基因總覽
RPL10A 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 ribosomal protein L10a。其產物屬於 universal ribosomal protein uL1 家族，並是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體，負責在細胞中合成蛋白質；RPL10A 因此具有核糖體蛋白的基本身分。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000322203 ★ | 35,468,401–35,470,780 | 6 |
| ENST00000864372 | 35,468,366–35,470,786 | 6 |
| ENST00000864373 | 35,468,366–35,470,786 | 5 |
| ENST00000864374 | 35,468,366–35,470,786 | 5 |
| ENST00000918617 | 35,468,366–35,470,786 | 6 |
| ENST00000918618 | 35,468,366–35,470,786 | 4 |
| ENST00000918619 | 35,468,366–35,470,786 | 5 |
| ENST00000918620 | 35,468,366–35,470,786 | 6 |
| ENST00000918621 | 35,468,366–35,470,786 | 6 |
| ENST00000918622 | 35,468,366–35,470,786 | 6 |
| ENST00000918623 | 35,468,366–35,470,786 | 6 |
| ENST00000961684 | 35,468,366–35,470,786 | 6 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
RPL10A 的產物是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是由 RNA 與蛋白質構成的大型核糖核蛋白複合體，其主要工作是在細胞中合成蛋白質。現有資料支持 RPL10A 參與核糖體的構成，並指出蛋白質合成是核糖體複合體所負責的功能；資料未進一步說明 RPL10A 在合成過程中的具體分子作用。
Promoter 與基因調控
>RPL10A ENST00000322203 GRCh38 chr6:35467401-35468501 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTACCTTCCTTCCCATGAATTCTGGGTATTGAGCCCATCCGCACCCCCTCCACTTCCCTGCTCAATGACA AGGAACATCTTTTTCCTGGTGAGGGGAAGGGTGTAGGGTATCTTATTCACCCTCTGAGGGCCAAATAATG TGTAATACCACCCACCCCATCCTATAGGAGCTGCCCCCACCAGGCAGGGGGGTAGGTGAGAATGGGCATC TTAAAGGTGGGAGTGACTCAGTCTGGAGTTCGGGAAGGGTTTTGGGCAGATGAATCCGAGGAGAGATCTG AAGGGCTCTGGGGGTTACTGTGGCTAAGAGGATGAGACCCATTGGACAGAGGAAAGAGCAGAGAAGACAC CTTATGGGTGTGCAGTGCTGTGTGCCTGTTTTACATCCTTGTATTCCTGTAGCACCTGGCTAGACGCCTT ATTCATAGCAGTCACACTTAAAACGTAGATGTTATCAAATTAACTATCAAGTGAAAGTTCACTTAAGGAC TTTCCCAGCTCTTCCCCTCTGCAGGCGTTGAAAGGACAGGAACAGAACTTTCCGGACACTTCCCTTACCA CGAGTCCACGTTAGAGCAAGGTGCTGAGGGAGGGAGGTCGGGCCAGGCTTCCTTTTGAGAACATAAGCTG GTGCGGAGGGCGCGAGGGGAGAGGGGTTTGAGGGACAAGCGTGCCGGAATCCACGCTGTCAGTGAACATC ACTGGGCTGTACCAGTACGTGTGACTACCGAAGCTCGAGCCCCGAACCCAGCCGCTTCCCTAGGGGTCCA GCAGCAGCGGGCGCGAATCGGCACATTACCGGGGGACCGCGGGGCGCTCAGGACTGCGACAACTCTGTGG GTTACCGCGCCGGCCTAGCGGCCCAGCGACGCCCCCCAGCGGCCAGAGAAGGCCGCGCTTCTCGGGGTTG GCCCACCCAACCGCTCTGCGGGTAGGACCGAGGAGCAAAGCATTATCGCGAGATCAGGGCCACTATTTGA GCGCATGCGCAAGACATGCTAGTCTCTTTTCCGGTTAGCGCGGCGTGAGAAGCCATGAGGTGAGTTGGTC CTGAAAGCCCTATCCGCGTTCATCCGCGCCTTCAGGTGCCCCGCCGAGGGT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| RPL10A_1 ↗ | 6:35,468,404 | 正股 | 35,468,355–35,468,414 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_9J44R · promoter · 35467911–35468411 · regulatory
ENSR6_5BC8MZ · CTCF_binding_site · 35468266–35468287 · regulatory
ENSR6_5BC8SZ · CTCF_binding_site · 35469344–35469365 · regulatory
ENSR6_5BC9D2 · CTCF_binding_site · 35472374–35472395 · regulatory
ENSR6_9J466 · promoter · 35472660–35473160 · regulatory
