基因總覽
RPL24 是蛋白質編碼基因,產物名稱為 ribosomal protein L24,屬於真核生物核糖體蛋白 eL24 家族。核糖體是由 RNA 與蛋白質組成的大型核糖核蛋白複合體;RPL24 產物是其中大型次單元的組成成分。這項家族與複合體資訊,界定了它作為核糖體蛋白的基本性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000394077 ★ | 101,681,091–101,686,718 | 6 |
| ENST00001107963 | 101,677,660–101,686,811 | 6 |
| ENST00001130649 | 101,677,660–101,686,811 | 5 |
| ENST00001130651 | 101,677,660–101,686,811 | 7 |
| ENST00001130650 | 101,677,715–101,686,811 | 5 |
| ENST00001104200 | 101,681,088–101,686,811 | 6 |
| ENST00000915208 | 101,681,091–101,686,811 | 6 |
| ENST00000915209 | 101,681,091–101,686,811 | 6 |
| ENST00000915210 | 101,681,091–101,686,811 | 4 |
| ENST00000915211 | 101,681,091–101,686,811 | 5 |
| ENST00000915212 | 101,681,091–101,686,811 | 6 |
| ENST00000915213 | 101,681,091–101,686,811 | 6 |
顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPL24 的產物是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體本身是大型核糖核蛋白複合體,負責細胞內蛋白質的合成;因此,來源所支持的功能定位是參與核糖體這個蛋白質合成複合體,而非提供更細部的分子作用機制。
核糖體由 RNA 與蛋白質構成,RPL24 所屬的蛋白質位於大型次單元。這項組成關係將 RPL24 與細胞蛋白質合成連結起來:核糖體負責合成蛋白質,而 RPL24 是執行此工作的複合體之一部分。現有資料沒有進一步說明它在核糖體內的具體位置、與 RNA 的作用方式,或對蛋白質合成各步驟的個別影響,因此不宜將其功能延伸至來源未指出的機制。
Promoter 與基因調控
>RPL24 ENST00000394077 GRCh38 chr3:101686618-101687718 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GAGCCCTTGGCCTCCCAGCGGGGCTCCACCGACCCCCTCAACTTCACTAGGCAGCAACTCCGAATTGTAG TTCTTAGGCAGGTACTTAATAGGAATTTTGGAAACTGAATGAGCTCATGTTTAAAAAGCCTTTGGCATAA TTCCCGGCACAGAGAAAGCGCTCAAAGAATGTTAATTATAATTAATGCAAAGCGCCAACGCGCACTGTTC GATTCGCACAGCCTGAGAAACGGTTCGGTTGTCATTACTTTCTTATAAATGGTGAAACTATTAATTTGTT TGGTTGAGGAAATGGGCCAACAGGGAAGGCAAAATGTGACTGGTTTTACCTGCGGGGCATTCGTCTTTGG GTCTCTTTATGAGAAGAGAGGACACCTTTCTCTTCAGTTCACATTCCCTGCAGCCGGAAGATGGCTCTAG GATACTTGGCAGTAAGAGAGGCAGAATGGGCCGGGCGCAGTGGCTCCCGCCTATAATCCCAACACTTTGG GAGGCCGAGGAGGGCGGACCACCTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCG TCTCTACGAAAAATACAAAATTAGCCGGACGTGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCT GAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGCGGAGGTTACGGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCACTCCA GCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAGAGAGGAGAGACAGAGACAGAATGACTC ATAAACCAACTGTCTGACTGCCTTTTTGGCAGGCCCTCTGGGCCCGAGAACCCTCCAGCGCCTCTGGATG AATTGCGCCAGAGGAAGTCAGCTGTCAGGGAAAACGAGATCTTTCGCCTCGCGATGATTACGTCATCAAG GAGGGCCAGGAGCATCGAAGGATATTGGGGAGGAGATTTCCGGCCCCCATCCCCGCAGCGACCTTATAAG GTCTCTTCCCATGATTCTCTCTTTCTTTTCGCCATCTTTTGTCTTTCCGTGGAGCTGTCGCCATGAAGTA AGCACGACCCGTGGTTCCCAATCCGCTTACATCCTCGGGCAGAACTCCTCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPL24_1 ↗ | 3:101,686,714 | 負股 | 101,686,704–101,686,763 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR3_CD4FP · enhancer · 101684672–101686694 · regulatory
ENSR3_5TWQZQ · CTCF_binding_site · 101686693–101686714 · regulatory
ENSR3_84ZPHH · promoter · 101686695–101686837 · regulatory
ENSR3_CD4FT · enhancer · 101686838–101687975 · regulatory
ENSR3_93HCRJ · enhancer · 101691012–101691420 · regulatory
· motif · 101685100–101685113 · motif
· motif · 101686404–101686421 · motif
· motif · 101686531–101686548 · motif
· motif · 101686673–101686683 · motif
· motif · 101686695–101686711 · motif
· motif · 101686702–101686712 · motif
· motif · 101686735–101686750 · motif
· motif · 101686735–101686750 · motif
· motif · 101686765–101686774 · motif
· motif · 101686811–101686824 · motif
· motif · 101686811–101686824 · motif
· motif · 101686868–101686877 · motif
· motif · 101686947–101686955 · motif
· motif · 101687028–101687037 · motif
· motif · 101691102–101691114 · motif
· motif · 101691104–101691111 · motif
· motif · 101691104–101691119 · motif
· motif · 101691110–101691117 · motif
· motif · 101691390–101691405 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:157 aa
RPL24 產物長 157 個胺基酸,屬於真核生物核糖體蛋白 eL24 家族。序列第 106 至 157 位被註記為無序區域;此註記描述的是蛋白質特徵,來源未提供該區域更具體的功能說明。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間有所差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
RPL24 是大型核糖體次單元的組成成分,支持其屬於該核糖體複合體。來源未指出特定的直接結合夥伴,也未提供其他獨立的功能性互作關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPL24 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ |
| 交互作用 | RPL24 是大型核糖體次單元的組成成分。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | RPL24 定位於細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTTTCTTTTCGCCATCTTTTGTCTTTCCGTGGAGCTGTCG40CCATGAAGGTCGAGCTGTGCAGTTTTAGCGGGTACAAGAT80CTACCCCGGACACGGGAGGCGCTACGCCAGGACCGACGGG120AAGGTTTTCCAGTTTCTTAATGCGAAATGCGAGTCGGCTT160TCCTTTCCAAGAGGAATCCTCGGCAGATAAACTGGACTGT200CCTCTACAGAAGGAAGCACAAAAAGGGACAGTCGGAAGAA240ATTCAAAAGAAAAGAACCCGCCGAGCAGTCAAATTCCAGA280GGGCCATTACTGGTGCATCTCTTGCTGATATAATGGCCAA320GAGGAATCAGAAACCTGAAGTTAGAAAGGCTCAACGAGAA360CAAGCTATCAGGGCTGCTAAGGAAGCAAAAAAGGCTAAGC400AAGCATCTAAAAAGACTGCAATGGCTGCTGCTAAGGCACC440TACAAAGGCAGCACCTAAGCAAAAGATTGTGAAGCCTGTG480AAAGTTTCAGCTCCCCGAGTTGGTGGAAAACGCTAAACTG520GCAGATTAGATTTTTAAATAAAGATTGGATTATAACTCTA560cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。