演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPL36ALRPL36A

ribosomal protein L36a like

RPL36AL 的基因身分與分類資料已收錄,功能註解尚待補充。

Homo sapiens14q21.3UniProt Q969Q0
OFFICIAL SYMBOL
RPL36AL
CHROMOSOME
14
UNIPROT
Q969Q0
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPL36AL 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 ribosomal protein L36a like。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 14q21.3。

Official symbol
RPL36AL
Gene name
ribosomal protein L36a like
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10346
UniProt
Q969Q0
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
RPL36ARPL36AP42

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1414q21.3
chr14 · 107,043,718 bp · GRCh38chr14p13 · 1–3600000 · gvarchr14p12 · 3600001–8000000 · stalkchr14p11.2 · 8000001–16100000 · gvarchr14p11.1 · 16100001–17200000 · acenchr14q11.1 · 17200001–18200000 · acenchr14q11.2 · 18200001–24100000 · gnegchr14q12 · 24100001–32900000 · gpos100chr14q13.1 · 32900001–34800000 · gnegchr14q13.2 · 34800001–36100000 · gpos50chr14q13.3 · 36100001–37400000 · gnegchr14q21.1 · 37400001–43000000 · gpos100chr14q21.2 · 43000001–46700000 · gnegchr14q21.3 · 46700001–50400000 · gpos100chr14q22.1 · 50400001–53600000 · gnegchr14q22.2 · 53600001–55000000 · gpos25chr14q22.3 · 55000001–57600000 · gnegchr14q23.1 · 57600001–61600000 · gpos75chr14q23.2 · 61600001–64300000 · gnegchr14q23.3 · 64300001–67400000 · gpos50chr14q24.1 · 67400001–69800000 · gnegchr14q24.2 · 69800001–73300000 · gpos50chr14q24.3 · 73300001–78800000 · gnegchr14q31.1 · 78800001–83100000 · gpos100chr14q31.2 · 83100001–84400000 · gnegchr14q31.3 · 84400001–89300000 · gpos100chr14q32.11 · 89300001–91400000 · gnegchr14q32.12 · 91400001–94200000 · gpos25chr14q32.13 · 94200001–95800000 · gnegchr14q32.2 · 95800001–100900000 · gpos50chr14q32.31 · 100900001–102700000 · gnegchr14q32.32 · 102700001–103500000 · gpos50chr14q32.33 · 103500001–107043718 · gnegRPL36ALpq1 bp107,043,718 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr14:49,600,815–49,620,649
Gene span
19,835 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000298289 ★49,618,530–49,620,6262
ENST0000109276849,600,815–49,620,6493
ENST0000088063249,617,444–49,620,6493
ENST0000088063449,617,444–49,620,6493
ENST0000088063549,617,444–49,620,4303
ENST0000088063649,617,444–49,620,4302
ENST0000093635949,617,444–49,620,6412
ENST0000093636049,617,444–49,620,6493
ENST0000093636149,617,444–49,620,6493
ENST0000093636249,617,444–49,620,6152
ENST0000093636349,617,444–49,620,6493
ENST0000093636449,617,444–49,620,5682

顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用;有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 49620626 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPL36AL ENST00000298289 GRCh38 chr14:49620526-49621626 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCACCAGCTCCCGGGGGGCCCAGGTGCCAGCCTTATCTACATTCCTCAGGGTCTGATCAAAGTTCAGCTG
GTACACCAGGGACCGGTACCGCAGCGTCAGGTTGTCCGCCTCGGGCTGGGGGACCGCCGGGACCAGGGAA
GCCGCCGACACGTTGGAGACCCTGCGGATGCCCACAGCCACAGAGGGGTGGTCCCCACCGCGGCCGCCGG
CACCCCGCGCGGGTTCGGCGTCCAGCAACGGTGGGGCGAGGGCCTCGTTCTTCCTTTGTCGCCCATTGCT
GCTCCAGAGGACGAAGCCGCAGGCGGCCACCACGAGCGTCAGGATTAGCACCTTCCGTTTGTAGATGCGG
AACCTCATGGTCTCCAGGGCCGGGAGCGCAGGCGGGCGGGCGCGGAAAGGAGCAGCTGCTTCTGCACGGA
AGGGGCGGGCGGGCGGCGGCCGTCGCCTTGGCCTGTCACGGTCGGAACTGGCCCCCGCGGCTGCCCTCGC
TAACTCATCCCGGGCCCCGGGGGTCCTGGGGCCCGAGACCTCTCATTTACCCCGCGCCGCCTGCGCTCCA
CACATCCTCGCCTGGCAGCTACAGCTCGAGCATCGGCGCCGCCGCTAGGAGCCGCGGCTCGGCTTCGTCT
CCGTCCTCTCCATTCAGCACCACGGGTCCCGGAAAAAGCTCAGCCGCGGTCCCAACCGCACCCTAGCTTC
GTTACCTGCGCCTCCAGCGGCCCTGCGTCCTCTGCGCTCTCATCCTTACAGGGGCCCTAGACGGCCAGAA
CTGAGCGACGCGGCCTCGCCTCACTCCGGCGGGGACCGTTATGACAACCCGCAACTGCCCCGCGGCACAC
CGCGGCCCTCCGGCCCACACCCCTCCGGCCCGCCCCTTAGACCGTTGGTTGGTGCTTTCCAGACGCGACC
GAAGGCGCCTGACCGCCGTGGCCGGCTGCCTATTGGTTTGCAGTACTGTCGCTCAGGTGCAGTTCCCACT
TCCGCCTGTTTCTTCCCTTTCCTGTTAGGCGAGAGCTGCGAAAGGCGAGAGCTGCGAAGGGCCAGGTGTC
GGGCGCTGTTTCTCGGTAAGCTAAGAACGAGGCTGTAGCGGCTCCAATAGG
RPL36AL 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPL36AL_1 ↗14:49,620,620負股49,620,610–49,620,669

