演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPL22EAP

ribosomal protein L22

RPL22 編碼 ribosomal protein L22,屬於真核生物核糖體蛋白 eL22 家族,是大型核糖體次單元的組成成分。

Homo sapiens1p36.31UniProt P35268
OFFICIAL SYMBOL
RPL22
CHROMOSOME
1
UNIPROT
P35268
PDB / ALPHAFOLD
22TU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPL22 是蛋白質編碼基因,其正式名稱為 ribosomal protein L22。產物屬於真核生物核糖體蛋白 eL22 家族,並被註記為大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質組成的大型核糖核蛋白複合體;現有資料未提供 RPL22 的序列長度、結構域或其他更細緻的結構特徵。

Official symbol
RPL22
Gene name
ribosomal protein L22
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10315
UniProt
P35268
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
EAPL22eL22

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11p36.31
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegRPL22pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr1:6,185,020–6,209,389
Gene span
24,370 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000234875 ★6,185,020–6,199,5954
ENST000009294666,185,020–6,199,7914
ENST000009294676,185,020–6,199,7915
ENST000009294686,185,020–6,199,7914
ENST000010639146,185,020–6,199,7914
ENST000011017796,185,020–6,199,7854
ENST000011454996,185,020–6,199,7914
ENST000009794516,185,021–6,199,7914
ENST000009794526,185,022–6,199,7913
ENST000009294696,185,031–6,199,7913
ENST000010639126,185,031–6,199,7914
ENST000010639206,185,102–6,199,7914

顯示 12/31 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RPL22 的產物是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是細胞內負責合成蛋白質的大型核糖核蛋白複合體,因此 RPL22 透過參與此複合體,屬於細胞蛋白質合成系統的一部分。現有資料僅支持其核糖體組成與核糖體整體功能,未進一步說明 RPL22 在蛋白質合成過程中的具體分子作用,也未提供其對其他生物學過程或細胞功能的獨立影響。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 6199595 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPL22 ENST00000234875 GRCh38 chr1:6199495-6200595 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GAGCCAAGAACAGCAGCTGGCTTTGGAGCTTGGTCAACCGGCTTGAGGCCTGAGTTGAAAGCTAGACCCA
TCAGCACAGTCTCTTCTGGTGATTGGACTTTTGCTAGGTGAGTACACTGAAGCCAGGTAAAGGGAGTGGA
GAGTGTGTGTGCCACTGAGTGATTTACAATTCAGGATCCTGGAATATAATTCCGTGAGGACGCAGCGGGT
GACTGGGTGCAAAGTAGCCCAGTTCAAGGGACCTGTGGGCCTGGGGATGAGGACCTTTGCTTCTCCACAT
GCGGTCCATGGACTCGCAGCATCAGCATCGTCTGAGAGCTTGTGAGAAATGCAGAATTTCAGGCCACTGA
GACCGCTGGAATTGGAATCTGCATTTTCCAGATCTCCTGGTGGTCCTCAACTACTTACTGGTTTGGGATG
GGAAACTAGAAGGCTTGGGCTGGGAAACTAGGGAGTGGTGATCAGCGAGGGGGCGGCCTGGCTACAGCAA
AAAGGACAGGCACTGGGAGACAGCCCCTGGGCATGAGCTTCCAAGCTGGGGCTTTTTGAGGAAGCCATAG
TGGTCTGGCATTGGGACCTCTGAACGAAATTTCCCGGTGGCTACAAGGAATTTTCCCACTTCCCCAAATT
AGTAGATTCGATTTCCATCCCACTAGCTGGTAATTTACAGTATAGTGAATTTCCTTATTTCTTTTTTCTT
CCCAAGACTTTCAAAAAGTAAAGCCAACCCCTTTATTTATCTTTGGGCTCGTCCAGTCTGGCTTCCCCCC
TCCGATCGTTCGCAGTGGGACAGCCCGCCGGGCCTCCTTCCTTCCCCAGAAACCCTCCAGGCCTGGGAGA
GGACGCGTTTTGCATTCAGGAAAAACCAATCGCTCCCCTATCGTACATAACCAAGAGAAAAGGTGGCGGA
CGAGGGGCGTGGCAAAGTGATTAGTGCGGCCTGGACCCTGCGTGCCTTGCGCGCTGCGGGCTCTTTGCGT
CTGCGTAGTTCGCTCACCTCCCTTTCTAACTCCGCTGCCGCCATGGCTCCTGTGGTTAGTATGGCTCCGC
GTGAGGCCTCGGCTCCAGGGGAGGCACGTGGGCCTCGCCGAGCCCGGCATC
RPL22 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPL22_1 ↗1:6,199,594負股6,199,584–6,199,643

