演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

RPL19FLJ27452

ribosomal protein L19

RPL19 編碼 ribosomal protein L19,屬於真核生物 eL19 家族,是大型核糖體次單元的組成成員。

Homo sapiens17q12UniProt P84098
OFFICIAL SYMBOL
RPL19
CHROMOSOME
17
UNIPROT
P84098
PDB / ALPHAFOLD
22TU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

RPL19 是蛋白質編碼基因,其產物為 ribosomal protein L19,屬於真核生物核糖體蛋白 eL19 家族。它是大型核糖體次單元的組成成員;核糖體則是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質。現有資料未提供更多關於此蛋白質結構或其他分子特性的說明。

Official symbol
RPL19
Gene name
ribosomal protein L19
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10312
UniProt
P84098
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FLJ27452MGC71997DKFZp779D216L19eL19

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q12
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegRPL19pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr17:39,200,282–39,204,840
Gene span
4,559 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000225430 ★39,200,283–39,204,7326
ENST0000057937439,200,283–39,204,7276
ENST0000086907639,200,283–39,204,7266
ENST0000086907739,200,283–39,204,7276
ENST0000091239339,200,283–39,204,7316
ENST0000091239439,200,283–39,204,7316
ENST0000091239539,200,283–39,204,7274
ENST0000091239639,200,283–39,204,7276
ENST0000091239739,200,283–39,204,7275
ENST0000091239839,200,283–39,204,7275
ENST0000091239939,200,283–39,204,7276
ENST0000091240039,200,283–39,204,7274

顯示 12/27 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

RPL19 的產物 ribosomal protein L19 是大型核糖體次單元的組成成員。核糖體由 RNA 與蛋白質組成,是細胞內負責合成蛋白質的大型核糖核蛋白複合體;因此,現有資料將 RPL19 的功能定位於核糖體的組成,而非描述其獨立執行的催化或調控作用。

資料指出核糖體負責細胞內蛋白質合成,但沒有進一步說明 ribosomal protein L19 如何參與這項過程,也未提供其與核糖體 RNA 或其他核糖體蛋白質的特定分子作用方式。來源亦未描述 RPL19 對蛋白質合成效率、核糖體組裝或其他生物學過程的獨立影響。因此,對其功能的說明應限於它是大型核糖體次單元的成員,以及該複合體負責細胞內蛋白質合成。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 39200283 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>RPL19 ENST00000225430 GRCh38 chr17:39199283-39200383 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTTCTTCTTGGATTTTTACATTGGGTGTTCCAGATCAGAAGAAAAGGACTGCTTTTTTTTTTTTTTTGAG
ACGGAGTCTCACTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTC
CTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGAATTACAAGCACGCGCCGCTACGCCC
GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTGGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGAC
CTCAAGTGATCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCATCGAGCCCAACCC
AATTTTTTTTTTTTTTAATTTTACTTTCTGCAATCATTCATCCATTCAGCCAGTGCGGTATTTCTGAGGT
GTGTTCGATCGCGGATCCATGCCTGCCGCAGTACAGTTGTGAGCCAAATGAGACTGAGACTAGTTCCCGC
CCTCCAAGAGCTTGCAAGACCCGCAGTGGCGTAAAAACACTAACATCTTTTAGTGATCGATTCTGCACTC
CAGGGGTTTTCAATCTACTACAAGAGTGAATAAGAGTTCGCCTTTGTCTGATATCTGTTGTCATTCTCTC
TCGCTTCTTTAACTGATTTTTTCTCAGCTAATAAAACATCCACCCACAACCCCCCGAACGCCCGCAAACA
CCAGGCCACTCTAGCAAAACCTCTCTCACTCCGCCTGCGCAATCCAGCTGACTTCCGGTTACAGATAACC
ACGTGATTGGGAACCCTTGCTGCGCATGTCTAGTAGGAAGTCGGACTATACCACTTTCCCTACGGAAGGG
GTACTTTTTTATGTTTTTAAGTTTAAAACCGATTTCTGATATTTGACTTTTATCATTTCAGGCCTATATG
GAGGCTATGAGTGAGTTTAGTGTGGCAGAAGATGAAAGAACCGGACAGGAATACGGACGAAATTGGAGCA
GGGTTTGGGCTCTCCCCTTCGCAGATAATGGGAGGAGCCGGGCCCGAGCGAGCTCTTTCCTTTCGCTGCT
GCGGCCGCAGCCATGAGGTGAGGGCGAGCTGGTCTCCATCAGGCGCTGACG
RPL19 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
RPL19_2 ↗17:39,200,061正股39,200,012–39,200,071
RPL19_1 ↗17:39,200,317正股39,200,268–39,200,327

