演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPL30L30

ribosomal protein L30

RPL30 編碼 ribosomal protein L30,屬於真核生物 eL30 核糖體蛋白家族,是大型核糖體次單元的組成成分。

Homo sapiens8q22.2UniProt P62888
OFFICIAL SYMBOL
RPL30
CHROMOSOME
8
UNIPROT
P62888
PDB / ALPHAFOLD
22TU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPL30 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 ribosomal protein L30。其產物屬於真核生物核糖體蛋白 eL30 家族,並構成大型核糖體次單元。核糖體是由 RNA 與蛋白質組成的大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質。

Official symbol
RPL30
Gene name
ribosomal protein L30
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10333
UniProt
P62888
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
L30eL30

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88q22.2
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegRPL30pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr8:98,016,387–98,046,469
Gene span
30,083 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000287038 ★98,041,721–98,045,5455
ENST0000112883098,016,387–98,045,6004
ENST0000112883198,025,303–98,045,6003
ENST0000112883298,025,339–98,045,6004
ENST0000091443898,041,709–98,045,5455
ENST0000109271298,041,709–98,045,6005
ENST0000107092598,041,710–98,045,6005
ENST0000109271098,041,710–98,045,6005
ENST0000109271198,041,712–98,045,5905
ENST0000091443798,041,714–98,045,6005
ENST0000091443698,041,714–98,045,5915
ENST0000109272198,041,716–98,045,5144

顯示 12/36 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RPL30 的產物 ribosomal protein L30 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體由 RNA 與蛋白質構成,是細胞合成蛋白質的複合體;因此,RPL30 所編碼的蛋白質參與核糖體的組成,而其功能背景與核糖體所執行的蛋白質合成密切相關。

來源資料將 RPL30 的角色描述為大型次單元的成分,並未進一步指出它如何與 RNA 或其他蛋白質接觸,也未說明它在蛋白質合成各步驟中的具體作用。依據現有資訊,可確認的功能範圍是其作為大型核糖體次單元的一部分,參與構成負責細胞蛋白質合成的核糖體;不宜據此延伸至特定調控機制或反應步驟。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 98045545 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPL30 ENST00000287038 GRCh38 chr8:98045445-98046545 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ATTTTCAGCGCCTAATATCTTCAGTGGTCTGTCTCTGGACATTTATACCAAGATCCAACGTTAACAGCAA
AAATACTTTTAAAAAATTAGACCTGTTTATCGCGCTCTCAGTGCAAACTCGGCTCACAAGTTCACGCTAA
CACAGTCACAAAAGGCGAGTTTTGGGAAACTCGAGCAGGGCGCCACCGTTCTCCAGGGGACAGGTAACTT
GGGTGACCGCAGGGGTGAGGACACAGCTGCTTCTACCAAGCGGAGAGTAAATGCGGGTGCTGCGGCGCAT
CGGAGTCACCCACAAGGCTCTCCAAGAGCCGCGCCTCAGGACAAAGATGAATTCAGCGGCATTGAGACCG
TGGTCGCAGCCGCCGCAGCCTCTTCTCATCTACCCTCCCACCTCACCTTCAGTCGGCTTTTCGAACTCCC
TCCGGGTTCTAAGCGCCTCGATTAGTTAGACCGCAGCTCGCAGCAGAACAGCAACACAACGCCGCGAAGC
TTAAAGGCCCGCAGAGGGGGAAAAGAACACCCCCGCCGTCATTCTTTTTTTTCCTTCTTTGAGACAGAGT
CTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAGTGCAGTGGCGCGATCATGGCTCACTGCAGCCTCGACCTACCGAGCTC
AAGCGACCTCTCCGCCTCAGCCTCCGGCGTAGCTGGGAGTAGCTAGGACTACTGGAGCGCGCCACCACGC
CCGGCTAATTTCTTTTTTATTTCTTTTTTATTTTTTTGTAGAGACAGGGGTGGTCTATGTTGTCCAGGCT
GGCCTTGAGCTGGACGCAACAGATCTTCCCGCCTCAACCTCCGAAAGTGCTGGGATTAAAGGTATGAGCA
GCCGCGTACGGCCCCCGCAGCCATTCTAGCTAGCGGTACCAATAGCAACCGGCAGCTGCCCTCCGCTTTT
GCTCCGCCCCTTCTGCTTGCGATCTGTTTCCGCTTCCGGTCCCGCAGTTCCGGCTCTGCCGTGAAGAGCT
TTGCATTGTGGGAAGTCTTTCCTTTCTCGTTCCCCGGCCATCTTAGCGGCTGCTGTTGGTGAGTGGGCTC
CTACCGACCGAGGTTTAGGCAGCGCGGGGAGCTTTGCGGGTTGCCATTTGT
RPL30 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPL30_2 ↗8:98,045,388負股98,045,378–98,045,437
RPL30_1 ↗8:98,045,545負股98,045,535–98,045,594

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_BPGC3 · enhancer · 98039776–98040644 · regulatory

ENSR8_BPGCM · enhancer · 98043830–98044588 · regulatory

ENSR8_84TSGC · promoter · 98045504–98045669 · regulatory

ENSR8_CCPNG · enhancer · 98045670–98046861 · regulatory

ENSR8_84TSJR · enhancer · 98049764–98049930 · regulatory

· motif · 98045447–98045462 · motif

· motif · 98045580–98045591 · motif

· motif · 98045582–98045591 · motif

· motif · 98045596–98045605 · motif

· motif · 98046083–98046098 · motif

· motif · 98046268–98046285 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:115 aa

ribosomal protein L30 歸屬於真核生物核糖體蛋白 eL30 家族。來源資料未提供其結構域、功能區域或序列特徵的進一步註解。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 22TU…

PDB · 22TU

EM · 3.00 A · Lc=1-115

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

來源資料將 RPL30 蛋白質定位於細胞質,未提供定位變化條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
L30RPL30LRRK2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RPL30 被註記為大型核糖體次單元的組成成分;資料未進一步說明其與特定分子的直接結合或其他互作關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RPL30 的產物是大型核糖體次單元的組成成分;核糖體為大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RPL30 的產物是大型核糖體次單元的組成成分。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RPL30 的產物定位於細胞質。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm

PMID 23636399 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000287038 · 498 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCTTTCTCGTTCCCCGGCCATCTTAGCGGCTGCTGTTGGT40
41TGGGGGCCGTCCCGCTCCTAAGGCAGGAAGATGGTGGCCG80
81CAAAGAAGACGAAAAAGTCGCTGGAGTCGATCAACTCTAG120
121GCTCCAACTCGTTATGAAAAGTGGGAAGTACGTCCTGGGG160
161TACAAGCAGACTCTGAAGATGATCAGACAAGGCAAAGCGA200
201AATTGGTCATTCTCGCTAACAACTGCCCAGCTTTGAGGAA240
241ATCTGAAATAGAGTACTATGCTATGTTGGCTAAAACTGGT280
281GTCCATCACTACAGTGGCAATAATATTGAACTGGGCACAG320
321CATGCGGAAAATACTACAGAGTGTGCACACTGGCTATCAT360
361TGATCCAGGTGACTCTGACATCATTAGAAGCATGCCAGAA400
401CAGACTGGTGAAAAGTAAACCTTTTCACCTACAAAATTTC440
441ACCTGCAAACCTTAAACCTGCAAAATTTTCCTTTAATAAA480
481ATTTGCTTGTTTTAAAAA498

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。