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR14_C6WX8 · enhancer · 49617267–49618301 · regulatory

ENSR14_C6WXD · enhancer · 49619249–49620615 · regulatory

ENSR14_83GDJN · promoter · 49620616–49620809 · regulatory

ENSR14_5FN5DJ · CTCF_binding_site · 49620924–49620945 · regulatory

ENSR14_5FN5DX · CTCF_binding_site · 49621009–49621030 · regulatory

ENSR14_BCSWF · enhancer · 49623829–49624562 · regulatory

· motif · 49616708–49616720 · motif

· motif · 49616711–49616718 · motif

· motif · 49616711–49616726 · motif

· motif · 49616837–49616852 · motif

· motif · 49616842–49616854 · motif

· motif · 49616845–49616852 · motif

· motif · 49616899–49616914 · motif

· motif · 49619235–49619243 · motif

· motif · 49620463–49620483 · motif

· motif · 49620637–49620650 · motif

· motif · 49620639–49620650 · motif

· motif · 49620639–49620650 · motif

· motif · 49620641–49620650 · motif

· motif · 49620750–49620760 · motif

· motif · 49620761–49620771 · motif

· motif · 49620763–49620773 · motif

· motif · 49620926–49620942 · motif

· motif · 49621011–49621027 · motif

· motif · 49621311–49621327 · motif

· motif · 49621311–49621327 · motif

· motif · 49621318–49621333 · motif

· motif · 49621559–49621574 · motif

· motif · 49621573–49621586 · motif

· motif · 49621607–49621620 · motif

· motif · 49621607–49621620 · motif

· motif · 49621987–49621998 · motif

· motif · 49622134–49622147 · motif

· motif · 49622134–49622147 · motif

· motif · 49623284–49623295 · motif

· motif · 49623546–49623560 · motif

· motif · 49623546–49623560 · motif

· motif · 49624231–49624245 · motif

· motif · 49624399–49624411 · motif

· motif · 49624449–49624464 · motif

· motif · 49624563–49624585 · motif

· motif · 49624563–49624585 · motif

· motif · 49624575–49624587 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:106 aa

1 aa106 aa功能區域
依 Q969Q0 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

RPL36AL 的蛋白質長 106 個胺基酸,屬於真核生物核糖體蛋白 eL42 家族。序列第 26 至 53 位胺基酸被註記為無序區域。

功能區域Disordered26–53 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q969Q0…

AlphaFold · Q969Q0

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
RPL36ARPL36ALKRTAP10-7
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
細胞定位RPL36AL 的定位註記為細胞質。推論支持
證據與來源

Cytoplasm

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000298289 · 676 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCTGTTAGGCGAGAGCTGCGAAAGGCGAGAGCTGCGAAGG40
41GCCAGGTGTCGGGCGCTGTTTCTCGTTTTCATCATATAGA80
81CAAAACAGCCCTGCTGCAAAGATGGTCAACGTACCTAAAA120
121CCCGAAGAACCTTCTGTAAGAAGTGTGGCAAGCATCAGCC160
161TCACAAAGTGACACAGTATAAGAAGGGCAAGGATTCTTTG200
201TATGCCCAGGGAAGGAGGCGCTATGATCGGAAGCAGAGTG240
241GCTATGGTGGGCAGACAAAGCCAATTTTCCGGAAGAAGGC280
281TAAGACCACAAAGAAGATTGTGCTAAGGCTGGAATGTGTT320
321GAGCCTAACTGCAGATCCAAGAGGATGCTGGCCATTAAGA360
361GATGCAAGCATTTTGAACTGGGAGGAGATAAGAAGAGAAA400
401GGGCCAAGTGATCCAGTTCTAAACTTTGGGATATTTTTCT440
441TCAATTTTGAAGAGAAAATGGTGAAGCCATAGAAAAGTTA480
481CCCGAGGGAAAATAAATACAGTGATATTCTTACGCAAACT520
521TTTTGTGGTTTTTACTTATAAATAGAATTCCATGTTTAGT560
561GTAGTCCCACCTCAAACTTTACTAACAAGTTTATATATGT600
601ATGAAGGGAAAATACTACTTTACTACTTTTTGTTTTCTGG640
641TCAATTTCAAATGTTGAATGAATTCATAAACATTGA676

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。