基因總覽
RPL29 是蛋白質編碼基因，其產物 ribosomal protein L29 屬於真核生物核糖體蛋白 eL29 家族。蛋白質全長 159 個胺基酸；序列註解指出，胺基端第 1–32 個胺基酸與第 117–159 個胺基酸區段具有無序特徵。此蛋白是大型核糖體次單元的組成部分。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000294189 ★ | 51,993,522–51,995,895 | 4 |
| ENST00000648640 | 51,993,522–51,995,857 | 4 |
| ENST00001061322 | 51,993,598–51,996,021 | 4 |
| ENST00001100294 | 51,993,598–51,995,986 | 4 |
| ENST00001003502 | 51,993,599–51,995,901 | 4 |
| ENST00000939894 | 51,993,600–51,995,953 | 4 |
| ENST00001061323 | 51,993,600–51,996,016 | 3 |
| ENST00001061325 | 51,993,600–51,995,952 | 3 |
| ENST00001100295 | 51,993,600–51,995,906 | 4 |
| ENST00000939896 | 51,993,602–51,995,859 | 4 |
| ENST00000939898 | 51,993,604–51,995,852 | 4 |
| ENST00000939897 | 51,993,607–51,995,857 | 4 |
顯示 12/28 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPL29 的產物是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體，負責在細胞內合成蛋白質；因此，來源所支持的功能定位，是 RPL29 作為核糖體結構組成的一員參與這個蛋白質合成複合體。現有資料未進一步說明 RPL29 在核糖體中的特定分子作用或其對蛋白質合成的獨立影響。
Promoter 與基因調控
>RPL29 ENST00000294189 GRCh38 chr3:51995795-51996895 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TACTCTTTCTTTGTCCACTCCTCTGCATTCCCACTGTCCTCCCTCAGGTCCAGGCAGCCCTCTCTCCTTC CTCCCCTCTGCTCCTTCTCCACGAAAGAGTCAGGCGTGCTTTTCTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCG CCCTGTAGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGATTCAAG CAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCAGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGTGCCACCACGCCCCGTGAATTTTT TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGTCCAGGCTGGTCT GGAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGGGTGCTTTTAAG AACACAGATCGGCCAGGTGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGGGACAGAGGCGAGCGGA TCGCGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATGTAAAA ATTAGCCGGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAAGAGAATCGCTTG AAACCGGAAGGCGGAGGTTGCAGTGGGCCGAGATTGTGCCACTGCCCTCCAGCCTCGGTGGAAGAGCGAA ACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACACAGATCTTCTTGCCCAACAACATCCCTCAAGGAC TCCTTTCTTTTTCAGTATCTTGAATAAGACTTAAGAGACAGGTCCTGGAGAAACAGAGAAGGGAGGAGGC AGCCTGAAGGGGGCGGAGGCAAGCTCGTAGCACCGCCTCCACGTCTGGCTTGCGTTCTTCCGGGCTTCGG AACTTTTCTTCGCGGAGCCTGGGGAAGCTTTTCCAGTAGTACTTTCCGGCGTTGTTGACCCTATTTCCCG TGCTGCACCGCAGCCCCTTTCTCTTCCGGTTCTAGGCGCTTCGGGAGCCGCGGCTTATGGTGAGTGTTGG CCGCGCGGCATCCGATGCCATCCGCGACTTACGGGTGGCGGCGGGGCGCGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPL29_1 ↗ | 3:51,995,895 | 負股 | 51,995,885–51,995,944 |
| RPL29_2 ↗ | 3:51,996,411 | 負股 | 51,996,401–51,996,460 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_C76B2 · enhancer · 51991189–51993083 · regulatory
ENSR3_9QM86 · promoter · 51995805–51996281 · regulatory
ENSR3_5G87MF · CTCF_binding_site · 51996037–51996058 · regulatory
ENSR3_5G87NF · CTCF_binding_site · 51996246–51996267 · regulatory
ENSR3_BDBLT · enhancer · 51997865–51998422 · regulatory
· motif · 51992742–51992753 · motif
· motif · 51995853–51995868 · motif
· motif · 51995881–51995901 · motif
· motif · 51995884–51995895 · motif
· motif · 51995884–51995895 · motif
· motif · 51995886–51995895 · motif
· motif · 51995990–51996001 · motif
· motif · 51996016–51996026 · motif
· motif · 51996037–51996047 · motif
· motif · 51996039–51996055 · motif
· motif · 51996248–51996264 · motif
· motif · 52000380–52000386 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：159 aa
ribosomal protein L29 屬於真核生物核糖體蛋白 eL29 家族，全長 159 個胺基酸。序列註解將第 1–32 個胺基酸及第 117–159 個胺基酸區域標示為無序區；資料未提供其他結構域或功能區域註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RPL29 的細胞內定位註記為細胞質。 來源未提供定位隨條件改變或異構型差異的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
RPL29 被列為大型核糖體次單元的組成成分，屬於複合體組成關係；來源未指出它與特定分子的直接結合，也未提供其他功能性互作資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPL29 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體，負責在細胞內合成蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ · PMID 12962325 ↗ |
| 交互作用 | RPL29 是大型核糖體次單元的組成成分；此敘述支持其屬於該核糖體次單元，未指出與特定分子的直接結合。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | RPL29 的細胞內定位註記為細胞質；此項資料未說明定位變化的條件或異構型差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTCTTCCGGTTCTAGGCGCTTCGGGAGCCGCGGCTTATGG40TGCAGACATGGCCAAGTCCAAGAACCACACCACACACAAC80CAGTCCCGAAAATGGCACAGAAATGGTATCAAGAAACCCC120GATCACAAAGATACGAATCTCTTAAGGGGGTGGACCCCAA160GTTCCTGAGGAACATGCGCTTTGCCAAGAAGCACAACAAA200AAGGGCCTAAAGAAGATGCAGGCCAACAATGCCAAGGCCA240TGAGTGCACGTGCCGAGGCTATCAAGGCCCTCGTAAAGCC280CAAGGAGGTTAAGCCCAAGATCCCAAAGGGTGTCAGCCGC320AAGCTCGATCGACTTGCCTACATTGCCCACCCCAAGCTTG360GGAAGCGTGCTCGTGCCCGTATTGCCAAGGGGCTCAGGCT400GTGCCGGCCAAAGGCCAAGGCCAAGGCCAAGGCCAAGGAT440CAAACCAAGGCCCAGGCTGCAGCCCCAGCTTCAGTTCCAG480CTCAGGCTCCCAAACGTACCCAGGCCCCTACAAAGGCTTC520AGAGTAGATATCTCTGCCAACATGAGGACAGAAGGACTGG560TGCGACCCCCCACCCCCGCCCCTGGGCTACCATCTGCATG600GGGCTGGGGTCCTCCTGTGCTATTTGTACAAATAAACCTG640AGGCAGGATTTGTTAGCCTCTGTCTATGATCCTGGGGATG680GGTTTGGTTGCTCCATCTGTTGGTGTGGGAGAAGACATGG720GTCTGGATGGTGGGGTGTGGGTGGGAGTCAGGAG754cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。