基因總覽
RPL12 是蛋白質編碼基因，產物為 ribosomal protein L12，隸屬於普遍存在的 uL11 核糖體蛋白家族。它是大型核糖體次單元的組成蛋白。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體，負責細胞內蛋白質的合成；RPL12 的基本角色因此位於核糖體的組成架構之中。現有資料指出，該蛋白可直接結合 26S ribosomal RNA，但未提供其序列長度或更細部的結構域資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000361436 ★ | 127,447,674–127,451,406 | 7 |
| ENST00000938714 | 127,447,422–127,451,446 | 7 |
| ENST00001069834 | 127,447,673–127,451,446 | 7 |
| ENST00001099224 | 127,447,673–127,451,446 | 7 |
| ENST00000938715 | 127,447,674–127,451,446 | 4 |
| ENST00000938716 | 127,447,674–127,451,446 | 7 |
| ENST00000938717 | 127,447,674–127,451,446 | 7 |
| ENST00000938718 | 127,447,674–127,451,446 | 5 |
| ENST00000938719 | 127,447,674–127,451,446 | 7 |
| ENST00000938720 | 127,447,674–127,451,446 | 7 |
| ENST00000938721 | 127,447,674–127,451,446 | 7 |
| ENST00000938722 | 127,447,674–127,451,446 | 6 |
顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPL12 的產物 ribosomal protein L12 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是負責細胞內蛋白質合成的大型核糖核蛋白複合體，因此 RPL12 的功能背景與核糖體的組成及其蛋白質合成角色相關。現有資料未進一步說明 RPL12 對蛋白質合成各步驟的具體影響，亦未描述其在不同生物學條件下的功能變化。
在分子層次上，ribosomal protein L12 可直接結合 26S ribosomal RNA。這項結合資訊指出該蛋白與核糖體 RNA 具有直接接觸，但來源沒有提供結合區域、結合方式或此作用對核糖體功能的具體後果，因此不能據此推定更細的分子機制。
資料將 RPL12 定位為大型核糖體次單元的成分，並指出核糖體負責在細胞內合成蛋白質。由此可知，RPL12 與蛋白質合成系統相關；不過目前提供的內容僅支持其核糖體組成身分及對 26S ribosomal RNA 的直接結合，沒有描述基因表現調控、細胞表型或特定生理過程中的額外作用。
Promoter 與基因調控
>RPL12 ENST00000361436 GRCh38 chr9:127451306-127452406 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGCCTGCAGAGCCAGTTCAGGCCCTCTTGTCACCCCACCTGCCTGCAAGGATGGGGAATGGTTTGAAAAC AGCCCTCCCCCATCCGTCCCTGATGACCAGCACTTACCCTTCTGCTCCCCAATCACTAACCCTCTTGCAC CCCCTTCCTGATGTGCAGCCCTCCCCACTTCCTCCCAACCACCATCGCTCTCCCACCCCTCCCCGAAGAT CAGTTCTTTCCAGGCTGCCCCACATGCCTGTCCCTCCCTCTCCGACGTCCAGCCTAGATGCGGGGGGAGG GCCACACCCATATTTCCTGGGGTGGGGTGGGCAGTGGCTGACCTGGCTTTGCGGATGGAGGGATCCCCCA CGTTGGGACCCGCGGGTGCACCCGAGGGCAGGCCGATCACTCGGAGGGCTTGGTCACGGACTCGGGGCCG CAGACCACCCGGCACGGGCCGGGCGGAGCCGGAGTCTGGTCTCCTTCAAAGGCAGGTGCTGGGAACAGAA ACTCAGAATCTCATAAAGTCACGCAGACCGGGATGACGAAGTCTGAGGCTCTAGGAATCGCGGACTCTCC GAATGAAGAGCGGGACTGGATTTCCACATAGACTGTTTTGATAACTAAAGTGCACACAACAAGTGCTCGA GGGAGCAGGGGTCGCCGCGGTACTGGGGTCTCGGAATGGGACTACGGACCCCTCAGGGGAGGGGCGGGGC TCTGGGATTGGGTGACGGGGACCGGGGTGACACTCACGATAAAGGAATATGGGAAACAGCTAGGGCTGGG ATCACCGGAGCCACCCTTCTCAGACTTCTCCGGAGCGAACTACCCGAACCCCCTTTCGGAATCTCTAGCT TCAGCGCACCGCGGTGCCCTGCTTGCCAGCCGTCAGCCTCAGGCGCCTGCCCACAACAAACATGGCGACA AGGGCGTCTCTGGAAGGCCGGGCAGTGACGACAGTTCTCGCGATAGCCGCGTTTTCCTGCCTATATCTGG CTTGTCCGCGCGATTTCCGGCCTCTCGGCTTTCGGCTCGGAGGAGGCCAAGGTGCAACTTCCTTCGGTCG TCCCGAATCCGGGTTCATCCGACACCAGCCGCCTCCACCATGCCGCCGAAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPL12_1 ↗ | 9:127,451,405 | 負股 | 127,451,395–127,451,454 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR9_BX9X7 · promoter · 127451363–127452265 · regulatory
ENSR9_534ZDXQ · CTCF_binding_site · 127452253–127452274 · regulatory
ENSR9_BX9XB · enhancer · 127452266–127453048 · regulatory
ENSR9_534ZF2Z · CTCF_binding_site · 127452728–127452749 · regulatory
