演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPL37AL37A

ribosomal protein L37a

RPL37A 編碼核糖體蛋白質 L37a,是大型核糖體次單元的組成成分,參與細胞內蛋白質合成。

Homo sapiens2q35UniProt P61513
OFFICIAL SYMBOL
RPL37A
CHROMOSOME
2
UNIPROT
P61513
PDB / ALPHAFOLD
22TU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPL37A 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 ribosomal protein L37a。其產物屬於核糖體蛋白質,為大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質。

Official symbol
RPL37A
Gene name
ribosomal protein L37a
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10348
UniProt
P61513
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
L37AeL43

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22q35
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegRPL37Apq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr2:216,498,797–216,580,097
Gene span
81,301 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000491306 ★216,498,844–216,504,0864
ENST00000600880216,498,797–216,529,4544
ENST00000446558216,498,797–216,580,0974
ENST00000939366216,498,797–216,501,6254
ENST00000939367216,498,797–216,501,6253
ENST00000939368216,498,797–216,501,4714
ENST00000939369216,498,797–216,501,4653
ENST00000948942216,498,797–216,501,4674
ENST00000993637216,498,797–216,529,5835
ENST00001039723216,498,797–216,529,5786
ENST00001067461216,498,797–216,529,5876
ENST00001067462216,498,797–216,502,4634

顯示 12/39 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RPL37A 的產物 ribosomal protein L37a 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體屬於核糖核蛋白複合體,由 RNA 與蛋白質構成,負責在細胞內合成蛋白質;因此,RPL37A 所編碼的蛋白質是執行此合成功能的核糖體組成部分。

現有資料將其角色界定為大型次單元的成分,並指出核糖體負責細胞內蛋白質合成;資料未進一步說明 ribosomal protein L37a 在核糖體中的特定分子作用方式,也未提供其他生物學過程或調控條件。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 216498844 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPL37A ENST00000491306 GRCh38 chr2:216497844-216498944 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCAACCAAACTTCCTAGTGTGTGTGTTCTACGTGAAGAAAGAAGATCATGTGTCTAGTTCCAGAACACAC
CCTCCCCACCCCCGGCCTCAACCAGAAATCCAATTCTTCCCTGCTGACCCCTTTGAGAGACCTGGAGGGA
CAGAGAATTGACGGTGGGTAAAGGGTAAGATGTTGGAGTTTAAGGGTTCAGGCCTGGACCAGGAAGCTGT
CTTAACAGCCTAGTGTGGGGCCATGGAAGTGAGTTCTGAAATGAAGTGGAAGGCAGGCCATCCGCACTGA
GATGCAGCAGCTGGAACACAAAACTCCAAGGTGACTGTTAACTTTTCCCCAGCCTTCCAATCTCAGACTT
TCCTCAGGAAACACCAGGCTCTTCTGAATTAGTCGCGAGCAGAACCATCGTCCTTTCCTTCAGAACTCTG
ACCAGTTTGAAACTGTCTAACTTCTTAATGTGGCTATATGATCGTTTGCAGCTGGCCTGCAACTTGTTCT
GGGAATGGAACCTTGGATTTTAGTCACCACTGTCGCTAGCATCCTGCACAGTCAGCCACTTTTAGAGAGC
ATAATGCAGAGGGGGAAATAAATGAGATTTGGAATAGAGACGGGGTTTCACCCTGCTGGCCAGGCTGGTC
TCGAACTCCTGACCCACCCCGCCTCCCAAAGTGTTAGAATCACAAGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCCA
CAAATGTAAGATTTATGCACTTCTCCAAGCCAAGTGCTGTGCATCGAATGGAGGAACTCGTACCTTTGCA
GGATTTTGTGATATATGTGAAATAATCCGGACATGCTTCTGCTATGGTTGTTTGTCGCCATAGTTTGCGA
ATCTGGGTAAACCTGGATGAGAGAGACGCCTTACAATTGCAAACATTTCTCAGGAGGCCGCCTGAAAACG
CCCAAACCATAGAGCTCAGTTCCTAGCTAGGCCTCTACCAGCCACTTCCGCTCGTCCGCCTAATACCGCG
CCTGCGCACCGCGTCTCTTCCTTTCTGGGCTCGGACCTAGGTCGCGGCGACATGGTGAGTGTGGGTCTCT
GTGCGGCCTAGAACTCTATCTGCCTGCATCTGTCCTTGTTTTCTTCTCCCG
RPL37A 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPL37A_1 ↗2:216,498,844正股216,498,795–216,498,854

