演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPL31L31

ribosomal protein L31

RPL31 編碼 ribosomal protein L31,屬於真核生物 eL31 家族,是大型核糖體次單元的組成成分。

Homo sapiens2q11.2UniProt P62899
OFFICIAL SYMBOL
RPL31
CHROMOSOME
2
UNIPROT
P62899
PDB / ALPHAFOLD
22TU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPL31 是蛋白質編碼基因,其正式名稱為 ribosomal protein L31。其產物屬於真核生物核糖體蛋白 eL31 家族,並是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責細胞內蛋白質的合成;RPL31 因而是這個蛋白質合成複合體的組成部分。

Official symbol
RPL31
Gene name
ribosomal protein L31
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10334
UniProt
P62899
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
L31eL31

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22q11.2
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegRPL31pq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr2:100,997,746–101,024,037
Gene span
26,292 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000264258 ★101,002,289–101,007,2675
ENST00001100310100,997,746–101,006,9695
ENST00000409000101,002,229–101,004,6043
ENST00000409028101,002,229–101,019,7285
ENST00000409320101,002,229–101,006,4184
ENST00000409650101,002,229–101,018,2895
ENST00000409038101,002,229–101,018,3065
ENST00000870891101,002,229–101,006,4195
ENST00000938459101,002,229–101,006,4234
ENST00000938460101,002,229–101,006,4235
ENST00000938461101,002,229–101,006,4236
ENST00000938462101,002,229–101,006,4235

顯示 12/41 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RPL31 的產物 ribosomal protein L31 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質;因此,來源所支持的功能重點,是 ribosomal protein L31 作為該複合體的一部分參與蛋白質合成。現有資料未進一步說明此蛋白質在核糖體內的具體作用方式,也未提供其對蛋白質合成的個別影響或其他相關生物學過程。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 101002289 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPL31 ENST00000264258 GRCh38 chr2:101001289-101002389 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGGAACATCAAGCTCCTTCGTTCTGGGAAATTTCCTTAAATTCAAGGTACCATCGTCATGAAATTTCTGA
ACTTTAAAGAGAAGATCCTAAAATCTTTCAGAGAGAAAAAAATGACGCATCACTTCTCACCACACTGAAA
AACTGAAGACAATGAAGCCTGCCTTCAAAATGCTGGGGAGAAATTCTTTTCAATCTAGAATTCCATACAA
GCCAGAATTTAAATTTGAGGGTTGAATAAATACTCAGGTATTTGAGGGCTCATAAACTTTTTAGCTAGTG
TACTCATCTTAAGAAACCACTAAAAATGGTGTGCTCCTGTGAAAGAAGGGAGTTCGACAAGAAAAAGGAA
GACATGGGTCCATAGATCCAACTGTCTCCGAATCTCTAGACTGGTGACACGCAGTTCCCAGTTCTCTGGG
GACCTCCTCAGATCTCCCTGTCGTGTCATCTCACATCTGTCATCTCTCAGGTCATATCCAACACACTGGG
CCACCCACGCACAGGGACGACGCGACAGCCCTGTGGCTCCACCGCACAGGACAGCCACGACTGGCAATCC
TGTGCCGGCCCTGCTCGACGCAAGCACCTCCAGCGCCGGGTTGCGTCTTAGTGACCCTGGGACCGCCAGC
CAGGCACCGCGCCCGACGCAGGCTCAGTCAGTGTTGGTCGGATGCATGAATGAATGGGAAAAACGAAGTC
TCTCTCTCCCTGGCCCTGCTCCCATACATCTGTAGGCCTAGGTCTTGGTTTTATCCGAAGACTTAGAGAA
GGGACGCAAGTTCCTTCGCGGAGCCAGAAGGAATCCGTCGAGAAGCGGGACCTCAAGCTCGCGGCCCAAA
AGCGCGGCCCCGCCACGACGCCTGCTAGCTGGCCCCACTTCGGCGCGCGCCGCTTACATCATAGCTCGCC
TCTCCCCTTCCCTAGCCACACCCCCTTGCCTGGCGACCCGGAAGTTGTACTTGCAACTGCGGCTTTCCTT
CTCCCACAATCCTTCGCGCTCTTCCTTTCCAACTTGGACGCTGCAGAGTGAGTATGGGTGGCGGAGTCTG
GGCTCCTGGAATCCAGCCCCATCCTCCTTTGGGATTGTGCTAACTGGGACC
RPL31 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPL31_1 ↗2:101,002,293正股101,002,244–101,002,303

