基因總覽
RPL18A 是蛋白質編碼基因，其正式名稱為 ribosomal protein L18a。它的產物屬於真核生物核糖體蛋白 eL20 家族，並是大型核糖體次單位的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體，負責細胞內蛋白質的合成。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000222247 ★ | 17,859,910–17,863,319 | 5 |
| ENST00000600147 | 17,859,868–17,864,153 | 5 |
| ENST00000599898 | 17,859,868–17,863,315 | 6 |
| ENST00000878958 | 17,859,868–17,863,316 | 4 |
| ENST00000916998 | 17,859,868–17,863,319 | 5 |
| ENST00000916999 | 17,859,868–17,863,318 | 5 |
| ENST00000917001 | 17,859,868–17,863,323 | 5 |
| ENST00000917002 | 17,859,868–17,863,321 | 5 |
| ENST00000917003 | 17,859,868–17,863,318 | 5 |
| ENST00000917005 | 17,859,868–17,863,316 | 5 |
| ENST00001094986 | 17,859,868–17,871,283 | 6 |
| ENST00001094988 | 17,859,868–17,863,318 | 5 |
顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPL18A 產物 ribosomal protein L18a 是大型核糖體次單位的組成成分。核糖體由 RNA 與蛋白質構成，負責在細胞內合成蛋白質；因此，來源所支持的功能定位是參與核糖體複合體，而非單獨執行蛋白質合成。
Promoter 與基因調控
>RPL18A ENST00000222247 GRCh38 chr19:17858910-17860010 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATGACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGTCTTTTTT TTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTACAGTGGCGCAATCTCGGG TCACTGCAACCTCTGGCTCCTGGGTTCAAACGATTCTCATGCCTCAGCCTCCTGCCTCTTTCCTCTTAAT TTTACTTCATAGCCTTGTCATCAGGGAGTTGTTTGCGGGTGTTTCTTTTTTCATATCTGGTCCCCGTCCT CATCCCCAGGAGGGCTTCTTTCTGCCCAAGCAAACTGCTAAGTCCAAGCCCCTCAAAGTGGGCGGCTGGA TCTTGATCCATTCTCCGGCTCTCCGCGCGCTCTCCCCCAACCCCTGCTCCCTCAGGTTCTTATGAACTGG AGGCAGACAGACAGAGTTTGAATCCCAGCTACTACGAAACACAAATCGGACCCCAAATTAACAAAAACAG CATTCCAGAGCTTATTCAATATTCGTGCTGCAACATCGCTAGGAGAAAAATATATTATTTGTATTCCCAT TTTACAGATACCCTCAGGTATCTGGTGGAGACCTCCGTAACACACCTCCCCGGAGGATGAGGCCCCGAGT GTGAAGCATCGGGATCTCACGGTAAACACCGCAGCCACCCGAGGTAGCTTAGGTTCAATGCTTAGGCATC CTGCAGGCGGCGCGCGCCGCCGCCCCTAGTTGCAGCCGGGACTGGCGGAGTGCCTACAACTCCCGACGTG CCGCGCGCGCAGACGCTCCGTTGCGGTCGTGGTGGAACAGGTGGAGCTTGCCTCGTTGCCTTCTGGGAAA CGAAGTCTCGCTGAAGAGAGGCGGAACTTTGAGTAGCAGGTGGATCCATAGCCAATGAAGACGCGGGTCG CTTTGAGTGCGGGGCAGAGAAGCCAATGGACGTGCGGCATTGAGAGGGCGGGTCTTCCGGTAGTGAAGGC CTGGTGAACGGCTGCGCGACAGAGGACACTTCCTTTTGCGGGTGGCGGCGAACGCGGAGAGCACGCCATG AAGGCCTCGGGCACGGTAAGGCGGGCGCGGCGCGGCAGGGGGCCAAGGGAT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPL18A_1 ↗ | 19:17,859,922 | 正股 | 17,859,873–17,859,932 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_B5JN9 · enhancer · 17855301–17856034 · regulatory
ENSR19_567DNJ · CTCF_binding_site · 17855746–17855767 · regulatory
ENSR19_B5JNT · promoter · 17859420–17859942 · regulatory
ENSR19_567FCD · CTCF_binding_site · 17859605–17859626 · regulatory
ENSR19_994DZ · promoter · 17860273–17860773 · regulatory
ENSR19_B5JP3 · enhancer · 17860774–17861305 · regulatory
· motif · 17855748–17855764 · motif
· motif · 17859508–17859518 · motif
· motif · 17859607–17859623 · motif
· motif · 17859715–17859724 · motif
· motif · 17859784–17859793 · motif
· motif · 17859863–17859873 · motif
· motif · 17860121–17860131 · motif
· motif · 17860132–17860148 · motif
· motif · 17860132–17860148 · motif
· motif · 17860278–17860298 · motif
· motif · 17860279–17860299 · motif
· motif · 17860506–17860526 · motif
· motif · 17864385–17864393 · motif
· motif · 17864427–17864442 · motif
· motif · 17864427–17864442 · motif
· motif · 17864864–17864880 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：176 aa
ribosomal protein L18a 屬於真核生物核糖體蛋白 eL20 家族。來源未提供其結構域、序列特徵或其他功能區域資訊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ribosomal protein L18a 的定位註記為細胞質；來源未提供定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- RPL4P36578 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ribosomal protein L18a 是大型核糖體次單位的組成成分；此外，來源記載它與 IPO9 具有高親和力結合。資料未進一步說明此結合的條件或功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ribosomal protein L18a 是大型核糖體次單位的組成成分。核糖體是大型核糖核蛋白複合體，負責在細胞內合成蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ |
| 交互作用 | ribosomal protein L18a 是大型核糖體次單位的組成成分，並與 IPO9 具有高親和力結合。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. Binds IPO9 with high affinity PMID 11823430 ↗ · PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ |
| 細胞定位 | ribosomal protein L18a 的定位註記為細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGAGGACACTTCCTTTTGCGGGTGGCGGCGAACGCGGAGA40GCACGCCATGAAGGCCTCGGGCACGCTACGAGAGTACAAG80GTAGTGGGTCGCTGCCTGCCCACCCCCAAATGCCACACGC120CGCCCCTCTACCGCATGCGAATCTTTGCGCCTAATCATGT160CGTCGCCAAGTCCCGCTTCTGGTACTTTGTATCTCAGTTA200AAGAAGATGAAGAAGTCTTCAGGGGAGATTGTCTACTGTG240GGCAGGTGTTTGAGAAGTCCCCCCTGCGGGTGAAGAACTT280CGGGATCTGGCTGCGCTATGACTCCCGGAGCGGCACCCAC320AACATGTACCGGGAATACCGGGACCTGACCACCGCAGGCG360CTGTCACCCAGTGCTACCGAGACATGGGTGCCCGGCACCG400CGCCCGAGCCCACTCCATTCAGATCATGAAGGTGGAGGAG440ATCGCGGCCAGCAAGTGCCGCCGGCCGGCTGTCAAGCAGT480TCCACGACTCCAAGATCAAGTTCCCGCTGCCCCACCGGGT520CCTGCGCCGTCAGCACAAGCCACGCTTCACCACCAAGAGG560CCCAACACCTTCTTCTAGGTGCAGGGCCCTCGTCCGGGTG600TGCCCCAAATAAACTCAGGAACGCCCCGGTGCTC634cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。