基因總覽
ROR2(ROR family WNT receptor 2)是蛋白質編碼基因,產物屬於蛋白質激酶超家族中的 Tyr protein kinase family,並歸於 ROR subfamily。其蛋白質具有單次跨膜的第一型膜蛋白架構:胞外區含 Ig-like C2-type、FZ 與 Kringle 結構域,跨膜區連接細胞質部分;細胞質區包含 Protein kinase 結構域。這種構造使 ROR2 成為受體型分子,具有胞外區與細胞內激酶區。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000375708 ★ | 91,722,601–91,950,228 | 9 |
| ENST00000375715 | 91,563,091–91,948,880 | 13 |
| ENST00000912487 | 91,722,596–91,950,240 | 8 |
| ENST00001033923 | 91,722,597–91,950,240 | 9 |
| ENST00000964760 | 91,722,598–91,950,240 | 9 |
| ENST00000912486 | 91,722,600–91,950,240 | 7 |
| ENST00001138763 | 91,722,601–91,950,240 | 9 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ROR2 是受體型酪胺酸蛋白激酶,可能參與軟骨細胞早期形成;依相似性推定,它似乎也是軟骨與生長板發育所需的因子。這些發育相關描述帶有推論性質,來源並未提供更具體的細胞或發育階段條件。
在骨形成方面,ROR2 可磷酸化 YWHAB,並由此促進骨生成與骨形成。這項作用將受體的磷酸化能力連結至骨骼相關生物學過程;來源描述的是促進作用,並未進一步交代其下游分子步驟。
ROR2 的酪胺酸激酶功能仍有需保留的限制:體外實驗曾顯示其酪胺酸激酶活性很低。因此,不能僅憑受體具有激酶結構域,便將其描述為在所有情境中都有強烈激酶活性;來源同時記載了磷酸化 YWHAB 的作用與體外活性偏低的觀察。
ROR2 也可能作為 WNT5A 的受體,並可能因此抑制由 WNT3A 介導的訊號傳遞。此處的受體作用及訊號抑制皆以可能性表述,來源未將其概括為所有 WNT 訊號的普遍調節方式。
Promoter 與基因調控
>ROR2 ENST00000375708 GRCh38 chr9:91950128-91951228 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACAAGCTAGAGCTGGCTTAGTCATTTTGTCCGCAGACCATAGCAAGAGAGTTTTTATTTCTGGCCACGTC TGAGGCCTCACGTCTGGCACCCAAGGCCAGGGCTCTCCCTAATGCCCTCCAATTAACAGAGCTTGGTACT CCAGCAAAAACACCAAACAAACTGCTGGATAATCAGTTAAAAGATCAATCTCATGGAACAAGCAACTGAG ATGCTGGAGAATCCAATTCCTTCCTCTAAGAGGAAAAACAAAGACATTTGCATGTGCTGAGCAAAACCAA GAATAAGCAAGAAAACATGCTATTTGAATTCCGTTCAAAATGTCTCTAATAAGTGAAGCAAATTCTGCAC ATTCTGGGCCTCTGCAGAGAACAAATAGTGTTCTGCCTTTAATGGGTAAAATTATACAATTTGCTTTTAA CAGTAAACCAAAAGCCGCGGTGGCTTCGGATAGCATCGCGCTCCCGAGGGCTCCCTCCACGCAGCTCGAC CCCTGGCAGTTTTGAGCATTTCGGGGGACGCGCTTGTCCCCACCGACCTGGGAGGGCGCCGGTGCCAAGG CGGCCTGTTTGTTTTCCTGAACATTTCCTTTTGCAACTTTCGCTTCTCCTCTTCCTGCCTCACCGCTGGT GTCTGGGGCTGGGTGGCTCTCAGATTTGTCCCGGTGCGCAGTGCAGCCTGGAGTTACTGATTTGTGACCT AGATCCCCGGGTGTGTCGCCCCCGAAAGTCGGGGGCACCCGCTCTGGGCGCCTCTCCTGCGTGGGCAGAC CCGCCGAACTCCGGCTGACGCCCCCAAGGCGCCACCTTTGTGTTCAAGCGTTCCGAGGCGCAGGCCCGAG GGCGGGCGCAGGAGGCAGGTCCGGGGCCCCAGCTGCAGCCCCAGCTCCTTGGGTCCCGCCCGCCGCCCGC GCGTTCCCCCGGCAGGGGGCGCCGGCGCAAGCCTCGCTCTGCCCATCGGGGCGGGCGAGCGGGGACCCTG CCTCCTGCGCGCTCGCCCGCGGTCCGCCCCCCGCGCTCGTCCTGGCGGCCGGCGGGACGCCCCAGCCCGC GCCAAGGAACCTCCCCAGCCAGCCCTTGCCGTGGCCGGAGCCGAGCGGCGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ROR2_2 ↗ | 9:91,856,851 | 負股 | 91,856,841–91,856,900 |
| ROR2_3 ↗ | 9:91,948,812 | 負股 | 91,948,802–91,948,861 |
| ROR2_1 ↗ | 9:91,950,162 | 負股 | 91,950,152–91,950,211 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR9_BN8NC · enhancer · 91945261–91946261 · regulatory
ENSR9_93CHCZ · enhancer · 91946660–91947042 · regulatory
ENSR9_BN8NP · enhancer · 91948016–91948869 · regulatory
ENSR9_93CHDM · promoter · 91948870–91949370 · regulatory
ENSR9_5RLXDL · CTCF_binding_site · 91949591–91949612 · regulatory
ENSR9_84NZRZ · promoter · 91950218–91950410 · regulatory
ENSR9_5RLXHT · CTCF_binding_site · 91950294–91950315 · regulatory
ENSR9_BN8P3 · enhancer · 91950411–91951040 · regulatory
ENSR9_84NZT3 · enhancer · 91952040–91952243 · regulatory
ENSR9_5RLZ85 · CTCF_binding_site · 91954461–91954482 · regulatory
ENSR9_BN8PN · enhancer · 91954657–91955597 · regulatory
ENSR9_5RLZB9 · CTCF_binding_site · 91954920–91954941 · regulatory
