基因總覽
RPL37A 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 ribosomal protein L37a。其產物屬於核糖體蛋白質,為大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000491306 ★ | 216,498,844–216,504,086 | 4 |
| ENST00000600880 | 216,498,797–216,529,454 | 4 |
| ENST00000446558 | 216,498,797–216,580,097 | 4 |
| ENST00000939366 | 216,498,797–216,501,625 | 4 |
| ENST00000939367 | 216,498,797–216,501,625 | 3 |
| ENST00000939368 | 216,498,797–216,501,471 | 4 |
| ENST00000939369 | 216,498,797–216,501,465 | 3 |
| ENST00000948942 | 216,498,797–216,501,467 | 4 |
| ENST00000993637 | 216,498,797–216,529,583 | 5 |
| ENST00001039723 | 216,498,797–216,529,578 | 6 |
| ENST00001067461 | 216,498,797–216,529,587 | 6 |
| ENST00001067462 | 216,498,797–216,502,463 | 4 |
顯示 12/39 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPL37A 的產物 ribosomal protein L37a 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體屬於核糖核蛋白複合體,由 RNA 與蛋白質構成,負責在細胞內合成蛋白質;因此,RPL37A 所編碼的蛋白質是執行此合成功能的核糖體組成部分。
現有資料將其角色界定為大型次單元的成分,並指出核糖體負責細胞內蛋白質合成;資料未進一步說明 ribosomal protein L37a 在核糖體中的特定分子作用方式,也未提供其他生物學過程或調控條件。
Promoter 與基因調控
>RPL37A ENST00000491306 GRCh38 chr2:216497844-216498944 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCAACCAAACTTCCTAGTGTGTGTGTTCTACGTGAAGAAAGAAGATCATGTGTCTAGTTCCAGAACACAC CCTCCCCACCCCCGGCCTCAACCAGAAATCCAATTCTTCCCTGCTGACCCCTTTGAGAGACCTGGAGGGA CAGAGAATTGACGGTGGGTAAAGGGTAAGATGTTGGAGTTTAAGGGTTCAGGCCTGGACCAGGAAGCTGT CTTAACAGCCTAGTGTGGGGCCATGGAAGTGAGTTCTGAAATGAAGTGGAAGGCAGGCCATCCGCACTGA GATGCAGCAGCTGGAACACAAAACTCCAAGGTGACTGTTAACTTTTCCCCAGCCTTCCAATCTCAGACTT TCCTCAGGAAACACCAGGCTCTTCTGAATTAGTCGCGAGCAGAACCATCGTCCTTTCCTTCAGAACTCTG ACCAGTTTGAAACTGTCTAACTTCTTAATGTGGCTATATGATCGTTTGCAGCTGGCCTGCAACTTGTTCT GGGAATGGAACCTTGGATTTTAGTCACCACTGTCGCTAGCATCCTGCACAGTCAGCCACTTTTAGAGAGC ATAATGCAGAGGGGGAAATAAATGAGATTTGGAATAGAGACGGGGTTTCACCCTGCTGGCCAGGCTGGTC TCGAACTCCTGACCCACCCCGCCTCCCAAAGTGTTAGAATCACAAGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCCA CAAATGTAAGATTTATGCACTTCTCCAAGCCAAGTGCTGTGCATCGAATGGAGGAACTCGTACCTTTGCA GGATTTTGTGATATATGTGAAATAATCCGGACATGCTTCTGCTATGGTTGTTTGTCGCCATAGTTTGCGA ATCTGGGTAAACCTGGATGAGAGAGACGCCTTACAATTGCAAACATTTCTCAGGAGGCCGCCTGAAAACG CCCAAACCATAGAGCTCAGTTCCTAGCTAGGCCTCTACCAGCCACTTCCGCTCGTCCGCCTAATACCGCG CCTGCGCACCGCGTCTCTTCCTTTCTGGGCTCGGACCTAGGTCGCGGCGACATGGTGAGTGTGGGTCTCT GTGCGGCCTAGAACTCTATCTGCCTGCATCTGTCCTTGTTTTCTTCTCCCG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPL37A_1 ↗ | 2:216,498,844 | 正股 | 216,498,795–216,498,854 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_88CT8W · enhancer · 216495688–216495910 · regulatory
ENSR2_B3KZ44 · enhancer · 216497711–216498728 · regulatory
ENSR2_88CTBM · promoter · 216498729–216498865 · regulatory
ENSR2_88CTBQ · enhancer · 216498866–216499036 · regulatory
ENSR2_7GPPMM · promoter · 216499037–216499150 · regulatory