ENSR9_BX9XQ · enhancer · 127455289–127455956 · regulatory
ENSR9_534ZFHJ · CTCF_binding_site · 127455444–127455465 · regulatory
· motif · 127446734–127446742 · motif
· motif · 127447725–127447736 · motif
· motif · 127447912–127447925 · motif
· motif · 127447912–127447925 · motif
· motif · 127449282–127449302 · motif
· motif · 127450417–127450428 · motif
· motif · 127450781–127450790 · motif
· motif · 127450967–127450989 · motif
· motif · 127450967–127450989 · motif
· motif · 127451077–127451086 · motif
· motif · 127451371–127451384 · motif
· motif · 127451406–127451415 · motif
· motif · 127451456–127451469 · motif
· motif · 127451597–127451619 · motif
· motif · 127451597–127451619 · motif
· motif · 127451977–127451992 · motif
· motif · 127452255–127452271 · motif
· motif · 127452728–127452740 · motif
· motif · 127452730–127452746 · motif
· motif · 127455446–127455462 · motif
· motif · 127455566–127455572 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：165 aa
ribosomal protein L12 屬於普遍存在的 universal ribosomal protein uL11 家族。現有資料未提供其胺基酸序列長度、結構域或其他功能區域的序列註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ribosomal protein L12 的定位記載為細胞質。 來源未提供條件依賴的定位變化、異構型差異或動態資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- CANXP27824 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OR10G4Q8NGN3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
RPL12 是大型核糖體次單元的組成蛋白。成熟核糖體由小型 40S 與大型 60S 次單元構成；40S 約含 33 種不同蛋白質及 1 個 18S RNA 分子，60S 約含 49 種不同蛋白質及 3 個 RNA 分子，分別為 28S、5.8S 與 5S。來源未列出 RPL12 與其他蛋白質的直接結合關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPL12 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成、負責細胞內蛋白質合成的大型複合體；ribosomal protein L12 也可直接結合 26S ribosomal RNA。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell. Binds directly to 26S ribosomal RNA PMID 25901680 ↗ |
| 交互作用 | RPL12 是大型核糖體次單元的組成成分。成熟核糖體由小型 40S 與大型 60S 次單元構成：40S 約含 33 種不同蛋白質及 1 個 18S RNA 分子；60S 約含 49 種不同蛋白質及 3 個 RNA 分子，分別為 28S、5.8S 與 5S。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. Mature ribosomes consist of a small (40S) and a large (60S) subunit. The 40S subunit contains about 33 different proteins and 1 molecule of RNA (18S). The 60S subunit contains about 49 different proteins and 3 molecules of RNA (28S, 5.8S and 5S) PMID 23636399 ↗ · PMID 25901680 ↗ |
| 細胞定位 | RPL12 的細胞內定位記載為細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CCTCTCGGCTTTCGGCTCGGAGGAGGCCAAGGTGCAACTT40CCTTCGGTCGTCCCGAATCCGGGTTCATCCGACACCAGCC80GCCTCCACCATGCCGCCGAAGTTCGACCCCAACGAGATCA120AAGTCGTATACCTGAGGTGCACCGGAGGTGAAGTCGGTGC160CACTTCTGCCCTGGCCCCCAAGATCGGCCCCCTGGGTCTG200TCTCCAAAAAAAGTTGGTGATGACATTGCCAAGGCAACGG240GTGACTGGAAGGGCCTGAGGATTACAGTGAAACTGACCAT280TCAGAACAGACAGGCCCAGATTGAGGTGGTGCCTTCTGCC320TCTGCCCTGATCATCAAAGCCCTCAAGGAACCACCAAGAG360ACAGAAAGAAACAGAAAAACATTAAACACAGTGGGAATAT400CACTTTTGATGAGATTGTCAACATTGCTCGACAGATGCGG440CACCGATCCTTAGCCAGAGAACTCTCTGGAACCATTAAAG480AGATCCTGGGGACTGCCCAGTCAGTGGGCTGTAATGTTGA520TGGCCGCCATCCTCATGACATCATCGATGACATCAACAGT560GGTGCTGTGGAATGCCCAGCCAGTTAAGCACAAAGGAAAA600CATTTCAATAAAGGATCATTTGACAACTGGTGGA634cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。