· motif · 35467743–35467765 · motif
· motif · 35467743–35467765 · motif
· motif · 35468266–35468276 · motif
· motif · 35468268–35468284 · motif
· motif · 35468380–35468391 · motif
· motif · 35468380–35468391 · motif
· motif · 35468409–35468426 · motif
· motif · 35468856–35468873 · motif
· motif · 35469346–35469362 · motif
· motif · 35469534–35469551 · motif
· motif · 35469543–35469551 · motif
· motif · 35469855–35469864 · motif
· motif · 35469855–35469864 · motif
· motif · 35470565–35470587 · motif
· motif · 35470565–35470587 · motif
· motif · 35470579–35470594 · motif
· motif · 35470605–35470614 · motif
· motif · 35470605–35470614 · motif
· motif · 35470817–35470830 · motif
· motif · 35470817–35470830 · motif
· motif · 35471263–35471271 · motif
· motif · 35472376–35472392 · motif
· motif · 35473283–35473291 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：217 aa
RPL10A 蛋白屬於 universal ribosomal protein uL1 家族。現有資料未提供其結構域、功能區域或序列特徵的詳細註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
RPL10A 蛋白定位於細胞質；現有資料未描述其他定位或定位變化條件。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- LRRK2Q5S007 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- RGS17Q9UGC6 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- RPL11P62913 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RPS3AP61247 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
資料指出 RPL10A 是大型核糖體次單元的組成成分，支持其屬於該核糖體複合體；未提供與特定分子的實體結合資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RPL10A 是大型核糖體次單元的組成成分。核糖體是大型核糖核蛋白複合體，負責在細胞中合成蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the large ribosomal subunit. The ribosome is a large ribonucleoprotein complex responsible for the synthesis of proteins in the cell PMID 23636399 ↗ · PMID 32669547 ↗ · PMID 12962325 ↗ |
| 交互作用 | RPL10A 是大型核糖體次單元的組成成分；此項敘述支持其屬於該次單元，但未提供特定分子結合資訊。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | RPL10A 蛋白定位於細胞質；這筆資料未提供定位變化條件或其他細胞內位置。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGTCTCTTTTCCGGTTAGCGCGGCGTGAGAAGCCATGAGC40AGCAAAGTCTCTCGCGACACCCTGTACGAGGCGGTGCGGG80AAGTCCTGCACGGGAACCAGCGCAAGCGCCGCAAGTTCCT120GGAGACGGTGGAGTTGCAGATCAGCTTGAAGAACTATGAT160CCCCAGAAGGACAAGCGCTTCTCGGGCACCGTCAGGCTTA200AGTCCACTCCCCGCCCTAAGTTCTCTGTGTGTGTCCTGGG240GGACCAGCAGCACTGTGACGAGGCTAAGGCCGTGGATATC280CCCCACATGGACATCGAGGCGCTGAAAAAACTCAACAAGA320ATAAAAAACTGGTCAAGAAGCTGGCCAAGAAGTATGATGC360GTTTTTGGCCTCAGAGTCTCTGATCAAGCAGATTCCACGA400ATCCTCGGCCCAGGTTTAAATAAGGCAGGAAAGTTCCCTT440CCCTGCTCACACACAACGAAAACATGGTGGCCAAAGTGGA480TGAGGTGAAGTCCACAATCAAGTTCCAAATGAAGAAGGTG520TTATGTCTGGCTGTAGCTGTTGGTCACGTGAAGATGACAG560ACGATGAGCTTGTGTATAACATTCACCTGGCTGTCAACTT600CTTGGTGTCATTGCTCAAGAAAAACTGGCAGAATGTCCGG640GCCTTATATATCAAGAGCACCATGGGCAAGCCCCAGCGCC680TATATTAAGGCACATTTGAATAAATTCTATTACCAGTT718cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。