演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPL26L26

ribosomal protein L26

RPL26 編碼 ribosomal protein L26,屬於 universal ribosomal protein uL24 family,是大型核糖體次單元的組成成分。

Homo sapiens17p13.1UniProt P61254
OFFICIAL SYMBOL
RPL26
CHROMOSOME
17
UNIPROT
P61254
PDB / ALPHAFOLD
22TU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPL26 是蛋白質編碼基因,其正式名稱為 ribosomal protein L26。產物屬於 universal ribosomal protein uL24 family,並是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質。現有資料未提供更多 RPL26 蛋白質的結構或家族特徵細節。

Official symbol
RPL26
Gene name
ribosomal protein L26
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10327
UniProt
P61254
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
L26uL24

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717p13.1
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegRPL26pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr17:8,377,500–8,384,062
Gene span
6,563 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000648839 ★8,377,516–8,383,1934
ENST000005841648,377,500–8,383,1934
ENST000005830118,377,500–8,383,2274
ENST000005825568,377,500–8,383,1664
ENST000008513898,377,500–8,384,0624
ENST000008513908,377,500–8,384,0624
ENST000008513918,377,500–8,383,2273
ENST000008513928,377,500–8,383,2275
ENST000008513938,377,500–8,383,1933
ENST000008513948,377,500–8,383,1934
ENST000009136888,377,500–8,383,2274
ENST000009136898,377,500–8,383,2274

顯示 12/78 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RPL26 的產物是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體本身是大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質;因此,來源所支持的功能定位,是 RPL26 蛋白質作為該次單元的一部分,參與核糖體所執行的蛋白質合成工作。現有資料未進一步說明此蛋白質在合成過程中的具體分子作用方式,也未提供其對特定生物學過程或細胞狀態的其他作用描述。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 8383193 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPL26 ENST00000648839 GRCh38 chr17:8383093-8384193 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTGCAGTGAGTGGAGATCGTGCCAGTGCGCTCCAGCCTGAGCAACAAGAGCGAAACTGTCTCAAAAAGAA
GAAAAAGACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA
CACGAAGAAGAAGAAAAGAAACCATTTGCAGGGAGCGCACGGCTTCCGTCTGGTCCTGAACTGGACGCAA
ACAGGCCGAGCATTTAGAAACCCGCGCAGCTCCCCGCACCGAGAGGCTTCCTCTCGCCTGGCTCCTTCGA
AGCGTGGTCTGGACCAGCACCTCCCACAGCACTGGGGGCGCCTTGGAAACGCGGCCTTGGACCTATTTCC
GCGGGGGCAGGCGGCGATCGGTGGCCCTGGTCCTCGCAAGGCCCCTCACCACCCAGAACTGAATCTCTGG
CGGGCCCTGCTGTGCGGTCAGCAGACGCCCAGGTGCAGGGGCGGTGGCCGGCGTCGCGGTGGAGCTCGTT
AAAGTACCGGCACGCTGGCCGCGCCCACGCCACGGGCGGGAGGGGACGGTGAGTGCAGGGACCCAGGCGA
CCGGCCGGCCGGCGTCCCCGCGCCTCCTGGCGGCCAGAAGCAGGGCCTGCGCTTCCCCGGCTAAGGGGTG
CCGGCCCCCGCCCCGGCACCTGGGAGTGAAGGTACCAGCGGGTCTCCTGGGCGGTCTCCTGGGGCCGCTC
GTTCCTTCATCACCCCCAGGGGCAGTTGGACCCTGAGCAGCCTTAGCCAATAGCCCCGGGACTACCCTTC
CCAGAGGATTCAGCGGCAGCACCCGGGTCTCGGAAGGGAGACACTAGGACCTGGAGGAGGGGAGTTTTGC
AATCCCTCGCAGTTCCCCTCCTAGCCACTAGGTGACACTAGCCATAAATTTATTTCCCAGTTTACTCCCC
TCGCTCAAACTCCGCGCCCCTCTCGCTCCGAGAGACATAGGTCTCGCGAGATCTTTGGTAAACTTACAGA
ACCGGAAGCAGCGTGTAGTTCTCTTCCCTTTTGCGGCCATCACCGAAGCGGGAGCGGGTAAGGATTCGGC
GGGCAAGCGGGTGTAATCAGCAGCCATCCGTTCTTGGGCATGGTGGCTTCC
RPL26 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 5 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPL26_2 ↗17:8,377,666負股8,377,656–8,377,715
RPL26_3 ↗17:8,379,827負股8,379,817–8,379,876
RPL26_5 ↗17:8,382,141負股8,382,131–8,382,190
RPL26_6 ↗17:8,382,747負股8,382,737–8,382,796
RPL26_1 ↗17:8,383,193負股8,383,183–8,383,242

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_B3MWR · enhancer · 8382393–8383153 · regulatory

