演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPL34L34

ribosomal protein L34

RPL34 編碼 ribosomal protein L34,屬於真核生物 eL34 家族,為大型核糖體次單元的組成蛋白;核糖體負責細胞內蛋白質合成。

Homo sapiens4q25UniProt P49207
OFFICIAL SYMBOL
RPL34
CHROMOSOME
4
UNIPROT
P49207
PDB / ALPHAFOLD
22TU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPL34 是一個蛋白質編碼基因,其產物為 ribosomal protein L34,屬於真核生物核糖體蛋白 eL34 家族。此蛋白是大型核糖體次單元的組成成員。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞中合成蛋白質;因此,RPL34 的基本角色是作為這個蛋白質合成複合體的一部分。現有資料未提供其胺基酸長度、結構域或其他序列特徵。

Official symbol
RPL34
Gene name
ribosomal protein L34
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10340
UniProt
P49207
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
L34eL34

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 44q25
chr4 · 190,214,555 bp · GRCh38chr4p16.3 · 1–4500000 · gnegchr4p16.2 · 4500001–6000000 · gpos25chr4p16.1 · 6000001–11300000 · gnegchr4p15.33 · 11300001–15000000 · gpos50chr4p15.32 · 15000001–17700000 · gnegchr4p15.31 · 17700001–21300000 · gpos75chr4p15.2 · 21300001–27700000 · gnegchr4p15.1 · 27700001–35800000 · gpos100chr4p14 · 35800001–41200000 · gnegchr4p13 · 41200001–44600000 · gpos50chr4p12 · 44600001–48200000 · gnegchr4p11 · 48200001–50000000 · acenchr4q11 · 50000001–51800000 · acenchr4q12 · 51800001–58500000 · gnegchr4q13.1 · 58500001–65500000 · gpos100chr4q13.2 · 65500001–69400000 · gnegchr4q13.3 · 69400001–75300000 · gpos75chr4q21.1 · 75300001–78000000 · gnegchr4q21.21 · 78000001–81500000 · gpos50chr4q21.22 · 81500001–83200000 · gnegchr4q21.23 · 83200001–86000000 · gpos25chr4q21.3 · 86000001–87100000 · gnegchr4q22.1 · 87100001–92800000 · gpos75chr4q22.2 · 92800001–94200000 · gnegchr4q22.3 · 94200001–97900000 · gpos75chr4q23 · 97900001–100100000 · gnegchr4q24 · 100100001–106700000 · gpos50chr4q25 · 106700001–113200000 · gnegchr4q26 · 113200001–119900000 · gpos75chr4q27 · 119900001–122800000 · gnegchr4q28.1 · 122800001–127900000 · gpos50chr4q28.2 · 127900001–130100000 · gnegchr4q28.3 · 130100001–138500000 · gpos100chr4q31.1 · 138500001–140600000 · gnegchr4q31.21 · 140600001–145900000 · gpos25chr4q31.22 · 145900001–147500000 · gnegchr4q31.23 · 147500001–150200000 · gpos25chr4q31.3 · 150200001–154600000 · gnegchr4q32.1 · 154600001–160800000 · gpos100chr4q32.2 · 160800001–163600000 · gnegchr4q32.3 · 163600001–169200000 · gpos100chr4q33 · 169200001–171000000 · gnegchr4q34.1 · 171000001–175400000 · gpos75chr4q34.2 · 175400001–176600000 · gnegchr4q34.3 · 176600001–182300000 · gpos100chr4q35.1 · 182300001–186200000 · gnegchr4q35.2 · 186200001–190214555 · gpos25RPL34pq1 bp190,214,555 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr4:108,620,508–108,632,886
Gene span
12,379 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000394667 ★108,620,576–108,625,3705
ENST00000502534108,620,508–108,625,5546
ENST00000853717108,620,508–108,632,8866
ENST00000926072108,620,508–108,632,6106
ENST00000926073108,620,508–108,631,3386
ENST00000926074108,620,508–108,631,3386
ENST00000926075108,620,508–108,630,4846
ENST00000926076108,620,508–108,625,2535
ENST00000926077108,620,508–108,625,2535
ENST00000926078108,620,508–108,625,2536
ENST00000926079108,620,508–108,625,2535
ENST00001094665108,620,508–108,632,8865