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_5C7X2N · CTCF_binding_site · 39197013–39197034 · regulatory

ENSR17_B9R2Z · promoter · 39197659–39198192 · regulatory

ENSR17_83656Q · enhancer · 39199193–39199327 · regulatory

ENSR17_B9R3B · promoter · 39199793–39200517 · regulatory

ENSR17_B9R43 · enhancer · 39205005–39205626 · regulatory

· motif · 39195865–39195878 · motif

· motif · 39195865–39195878 · motif

· motif · 39196783–39196796 · motif

· motif · 39196808–39196821 · motif

· motif · 39196987–39197000 · motif

· motif · 39197015–39197031 · motif

· motif · 39197831–39197840 · motif

· motif · 39198381–39198396 · motif

· motif · 39198386–39198398 · motif

· motif · 39198390–39198403 · motif

· motif · 39198406–39198415 · motif

· motif · 39198412–39198425 · motif

· motif · 39198918–39198929 · motif

· motif · 39199971–39199986 · motif

· motif · 39200012–39200023 · motif

· motif · 39200012–39200023 · motif

· motif · 39200032–39200041 · motif

· motif · 39200032–39200043 · motif

· motif · 39200032–39200043 · motif

· motif · 39200032–39200045 · motif

· motif · 39200073–39200084 · motif

· motif · 39200073–39200084 · motif

· motif · 39200374–39200390 · motif

· motif · 39200467–39200482 · motif

· motif · 39200582–39200591 · motif

· motif · 39200582–39200591 · motif

· motif · 39200687–39200696 · motif

· motif · 39200687–39200696 · motif

· motif · 39205282–39205295 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:196 aa

1 aa196 aa功能區域
依 P84098 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ribosomal protein L19 長 196 個胺基酸,屬於真核生物核糖體蛋白 eL19 家族。序列註解指出第 157 至 176 位胺基酸區段為無序區。

功能區域Disordered157–176 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 22TU…

PDB · 22TU

EM · 3.00 A · LR=1-196

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

資料將 ribosomal protein L19 定位於細胞質;未提供其他定位或定位變化的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FLJ27452RPL19ATXN1HTTMRPL49TERF1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

RPL19 的產物是大型核糖體次單元的組成成員。資料未指出它與特定分子的實體結合、其他複合體,或超出核糖體組成角色的功能性關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ribosomal protein L19 是大型核糖體次單元的組成成員。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體,負責在細胞內合成蛋白質。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ribosomal protein L19 是大型核糖體次單元的組成成員。含實驗來源
證據與來源

Component of the large ribosomal subunit

PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ribosomal protein L19 位於細胞質。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm

PMID 23636399 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000225430 · 737 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCAGATAATGGGAGGAGCCGGGCCCGAGCGAGCTCTTTCC40
41TTTCGCTGCTGCGGCCGCAGCCATGAGTATGCTCAGGCTT80
81CAGAAGAGGCTCGCCTCTAGTGTCCTCCGCTGTGGCAAGA120
121AGAAGGTCTGGTTAGACCCCAATGAGACCAATGAAATCGC160
161CAATGCCAACTCCCGTCAGCAGATCCGGAAGCTCATCAAA200
201GATGGGCTGATCATCCGCAAGCCTGTGACGGTCCATTCCC240
241GGGCTCGATGCCGGAAAAACACCTTGGCCCGCCGGAAGGG280
281CAGGCACATGGGCATAGGTAAGCGGAAGGGTACAGCCAAT320
321GCCCGAATGCCAGAGAAGGTCACATGGATGAGGAGAATGA360
361GGATTTTGCGCCGGCTGCTCAGAAGATACCGTGAATCTAA400
401GAAGATCGATCGCCACATGTATCACAGCCTGTACCTGAAG440
441GTGAAGGGGAATGTGTTCAAAAACAAGCGGATTCTCATGG480
481AACACATCCACAAGCTGAAGGCAGACAAGGCCCGCAAGAA520
521GCTCCTGGCTGACCAGGCTGAGGCCCGCAGGTCTAAGACC560
561AAGGAAGCACGCAAGCGCCGTGAAGAGCGCCTCCAGGCCA600
601AGAAGGAGGAGATCATCAAGACTTTATCCAAGGAGGAAGA640
641GACCAAGAAATAAAACCTCCCACTTTGTCTGTACATACTG680
681GCCTCTGTGATTACATAGATCAGCCATTAAAATAAAACAA720
721GCCTTAATCTGCCTTCC737

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。