演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPL36DKFZp566B023

ribosomal protein L36

RPL36 是蛋白質編碼基因,其產物與 C2CD2L/TMEM24 的磷脂醯肌醇運輸及 PI3K-AKT-mTOR 訊息傳遞調控相關。

Homo sapiens19p13.3UniProt C0HME6
OFFICIAL SYMBOL
RPL36
CHROMOSOME
19
UNIPROT
C0HME6
PDB / ALPHAFOLD
無模型
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPL36 是位於人類第 19 號染色體的蛋白質編碼基因,正式名稱為 ribosomal protein L36。來源資料指出,其相關蛋白質產物 alt-RPL36 與 C2CD2L/TMEM24 具有功能關聯;目前提供的資料未說明其家族特徵或典型核糖體角色,因此不進一步推定。

Official symbol
RPL36
Gene name
ribosomal protein L36
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13631
UniProt
C0HME6
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
DKFZp566B023L36eL36

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p13.3
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25RPL36pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:5,674,947–5,691,881
Gene span
16,935 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000347512 ★5,690,295–5,691,8754
ENST000005796495,674,947–5,691,8815
ENST000005772225,680,765–5,691,8816
ENST000005794465,690,193–5,691,6533
ENST000009135505,690,193–5,691,8814
ENST000009135515,690,193–5,691,8813
ENST000009135525,690,193–5,691,8814
ENST000009135545,690,193–5,691,8814
ENST000009135555,690,193–5,691,8814
ENST000009135575,690,193–5,691,8814
ENST000009135595,690,193–5,691,6674
ENST000010629305,690,193–5,691,8814

顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RPL36 相關產物 alt-RPL36 可抑制 C2CD2L/TMEM24 依賴的磷脂醯肌醇運輸。這種脂質由內質網合成,並可作為磷脂醯肌醇 4,5-二磷酸〔PI(4,5)P2〕的前驅物;其運輸方向是由內質網前往細胞膜。資料所述的抑制作用因此涉及脂質從合成位置移出的過程。

這項運輸調控與訊息傳遞變化相關:C2CD2L/TMEM24 依賴的磷脂醯肌醇運輸受到抑制時,PI3K-AKT-mTOR 訊息傳遞路徑的活性會下調。來源支持的是運輸抑制與路徑下調之間的關聯,未提供更細節的中間步驟或其他生物學結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 5690295 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPL36 ENST00000347512 GRCh38 chr19:5689295-5690395 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTAGTAGCATTAAAGGAGAAAAACTGGAAACTTGTGTGTTTCTGCCACCCGATTCAGTTATTTAGCGTCC
CGTCCCTACACCACCTAAATTACATCAGATGTCCGCAAGGGGCACTATTACACGTTGCTGTATTCAGACC
TAGTCTAGAGCTTGACCAATTGATAACAAAACCAATACCTTTTTTTTTAAATGGAGTTTCGCTCTGTCGC
CCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCTTGGGCTCAAGCAATTCTCC
TGCCTCAGCCTCCTGCGTAGCTGGGATTACAGGAGCATGCCACCACGCCTGGCTATTTATTTATTTATTT
ATTTATTTATTTATTTATTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTC
GGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGACT
ACAGGTGCCCACCACCACGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTATTAGG
CTGGTCTCGAGCTCCTGACCTCGTGATCCACATGCCTCGACCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGCGTGA
GCCACCGCGCCCGGCCTAATGGGCGTTTTAACAGTTCATACAGTTTGGTATTATTATTCCCGCTCTACAA
GTGAAGAAATTCTGAGAGGTGATGTCGTCGATGCAGGGTCGGCCCGAAATAGGCGGAGTTGGGATTCGAA
CTCATTTCACAGGCAGAGGGAGGAGAGCAGCCATAGCCACCTCCACTGGTTCCGACTCCAGCTCCCGGGC
TCGCAGGAGTAAACGCGCATGCTCAGGGAGCTCGGTCGCGCATGCTCAGCGCAACGGCGGGGAAGACTCC
AGCCGCCAGGGGGAGCGCGTGCCGTTCTTGCCTCTCTGGCCTGCGCCTCCTGAGCCGAGTAGATATCCCG
GAGTTCCGCGCGGCGCCAGCCCTTCCGCCACGGCCGTCTCTGGAGAGCAGCAGGTAAGTGGTTTCCCGCA
CTGCCGGTATCCGCCGCCATCCGGACTCCCGGGTCCTCTGTGCAGGTTGGA
RPL36 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPL36_1 ↗19:5,690,296正股5,690,247–5,690,306

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_53C56Z · CTCF_binding_site · 5687266–5687287 · regulatory