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_84Z6Q5 · enhancer · 100998256–100998453 · regulatory

ENSR2_BQ37K · promoter · 101001739–101002701 · regulatory

ENSR2_CD2LC · enhancer · 101002702–101003812 · regulatory

ENSR2_84Z6X7 · enhancer · 101007005–101007225 · regulatory

· motif · 100997734–100997749 · motif

· motif · 100997734–100997749 · motif

· motif · 100998092–100998103 · motif

· motif · 101000078–101000091 · motif

· motif · 101002213–101002223 · motif

· motif · 101002233–101002244 · motif

· motif · 101002233–101002244 · motif

· motif · 101002235–101002244 · motif

· motif · 101002361–101002374 · motif

· motif · 101002514–101002523 · motif

· motif · 101002514–101002525 · motif

· motif · 101002514–101002525 · motif

· motif · 101004888–101004901 · motif

· motif · 101004888–101004901 · motif

· motif · 101006672–101006683 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:125 aa

ribosomal protein L31 屬於真核生物核糖體蛋白 eL31 家族。現有資料未提供其胺基酸序列、結構域或其他功能區域的註解。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 22TU…

PDB · 22TU

EM · 3.00 A · Ld=1-125

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

資料將 RPL31 產物定位於細胞質;未提供其在不同條件下的定位變化或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 8 個夥伴 · 最多顯示 50 個
L31RPL31CHATCTCFFGFR3GSNHTTUBQLN1Q9Y649N
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

資料指出 ribosomal protein L31 是大型核糖體次單元的組成成分,支持其屬於該複合體;未提供與特定分子的直接結合資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ribosomal protein L31 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質;此資料將該蛋白質定位為複合體組成部分,未說明其個別作用機制。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ribosomal protein L31 是大型核糖體次單元的組成成分。這項敘述支持其屬於該核糖體複合體,但未提供與其他特定分子的直接結合資料,也未描述更細部的互作方式。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位資料將 RPL31 產物的細胞內定位記載為細胞質;未提供定位所依據的條件、變化情形或異構型差異,因此不宜據此推論其他定位資訊。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm

PMID 23636399 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000264258 · 1,291 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1CTTCCTTTCCAACTTGGACGCTGCAGAATGGCTCCCGCAA40
41AGAAGGGTGGCGAGAAGAAAAAGGGCCGTTCTGCCATCAA80
81CGAAGTGGTAACCCGAGAATACACCATCAACATTCACAAG120
121CGCATCCATGGAGTGGGCTTCAAGAAGCGTGCACCTCGGG160
161CACTCAAAGAGATTCGGAAATTTGCCATGAAGGAGATGGG200
201AACTCCAGATGTGCGCATTGACACCAGGCTCAACAAAGCT240
241GTCTGGGCCAAAGGAATAAGGAATGTGCCATACCGAATCC280
281GTGTGCGGCTGTCCAGAAAACGTAATGAGGATGAAGATTC320
321ACCAAATAAGCTATATACTTTGGTTACCTATGTACCTGTT360
361ACCACTTTCAAAAATCTACAGACAGTCAATGTGGATGAGA400
401ACTAATCGCTGATCGTCAGATCAAATAAAGTTATAAAATT440
441GCCTTCATGTTTTTGTTCTTTTTAGTTGCAACATAATGTA480
481CTTGTATACCCTATCCTAATTATGGGATCATTTGAAGAGC520
521TTTTCCCAAATTGATGGCCTGTGCTGCCTTCTCCCCATCC560
561CCTGGGGTTTTAAAGTGATTTCAAACTGCAACCTAGTTTT600
601AGAACCACTGTTCTGGGTAGTTGGGATACTGAAGGCATAT640
641TGTTAATTATTCTACTTGTATGTTTTGCTAATTCTAAGAT680
681AAGCATTTTTCCAGAAACCAGGATGTAGAATCCAGTTGCC720
721ATTGACATCTTAACATTTTAGGAAACAACTTTAAAATGAT760
761ATACTATCTATCTATCTATCTGTAGCATCTTAAAGGTAAT800
801GAAATTAATGTGGCAGTAGGTCTTTTAAGCTTCTGCCTAC840
841ATCCATATTGAGTATAGTTGTTGTCTTCTAAAATAATTAA880
881TTGATTTTTGGTGAGATAACCAGATTCATATTTTAAGCCT920
921TTTGTAATGGCCCCGTGGTACCTGGAGTCAAGGTTCAGAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。