基因總覽
RPL36A 是蛋白質編碼基因,其產物 ribosomal protein L36a 屬於真核生物核糖體蛋白 eL42 家族。該蛋白是大型核糖體次單元的組成成分;核糖體則是由 RNA 與蛋白質構成、負責在細胞中合成蛋白質的大型核糖核蛋白複合體。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000553110 ★ | 101,391,011–101,396,155 | 5 |
| ENST00000427805 | 101,390,824–101,396,155 | 5 |
| ENST00000903140 | 101,390,824–101,396,155 | 4 |
| ENST00000933520 | 101,390,824–101,395,800 | 5 |
| ENST00000933521 | 101,390,824–101,396,155 | 5 |
| ENST00001083789 | 101,390,824–101,395,800 | 5 |
| ENST00001097080 | 101,390,824–101,395,802 | 5 |
| ENST00001097081 | 101,390,824–101,396,155 | 5 |
| ENST00001097085 | 101,390,824–101,395,795 | 5 |
| ENST00001097086 | 101,390,824–101,396,155 | 5 |
| ENST00001097089 | 101,390,824–101,395,793 | 5 |
| ENST00000392994 | 101,390,989–101,395,793 | 4 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ribosomal protein L36a 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質組成的大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞中合成蛋白質。因此,來源支持 RPL36A 產物參與核糖體的蛋白質合成功能,並指出其位於核糖體的大型次單元中。現有資料未提供更細的分子作用機制、調控方式或其他生物學過程,故不進一步推定。
Promoter 與基因調控
>RPL36A ENST00000553110 GRCh38 chrX:101390011-101391111 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AAGGAACGCGGGCTCTAGAGTCAGTCTACTTGGGTTTGTATCCTAGATTCACTAAATACCGTTGACATTG GGCAAATCGTTTAACATCCTACAGCCTCAATTTCTTAATCTGTAAAATGAGAATAATAGTACCACCTGTC TCCTAGAATTATTGTGAGAATTGTATGACACAATCTATTTAAAATGTTTAGCACCCTGAAGTCTTTCTAT GCTGGACTCTCTTGAGACCTAGTATATGCCTTCTGCCAGGTTTGCAAGGAAGGGAAGAGCCGCTAGGTAC TTTCTACTTCTAGGCTTGATGATTGCTATTACAGGAGCCAAACAATTTCATTGTCACTTTTCAGAACCTA GAGCTGCTGACTTACTCCCTCAACAGAAGGGTGCTGCTTTAATGCCAATCATTGTTCCTTTTCTTCAAAG TACTTAGTTCATAATTGCACATTTATAAGCCTATTAGATTACTGTACCTCTCCCCCGGAACAGTGCCTGC CACATAATGGGCATCCAATAACCATTTGTTGAATGGACCAACTGGCCATGTGATAGATGAACTGGAACAA TTGGCTCCCTCCAGGTCTTCATTGAATTAGCAGTTTGCTGCGAAAGGTGTTCCCAGTGACCTTGAGGTGG AACAGGAATGGAACGTGGAGGTGGAGGACCCCTTCATTCGACCCTAGTCCTGGCTTCCCTCGGGGACGGG GAGGCCAGAGGATCTGGGAAAAACACTGCTCCCTTCACTGAACGCCACTACGTAGCAGAGTCCACCAAAA GAGATAAAGTGACGAAACGTTGAAAGCTGCGGGGCGGGAGGAAGTCGGGGTGAGTGGACCACCCTTTAGG CGGAGTCCTTCCTTAAGCTCCCGCCCGCGGCTCCGAACTGAGTCCTCTCAGCCGCCCGAGGGCGCTGCGC TGAGCCTTACACTCTATGATTGCTCCTACCGACTCCCATGAGGAAGTGCGATCGGGAACCTCCTATATAC TTCCGTTTGCCTCGCGGTTTCTTTCTTTCCGCGCCGATAGCGCTCACGCAAGCATGGTAGGACTTGCTGG TGGGGGCCGAGTAACATCCAGCTTAATCTTTCCCCCCCTTCGTCGCCCGTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPL36A_1 ↗ | X:101,391,015 | 正股 | 101,390,966–101,391,025 |
| RPL36A_4 ↗ | X:101,391,540 | 正股 | 101,391,491–101,391,550 |
| RPL36A_3 ↗ | X:101,391,786 | 正股 | 101,391,737–101,391,796 |