顯示 12/51 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RPL34 的產物 ribosomal protein L34 是大型核糖體次單元的組成成員。其功能資訊主要指出它參與核糖體複合體,而非描述獨立於核糖體之外的作用。核糖體是由 RNA 與蛋白質組成的大型核糖核蛋白複合體,負責細胞內蛋白質的合成;RPL34 因而是細胞蛋白質合成機器的一部分。

蛋白質合成是核糖體所執行的核心工作。來源將 ribosomal protein L34 的角色定位於大型次單元,並未進一步說明它如何影響核糖體的組裝、RNA 或其他分子的結合,也未描述它在合成過程中特定步驟中的作用。因此,可支持的功能層級是其作為大型核糖體次單元成員,參與負責蛋白質合成的核糖體複合體;不能據此延伸出更具體的分子機制或調控作用。

這項功能描述將 RPL34 與核糖體整體的蛋白質合成任務連結,但沒有提供 RPL34 單獨作用的實驗細節,也未指出特定細胞類型、條件或蛋白質產物。其生物學意義可限於:它是核糖體大型次單元的一部分,而核糖體執行細胞內蛋白質合成。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 108620576 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPL34 ENST00000394667 GRCh38 chr4:108619576-108620676 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CACCTGACCCCGCCTTTCTCAGCTTCCTGGAGGTGCATTCTAAGAGCGCTCCCCATAAGCCAACACTCAA
GTCTCTTCGAGGTGTGTTTCCAGGGAGCCTGATCTAAGATTAAAAACTTAAAGGCCCCTTTTAGAATTGT
CTTTTACAGCCCAGGCAAAGAGTTCTTTACTTTTTTAGAGGTCATGAATCCCTTTGACAAGGTGATGAAA
GCCAGGGACCCTCTTCTCAGAAAAATACACACGTGCGCTTAATGTAAAATTTTACATACTGTTTTAAAGG
TTAAACTTTACCACCCATGAAAAGCCTCAAGTAGTTCTTTGTACATAATCATAAGATTAGCAACCATTTA
CTGAGCACTTCCTCTCTATAAGACCCTGTGCTAAGTGCTTTAACTTCATAATGCCTTTGATCATGACATA
ACATGGCACGGTAGTTCCTAATATCTTCCTTTTAGAGATTTAAGGGCTTGCTCAAAGTAACATAGCTAAT
AATTAGCAGACACTGGATTAAAATCCCAATTTGTTTGTAAAGCTTGTGCTCTGAATAAATGACAAGGAAA
GAGAAGGGAAGGTTGAAGAAGGGAAGGTTCTTGAAGGTCCCTGGTCCTTGAAGGTCCCTTAACCATAAAT
GTCAAGAGTTGGGATTTAAACCCAGGTCTAACGCCAGAGCTGGCGCCCTTTAGATTAAAAGTGCAGTGTC
CATGACAACGAAAGAAGTTGATTTTGTCCCACCTTTGCTCTTTGCGGCTTTTCATTTGCGTTTGTTTCCA
CAGCGATTTCCAATAGATTTCTGCGTGGCCTTGACACAGACAGCTAGTGTGAATCCCCGCCCACAGAGGG
GCGGCACGTTGGTTGCCGTACAACGTGGTGGTTCCCTGCATCTCTGCCCACGTCGGAGAGGTGCGTCGGC
TTCCGTACAACACGGATACTCTCTCTCTGACGCAACTTCCTGTCCTGCGCAATTCTATTTGACCTTTGAA
CTGGCAAAGGCTTTTTTCTTCCTCTTCCGGGGACGTTGTCTGCAGGTATGGATGTTGTTCTCTTTTCCCT
GTCTTTATTTCCTTACCAATCGGCTGCCATCCGAGGAGCTGAGGAAGCCTA
RPL34 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPL34_1 ↗4:108,620,577正股108,620,528–108,620,587

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR4_CDR2C · enhancer · 108619268–108620375 · regulatory