ENSR19_B35H7 · promoter · 5689805–5690326 · regulatory

ENSR19_53C5NK · CTCF_binding_site · 5690203–5690224 · regulatory

· motif · 5686429–5686438 · motif

· motif · 5686531–5686541 · motif

· motif · 5686601–5686611 · motif

· motif · 5686618–5686627 · motif

· motif · 5686652–5686662 · motif

· motif · 5686658–5686668 · motif

· motif · 5686835–5686845 · motif

· motif · 5686955–5686970 · motif

· motif · 5686987–5686996 · motif

· motif · 5687015–5687025 · motif

· motif · 5687109–5687119 · motif

· motif · 5687148–5687158 · motif

· motif · 5687165–5687176 · motif

· motif · 5687204–5687214 · motif

· motif · 5687268–5687284 · motif

· motif · 5690148–5690159 · motif

· motif · 5690148–5690159 · motif

· motif · 5690171–5690182 · motif

· motif · 5690171–5690182 · motif

· motif · 5690205–5690221 · motif

· motif · 5690642–5690655 · motif

· motif · 5690906–5690914 · motif

· motif · 5690906–5690923 · motif

· motif · 5691029–5691037 · motif

· motif · 5691029–5691046 · motif

· motif · 5691307–5691318 · motif

· motif · 5691585–5691595 · motif

· motif · 5691684–5691697 · motif

· motif · 5691688–5691701 · motif

· motif · 5692255–5692264 · motif

· motif · 5692679–5692696 · motif

· motif · 5693294–5693302 · motif

· motif · 5693524–5693533 · motif

· motif · 5693562–5693571 · motif

· motif · 5693575–5693587 · motif

· motif · 5693577–5693592 · motif

· motif · 5694305–5694314 · motif

· motif · 5694548–5694557 · motif

· motif · 5694595–5694604 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:148 aa

1 aa148 aa功能區域
依 C0HME6 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

來源將 RPL36 相關蛋白質序列標示為 148 個胺基酸,並預測其第 1–79 與第 93–148 位胺基酸區段為無序區。此處為序列特徵註解;資料未提供其他結構域或功能區域資訊。

功能區域Disordered1–79 aa
功能區域Disordered93–148 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
目前沒有可用的 PDB 或 AlphaFold DB 模型。
08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Endoplasmic reticulum

資料將此蛋白質定位於內質網。 另有資料指出,alt-RPL36 與 C2CD2L/TMEM24 的交互作用對 alt-RPL36 定位至內質網是必要的;該交互作用發生於 RPL36 磷酸化時。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
DKFZp566B023RPL36
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

磷酸化的 alt-RPL36 會透過 C2CD2L/TMEM24 的 SMP-LBD 與 C2 結構域和其互作。這項互作是 alt-RPL36 定位至內質網所必需,並會抑制 C2CD2L/TMEM24 依賴的磷脂醯肌醇由內質網運輸至細胞膜。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能alt-RPL36 會抑制 C2CD2L/TMEM24 依賴的磷脂醯肌醇運輸;該脂質由內質網合成,並是 PI(4,5)P2 的前驅物。這項運輸受抑制時,PI3K-AKT-mTOR 訊息傳遞路徑會下調。含實驗來源
證據與來源

Inhibits C2CD2L/TMEM24-dependent transport of phosphatidylinositol, the precursor of phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate (PI(4,5)P2), from its site of synthesis in the endoplasmic reticulum to the cell membrane. This leads to down-regulation of the PI3K-AKT-mTOR signaling pathway

PMID 33479206 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用在 RPL36 磷酸化時,alt-RPL36 會透過 C2CD2L/TMEM24 的 SMP-LBD 與 C2 結構域和其互作。此互作是 alt-RPL36 定位至內質網所必需,並抑制 C2CD2L/TMEM24 依賴的磷脂醯肌醇由內質網運往細胞膜。含實驗來源
證據與來源

Interacts (when phosphorylated) with C2CD2L/TMEM24 (via the SMP-LBD and C2 domains); the interaction is required for localization of alt-RPL36 to the endoplasmic reticulum and inhibits C2CD2L-dependent transport of phosphatidylinositol from the endoplasmic reticulum to the cell membrane

PMID 33479206 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位此筆定位資料將蛋白質所在位置標示為內質網。含實驗來源
證據與來源

Endoplasmic reticulum

PMID 33479206 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000347512 · 607 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCTTCCGCCACGGCCGTCTCTGGAGAGCAGCAGCCATGGC40
41CCTACGCTACCCTATGGCCGTGGGCCTCAACAAGGGCCAC80
81AAAGTGACCAAGAACGTGAGCAAGCCCAGGCACAGCCGAC120
121GCCGCGGGCGTCTGACCAAACACACCAAGTTCGTGCGGGA160
161CATGATTCGGGAGGTGTGTGGCTTTGCCCCGTACGAGCGG200
201CGCGCCATGGAGTTACTGAAGGTCTCCAAGGACAAACGGG240
241CCCTCAAATTTATCAAGAAAAGGGTGGGGACGCACATCCG280
281CGCCAAGAGGAAGCGGGAGGAGCTGAGCAACGTACTGGCC320
321GCCATGAGGAAAGCTGCTGCCAAGAAAGACTGAGCCCCTC360
361CCCTGCCCTCTCCCTGAAATAAAGAACAGCTTGACAGAAG400
401CCCTGGCTCTCCTGCTGTCCGTGGGTGGGTGTGGGTGTGT440
441CGGGGGCCCGCAGTCCCCTGTCTGGTGCCCGCTCTGAGCC480
481ACACCCTCTCCGGGTGCTGCCTGGTCGTGAATCAAAAGCC520
521GTGGCCCGCCCACCCTTCCCGGGGCAGCAGGTGAGGAAGC560
561CGCCGTACTGCAAATGACTTTAATCATTAAATAGCTTCTA600
601TGCCACA607

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。