ENSR2_956X7K · enhancer · 216502869–216503239 · regulatory
ENSR2_CRH3G · enhancer · 216503386–216504738 · regulatory
· motif · 216496933–216496945 · motif
· motif · 216498796–216498805 · motif
· motif · 216498796–216498807 · motif
· motif · 216498820–216498831 · motif
· motif · 216498820–216498831 · motif
· motif · 216499154–216499170 · motif
· motif · 216499154–216499170 · motif
· motif · 216499165–216499181 · motif
· motif · 216499165–216499181 · motif
· motif · 216500110–216500122 · motif
· motif · 216502056–216502064 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:92 aa
ribosomal protein L37a 長 92 個胺基酸,屬於真核生物核糖體蛋白質 eL43 家族。蛋白質序列第 39 至 60 位註記為 C4 型鋅指。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 ribosomal protein L37a 的定位記為細胞質;未提供定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- MAGEA6P43360 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- PECAM1P16284 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRKACAP17612 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RRP8O43159 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SERPINH1P50454 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TGFBR2P37173 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ribosomal protein L37a 是大型核糖體次單元的組成成分。現有資料未指出它與特定分子的實體結合關係,也未提供超出其次單元組成身分的互作資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ribosomal protein L37a 是大型核糖體次單元的組成成分;核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ |
| 交互作用 | ribosomal protein L37a 是大型核糖體次單元的組成成分;此項描述指出其核糖體次單元組成身分,未提供其他特定互作關係。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | ribosomal protein L37a 的細胞內定位記為細胞質;此資料未進一步描述其定位變化條件、異構型差異或動態。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTTTCTGGGCTCGGACCTAGGTCGCGGCGACATGGCCAAA40CGTACCAAGAAAGTCGGGATCGTCGGTAAATACGGGACCC80GCTATGGGGCCTCCCTCCGGAAAATGGTGAAGAAAATTGA120AATCAGCCAGCACGCCAAGTACACTTGCTCTTTCTGTGGC160AAAACCAAGATGAAGAGACGAGCTGTGGGGATCTGGCACT200GTGGTTCCTGCATGAAGACAGTGGCTGGCGGTGCCTGGAC240GTACAATACCACTTCCGCTGTCACGGTAAAGTCCGCCATC280AGAAGACTGAAGGAGTTGAAAGACCAGTAGACGCTCCTCT320ACTCTTTGAGACATCACTGGCCTATAATAAATGGGTTAAT360TTATGTAACAAAATTGCCTTGGCTTGTTAACTTTATTAGA400CATTCTGATGTTTGCATTGTGTAAATACTGTTGTATTGGA440AAAGCATGCCAAGATGGATTATTGTAATTCAGTGTCTTTT480TTAGTAGTCAAATGGTAAAATGCAGCATAAGAATATAAGT520CTTCCAAGTTAGATATGAGTGTTAGCTTTTTATAAGTCTG560CTCCTGCCAGTTTGACTTTGAGATACATTGGAGCCAACTG600TAAACTTTAGTTTTTAAATTACAGTTAGTTTTTTTGTTTG640TTTTTGAGGCGGAGTCTCTGTTACCCAGGCTGGAGTGCAG680TATACCAGTCTTGGCCCACTTCAACCTCCACTTCTTAGGT720TCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGA760TTACAGGCACGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTATT800TTGAGTAGAGATGGAGTTTTCACCACATTGGCCAGGCTGT840TCTTGAACTGACCTCAAGCGATCCACCTGCCTTGGCCTTC880CAGAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGC920CTTGCATTTAATATTTTTATAATGTGTCTAGGCTGGGTGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。