| RPL36A_2 ↗ | X:101,395,373 | 正股 | 101,395,324–101,395,383 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSRX_93H8J7 · enhancer · 101385791–101386168 · regulatory
ENSRX_93H8JC · promoter · 101386169–101386618 · regulatory
ENSRX_93H8KN · promoter · 101390786–101391212 · regulatory
ENSRX_5TSW9C · CTCF_binding_site · 101390898–101390919 · regulatory
ENSRX_84ZH98 · enhancer · 101395865–101396077 · regulatory
· motif · 101386220–101386233 · motif
· motif · 101386308–101386321 · motif
· motif · 101390900–101390916 · motif
· motif · 101390957–101390968 · motif
· motif · 101390957–101390968 · motif
· motif · 101390988–101390997 · motif
· motif · 101390988–101390999 · motif
· motif · 101390988–101390999 · motif
· motif · 101390988–101391002 · motif
· motif · 101391002–101391010 · motif
· motif · 101393725–101393736 · motif
· motif · 101395991–101396000 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:106 aa
ribosomal protein L36a 長 106 個胺基酸,屬於真核生物核糖體蛋白 eL42 家族。序列第 34 至 53 位被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ribosomal protein L36a 的定位資料為細胞質;來源未提供定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- AIDAQ96BJ3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ribosomal protein L36a 是大型核糖體次單元的組成成分。現有資料支持其複合體成員身分,但未指出特定的直接結合對象或其他功能性互作。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ribosomal protein L36a 是大型核糖體次單元的組成成分;核糖體是大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞中合成蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ |
| 交互作用 | ribosomal protein L36a 是大型核糖體次單元的組成成分。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | ribosomal protein L36a 的定位記錄為細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTTTCTTTCCGCGCCGATAGCGCTCACGCAAGCATGGTTA40ACGTCCCTAAAACCCGCCGGACTTTCTGTAAGAAGTGTGG80CAAGCACCAACCCCATAAAGTGACACAGTACAAGAAGGGC120AAGGATTCTCTGTACGCCCAGGGAAAGCGGCGTTATGACA160GGAAGCAGAGTGGCTATGGTGGGCAAACTAAGCCGATTTT200CCGGAAAAAGGCTAAAACTACAAAGAAGATTGTGCTAAGG240CTTGAGTGCGTTGAGCCCAACTGCAGATCTAAGAGAATGC280TGGCTATTAAAAGATGCAAGCATTTTGAACTGGGAGGAGA320TAAGAAGAGAAAGGGCCAAGTGATCCAGTTCTAAGTGTCA360TCTTTTATTATGAAGACAATAAAATCTTGAGTTTATGTTC400ACTTCATTTGTTTGCTGTTCATCTTTTGGGAGGGAATAAG440CTAGAGCCATCAATACAATTCCGCTTGTGGGGAAATTTAT480GCCTCTTACTGGTACTACTTGTTTTGCATTGAAGCTGACT520GGTTGAGTTCACATCATATGTTGCAATTTTCTAATTTGGC560ACTTCAATCACTAGGGGCCTTATGAGGCAGTTTGTCATTA600TGCAATGGTTATTGGTTATCATGTGAGTAGACACATTTCA640GGCTAATAGGGAGAAGTCAGTAACACATTCATAGTGAATA680TGAGATGTCTTTGCTAAGAGTTAAGTGTCAGATCTTTGTT720ATAACAGTTAATTTAATAAAGAATTTTGGCATTGTTCTTC760A761cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。