· motif · 91949593–91949609 · motif
· motif · 91950121–91950130 · motif
· motif · 91950296–91950312 · motif
· motif · 91954463–91954479 · motif
· motif · 91954922–91954938 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:943 aa
ROR2 蛋白質長 943 個胺基酸,N 端含訊號胜肽,胞外區之後為單一螺旋跨膜區,並接續細胞質區。胞外結構域包括 Ig-like C2-type、FZ 與 Kringle;細胞質區含 Protein kinase 結構域。另有兩段被註記為無序區,分別位於 757–796 與 850–931 胺基酸位置。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ROR2 位於細胞膜,屬單次跨膜的第一型膜蛋白。 來源未提供其在不同條件下的定位變化或異構型間差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 29 個夥伴
- ACTMAPQ5BKX5-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ALG13Q9NP73-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARID5AQ03989 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BHLHE40O14503 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C10orf55Q5SWW7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C1orf94Q6P1W5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CREMQ03060-25 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CRXO43186 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- DAZAP2Q15038 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- FAM168BA1KXE4-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FOSBP53539 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSP90AB1P08238 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ISXQ2M1V0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KIAA1218A4D0Q3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP19-7Q3SYF9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP6-2Q3LI66 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP7-1Q8IUC3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LHX6Q9UPM6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MSX2P35548 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PITX1P78337 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PLA2G10O15496 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- POU2AF1Q16633 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRKAB2O43741 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRR20DP86480 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRR23EQ8N813 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ROR2 可形成同源二聚體,也會與自身 ROR2 相互作用。它與 YWHAB 結合,並與 WTIP 互作;其中 WTIP 的互作依相似性推定。來源另述 ROR2 促進骨生成,這是功能關係,不等同於蛋白質結合證據。
疾病與遺傳關聯
ROR2 相關變異與 Brachydactyly B1 及常染色體隱性 Robinow syndrome 1 有關。Brachydactyly B1 的特徵包括中節指骨較短,末節指骨發育不全或缺失,手指與腳趾均可能受影響,拇指及大拇趾通常變形,也可有指骨融合。Robinow syndrome 1 為隱性形式,常見短肢侏儒、脊椎與肋骨分節異常,以及頭面部和外生殖器異常;來源指出其骨骼表現通常較嚴重,並可伴隨脊柱側彎、胸廓變形、肋骨融合及肢端骨發育不全。疾病條目將兩者描述為由影響 ROR2 的基因變異所致。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ROR2 是酪胺酸蛋白激酶受體,可能參與軟骨細胞早期形成,且依相似性推定似乎是軟骨與生長板發育所需。它可磷酸化 YWHAB,進而誘導骨生成與骨形成;但體外酪胺酸激酶活性很低。此外,ROR2 可能是 WNT5A 受體,並可能抑制 WNT3A 介導的訊號傳遞。 | 含實驗來源 | 證據與來源Tyrosine-protein kinase receptor which may be involved in the early formation of the chondrocytes. It seems to be required for cartilage and growth plate development (By similarity). Phosphorylates YWHAB, leading to induction of osteogenesis and bone formation. In contrast, has also been shown to have very little tyrosine kinase activity in vitro. May act as a receptor for wnt ligand WNT5A which may result in the inhibition of WNT3A-mediated signaling PMID 17717073 ↗ · PMID 25029443 ↗ |