ENSR4_93L53J · promoter · 108620376–108620666 · regulatory

ENSR4_CDR2F · enhancer · 108620667–108621795 · regulatory

· motif · 108620308–108620325 · motif

· motif · 108620310–108620325 · motif

· motif · 108620399–108620409 · motif

· motif · 108620519–108620528 · motif

· motif · 108620541–108620553 · motif

· motif · 108620543–108620558 · motif

· motif · 108620543–108620558 · motif

· motif · 108620544–108620551 · motif

· motif · 108620544–108620558 · motif

· motif · 108620545–108620558 · motif

· motif · 108620709–108620722 · motif

· motif · 108620752–108620766 · motif

· motif · 108620870–108620878 · motif

· motif · 108620870–108620885 · motif

· motif · 108620878–108620886 · motif

· motif · 108622767–108622778 · motif

· motif · 108623986–108624008 · motif

· motif · 108623986–108624008 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:117 aa

ribosomal protein L34 屬於真核生物核糖體蛋白 eL34 家族。現有資料未列出其結構域、功能區域或序列註解,因此無法據此描述更細部的蛋白質結構特徵。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 22TU…

PDB · 22TU

EM · 3.00 A · Lg=1-117

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, cytosol;Cytoplasm;Endoplasmic reticulum

ribosomal protein L34 曾於細胞質多核糖體中檢出;另有相似性推論指出,它也存在於與粗面內質網相關的核糖體中。 這些資料分別描述細胞質多核糖體的檢出結果,以及依相似性提出的定位資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
L34RPL34LRRK2NPM1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

資料指出 RPL34 是大型核糖體次單元的組成成員,支持其參與核糖體複合體;但未提供與特定蛋白質或其他分子的直接結合資訊,也未描述超出複合體組成關係的功能性互作。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ribosomal protein L34 是大型核糖體次單元的組成成員。核糖體由 RNA 與蛋白質構成,是細胞內負責合成蛋白質的大型核糖核蛋白複合體。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell

PMID 23636399 ↗ · PMID 25901680 ↗ · PMID 25957688 ↗ · PMID 32669547 ↗ · PMID 12962325 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ribosomal protein L34 是大型核糖體次單元的組成成員;此項描述說明其屬於該核糖體部分,未提供其他特定互作資訊。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit

PMID 23636399 ↗ · PMID 25901680 ↗ · PMID 25957688 ↗ · PMID 32669547 ↗ · PMID 12962325 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ribosomal protein L34 曾於細胞質多核糖體中檢出;另依相似性推論,它也位於與粗面內質網相關的核糖體中。後者屬於相似性推論,而非此處所述的直接檢出結果。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm, cytosol; Cytoplasm; Endoplasmic reticulum; Detected on cytosolic polysomes. Detected in ribosomes that are associated with the rough endoplasmic reticulum (By similarity)

PMID 25957688 ↗ · PMID 23636399 ↗ · PMID 25901680 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000394667 · 546 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCTCTTCCGGGGACGTTGTCTGCAGGCACTCAGAATGGTC40
41CAGCGTTTGACATACCGACGTAGGCTTTCCTACAATACAG80
81CCTCTAACAAAACTAGGCTGTCCCGAACCCCTGGTAATAG120
121AATTGTTTACCTTTATACCAAGAAGGTTGGGAAAGCACCA160
161AAATCTGCATGTGGTGTGTGCCCAGGCAGACTTCGAGGGG200
201TTCGTGCTGTAAGACCTAAAGTTCTTATGAGATTGTCCAA240
241AACAAAGAAACATGTCAGCAGGGCCTATGGTGGTTCCATG280
281TGTGCTAAATGTGTTCGTGACAGGATCAAGCGTGCTTTCC320
321TTATCGAGGAGCAGAAAATCGTTGTGAAAGTGTTGAAGGC360
361ACAAGCACAGAGTCAGAAAGCTAAATAAAAAAATGAAACT400
401TTTTTGAGTAATAAAAATGAAAAGACGCTGTATGTATGAC440
441TTTTTTTTTTTCTGTTGTAATGTGTTAGTATACAGATTTT480
481GTTTCTGTATGGTATTTGGGGACCCTATAGTTTTTAGCAG520
521ATTACTTTTTCTTGTTTTGTTTGTTG546

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。