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_B387T · enhancer · 6198734–6199584 · regulatory

ENSR1_94GFX · promoter · 6199585–6200085 · regulatory

ENSR1_53GD59 · CTCF_binding_site · 6200117–6200138 · regulatory

· motif · 6197965–6197972 · motif

· motif · 6199284–6199299 · motif

· motif · 6199514–6199523 · motif

· motif · 6199514–6199523 · motif

· motif · 6199549–6199566 · motif

· motif · 6199558–6199566 · motif

· motif · 6199558–6199575 · motif

· motif · 6199624–6199639 · motif

· motif · 6199654–6199671 · motif

· motif · 6199673–6199683 · motif

· motif · 6199943–6199963 · motif

· motif · 6199966–6199979 · motif

· motif · 6200119–6200135 · motif

· motif · 6200238–6200255 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:128 aa

RPL22 產物屬於真核生物核糖體蛋白 eL22 家族。現有蛋白質註解未提供序列長度、功能區域或結構域等更細節的特徵。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 22TU…

PDB · 22TU

EM · 3.00 A · LU=1-128

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

RPL22 蛋白質的定位註記為細胞質。 來源未說明其在不同條件下的定位變化或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 15 個夥伴 · 最多顯示 50 個
EAPRPL22AP2M1ATXN1BEND7CT45A1DDIT4LFGF11H2BC15HTTSDCBPSDCBP2STAC3SURF6THAP1ZCCHC10IE
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 15 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RPL22 被註記為大型核糖體次單元的組成成分,支持其參與該核糖體複合體。現有資料未指出特定的直接結合夥伴,亦未提供其他互作或功能關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能RPL22 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是細胞內負責合成蛋白質的大型核糖核蛋白複合體;此註解未描述 RPL22 在其中的具體分子作用。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用RPL22 被註記為大型核糖體次單元的組成成分,表示它是該核糖體部分的組成之一;此項資料未列出特定結合夥伴或更細緻的互作方式。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位RPL22 的細胞內定位註記為細胞質。這筆資料未提供定位變化的條件、異構型差異或其他亞細胞位置資訊。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm

PMID 23636399 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000234875 · 2,061 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCTTTCTAACTCCGCTGCCGCCATGGCTCCTGTGAAAAAG40
41CTTGTGGTGAAGGGGGGCAAAAAAAAGAAGCAAGTTCTGA80
81AGTTCACTCTTGATTGCACCCACCCTGTAGAAGATGGAAT120
121CATGGATGCTGCCAATTTTGAGCAGTTTTTGCAAGAAAGG160
161ATCAAAGTGAACGGAAAAGCTGGGAACCTTGGTGGAGGGG200
201TGGTGACCATCGAAAGGAGCAAGAGCAAGATCACCGTGAC240
241ATCCGAGGTGCCTTTCTCCAAAAGGTATTTGAAATATCTC280
281ACCAAAAAATATTTGAAGAAGAATAATCTACGTGACTGGT320
321TGCGCGTAGTTGCTAACAGCAAAGAGAGTTACGAATTACG360
361TTACTTCCAGATTAACCAGGACGAAGAAGAGGAGGAAGAC400
401GAGGATTAAATTTCATTTATCTGGAAAATTTTGTATGAGT440
441TCTTGAATAAAACTTGGGAACCAAAATGGTGGTTTATCCT480
481TGTATCTCTGCAGTGTGGATTGAACAGAAAATTGGAAATC520
521ATAGTCAAAGGGCTTCCCTTGGTTCGCCACTCATTTATTT560
561GTAACTTGACTTCTTTTTTTTTCTGCTTAAAAATTTCAAT600
601TCTCGTGGTAATACCAGAGTAGAAGGAGAGGGTGACTTTA640
641CCGAACTGACAGCCATTGGGGAGGCAGATGCGGGTGTGGA680
681GGTGTGGGCTGAAGGTAGTGACTGTTTGATTTTAAAAAGT720
721GTGACTGTCAGTTGTATCTGTTGCTTTTCTCAATGATTCA760
761GGGATACAAATGGGCTTCTCTCATTCATTAAAAGAAAACG800
801CGACATCTTTCTAAGATTCTCTGTGGGAAAATGACTGTCA840
841ATAAAATGCGGGTTTCTGGGCCATTCGTCTTACTTTCATT880
881TTTTGATTACAAATTTCTCTTGACGCACACAATTATGTCT920
921GCTAATCCTCTTCTTCCTAGAGAGAGAAACTGTGCTCCTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。