基因總覽
RPL37 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 ribosomal protein L37。其產物屬於真核生物核糖體蛋白 eL37 家族,並是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責細胞內蛋白質合成。RPL37 蛋白質長 97 個胺基酸,序列中有一段 C4 型鋅指結構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000274242 ★ | 40,825,262–40,835,222 | 4 |
| ENST00001096008 | 40,825,262–40,835,269 | 4 |
| ENST00001132176 | 40,825,262–40,835,269 | 4 |
| ENST00001096009 | 40,827,733–40,835,269 | 4 |
| ENST00001096010 | 40,830,499–40,835,269 | 4 |
| ENST00000509877 | 40,832,103–40,835,269 | 3 |
| ENST00001096019 | 40,832,448–40,835,269 | 4 |
| ENST00001096013 | 40,832,452–40,835,269 | 4 |
| ENST00001096014 | 40,832,452–40,835,269 | 4 |
| ENST00001096016 | 40,832,452–40,835,269 | 4 |
| ENST00001096017 | 40,832,453–40,835,269 | 4 |
| ENST00000916325 | 40,832,454–40,835,269 | 4 |
顯示 12/27 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPL37 的產物是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體為大型核糖核蛋白複合體,由 RNA 與蛋白質構成,負責細胞內蛋白質的合成;因此,RPL37 所屬的核糖體蛋白參與構成執行這項工作的細胞複合體。
現有資料支持 RPL37 與核糖體及蛋白質合成之間的關聯,但未提供其在核糖體中的具體分子作用方式,也未說明它是否直接參與特定合成步驟。因此,這裡可將其功能描述為大型核糖體次單元的組成角色,不進一步推定其作用機制或其他生物學效應。
Promoter 與基因調控
>RPL37 ENST00000274242 GRCh38 chr5:40835122-40836222 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCTCAGTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCCGTCATCCAAGCTGGAGTGCAATGGCGCAATCTCGGCTC ACTGCAACCTCCACCTTCCGGGTTCAAGCCTCCCTCCACCTCCACCCCCTGAGTAGCTGGGTTGGCAGGC GCGCGCCACCACGCCTGGATAATTTTTTGTATTTTTTTTGTAGCGACAGTGTCTCCCTATGTTGCCCAGG CTGGTCTCCAACGCCTGGGCTCAAGAGATCCGCCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGT AAGCCACGGCGCCAGGCCCTTGGAAACTATATTGAACAAGTTCCATGTGTGATTCCTTGGCACAATGAAA TATGGGATCAGATAACTTGCCTCTGATTTACTACAGTAACAACAACAACAAAATCACTGTCTGCTTTTCC CTTTATATTCTAAGCTCCAGCTCCATGCCTCCGTACTCCTAGCGACCTCTCGCAGGGAAAGTCAGCGTCG GCCAAAAGCCTCCGGGATCGGAATGAGGAGGCTGCTGGAGAAGTTGCTTTCTCCTAAAAGGGATTATCCC AGGCGCACACGGTCATTACACGCCGGGGACGCTCAGTCGGTGCGGGTACCCCTGGGCAGGGCCAGCCCCG CATTCCAGGTTCTCCATGTGCCTAGAAGACAGTAATCGACGGTATAGCAACAGATCTGACTGCTAACGTG CGAAACCGATCAGTAGTAGCAGTAGCACCAGCAACAGCAGCACGAAAAGCAAAACTGTAATCTAAACGGC CCTCAGGGTCTAAGCAGGCCCGACGAAGACTCGCCCATCCGGTCGCCAGAAAACTGGGAGTCCCGCCCGC CTTTCCGGCACTGAAACGCGATCGGCCCTGCCTGGTACCGCATCCTCCTCTTGACCCCACCTACACTACG ACGACGGACGCTCGAGAACGCTGCACCGCGCCCCGCAGGAAGTGCTTCCCTGGGCGGAAGCTTCTGAGCG TGATATAGCGGAAGTGCCTTCTCTTCCGGTCTTTCTGGTCTCGGCCGCAGAAGCGAGATGGTGAGTTGTG ACTGTGGTGTTTGTGAATCGCGTTCCATCCTCGTCCTTTGTGCCTCTCTGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPL37_1 ↗ | 5:40,835,212 | 負股 | 40,835,202–40,835,261 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR5_837F6L · enhancer · 40831885–40832099 · regulatory
ENSR5_9L7LS · promoter · 40835202–40835712 · regulatory
· motif · 40831242–40831251 · motif
· motif · 40831902–40831915 · motif
· motif · 40831906–40831919 · motif
· motif · 40831906–40831919 · motif
