演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPL36AL36A

ribosomal protein L36a

RPL36A 編碼 ribosomal protein L36a,屬於真核生物核糖體蛋白 eL42 家族,是大型核糖體次單元的組成成分。

Homo sapiensXq22.1UniProt P83881
OFFICIAL SYMBOL
RPL36A
CHROMOSOME
X
UNIPROT
P83881
PDB / ALPHAFOLD
22TU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPL36A 是蛋白質編碼基因,其產物 ribosomal protein L36a 屬於真核生物核糖體蛋白 eL42 家族。該蛋白是大型核糖體次單元的組成成分;核糖體則是由 RNA 與蛋白質構成、負責在細胞中合成蛋白質的大型核糖核蛋白複合體。

Official symbol
RPL36A
Gene name
ribosomal protein L36a
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10359
UniProt
P83881
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
L36AeL42RPL44

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome XXq22.1
chrX · 156,040,895 bp · GRCh38chrXp22.33 · 1–4400000 · gnegchrXp22.32 · 4400001–6100000 · gpos50chrXp22.31 · 6100001–9600000 · gnegchrXp22.2 · 9600001–17400000 · gpos50chrXp22.13 · 17400001–19200000 · gnegchrXp22.12 · 19200001–21900000 · gpos50chrXp22.11 · 21900001–24900000 · gnegchrXp21.3 · 24900001–29300000 · gpos100chrXp21.2 · 29300001–31500000 · gnegchrXp21.1 · 31500001–37800000 · gpos100chrXp11.4 · 37800001–42500000 · gnegchrXp11.3 · 42500001–47600000 · gpos75chrXp11.23 · 47600001–50100000 · gnegchrXp11.22 · 50100001–54800000 · gpos25chrXp11.21 · 54800001–58100000 · gnegchrXp11.1 · 58100001–61000000 · acenchrXq11.1 · 61000001–63800000 · acenchrXq11.2 · 63800001–65400000 · gnegchrXq12 · 65400001–68500000 · gpos50chrXq13.1 · 68500001–73000000 · gnegchrXq13.2 · 73000001–74700000 · gpos50chrXq13.3 · 74700001–76800000 · gnegchrXq21.1 · 76800001–85400000 · gpos100chrXq21.2 · 85400001–87000000 · gnegchrXq21.31 · 87000001–92700000 · gpos100chrXq21.32 · 92700001–94300000 · gnegchrXq21.33 · 94300001–99100000 · gpos75chrXq22.1 · 99100001–103300000 · gnegchrXq22.2 · 103300001–104500000 · gpos50chrXq22.3 · 104500001–109400000 · gnegchrXq23 · 109400001–117400000 · gpos75chrXq24 · 117400001–121800000 · gnegchrXq25 · 121800001–129500000 · gpos100chrXq26.1 · 129500001–131300000 · gnegchrXq26.2 · 131300001–134500000 · gpos25chrXq26.3 · 134500001–138900000 · gnegchrXq27.1 · 138900001–141200000 · gpos75chrXq27.2 · 141200001–143000000 · gnegchrXq27.3 · 143000001–148000000 · gpos100chrXq28 · 148000001–156040895 · gnegRPL36Apq1 bp156,040,895 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chrX:101,390,824–101,396,155
Gene span
5,332 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000553110 ★101,391,011–101,396,1555
ENST00000427805101,390,824–101,396,1555
ENST00000903140101,390,824–101,396,1554
ENST00000933520101,390,824–101,395,8005
ENST00000933521101,390,824–101,396,1555
ENST00001083789101,390,824–101,395,8005
ENST00001097080101,390,824–101,395,8025
ENST00001097081101,390,824–101,396,1555
ENST00001097085101,390,824–101,395,7955
ENST00001097086101,390,824–101,396,1555
ENST00001097089101,390,824–101,395,7935
ENST00000392994101,390,989–101,395,7934

顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ribosomal protein L36a 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質組成的大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞中合成蛋白質。因此,來源支持 RPL36A 產物參與核糖體的蛋白質合成功能,並指出其位於核糖體的大型次單元中。現有資料未提供更細的分子作用機制、調控方式或其他生物學過程,故不進一步推定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 101391011 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPL36A ENST00000553110 GRCh38 chrX:101390011-101391111 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AAGGAACGCGGGCTCTAGAGTCAGTCTACTTGGGTTTGTATCCTAGATTCACTAAATACCGTTGACATTG
GGCAAATCGTTTAACATCCTACAGCCTCAATTTCTTAATCTGTAAAATGAGAATAATAGTACCACCTGTC
TCCTAGAATTATTGTGAGAATTGTATGACACAATCTATTTAAAATGTTTAGCACCCTGAAGTCTTTCTAT
GCTGGACTCTCTTGAGACCTAGTATATGCCTTCTGCCAGGTTTGCAAGGAAGGGAAGAGCCGCTAGGTAC
TTTCTACTTCTAGGCTTGATGATTGCTATTACAGGAGCCAAACAATTTCATTGTCACTTTTCAGAACCTA
GAGCTGCTGACTTACTCCCTCAACAGAAGGGTGCTGCTTTAATGCCAATCATTGTTCCTTTTCTTCAAAG
TACTTAGTTCATAATTGCACATTTATAAGCCTATTAGATTACTGTACCTCTCCCCCGGAACAGTGCCTGC
CACATAATGGGCATCCAATAACCATTTGTTGAATGGACCAACTGGCCATGTGATAGATGAACTGGAACAA
TTGGCTCCCTCCAGGTCTTCATTGAATTAGCAGTTTGCTGCGAAAGGTGTTCCCAGTGACCTTGAGGTGG
AACAGGAATGGAACGTGGAGGTGGAGGACCCCTTCATTCGACCCTAGTCCTGGCTTCCCTCGGGGACGGG
GAGGCCAGAGGATCTGGGAAAAACACTGCTCCCTTCACTGAACGCCACTACGTAGCAGAGTCCACCAAAA
GAGATAAAGTGACGAAACGTTGAAAGCTGCGGGGCGGGAGGAAGTCGGGGTGAGTGGACCACCCTTTAGG
CGGAGTCCTTCCTTAAGCTCCCGCCCGCGGCTCCGAACTGAGTCCTCTCAGCCGCCCGAGGGCGCTGCGC
TGAGCCTTACACTCTATGATTGCTCCTACCGACTCCCATGAGGAAGTGCGATCGGGAACCTCCTATATAC
TTCCGTTTGCCTCGCGGTTTCTTTCTTTCCGCGCCGATAGCGCTCACGCAAGCATGGTAGGACTTGCTGG
TGGGGGCCGAGTAACATCCAGCTTAATCTTTCCCCCCCTTCGTCGCCCGTG
RPL36A 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPL36A_1 ↗X:101,391,015正股101,390,966–101,391,025
RPL36A_4 ↗X:101,391,540正股101,391,491–101,391,550
RPL36A_3 ↗X:101,391,786正股101,391,737–101,391,796
RPL36A_2 ↗X:101,395,373正股101,395,324–101,395,383

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSRX_93H8J7 · enhancer · 101385791–101386168 · regulatory

ENSRX_93H8JC · promoter · 101386169–101386618 · regulatory

ENSRX_93H8KN · promoter · 101390786–101391212 · regulatory

ENSRX_5TSW9C · CTCF_binding_site · 101390898–101390919 · regulatory

ENSRX_84ZH98 · enhancer · 101395865–101396077 · regulatory

· motif · 101386220–101386233 · motif

· motif · 101386308–101386321 · motif

· motif · 101390900–101390916 · motif

· motif · 101390957–101390968 · motif

· motif · 101390957–101390968 · motif

· motif · 101390988–101390997 · motif

· motif · 101390988–101390999 · motif

· motif · 101390988–101390999 · motif

· motif · 101390988–101391002 · motif

· motif · 101391002–101391010 · motif

· motif · 101393725–101393736 · motif

· motif · 101395991–101396000 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:106 aa

1 aa106 aa功能區域
依 P83881 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ribosomal protein L36a 長 106 個胺基酸,屬於真核生物核糖體蛋白 eL42 家族。序列第 34 至 53 位被註記為無序區域。

功能區域Disordered34–53 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 22TU…

PDB · 22TU

EM · 3.00 A · Lo=1-106

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

ribosomal protein L36a 的定位資料為細胞質;來源未提供定位變化條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
L36ARPL36AAIDA
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ribosomal protein L36a 是大型核糖體次單元的組成成分。現有資料支持其複合體成員身分,但未指出特定的直接結合對象或其他功能性互作。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ribosomal protein L36a 是大型核糖體次單元的組成成分;核糖體是大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞中合成蛋白質。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ribosomal protein L36a 是大型核糖體次單元的組成成分。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ribosomal protein L36a 的定位記錄為細胞質。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm

PMID 23636399 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000553110 · 761 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTTTCTTTCCGCGCCGATAGCGCTCACGCAAGCATGGTTA40
41ACGTCCCTAAAACCCGCCGGACTTTCTGTAAGAAGTGTGG80
81CAAGCACCAACCCCATAAAGTGACACAGTACAAGAAGGGC120
121AAGGATTCTCTGTACGCCCAGGGAAAGCGGCGTTATGACA160
161GGAAGCAGAGTGGCTATGGTGGGCAAACTAAGCCGATTTT200
201CCGGAAAAAGGCTAAAACTACAAAGAAGATTGTGCTAAGG240
241CTTGAGTGCGTTGAGCCCAACTGCAGATCTAAGAGAATGC280
281TGGCTATTAAAAGATGCAAGCATTTTGAACTGGGAGGAGA320
321TAAGAAGAGAAAGGGCCAAGTGATCCAGTTCTAAGTGTCA360
361TCTTTTATTATGAAGACAATAAAATCTTGAGTTTATGTTC400
401ACTTCATTTGTTTGCTGTTCATCTTTTGGGAGGGAATAAG440
441CTAGAGCCATCAATACAATTCCGCTTGTGGGGAAATTTAT480
481GCCTCTTACTGGTACTACTTGTTTTGCATTGAAGCTGACT520
521GGTTGAGTTCACATCATATGTTGCAATTTTCTAATTTGGC560
561ACTTCAATCACTAGGGGCCTTATGAGGCAGTTTGTCATTA600
601TGCAATGGTTATTGGTTATCATGTGAGTAGACACATTTCA640
641GGCTAATAGGGAGAAGTCAGTAACACATTCATAGTGAATA680
681TGAGATGTCTTTGCTAAGAGTTAAGTGTCAGATCTTTGTT720
721ATAACAGTTAATTTAATAAAGAATTTTGGCATTGTTCTTC760
761A761

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。