基因總覽
RPL22 是蛋白質編碼基因,其正式名稱為 ribosomal protein L22。產物屬於真核生物核糖體蛋白 eL22 家族,並被註記為大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質組成的大型核糖核蛋白複合體;現有資料未提供 RPL22 的序列長度、結構域或其他更細緻的結構特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000234875 ★ | 6,185,020–6,199,595 | 4 |
| ENST00000929466 | 6,185,020–6,199,791 | 4 |
| ENST00000929467 | 6,185,020–6,199,791 | 5 |
| ENST00000929468 | 6,185,020–6,199,791 | 4 |
| ENST00001063914 | 6,185,020–6,199,791 | 4 |
| ENST00001101779 | 6,185,020–6,199,785 | 4 |
| ENST00001145499 | 6,185,020–6,199,791 | 4 |
| ENST00000979451 | 6,185,021–6,199,791 | 4 |
| ENST00000979452 | 6,185,022–6,199,791 | 3 |
| ENST00000929469 | 6,185,031–6,199,791 | 3 |
| ENST00001063912 | 6,185,031–6,199,791 | 4 |
| ENST00001063920 | 6,185,102–6,199,791 | 4 |
顯示 12/31 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPL22 的產物是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是細胞內負責合成蛋白質的大型核糖核蛋白複合體,因此 RPL22 透過參與此複合體,屬於細胞蛋白質合成系統的一部分。現有資料僅支持其核糖體組成與核糖體整體功能,未進一步說明 RPL22 在蛋白質合成過程中的具體分子作用,也未提供其對其他生物學過程或細胞功能的獨立影響。
Promoter 與基因調控
>RPL22 ENST00000234875 GRCh38 chr1:6199495-6200595 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GAGCCAAGAACAGCAGCTGGCTTTGGAGCTTGGTCAACCGGCTTGAGGCCTGAGTTGAAAGCTAGACCCA TCAGCACAGTCTCTTCTGGTGATTGGACTTTTGCTAGGTGAGTACACTGAAGCCAGGTAAAGGGAGTGGA GAGTGTGTGTGCCACTGAGTGATTTACAATTCAGGATCCTGGAATATAATTCCGTGAGGACGCAGCGGGT GACTGGGTGCAAAGTAGCCCAGTTCAAGGGACCTGTGGGCCTGGGGATGAGGACCTTTGCTTCTCCACAT GCGGTCCATGGACTCGCAGCATCAGCATCGTCTGAGAGCTTGTGAGAAATGCAGAATTTCAGGCCACTGA GACCGCTGGAATTGGAATCTGCATTTTCCAGATCTCCTGGTGGTCCTCAACTACTTACTGGTTTGGGATG GGAAACTAGAAGGCTTGGGCTGGGAAACTAGGGAGTGGTGATCAGCGAGGGGGCGGCCTGGCTACAGCAA AAAGGACAGGCACTGGGAGACAGCCCCTGGGCATGAGCTTCCAAGCTGGGGCTTTTTGAGGAAGCCATAG TGGTCTGGCATTGGGACCTCTGAACGAAATTTCCCGGTGGCTACAAGGAATTTTCCCACTTCCCCAAATT AGTAGATTCGATTTCCATCCCACTAGCTGGTAATTTACAGTATAGTGAATTTCCTTATTTCTTTTTTCTT CCCAAGACTTTCAAAAAGTAAAGCCAACCCCTTTATTTATCTTTGGGCTCGTCCAGTCTGGCTTCCCCCC TCCGATCGTTCGCAGTGGGACAGCCCGCCGGGCCTCCTTCCTTCCCCAGAAACCCTCCAGGCCTGGGAGA GGACGCGTTTTGCATTCAGGAAAAACCAATCGCTCCCCTATCGTACATAACCAAGAGAAAAGGTGGCGGA CGAGGGGCGTGGCAAAGTGATTAGTGCGGCCTGGACCCTGCGTGCCTTGCGCGCTGCGGGCTCTTTGCGT CTGCGTAGTTCGCTCACCTCCCTTTCTAACTCCGCTGCCGCCATGGCTCCTGTGGTTAGTATGGCTCCGC GTGAGGCCTCGGCTCCAGGGGAGGCACGTGGGCCTCGCCGAGCCCGGCATC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPL22_1 ↗ | 1:6,199,594 | 負股 | 6,199,584–6,199,643 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_B387T · enhancer · 6198734–6199584 · regulatory
ENSR1_94GFX · promoter · 6199585–6200085 · regulatory
ENSR1_53GD59 · CTCF_binding_site · 6200117–6200138 · regulatory
· motif · 6197965–6197972 · motif
· motif · 6199284–6199299 · motif
· motif · 6199514–6199523 · motif
· motif · 6199514–6199523 · motif
· motif · 6199549–6199566 · motif
· motif · 6199558–6199566 · motif
· motif · 6199558–6199575 · motif
· motif · 6199624–6199639 · motif