· motif · 40831923–40831935 · motif
· motif · 40832092–40832100 · motif
· motif · 40832204–40832226 · motif
· motif · 40832325–40832335 · motif
· motif · 40832484–40832492 · motif
· motif · 40834297–40834312 · motif
· motif · 40834306–40834328 · motif
· motif · 40834306–40834328 · motif
· motif · 40834755–40834770 · motif
· motif · 40834983–40835000 · motif
· motif · 40835077–40835090 · motif
· motif · 40835202–40835219 · motif
· motif · 40835213–40835222 · motif
· motif · 40835227–40835236 · motif
· motif · 40835227–40835238 · motif
· motif · 40835227–40835238 · motif
· motif · 40835227–40835240 · motif
· motif · 40835269–40835278 · motif
· motif · 40835323–40835335 · motif
· motif · 40835325–40835332 · motif
· motif · 40835325–40835340 · motif
· motif · 40835410–40835419 · motif
· motif · 40835466–40835486 · motif
· motif · 40835516–40835528 · motif
· motif · 40835674–40835685 · motif
· motif · 40836129–40836140 · motif
· motif · 40836129–40836140 · motif
· motif · 40836161–40836170 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:97 aa
RPL37 蛋白質長 97 個胺基酸,屬於真核生物核糖體蛋白 eL37 家族。其序列第 19 至 37 位胺基酸區段被註記為 C4 型鋅指。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RPL37 的定位註記為細胞質。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
RPL37 被註記為大型核糖體次單元的組成成分。這項資料支持其屬於該核糖體複合體,但未提供特定的直接結合夥伴或其他分子互作資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPL37 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是大型核糖核蛋白複合體,負責細胞內蛋白質合成;這項註記說明 RPL37 與執行蛋白質合成的核糖體複合體相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ |
| 交互作用 | RPL37 被註記為大型核糖體次單元的組成成分。此敘述指出它屬於該核糖體次單元,但未進一步描述特定結合夥伴或互作方式。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | RPL37 的細胞內定位註記為細胞質。這筆資料僅提供其定位資訊,未說明定位變化的條件、時間動態或不同異構型之間的差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTCTTCCGGTCTTTCTGGTCTCGGCCGCAGAAGCGAGATG40ACGAAGGGAACGTCATCGTTTGGAAAGCGTCGCAATAAGA80CGCACACGTTGTGCCGCCGCTGTGGCTCTAAGGCCTACCA120CCTTCAGAAGTCGACCTGTGGCAAATGTGGCTACCCTGCC160AAGCGCAAGAGAAAGTATAACTGGAGTGCCAAGGCTAAAA200GACGAAATACCACCGGAACTGGTCGAATGAGGCACCTAAA240AATTGTATACCGCAGATTCAGGCATGGATTCCGTGAAGGA280ACAACACCTAAACCCAAGAGGGCAGCTGTTGCAGCATCCA320GTTCATCTTAAGAATGTCAACGATTAGTCATGCAATAAAT360GTTCTGGTTTTAAAAAATACATATCTGGTTTTGGTAAGGT400ATTTTTAATCAATTAGGCTTGTAGTATCAGTGAAATACTG440TAGGTTTAGGGACTGGGCTAGCTTCATATCAGATTTACTT480GTTAAGTGACTGTTTTGGAATGTTTACTTTTGGACTGGGT520TTGTAACACGGTTAAAGGCAATGAGAAACAAGCAGAATTC560CAGGAGTCCTTGAAGCAGAGGGCACTGGAAGACAATATAG600CAGATTAAAATAGCACAGCTCATGTGGCATAGGTGGGTAT640TTTAGATGTTTGAGTAAATTTGAAAGAGTATGATGTTTAA680ATTACCTTTAGCAACATGTTCATCTGCTATGCTGTCATGA720CTAGGGGGATGATTATTAGTCACATAGAGCTTGGGAGTAC760CACTGGAAACGTATGGGTAGGAGTTTAGGTGGCTTCTGTT800TTTCAAAAGATGATCTTATCCTAGTATCTGTAATGCTCAC840TTGGCACACCTGACTTGTGGGCTGTGTGTAAGGTGGCTAG880CTAAGTGAAAAAAGCCTGCTAGGTGTGAGTCAACTTAAGA920ATATGTAAATAGGTTTGAGAAAAAGTAGGGCTTGGGTGCA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。