| 分子活性 | L-tyrosyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | ROR2 可形成同源二聚體,也與自身 ROR2 相互作用;它能結合 YWHAB,並依相似性推定與 WTIP 互作。來源另述其促進骨生成,但此功能描述不等同於分子結合關係。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer; promotes osteogenesis. Binds YWHAB. Interacts with WTIP (By similarity). Interacts with ROR2 PMID 17717073 ↗ · PMID 26035863 ↗ |
| 細胞定位 | ROR2 位於細胞膜,是單次跨膜的第一型膜蛋白;此定位資料未說明條件變化或異構型差異。 | 推論支持 | |
| 疾病關聯 | Brachydactyly B1 是一種遺傳性肢端短小畸形,與影響 ROR2 的基因變異相關。其特徵為中節指骨短,末節指骨發育不全或缺失,手指與腳趾均受影響;拇指和大拇趾通常變形,亦可出現指骨融合。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Brachydactyly B1 BDB1 A form of brachydactyly. Brachydactyly defines a group of inherited malformations characterized by shortening of the digits due to abnormal development of the phalanges and/or the metacarpals. In brachydactyly type B1 the middle phalanges are short but in addition the terminal phalanges are rudimentary or absent. Both fingers and toes are affected. The thumbs and big toes are usually deformed. Symphalangism is also a feature. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 113000 |
| 疾病關聯 | 常染色體隱性 Robinow syndrome 1 與影響 ROR2 的基因變異相關,屬 Robinow syndrome 的隱性形式,臨床表現通常較嚴重,尤其涉及骨骼。患者均有脊椎分節異常,可致脊柱側彎與胸廓變形;肋骨融合具有代表性,也可能出現短肢、肢端骨發育不全,以及手足指趾數目或融合異常。 | 含實驗來源 | 證據與來源Robinow syndrome, autosomal recessive 1 RRS1 A recessive form of Robinow syndrome, a disease characterized by short-limb dwarfism, costovertebral segmentation defects and abnormalities of the head, face and external genitalia. The clinical signs are generally far more severe in recessive cases, particularly skeletal abnormalities. All patients with the recessive form suffer from vertebral segmentation abnormalities, resulting in scoliosis and chest deformities. Rib fusions are considered to be characteristic of the autosomal recessive form. Patients can also present brachydactyly, with extensive aplasia/hypoplasia of the phalanges and metacarpals/metatarsals, and brachy-syn-polydactyly of the hands and oligodactyly of the feet. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 268310 PMID 10932186 ↗ · PMID 10932187 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GGTCCGCCCCCCGCGCTCGTCCTGGCGGCCGGCGGGACGC40CCCAGCCCGCGCCAAGGAACCTCCCCAGCCAGCCCTTGCC80GTGGCCGGAGCCGAGCGGCGCATCCGGGCCGGAGAAGAGG120ACGACGACGAGGTCCTCGAAGTGGACCCGTTTGCGAAGCG160CCAGGGAGAAGGAGGAGCGGACGCATCGTAGAAAGGGGTG200GTGGCGCCCGACCCCGCGCCCCGGCCCGAAGCTCTGAGGG240CTTCCCGGCCCCCACTGCCTGCGGCATGGCCCGGGGCTCG280GCGCTCCCGCGGCGGCCGCTGCTGTGCATCCCGGCCGTCT320GGGCGGCCGCCGCGCTTCTGCTCTCAGTGTCCCGGACTTC360AGGTGAAGTGGAGGTTCTGGATCCGAACGACCCTTTAGGA400CCCCTTGATGGGCAGGACGGCCCGATTCCAACTCTGAAAG440GTTACTTTCTGAATTTTCTGGAGCCAGTAAACAATATCAC480CATTGTCCAAGGCCAGACGGCAATTCTGCACTGCAAGGTG520GCAGGAAACCCACCCCCTAACGTGCGGTGGCTAAAGAATG560ATGCCCCGGTGGTGCAGGAGCCGCGGCGGATCATCATCCG600GAAGACAGAATATGGTTCACGACTGCGAATCCAGGACCTG640GACACGACAGACACTGGCTACTACCAGTGCGTGGCCACCA680ACGGGATGAAGACCATTACCGCCACTGGCGTCCTGTTTGT720GCGGCTGGGTCCAACGCACAGCCCAAATCATAACTTTCAG760GATGATTACCACGAGGATGGGTTCTGCCAGCCTTACCGGG800GAATTGCCTGTGCACGCTTCATTGGCAACCGGACCATTTA840TGTGGACTCGCTTCAGATGCAGGGGGAGATTGAAAACCGA880ATCACAGCGGCCTTCACCATGATCGGCACGTCTACGCACC920TGTCGGACCAGTGCTCACAGTTCGCCATCCCATCCTTCTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。