· motif · 6199654–6199671 · motif
· motif · 6199673–6199683 · motif
· motif · 6199943–6199963 · motif
· motif · 6199966–6199979 · motif
· motif · 6200119–6200135 · motif
· motif · 6200238–6200255 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
細胞內定位
RPL22 蛋白質的定位註記為細胞質。 來源未說明其在不同條件下的定位變化或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 15 個夥伴
- AP2M1Q96CW1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATXN1P54253 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BEND7Q8N7W2-2 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- CT45A1Q5HYN5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DDIT4LQ96D03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FGF11Q92914 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- H2BC15U3KQK0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SDCBPO00560 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- SDCBP2Q9H190 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- STAC3Q96MF2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SURF6O75683 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- THAP1Q9NVV9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZCCHC10Q8TBK6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IEP17473 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
RPL22 被註記為大型核糖體次單元的組成成分,支持其參與該核糖體複合體。現有資料未指出特定的直接結合夥伴,亦未提供其他互作或功能關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPL22 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是細胞內負責合成蛋白質的大型核糖核蛋白複合體;此註解未描述 RPL22 在其中的具體分子作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ |
| 交互作用 | RPL22 被註記為大型核糖體次單元的組成成分,表示它是該核糖體部分的組成之一;此項資料未列出特定結合夥伴或更細緻的互作方式。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | RPL22 的細胞內定位註記為細胞質。這筆資料未提供定位變化的條件、異構型差異或其他亞細胞位置資訊。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CCTTTCTAACTCCGCTGCCGCCATGGCTCCTGTGAAAAAG40CTTGTGGTGAAGGGGGGCAAAAAAAAGAAGCAAGTTCTGA80AGTTCACTCTTGATTGCACCCACCCTGTAGAAGATGGAAT120CATGGATGCTGCCAATTTTGAGCAGTTTTTGCAAGAAAGG160ATCAAAGTGAACGGAAAAGCTGGGAACCTTGGTGGAGGGG200TGGTGACCATCGAAAGGAGCAAGAGCAAGATCACCGTGAC240ATCCGAGGTGCCTTTCTCCAAAAGGTATTTGAAATATCTC280ACCAAAAAATATTTGAAGAAGAATAATCTACGTGACTGGT320TGCGCGTAGTTGCTAACAGCAAAGAGAGTTACGAATTACG360TTACTTCCAGATTAACCAGGACGAAGAAGAGGAGGAAGAC400GAGGATTAAATTTCATTTATCTGGAAAATTTTGTATGAGT440TCTTGAATAAAACTTGGGAACCAAAATGGTGGTTTATCCT480TGTATCTCTGCAGTGTGGATTGAACAGAAAATTGGAAATC520ATAGTCAAAGGGCTTCCCTTGGTTCGCCACTCATTTATTT560GTAACTTGACTTCTTTTTTTTTCTGCTTAAAAATTTCAAT600TCTCGTGGTAATACCAGAGTAGAAGGAGAGGGTGACTTTA640CCGAACTGACAGCCATTGGGGAGGCAGATGCGGGTGTGGA680GGTGTGGGCTGAAGGTAGTGACTGTTTGATTTTAAAAAGT720GTGACTGTCAGTTGTATCTGTTGCTTTTCTCAATGATTCA760GGGATACAAATGGGCTTCTCTCATTCATTAAAAGAAAACG800CGACATCTTTCTAAGATTCTCTGTGGGAAAATGACTGTCA840ATAAAATGCGGGTTTCTGGGCCATTCGTCTTACTTTCATT880TTTTGATTACAAATTTCTCTTGACGCACACAATTATGTCT920GCTAATCCTCTTCTTCCTAGAGAGAGAAACTGTGCTCCTT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。