACC TAGCAAAGCCAGGCTGGGGTCTGAGGGGTTGCGGGGGAAGACAGGAAGGGGTGGACGGGGAAGAGGCGGG GGTCCTAGGAGGAAGGGATGGGGAGGAGCGAGAGGAGGGAGGCGGAGGGAGGGCGGCAGCCAGGATGGTC CATTCCATTCTTGGAGCTGCACTGTTGACTTCGACCACAAGGGGGCAGGGCTGCTGAAATTGGAAGTGCG AACGCCTACATGAGTCTTGATCCTCGGCAGGCACCGTACCCAGTTTCCTCCGTTGGGAGGGTTTAACTGC CCGGAAACGGAAGTCTCGTTCTTTTTCGTCCTTTTCCCCGGTTGCTGCTTGCTGTGAGTGTCTCTAGGGT GATACGTGGGTGAGAAAGGTAATCTGGGGCAATCCACTGCCAGGTGAAATC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPL38_1 ↗ | 17:74,203,678 | 正股 | 74,203,629–74,203,688 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_BJPKX · enhancer · 74199453–74200371 · regulatory
ENSR17_6BPLFR · CTCF_binding_site · 74199787–74199821 · regulatory
ENSR17_934G7B · enhancer · 74201215–74201664 · regulatory
ENSR17_BJPLG · promoter · 74203092–74203714 · regulatory
ENSR17_5MG8G5 · CTCF_binding_site · 74203147–74203168 · regulatory
ENSR17_5MG8HZ · CTCF_binding_site · 74203548–74203569 · regulatory
ENSR17_BJPLK · enhancer · 74203715–74204638 · regulatory
ENSR17_934G8R · enhancer · 74206332–74206650 · regulatory
ENSR17_846WJG · enhancer · 74207895–74208142 · regulatory
· motif · 74198764–74198777 · motif
· motif · 74198764–74198777 · motif
· motif · 74198765–74198778 · motif
· motif · 74198765–74198778 · motif
· motif · 74198900–74198907 · motif
· motif · 74198913–74198925 · motif
· motif · 74199789–74199805 · motif
· motif · 74199802–74199818 · motif
· motif · 74203149–74203165 · motif
· motif · 74203550–74203566 · motif
· motif · 74203558–74203568 · motif
· motif · 74203661–74203672 · motif
· motif · 74203661–74203672 · motif
· motif · 74203728–74203741 · motif
· motif · 74203842–74203853 · motif
· motif · 74204154–74204165 · motif
· motif · 74207068–74207080 · motif
· motif · 74207969–74207977 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：70 aa
ribosomal protein L38 屬於真核生物核糖體蛋白 eL38 家族。現有資料未提供其結構域、功能區域或序列特徵的描述。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料記載此蛋白質位於細胞質；未提供其他定位、異構型差異或定位變化條件。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- BCCIPQ9P287 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
RPL38 被記載為大型核糖體次單元的組成成分，支持其屬於該複合體；現有資料未指出特定的直接結合夥伴。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPL38 的產物是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體，負責在細胞中合成蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ |
| 交互作用 | RPL38 的產物是大型核糖體次單元的組成成分；此敘述指出其複合體組成身分，未提供特定結合夥伴或其他互作細節。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | 資料將 RPL38 的產物定位於細胞質；未提供定位變化條件、異構型差異或其他細胞內位置的資訊。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTTTTTCGTCCTTTTCCCCGGTTGCTGCTTGCTGTGAGTG40TCTCTAGGGTGATACGTGGGTGAGAAAGGTCCTGGTCCGC80GCCAGAGCCCAGCGCGCCTCGTCGCCATGCCTCGGAAAAT120TGAGGAAATCAAGGACTTCCTGCTCACAGCCCGACGAAAG160GATGCCAAATCTGTCAAGATCAAGAAAAATAAGGACAACG200TGAAGTTTAAAGTTCGATGCAGCAGATACCTTTACACCCT240GGTCATCACTGACAAAGAGAAGGCAGAGAAACTGAAGCAG280TCCCTGCCCCCCGGTTTGGCAGTGAAGGAACTGAAATGAA320CCAGACACACTGATTGGAACTGTATTATATTAAAATACTA360AAAATCCTAAGTGTCTTTCGTCTTTGCGGATGGGAAAGGG400AAAAATGCTACCTCGTAGTGGCTTCTGATGGGAACAGGAC440GCGGGTTCTGTTGCTGCCTTCCTGTGTCTTTTTTTTTTTT480TTTTTTTCTTTCTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTGGCTC520ATCCTGGAGCACAGTGGTGCGATATCAGCTCACTACCACC560TCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGACTGTCCTGCCTCAGCCTC600CCGAGTGGCTGGGATTACAGGCACACATCACCACGCCTGG640CCAATTTTTGTATTTGTAGTAGAGACAGGGTTTCACTGCC680TGCCTCAGCCTCCCATAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGC720CTCCGTGCCCGGTGCATCCCTAATCTTGAGCATGATCTCA760GTCGGCAAATGAGGCCATCTGTTTTCAGCCTGTTTGAAAA800TAAGATGTGGGGAGGCCATGATGGAAATAGCACGTGGGGT840TAAACATAACTGGCAGATGTGGGAGCGATGGTGGGGCATG880CCATTCAAACAGGTCCCAAAATGGGTGCAACAAGGTATAG920CACATCTACCACTCGCTAACTTGACTGACTTGGAGAAATG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。