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_88CT8W · enhancer · 216495688–216495910 · regulatory

ENSR2_B3KZ44 · enhancer · 216497711–216498728 · regulatory

ENSR2_88CTBM · promoter · 216498729–216498865 · regulatory

ENSR2_88CTBQ · enhancer · 216498866–216499036 · regulatory

ENSR2_7GPPMM · promoter · 216499037–216499150 · regulatory

ENSR2_956X7K · enhancer · 216502869–216503239 · regulatory

ENSR2_CRH3G · enhancer · 216503386–216504738 · regulatory

· motif · 216496933–216496945 · motif

· motif · 216498796–216498805 · motif

· motif · 216498796–216498807 · motif

· motif · 216498820–216498831 · motif

· motif · 216498820–216498831 · motif

· motif · 216499154–216499170 · motif

· motif · 216499154–216499170 · motif

· motif · 216499165–216499181 · motif

· motif · 216499165–216499181 · motif

· motif · 216500110–216500122 · motif

· motif · 216502056–216502064 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:92 aa

1 aa92 aa鋅指
依 P61513 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ribosomal protein L37a 長 92 個胺基酸,屬於真核生物核糖體蛋白質 eL43 家族。蛋白質序列第 39 至 60 位註記為 C4 型鋅指。

鋅指C4-type39–60 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 22TU…

PDB · 22TU

EM · 3.00 A · Lp=1-92

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

資料將 ribosomal protein L37a 的定位記為細胞質;未提供定位變化條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 6 個夥伴 · 最多顯示 50 個
L37ARPL37AMAGEA6PECAM1PRKACARRP8SERPINH1TGFBR2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ribosomal protein L37a 是大型核糖體次單元的組成成分。現有資料未指出它與特定分子的實體結合關係,也未提供超出其次單元組成身分的互作資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ribosomal protein L37a 是大型核糖體次單元的組成成分;核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ribosomal protein L37a 是大型核糖體次單元的組成成分;此項描述指出其核糖體次單元組成身分,未提供其他特定互作關係。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ribosomal protein L37a 的細胞內定位記為細胞質;此資料未進一步描述其定位變化條件、異構型差異或動態。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm

PMID 23636399 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000491306 · 2,992 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTTTCTGGGCTCGGACCTAGGTCGCGGCGACATGGCCAAA40
41CGTACCAAGAAAGTCGGGATCGTCGGTAAATACGGGACCC80
81GCTATGGGGCCTCCCTCCGGAAAATGGTGAAGAAAATTGA120
121AATCAGCCAGCACGCCAAGTACACTTGCTCTTTCTGTGGC160
161AAAACCAAGATGAAGAGACGAGCTGTGGGGATCTGGCACT200
201GTGGTTCCTGCATGAAGACAGTGGCTGGCGGTGCCTGGAC240
241GTACAATACCACTTCCGCTGTCACGGTAAAGTCCGCCATC280
281AGAAGACTGAAGGAGTTGAAAGACCAGTAGACGCTCCTCT320
321ACTCTTTGAGACATCACTGGCCTATAATAAATGGGTTAAT360
361TTATGTAACAAAATTGCCTTGGCTTGTTAACTTTATTAGA400
401CATTCTGATGTTTGCATTGTGTAAATACTGTTGTATTGGA440
441AAAGCATGCCAAGATGGATTATTGTAATTCAGTGTCTTTT480
481TTAGTAGTCAAATGGTAAAATGCAGCATAAGAATATAAGT520
521CTTCCAAGTTAGATATGAGTGTTAGCTTTTTATAAGTCTG560
561CTCCTGCCAGTTTGACTTTGAGATACATTGGAGCCAACTG600
601TAAACTTTAGTTTTTAAATTACAGTTAGTTTTTTTGTTTG640
641TTTTTGAGGCGGAGTCTCTGTTACCCAGGCTGGAGTGCAG680
681TATACCAGTCTTGGCCCACTTCAACCTCCACTTCTTAGGT720
721TCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGA760
761TTACAGGCACGCACCACCATACCTGGCTAATTTTTGTATT800
801TTGAGTAGAGATGGAGTTTTCACCACATTGGCCAGGCTGT840
841TCTTGAACTGACCTCAAGCGATCCACCTGCCTTGGCCTTC880
881CAGAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGCCCAGC920
921CTTGCATTTAATATTTTTATAATGTGTCTAGGCTGGGTGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。