ENSR17_B3MWT · promoter · 8383154–8383706 · regulatory

ENSR17_53Z8GN · CTCF_binding_site · 8383313–8383334 · regulatory

ENSR17_53Z8HZ · CTCF_binding_site · 8383597–8383618 · regulatory

ENSR17_CSGJ · enhancer · 8383707–8385536 · regulatory

· motif · 8382428–8382437 · motif

· motif · 8382428–8382437 · motif

· motif · 8383076–8383093 · motif

· motif · 8383138–8383149 · motif

· motif · 8383175–8383190 · motif

· motif · 8383204–8383213 · motif

· motif · 8383204–8383215 · motif

· motif · 8383204–8383215 · motif

· motif · 8383204–8383217 · motif

· motif · 8383315–8383331 · motif

· motif · 8383414–8383427 · motif

· motif · 8383599–8383615 · motif

· motif · 8383671–8383684 · motif

· motif · 8383676–8383686 · motif

· motif · 8383729–8383742 · motif

· motif · 8383737–8383746 · motif

· motif · 8384030–8384040 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:145 aa

1 aa145 aa功能區域
依 P61254 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

RPL26 蛋白質長 145 個胺基酸,屬於 universal ribosomal protein uL24 family。序列註解將第 1–21 位及第 122–145 位分別標示為無序區域;資料未提供這些區域的其他功能說明。

功能區域Disordered1–21 aa
功能區域Disordered122–145 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 22TU…

PDB · 22TU

EM · 3.00 A · LY=1-145

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

現有資料未提供定位隨條件改變或不同異構型之間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
L26RPL26
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RPL26 是大型核糖體次單元的組成成分,來源另記載它與 DHX33 互作;資料未進一步說明兩者互作的具體方式或條件。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

RPL26 與 Diamond-Blackfan anemia 11(DBA11)相關。此病為常染色體顯性形式的 Diamond-Blackfan anemia,是先天性、非再生性低增生性貧血,通常在嬰兒早期發病;其特徵包括中度至重度大球性貧血、紅系母細胞減少及惡性腫瘤風險增加。30–40% 患者有身材矮小或先天異常,常見於顱顏、拇指及泌尿生殖系統。來源指出,影響此基因的變異會導致該病。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RPL26 的產物是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ · PMID 26100019 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RPL26 是大型核糖體次單元的組成成分;資料也記載 RPL26 與 DHX33 互作,但未說明互作方式或條件。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit. Interacts with DHX33

PMID 23636399 ↗ · PMID 26100019 ↗ · PMID 32669547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RPL26 蛋白質定位於細胞質。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm

PMID 23636399 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 RPL26 的變異會導致 Diamond-Blackfan anemia 11(DBA11),此病為常染色體顯性形式,通常在嬰兒早期發病,具有中度至重度大球性貧血、紅系母細胞減少及惡性腫瘤風險增加等特徵。30–40% 患者有身材矮小或先天異常,常見異常包括顱顏、拇指及泌尿生殖系統問題。含實驗來源
證據與來源

Diamond-Blackfan anemia 11 DBA11 An autosomal dominant form of Diamond-Blackfan anemia, a congenital non-regenerative hypoplastic anemia that usually presents early in infancy. Diamond-Blackfan anemia is characterized by a moderate to severe macrocytic anemia, erythroblastopenia, and an increased risk of malignancy. 30 to 40% of Diamond-Blackfan anemia patients present with short stature and congenital anomalies, the most frequent being craniofacial (Pierre-Robin syndrome and cleft palate), thumb and urogenital anomalies. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 614900

PMID 22431104 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000648839 · 528 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTCTTCCCTTTTGCGGCCATCACCGAAGCGGGAGCGGCCA40
41AAATGAAGTTTAATCCCTTTGTGACTTCCGACCGAAGCAA80
81GAATCGCAAAAGGCATTTCAATGCACCTTCCCACATTCGA120
121AGGAAGATTATGTCTTCCCCTCTTTCCAAAGAGCTGAGAC160
161AGAAGTACAACGTGCGATCCATGCCCATCCGAAAGGATGA200
201TGAAGTTCAGGTTGTACGTGGACACTATAAAGGTCAGCAA240
241ATTGGCAAAGTAGTCCAGGTTTACAGGAAGAAATATGTTA280
281TCTACATTGAACGGGTGCAGCGGGAAAAGGCTAATGGCAC320
321AACTGTCCACGTAGGCATTCACCCCAGCAAGGTGGTTATC360
361ACTAGGCTAAAACTGGACAAAGACCGCAAAAAGATCCTCG400
401AACGGAAAGCCAAATCTCGCCAAGTAGGAAAGGAAAAGGG440
441CAAATACAAGGAAGAAACCATTGAGAAGATGCAGGAATAA480
481AGTAATCTTATATACAAGCTTTGATTAAAACTTGAAACAA520
521AGAGCCTG528

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。